Glycine soja (wild soybean): 114394719
Help
Entry
114394719 CDS
T06057
Name
(RefSeq) pentatricopeptide repeat-containing protein At2g44880
Organism
gsj
Glycine soja (wild soybean)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PPR
PPR_2
PPR_1
PPR_3
E_motif
PPR_long
SNN_transmemb
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114394719
NCBI-ProteinID:
XP_028212189
LinkDB
All DBs
Position
18:complement(50448560..50451267)
Genome browser
AA seq
599 aa
AA seq
DB search
MGEESQPQRTLWSNAERTCLHLLQCRTKSIPTLLQIHAFILRHSLHSNLNLLTAFVTTCA
SLAASAKRPLAIINHARRFFNATHTRDTFLCNSMIAAHFAARQFSQPFTLFRDLRRQAPP
FTPDGYTFTALVKGCATRVATGEGTLLHGMVLKNGVCFDLYVATALVDMYVKFGVLGSAR
KVFDEMSVRSKVSWTAVIVGYARCGDMSEARRLFDEMEDRDIVAFNAMIDGYVKMGCVGL
ARELFNEMKERNVVSWTSMVSGYCGNGDVENAKLMFDLMPEKNVFTWNAMIGGYCQNRRS
HDALELFREMQTASVEPNEVTVVCVLPAVADLGALDLGRWIHRFALRKKLDRSARIGTAL
IDMYAKCGEITKAKLAFEGMTERETASWNALINGFAVNGCVKEALEVFARMIEEGFGPNE
VTMIGVLSACNHCGLVEEGRRWFNAMERFGIAPQVEHYGCMVDLLGRAGCLDEAENLIQT
MPYDANGIILSSFLFACGYFNDVLRAERVLKEVVKMDEDVAGNYVMLRNLYATRQRWTDV
EDVKQMMKKRGTSKEVACSVIEIGGSFIEFAAGDYLHSHLEVIQLTLGQLSKHMKVEII
NT seq
1800 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagaggagtcccaaccacaacgaaccctatggagcaacgcagagagaacgtgctta
caccttctccaatgcagaacaaagagcatccccacgcttctccaaatccacgccttcatc
ctccgacactctctccacagcaacctcaacctcctcaccgctttcgtcacaacttgtgcc
tccctcgccgcctccgccaagcgccctctcgcaatcattaaccacgcgcgccgcttcttc
aatgccacccacacccgcgacaccttcctctgcaactccatgatcgccgcccacttcgcc
gctcgccagttttcgcaacccttcaccctcttccgagaccttcgccgccaagcaccacct
tttacgcccgatgggtacaccttcaccgcgctcgtgaagggttgcgcgacgcgtgtggcc
actggtgagggcacgctgcttcatgggatggttttgaaaaatggggtttgctttgatttg
tacgtggctactgcgttggttgatatgtatgtgaagtttggggttttaggtagtgcgagg
aaggtatttgatgaaatgtctgtgagaagcaaggtttcgtggactgctgttatcgtgggc
tatgcgaggtgtggggatatgagtgaggctaggaggctttttgatgagatggaggatcgg
gatattgtggcttttaacgcaatgattgatgggtatgtgaagatggggtgtgtgggtttg
gcgagagagttgtttaatgagatgaaggagagaaatgtggtttcttggactagtatggtt
tctgggtattgtgggaatggtgatgttgagaatgctaagttgatgtttgatcttatgccg
gagaagaatgtgtttacttggaatgccatgattggggggtattgccagaatagaaggtct
catgacgcgttggagttgtttcgtgagatgcagacagcatcggtggagccaaatgaggtg
actgttgtgtgtgttcttcctgctgtggctgatttgggtgctttggatttggggagatgg
attcacaggtttgccctaaggaagaagcttgataggtctgctcgcattgggactgctttg
atcgatatgtatgcgaaatgtggtgaaatcacaaaagcaaaattggcttttgaggggatg
actgagagggaaacagcttcgtggaatgctttgataaatggttttgcagttaatggctgt
gtgaaggaagcgttggaggtgtttgcgaggatgattgaggaagggtttggaccaaatgag
gtgactatgattggcgtgttatctgcttgcaaccattgtggtctggtagaggaaggaaga
agatggttcaatgcaatggagagatttggaattgcgcctcaggttgagcattatggttgc
atggttgaccttcttggaagggctggatgcttggatgaggctgaaaatttgattcagacc
atgccttatgatgctaatgggataatattgagttcttttctgtttgcttgtggttacttt
aatgatgttttgcgggcagagagagtgctgaaagaggtggtgaaaatggatgaagacgtt
gcaggaaactatgtgatgttgagaaatctgtatgcgaccaggcaaaggtggacagatgtg
gaagatgttaaacaaatgatgaagaaaagaggaacaagtaaagaagttgcttgcagtgtt
attgagattggtggaagttttatagagtttgcggctggggattacttgcattcacatctg
gaggttattcagttaaccttggggcagttaagtaagcacatgaaagttgaaataatctaa
DBGET
integrated database retrieval system
