Glycine soja (wild soybean): 114379658
Help
Entry
114379658 CDS
T06057
Name
(RefSeq) pumilio homolog 2-like
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
gsj
Glycine soja (wild soybean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
NABP
PUF
PUF_NOP9
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114379658
NCBI-ProteinID:
XP_028194151
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(4411399..4418534)
Genome browser
AA seq
1034 aa
AA seq
DB search
MLSELGRRPMLGSNEGSFGDELEKEIGMLLREQRRQEADDRERELNIFRSGSAPPTVDGS
LSAVGGLFAGGGGGGAPAAFSEFRGTKDVNGIASEEELRSDPAYLSYYYSNVNLNPRLPP
PLLSKEDWRFQQRLKGGASALGGIGDRRKVNRTDDNAGRSLFATPPGFNMRKQESEVDNE
KTRGSAEWGGDGLIGLPGLGLSKQKSFAEIFQDDLGHNTSIGCLPSRPASRNTFDDTDII
SSAEAELAHVQGSSAAQNVGLPASYSYAVAVGSSLSRSTTPDPQLVARAPSPCITPIGGG
RAIASDKRAIANPDAFNGVSSGINESADLVAALSVMNLSADDVLDGANHLPSQVESDVDS
HQRYLFGRLGGQDHGKQQAYLKKSESAHLQNSSKSSRSGSGLNNPSLDRQVELQKSTVPS
NNSYFKGSPTSHFSRGGSMPLQYQPLDGTNSSFTNYGMSGYAGNPALASLMTNQLGTGNL
PPLFENVAAASAMAAPRMDSRILGGGLASGAAAPSDVHNLGRMGNQIQGSALQAPFVDPM
YLQYLRTPEFAAAQLAALNDPSVDRNYLGNSYMNLLELQKAYLGSVLSPQKSQYNVPLGG
KSGSSPAHGYYGNAAYGGGLSYPGSPMANSVVSTSPVGSGSPVRHNELNMRFASGMRNLA
GVMGPWHVDNGNIDDESFASSLLEEFKSNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQYGSRFIQQKL
ETATTEEKNMVYQEIMPHALALMTDVFGNYVVQKFFEHGLASQKRELANKLLGHVLALSL
QMYGCRVIQKAIEVVDLDQKIEMVQELDGNVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPEDAIHFIV
STFFDQVVTLSTHPYGCRVIQRVLEHCKDPTTQQKVMDEILGAVSMLAQDQYGNYVVQHV
LEHGKPHERSSIIKELAGKIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGGPSERQLLVCEMLGTTDENE
PLQAMMKDQFANYVVQKVLETCDDQQRELILYRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAA
GERRIAAQAPPQPA
NT seq
3105 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgttgtctgaattgggaagaagacctatgcttgggagtaacgagggttcttttggtgat
gaattggagaaggagatagggatgttacttcgtgagcaacgcagacaagaggctgatgat
cgtgagcgagagcttaatatttttaggagtggatcggcgcctccaactgtggacggttct
ttgagtgccgttggagggttgtttgctggtggtggtggtggtggtgctcctgctgccttt
tcagagtttcgaggaacgaaggatgtgaatgggattgcttctgaggaagagcttaggtct
gatccagcgtatctttcatactactactccaatgtgaatttgaatcctaggctgccacct
cctttgctgtcaaaggaggattggagatttcaacaaagacttaaaggtggagcttctgct
ctaggtggaattggagataggaggaaagtaaacaggactgatgataatgctggaagatcg
ctttttgctaccccaccaggttttaacatgaggaaacaagagagtgaggtggataatgaa
aaaacaagaggttcggccgagtggggtggtgatggactgattggtttgcctggactaggg
ctgagcaaacagaagagctttgcagaaatttttcaggatgatttggggcataatacctct
atcggatgccttccttcccgtccagccagtcgtaatacatttgatgacactgatatcatt
