KEGG   Geotrypetes seraphini (Gaboon caecilian): 117347204
Entry
117347204         CDS       T09159                                 
Name
(RefSeq) collagen alpha-1(I) chain isoform X1
  KO
K06236  collagen type I alpha
Organism
gsh  Geotrypetes seraphini (Gaboon caecilian)
Pathway
gsh04510  Focal adhesion
gsh04512  ECM-receptor interaction
gsh04518  Integrin signaling
gsh04820  Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:gsh00001]
 09130 Environmental Information Processing
  09133 Signaling molecules and interaction
   04512 ECM-receptor interaction
    117347204
   04518 Integrin signaling
    117347204
 09140 Cellular Processes
  09144 Cellular community - eukaryotes
   04510 Focal adhesion
    117347204
  09142 Cell motility
   04820 Cytoskeleton in muscle cells
    117347204
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:gsh00536]
    117347204
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:gsh00536]
 Heparan sulfate / Heparin
  Extracellular matrix molecules
   117347204
SSDB
Motif
Pfam: Collagen COLFI VWC VWC2L_2nd Zn_ribbon_3CxxC_2
Other DBs
NCBI-GeneID: 117347204
NCBI-ProteinID: XP_033773688
UniProt: A0A6P8PG48
LinkDB
Position
13:60443899..60484505
AA seq 1450 aa
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NT seq 4353 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system