Garra rufa (doctor fish): 141298751
Help
Entry
141298751 CDS
T11039
Symbol
fbn2a
Name
(RefSeq) LOW QUALITY PROTEIN: fibrillin-2
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
grf Garra rufa (doctor fish)
Pathway
grf04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
grf00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
141298751 (fbn2a)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
grf00536
]
141298751 (fbn2a)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
grf00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
141298751 (fbn2a)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
hEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
EGF_3
Plasmod_Pvs28
EGF_FBN_1st
EGF_MSP1_1
EGF_PEAR1L
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
141298751
NCBI-ProteinID:
XP_073685157
LinkDB
All DBs
Position
23:32025921..32097745
Genome browser
AA seq
2655 aa
AA seq
DB search
MDGSQRLEKQESLRGPNVCGSGLQSYCCPGWSSLPGGNRCVVPICRNSCGDGFCSRPNMC
TCPDGQIAPTCATKSSIQCNIRCMNGGLCEEDHCQCPKGYTGSFCGQPVCEKTCHNGGRC
VGPNRCVCVYGFTGPQCERDYRTGPCFIQVRGGQCAAQSGGFVCSKALCCATVGRAWGHL
CELCPPLSASCRRGFTPNTRTGACQDVDECKVVPGLCKGGKCTNTVGSYQCQCPAGFQQH
LSSLMCEDVDECSSVQHVCDGGRCINSVGSFSCVCPAGYLPSADRTHCLEQRSGVCYASV
VNGRCAQEISGRFSKIQCCCDRGRCWSQSTAHEMCPTPGSDEYFRICLVGSALSGFSEED
PDTHPQHPSGFSSTSNDQILHPLHDNGLLTPQIHQIPQIPQISGDSNGFKPQRPVVVRMN
ETVNRCRLFPNLCLNGRCVGSDYRCDCNTGYREDTRGECSDVDECADEPCTNGNCINTPG
SYYCRCHSGFLRAPAKQACTDIDECLQNGLLCKNGRCLNTEGSFQCICNAGFKLTPDGKN
CTDHDECAAANMCLNGMCINEDGSYKCVCKPGFTLHSSGRYCTDVDECRTPGVCMNGRCV
NTQGSFRCECFAGLTIGIDGRTCVDTHMRSTCYGAVKRGLCVXQQSVTKSQCCCANPNYG
FGEPCRPCPGKNSGEFQALCASGVGFSADGKDINECALDPDICSNGVCENLRGSFRCVCN
SGYESDQNGRNCLDIDECVVNSLLCDNGLCRNVPGSYSCTCPSGYTFRHDTETCDDVNEC
VSSPCVNGVCKNSAGSFSCECPLGSKLDFTGLLCVDSLKGSCWLTLQDGRCEVNINGATL
RSQCCATLGAAWGSPCEPCQSDPVCERGFARPRGALCEDVNECEVFPGVCHNGHCVNTRG
SFKCQCPESLTLDVTGRVCVDVRSEPCFLTYDEDVCTQALPGRFRMDVCCCTVGLAWGKD
CDLCPEPGSRQFDALCPRGPGFANKGDVLTGRAVYKDINECKVFQSICIHGKCRNTIGSF
RCRCDSGFALDSNEKNCTDIDECVISPDVCGHGTCVNTLGSFQCDCFPGYESGLMMMKNC
MDIDECERNLSLCNGGTCENTDGSYRCVCPPGHQLSVDASSCQDVNECELSSTLCLNGRC
VNVVGTYQCSCNSGYQTTPDRKDCTDVDECTIENGGCELYCSNSEGSYSCSCSQGYALTP
DQRTCADVNECEEDVDICEGGQCTNVPGAYHCVCHEGFMTSMDMRTCVDVNECELNTNIC
VFGECENTKGSFVCHCEMGYAVKKGTSGCTDVDECEMNTHDCDTHATCINTPGHYRCSCR
DGWSGDGVRCADVDECSDTTHVCSADAECVNTVGSYRCRCSDGFTGDGFTCTDKDECAED
VDLCENGQCLNVPGSYRCECEMGFTHTPNSKTCQDIDECTFQNICVYGTCQNIPGMFRCV