agttctgctgaagcagagttggctcatgttcaaggatcatctgcagcccaaaatgttggc
ttaccagcttcatattcttatgctgttgcagtaggatcttccttgtcaagaagcactact
cctgatccacaacttgttgctagggctcccagtccctgcatcacgcctattggtggcggc
agagccattgcttctgacaagagagctattgccaatccagatgcatttaatggtgtttca
tctggcatcaatgagtcagcagatcttgtggctgcattgtcagtgatgaacttgtcagca
gatgatgtgttagatggtgcaaaccatttgccatcacaggttgaatcagatgtagatagt
catcagagatatctttttggtaggctaggtggtcaagatcatgggaagcaacaggcttat
ttaaagaaatctgaatcagcacacttgcaaaattcaagtaagagcagcaggagtgggtca
ggtctcaacaatccatccttggataggcaggttgagctacaaaagtctaccgttccttcc
aataactcatatttcaaaggatcgcctacctcccattttagtagaggaggaagtatgcca
cttcagtaccagcctttagatggtacaaattcatcatttactaactacggtatgagtggc
tatgctggaaatccagcactggcatccttgatgactaaccaacttggcactggtaatctg
ccacccttgtttgaaaatgttgctgcagcatcagcaatggcagcccctcgaatggactcg
agaattcttggaggtggtttggcttctggagctgctgctccatctgatgtgcataatctt
ggtaggatgggaaatcaaattcaaggcagtgctcttcaggctccttttgttgatcccatg
tatcttcagtacctgaggacacctgagtttgctgcagcacaacttgctgctctcaatgac
ccctctgtggacaggaactacttgggcaattcatacatgaatttgcttgagcttcagaaa
gcttatcttgggtctgtcctctcacctcagaaatcccaatacaatgtaccgctgggtggt
aaatcaggcagctcccctgctcatggttattatggaaatgctgcatatggtggcgggttg
tcttacccaggaagtcctatggcaaactctgttgtgtccacttctccagttggatctgga
agtcctgttaggcacaatgaactgaatatgcgttttgcttctggaatgaggaatttagct
ggggtcatgggaccttggcatgtagataatgggaacattgatgatgaaagttttgcttct
tctctgttggaagagtttaaaagcaataaaacaaagtgttttgagctgtctgaaattgct
ggtcatgttgttgaattcagtgcggatcaatatgggagtcgatttattcaacaaaagcta
gaaacagctactacagaagaaaaaaacatggtttatcaggaaatcatgccacatgccctt
gctttgatgactgatgtctttggtaattatgtggttcaaaagttttttgagcatggactt
gcatcccagaaaagagaattagccaacaaacttcttggccatgttctggcacttagcctt
caaatgtatggttgccgtgtcatccagaaggccattgaagttgttgatctggatcagaag
atagagatggttcaagagcttgatggtaatgttatgcgctgtgtacgtgatcagaatggt
aatcatgtcattcagaagtgtattgaatgtgttcctgaagatgcaatccactttattgtg
tcaacattttttgatcaagttgtgacactctcaacccatccatatggttgccgggtgata
cagagagtgctggaacactgcaaagaccctacgacacaacagaaagttatggatgaaata
ttaggagcagttagcatgttagctcaggatcagtatggcaactacgttgttcagcatgtg
ctggaacatgggaagcctcatgaacgttcttctatcataaaggaattagcaggcaagata
gttcaaatgagtcaacagaagtttgcctccaatgttgtggagaaatgtttgacctttggt
ggtccttctgagcgccaattactagtgtgtgagatgcttggcaccacagatgaaaatgag
cctcttcaggcgatgatgaaagatcaatttgcaaattacgtagtacaaaaggtgctggaa
acttgtgatgatcaacaacgcgagctgattctttaccgaattaaggttcatttgaatgca
ttgaaaaagtacacctatggaaagcacattgtcgcccgtgtggagaaacttgttgctgct
ggagaaaggagaattgctgctcaggctcctcctcaacctgcttag
DBGET
integrated database retrieval system