Glycine soja (wild soybean): 114402279
Help
Entry
114402279 CDS
T06057
Name
(RefSeq) heterogeneous nuclear ribonucleoprotein 1-like
KO
K14411
RNA-binding protein Musashi
Organism
gsj
Glycine soja (wild soybean)
Pathway
gsj03015
mRNA surveillance pathway
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gsj00001
]
09120 Genetic Information Processing
09122 Translation
03015 mRNA surveillance pathway
114402279
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03019 Messenger RNA biogenesis [BR:
gsj03019
]
114402279
Messenger RNA biogenesis [BR:
gsj03019
]
Eukaryotic type
mRNA surveillance and transport factors
Transport factors
Other transport factors
114402279
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
RRM_1
RRM_7
RRM_PARP14_3
RRM_PARP14_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
114402279
NCBI-ProteinID:
XP_028220591
LinkDB
All DBs
Position
20:46874386..46878116
Genome browser
AA seq
476 aa
AA seq
DB search
MDSDQGKLFIGGISWDTTEDKLKEHFGNYGDVLSTSVMREKNTGKPRGFGFVVFADPNIL
DRVLEDKHVIDGRTVDAKKAFSREDQQISVTSRGGNSNSGMNSENGGNIRTKKIFVGGLP
PTLTEEKFRLYFESYGHVTDVVVMYDQNTGRPRGFGFISFDTEEAVDRVLHKSFHDLNGK
QVEVKRALPKDANPGASGRMMGGAGGGGAGIGGYQGYGASGGSQNAYDGRMDSSRYMQPQ
SAAGGFPPYGSSAYSAPGYGYGPANNGIGYGAYGSYGSATAGYGGPAGATYGNPNVPNAA
YAGGPPGGPRSSWPAQAPSGYGSMGYGNTAAWGAPSGGAGSGGGGPGSATAGQSPGGAAG
YGNQGYGYGGYAGYGGSDSSYGNSSAYGTVGGRTGSGPNSNASAPGGTELTSSGGSGNYM
GGGYGDANGNSGYGNAAWRSEQTHASGNYGTPQGNGGQVGYGGGYGGAQSRQAQQQ
NT seq
1431 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggattcggatcaaggcaagcttttcatcggtgggatttcatgggatacgacggaggac
aagctcaaggagcatttcggtaactacggcgacgttttgagcacttccgtcatgcgggag
aagaacactgggaagccaaggggcttcggtttcgtcgtttttgcggatcctaacattcta
gatagggttttggaagacaaacatgtcatagatggcagaacggttgatgccaaaaaggcc
ttctcaagagaggatcaacaaatttctgtcacttccagaggtggaaattccaattctggc
atgaattctgaaaatggaggaaacatcaggactaaaaagatatttgttggagggttgcct
cccaccctgactgaagaaaaatttcgtctgtactttgagtcttatggacatgtaactgat
gtagtagtcatgtatgaccagaatactgggcggccacggggatttgggtttatttcattt
gatactgaggaggcagttgatagggttttgcacaaatcatttcatgatttaaatggtaaa
caagttgaggtaaagcgtgcacttcccaaggatgccaatcctggtgcaagtggccgtatg
atgggtggtgctggaggtggtggtgctggaattggtgggtatcaagggtatggggcatct
ggtggcagccaaaatgcatatgatggtcgtatggattctagtaggtatatgcagcctcaa
agcgctgcaggtggattccctccttacggttcttctgcctatagtgctcctgggtatggt
tatggtccggctaataatggcattggttatggtgcatatggaagttatggtagtgccact
gctgggtatggtggacctgctggtgcaacatatgggaatcctaatgtccctaatgctgct
tatgctggtggtccacctggtggcccaagaagttcatggcctgctcaggctccttctggt
tatggatctatgggttatgggaacactgctgcttggggtgctcctagtggtggtgctgga
tctggtggtggcggtcctggttcagcaactgcaggtcagtcccctggtggagctgctgga
tatgggaatcaaggttatggatatggtgggtatgctggatatggtggaagtgatagttct
tatgggaattcaagtgcatatggtactgttggtggacgtactgggagtggtccaaacagt
aatgctagtgctcctggtgggactgaactaacaagtagtggtggcagtggcaactatatg
ggtggtggctatggggatgcaaatggaaattcaggttatggaaatgcagcttggagatct
gaacaaactcatgcatctggaaattatgggactcctcagggaaatggtgggcaagttggt
tatggtggtggctatggtggtgctcagtctcgacaagcccaacagcagtaa
DBGET
integrated database retrieval system