CDEGYELDRTGGNCTDVDECLDPVSCVNGHCENTAGSYQCNCPIDFELNPTGIGCVDTRV
GGCFLALAYYGHDGLACSVELGFGVGRSSCCCSLGRAWGNPCDLCPPLNTTEYNTLCPGG
EGFKPNPITIILEDIDECQELPGLCQGGNCINTFGSFQCDCLAGYYLNTDSRMCEDIDEC
VLSSGVCGPGTCYNTLGNYTCVCPQDYMPVNRGHSCMDMRKSLCYRNYSGSTCEHQLNFN
TTQRLCCCAYNVGKAWNKPCQACPSPGTGDYRSLCGSVTGFRIDIDTGKLKDIDECHEIP
GICAHGVCINHMGSFHCECPTGFSYSDLQLTCEDIDECSSGEHVCQRNADCINWPGSYQC
ECSDGYILTPNGACTDRNECVEMPSVCRHGECVDFPGGYECVCHTGFTATQNRRMCVDVN
ECSHQLCGNGTCTNSVGSFNCICHQGFDLASNNYCTDIDECAVFHSQLCRNGRCVNNVGS
FQCLCREGYELTLEGRSCIDVNECILNRGICAPGTCVNLDGSFRCVCPDGYIVHNEHCVD
VNECSEEPGICAYGSCFNSLGSFECVCKPGFMLSEDRRRCYDTRESFCFTRFESGKCSVP
QAFNTSKAKCCCSIMAKEGWGDPCELCPKEQDAAFQDLCPFGHGTIPGVGDTRVDLNECV
ENPEICANGRCINIDGSFRCECPSGYMLDYTGTRCDDIDECSVGNPCGNGTCSNVVGGFE
CLCEQGFEPGPMMTCEDVNECSQNPLLCAFRCINTFGAYECSCPSGYTLREDGRMCQDVD
ECTNDLHNCDSRGMECNNLIGTFMCVCPAGKIRRMNDDLCQDENECLTQPGVCENGRCVN
TVGSYTCECGVGFKADSTGTQCLDYRKGFCFTEVLHTMCQMSSSSRVPVSRSQCCCNGGS
GWGDQCDLCPLPATTNYKKLCPYGHGYTIDGTDIDECKLIPGVCANGVCINIMGSYRCHC
KPGYVASAAGTACVDVDECSMSPKPCNFICKNTEGSYACSCPRGYTLQDDSRTCRDVDEC
QSRRHTCQFSCINTIGGFTCKCPAGFSQHHTACRDVNECLSERGPCGQRGVCQNSVGSFS
CECPQGFSLDSLRLNCDDVDECVRDHRCQFGCQNFAGGFRCSCPEGYTQHQQWNQCVDDN
ECLNPGSCGSASCFNTLGSFKCGCPSGFTFDPVSTSCEDVDECVSFMNPCRYSCSNTQGG
FMCGCPAGYYRAGQG
NT seq
7968 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggatggatctcagagactggaaaaacaggagtccctgagaggccctaatgtgtgtgga
tctggcctgcagtcctactgctgtccgggctggagctctctgcctggaggaaaccgctgt
gttgtgcctatttgcaggaacagctgtggtgatggtttctgctccagacccaacatgtgc
acgtgtcccgatggccagatagccccaacctgtgccaccaaatcatccatacaatgcaat
atcagatgtatgaacggagggttatgtgaggaggaccattgccagtgtccaaagggatac
acgggcagcttctgtggacagcccgtctgtgagaagacctgtcataatggtggacgctgc
gttggaccgaaccgctgtgtgtgtgtatacggcttcaccgggccgcagtgcgagagagat
taccgaacagggccgtgcttcatccaggtgcgcggcgggcagtgtgcggctcagagcggt
gggtttgtgtgcagtaaggcgctgtgctgtgccacggtgggacgagcgtggggtcacctg
tgtgagctgtgtcctccgctgagtgcgtcctgcagaagaggattcacaccaaacactcgc
acaggagcctgccaagatgttgacgaatgtaaggttgtgcctggcctgtgtaaaggagga
aagtgcactaacactgtgggctcatatcagtgccagtgtcccgctggtttccagcagcac
ctgagttcgctgatgtgtgaggatgtggatgaatgctccagcgtccagcatgtgtgtgat
ggaggacgctgcattaattcagtgggcagtttctcctgtgtgtgtcctgctggatatctg
ccgtctgcagaccggacacactgcctcgagcagcggtcaggcgtctgttatgcatcagtt
gtgaatggacgctgtgctcaggaaatcagcggacgcttcagtaaaatccagtgctgctgt
gaccgtggacgctgctggagtcaaagcacagctcatgaaatgtgtcccacacctggatca
