Globicatella sanguinis: CYJ72_003215
Help
Entry
CYJ72_003215 CDS
T09094
Name
(GenBank) helix-turn-helix domain-containing protein
KO
K03491
probable licABCH operon transcriptional regulator
Organism
gsg
Globicatella sanguinis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gsg00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
gsg03000
]
CYJ72_003215
Transcription factors [BR:
gsg03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
CYJ72_003215
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HTH_11
Mga
PRD
HTH_DeoR
HTH_Mga
Fe_dep_repress
PuR_N
HTH_5
CCDC93_N
PTS_IIB
HTH_10
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WIK67115
LinkDB
All DBs
Position
complement(771502..773355)
Genome browser
AA seq
617 aa
AA seq
DB search
MSIIDRWYKLLNYLLLNDTVSINDLENYLQNSQQTIKNSINQLNSEMSQIAHITEKNNYF
RIEILNYSEFERIMGGSIKLQTDFNSSDKRQAYIIKRLLEEEKYIITLDLSEELGVSRGT
FSNDLKTIKKLTNDYGVQIISVPNKGIKLEGEELNLRLFGIYHCIDFFEFKNINQEHIDM
ILGLQNKYSFRKQDAHFLLKVLELTICRIRNNQHLTKPIPKYVNYIKNSQLYNEIILYIE
TEFTITLNEYEKDFITFPLCINGNSINISISQLMENDYLLESFQLIMGTIKNYFMIEIDE
DNFFNDLSKHLAFLNNRLIFNYQIEDIFHGEIEKKYPFSYRLAKDTLKVLKTYFNSHISD
VEANFLTFYYELDSKTKDEEKVKKEIAIICNTGKATAGMIRRQIEKVVGQNIKIVQFSES
NYENEDLSKYFAIITTIPLKNIPQEIPTIRLTNIFKDDYLALEWGKLKVDRNNLGDKTLV
FLNRYSSSTYEEVITKMVSELREEKLIDYDFKERLFNRKAPVLNNNGIIFPHELNYTSKK
IIIKIGVLENTVILDNESVELILLVAIPNNIQNDDNDLLDLYDFIFGIGQNPQLKERIIR
MDSVEEFNRYFSKGMMK
NT seq
1854 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagtataattgatcgttggtataaattattaaattatttactcttaaatgatacagtc
tctatcaatgatttagaaaattatttacaaaattctcaacagacaatcaaaaactcaatt
aatcagttaaacagtgaaatgagccaaatagctcatattactgagaaaaacaattatttt
agaattgagatactcaattattcagaatttgaaagaattatgggtggatcaataaaactc
caaacagattttaattcgtcggataaacgtcaagcctatatcattaaacgattattagaa
gaagaaaaatatataattaccttagacctatctgaagagttaggcgtaagtagagggaca
tttagtaatgatttaaaaacaataaagaagttaacaaatgattatggagtacaaattatt
agtgttccaaataaaggaataaaattagaaggggaagagctaaacttaaggttgtttgga
atttatcattgtattgatttttttgaatttaagaatattaatcaagaacatattgatatg
attctcggattacagaataaatattcttttcgaaaacaagatgctcattttcttttaaaa
gttttagaattaacgatttgtaggattagaaacaatcaacatcttactaaacctattcca
aaatatgtgaattatataaagaattctcagttgtataacgaaataatactttatattgaa
acggaatttacaattactttgaatgaatatgaaaaagattttattacatttcctttatgt
attaacggaaatagtattaatatttctattagtcaattaatggagaatgattatctccta
gagtcatttcaattaataatggggacaataaaaaattattttatgattgaaattgatgaa
gataatttttttaatgacttgtctaaacaccttgcatttttgaataatcgattaattttc
aattatcaaatagaagatatatttcatggagaaattgaaaagaaatatcctttctcttat
cggttagcaaaagatactttaaaagttttaaaaacgtattttaattcacacataagcgat
gtagaggctaactttcttactttttattatgaattggatagtaaaactaaagacgaagaa
aaagtcaaaaaggaaattgcgattatttgtaatacaggtaaagcaacggctggtatgatc
cgtagacaaattgaaaaagtagtaggtcaaaatattaaaattgtacaattttctgaaagt
aattatgaaaatgaagacttatcaaaatatttcgcaattatcacaactataccgttaaaa
aatattcctcaagaaattccgactattagattaactaatatttttaaagacgactacctt
gctttggaatggggaaaattaaaagttgatcgaaataatttaggagataagacattagtt
tttttaaatagatattcatcctcaacatatgaggaagtaattacaaaaatggtttcagaa
ttaagggaagaaaaattaattgactatgactttaaggaaagattatttaatcgaaaagct
ccagtacttaacaataatggtattattttccctcatgaattaaactatactagtaaaaaa
ataataataaaaataggtgtattagaaaatacagtaattttagataatgaatcagttgaa
ttgattttattagtggctattccaaacaatattcaaaatgatgataatgatttattagat
ttatatgattttatatttggaattggacaaaatccacaattaaaagaacgaataataaga
atggattcagttgaagaatttaatcgttattttagtaaaggaatgatgaaatga
DBGET
integrated database retrieval system