gacgaatacttcaggatctgtctggtgggctctgctctgagtgggttcagtgaagaagat
cctgatacgcatcctcaacatcccagcggcttcagttctacctctaatgaccagatactt
cacccacttcatgacaatggactcctcacacctcagattcatcaaattccccaaatccct
cagatctcaggcgatagtaatggatttaaaccacagcgtcctgttgttgttcgtatgaat
gagaccgtcaacaggtgtcgtctgtttcctaatctgtgtctgaacggacgctgtgtgggc
tctgactaccgctgtgactgtaacactggatacagagaggacaccagaggagagtgttca
gatgtagatgagtgtgcggatgagccctgcactaatggaaactgtatcaacactcctggt
tcctactactgcagatgccactcaggctttctcagggctccagccaaacaggcctgcact
gacattgacgaatgtcttcagaatgggttgctgtgtaagaacggccgctgtctcaacaca
gagggcagctttcagtgcatctgtaacgcaggattcaagctcacacctgatggcaaaaac
tgcacagatcatgatgaatgtgccgctgcaaacatgtgtctcaacggcatgtgcattaat
gaagacggcagctataaatgtgtgtgtaaacctggattcaccctccactccagcggacgc
tactgtacagatgtggatgagtgccggactccaggtgtgtgtatgaacggacggtgtgta
aacactcagggctcattcaggtgtgagtgttttgcgggtcttaccataggaatagatggc
cgcacatgtgtagacacacacatgcgcagcacctgttatggggctgtaaaaagaggcctg
tgtgttnnacagcaatctgtcaccaagtcccagtgctgctgtgccaaccccaactatggc
tttggtgagccatgccggccctgccctggcaaaaactcaggtgagtttcaagccttgtgt
gcgagcggtgttggattttctgctgatggcaaagacattaatgagtgtgctctggatcct
gatatctgctctaatggagtgtgtgagaatctcagaggaagtttccgctgcgtctgtaac
agtggctatgaaagtgaccagaacggcagaaactgtctggacattgatgaatgtgtagtg
aacagtctcctctgtgataacggcctgtgccggaatgtgcccgggagctacagctgcacc
tgcccatcgggatacaccttcagacacgacacggagacatgtgacgatgtgaacgagtgt
gtgagcagcccatgtgttaatggagtctgtaagaacagtgcgggctcgttctcctgtgag
tgtccactaggaagtaaactggacttcactggacttctatgtgttgacagcctgaagggc
tcgtgctggttaacccttcaagacggccgctgtgaagtgaacattaacggagctacgctg
aggtctcagtgctgtgccacgcttggagcggcctggggtagcccatgtgaaccgtgtcaa
agtgatcccgtatgtgaaagaggatttgctcgaccaagaggggctttgtgtgaagatgta
aatgaatgtgaggtgtttcctggtgtgtgtcacaatggacactgtgtgaacactagaggc
tcttttaaatgtcagtgtccagagagcctgacgctggatgtgactggacgtgtctgtgtg
gatgttcgttcagagccctgtttcctcacctacgatgaagacgtgtgtacacaggcatta
ccaggacgcttccgcatggacgtgtgctgctgtacggtgggtttggcctggggcaaagat
tgtgatttgtgccctgagcctggctcacgccagtttgatgctctttgcccgagaggacca
ggcttcgccaacaaaggggatgtgctcactggcagagctgtctataaagatatcaatgag
tgtaaagtttttcaaagcatctgtattcatggaaaatgtcggaacaccattggaagcttc
agatgtcgttgtgacagtgggtttgcactggatagcaatgagaaaaactgcacagacatt
gatgagtgtgtgatctctcctgatgtttgtggtcatggcacatgtgtgaacacgctgggc
agtttccagtgtgactgtttcccgggctatgagagcggattgatgatgatgaagaactgc
atggatattgacgagtgtgaacgaaacctctcgctctgcaatggaggcacctgtgaaaac
actgatggcagctacaggtgtgtgtgtccacctggtcatcagctgtctgtcgacgccagt
tcctgtcaagatgtgaacgagtgtgagttgagcagcacattgtgtcttaatggcaggtgt
gtgaatgtggtggggacgtaccagtgctcctgtaactctggttatcagacgacacccgat
aggaaagactgcacagatgtagatgagtgtacaatagagaatggaggatgtgagctgtac
tgcagtaattcagaggggagttactcctgcagctgcagtcagggttacgctctgacgccg
gaccaaaggacatgtgcagatgtgaatgaatgtgaagaggatgttgacatctgtgaaggt
ggtcagtgtactaatgtccctggagcatatcactgtgtgtgtcatgaaggattcatgact
tctatggacatgaggacatgcgttgatgtgaatgagtgtgaactcaacaccaacatctgt
gtgtttggagagtgtgagaataccaagggttcttttgtctgtcattgtgagatgggttac
gctgtgaagaaaggaacctctggctgcaccgatgttgatgagtgtgagatgaacactcac
gactgtgacacacacgccacctgtatcaacacaccgggacattaccgctgctcctgcagg
gatggatggtctggtgatggagtcagatgtgctgatgtggatgagtgcagtgacacgact
catgtctgcagcgctgatgctgagtgtgtgaacacggtcggttcgtaccgctgtcggtgt
tcagatggctttactggagacggatttacctgcacagataaggatgagtgtgctgaagat
gtggatctgtgtgagaacgggcagtgtctcaatgttcctggaagctatcgctgtgaatgt
gagatgggcttcacacacactccaaacagcaaaacctgtcaagatatagatgagtgcacc
ttccagaacatctgtgtatatggcacatgtcagaatattccaggcatgtttcgctgtgtt
tgtgatgaaggctatgagctggacaggaccggtggaaactgcacagacgtggacgagtgt
ctcgatcctgtcagctgtgttaatggtcactgtgagaacacagccggctcctaccagtgt
aactgtcccattgactttgagctcaaccccactggaatcggctgcgttgacacacgagtg
gggggctgttttctggctttggcgtactatggccatgatgggctcgcgtgtagcgttgag
ctgggatttggagttggtcgttcatcatgctgctgttctctgggacgagcatggggtaac
ccatgtgacctttgccctccactcaacaccacggagtataacacactatgtcctggagga
gaggggttcaaacccaaccccatcaccatcatcctggaagatattgatgaatgtcaggag
ctgcctggtctgtgtcaaggtggaaactgcatcaatacatttggaagtttccagtgtgac
tgtctggccggatattacctcaacacggatagccgcatgtgtgaggatattgatgagtgt
gtgctcagttcaggcgtttgtggtccaggcacctgctataacacactgggaaactacaca
tgtgtctgcccacaggactacatgccagtcaacagaggacacagctgcatggatatgagg
aaaagtctgtgttatcgtaactacagtggcagtacctgtgaacaccagctcaacttcaac
accacacagagattgtgctgctgtgcctacaatgtgggcaaagcctggaacaaaccatgc
caggcctgtccgagtcctggcacaggtgactatagaagcctttgtggcagcgtgactgga
ttcaggattgacattgacactggaaagctgaaagatattgatgaatgtcatgaaatccca
ggcatctgtgctcatggtgtctgtataaaccacatgggtagtttccactgcgagtgtccc
acaggcttcagttacagtgacttgcagctcacctgtgaagacattgatgaatgcagcagt
ggagagcatgtgtgtcagagaaacgcagactgcatcaactggccgggcagctatcaatgt
gaatgttctgatgggtatatactgacacctaatggagcctgcactgaccgtaatgagtgt
gtggagatgcctagcgtgtgtcgtcatggtgaatgtgtggactttccaggtggatacgag
tgtgtgtgtcacacaggctttactgcgacacaaaaccgcaggatgtgtgtagatgttaat
gagtgttcacaccagctgtgtgggaatgggacatgtacaaactctgttggctcatttaac
tgtatctgtcatcaaggatttgatctcgccagtaataactactgtacagatattgacgag
tgtgcagtttttcactctcagctctgcaggaacggccgctgtgttaataatgtggggtcc
ttccaatgcctctgtagagagggctatgagctaactcttgaaggaaggagctgcatagat
gttaatgagtgtatattgaatcgtgggatatgtgctcctggaacgtgtgtgaatctggat
ggttctttcagatgtgtctgtcctgatgggtatattgtccacaatgagcactgtgtagat
gtaaacgagtgttcagaggagcccggcatctgtgcatatggctcctgcttcaacagtctg
ggcagcttcgagtgcgtgtgtaaacctggatttatgctgtcagaagacagacgcagatgt
tacgacactagagagagcttctgtttcacacgctttgagagcggcaagtgctctgtcccg
caggcgttcaacaccagcaaagccaagtgctgctgtagcatcatggcaaaagagggctgg
ggcgatccctgtgagctttgccctaaagaacaggatgctgcattccaagatctgtgtcca
tttggccatgggaccattcctggtgttggggacacacgtgtggacctaaatgaatgtgtg
gagaacccagagatctgtgcgaacggccgctgcatcaacatagatggctccttccgctgt
gaatgtcccagcggctacatgctcgactacacaggaacacgttgtgatgatattgatgag
tgttcagtgggaaacccctgtggaaacggcacatgctcaaatgtggttggaggattcgag
tgtctgtgtgagcagggatttgagcctggaccaatgatgacctgtgaagatgtgaacgag
tgcagtcagaatcctctgctctgtgcgtttcgctgcattaacactttcggggcttatgaa
tgcagctgtccatctggttacactctgcgagaggatggacgcatgtgtcaggatgtagac
gagtgtacaaatgaccttcataactgtgactccagaggaatggagtgtaacaacttaatt
ggcaccttcatgtgtgtttgtccagctgggaagatccgcaggatgaacgacgacctgtgt
caagatgaaaatgaatgcttgactcagcctggggtttgtgagaacggtcgatgtgtgaac
actgtgggcagctacacgtgtgaatgtggtgttggattcaaagctgactctacaggcacg
caatgccttgattacaggaaaggcttttgtttcactgaagttctgcacaccatgtgtcag
atgtcgtccagcagtcgtgttcctgtcagcagatctcagtgctgctgtaacggaggcagc
gggtggggggaccagtgtgacctctgccctttgccagccactaccaactacaagaaactc
tgtccatatggccatggctataccattgacggaacagatatagatgagtgtaagctgatt
ccaggagtttgtgccaatggtgtctgtatcaacatcatgggctcttacagatgccactgt
aagccaggatacgtcgcctctgctgcaggaaccgcatgcgtcgatgtcgatgaatgcagt
atgtccccaaaaccctgtaacttcatctgtaagaacactgagggcagctatgcatgttct
tgtccccgtggttacacgctgcaggacgacagcaggacgtgtagagatgtggatgaatgt
cagagcagacgacacacctgccagttctcgtgtatcaacaccatcggtggattcacctgc
aagtgtccagcaggcttcagccaacatcatacggcctgcagagatgttaatgaatgtttg
tctgagcggggtccgtgtggccagcggggcgtctgtcagaattcagtgggcagcttcagc
tgtgagtgtccacagggcttcagtctggactctctccgtctcaactgtgacgacgtagat
gagtgtgtgcgtgaccacaggtgtcagttcggatgtcagaattttgcaggtgggttccgt
tgcagctgtccagagggatacacacagcaccagcagtggaaccagtgtgttgatgacaat
gagtgcttgaacccgggcagctgtggttcagcttcttgtttcaacacattgggcagtttt
aagtgtggctgtccatctggcttcacctttgaccccgtgtccacgagctgtgaggatgtg
gatgagtgcgtgtccttcatgaacccctgcagatacagctgctccaacacacagggagga
ttcatgtgcggatgtcctgcgggatattacagagctggacaggggtga
DBGET
integrated database retrieval system
