Gynuella sunshinyii: YC6258_01294
Help
Entry
YC6258_01294 CDS
T03690
Name
(GenBank) hypothetical Protein
Organism
gsn
Gynuella sunshinyii
Pathway
gsn02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gsn00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
YC6258_01294
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DUF4347
Big_13
Cadherin_3
K319L-like_PKD
He_PIG
Big_9
Calx-beta
DUF4843
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AJQ93342
UniProt:
A0A0C5VFL1
LinkDB
All DBs
Position
1273472..1282924
Genome browser
AA seq
3150 aa
AA seq
DB search
MKYKNTSRQFHETNLLTRYRIDDRFVRDRTIRRAAIRYLRLLDQDSVSAAQQSKAVRKLK
RSYSKYSWFHKVSKTLTFASFLLFMQGQNAYASTQLADVTSQRLEKDLSHYSQAVPVLPA
VNLASETLIVADQQSLGYGADLSLGDKKQLLHIVSARPSSSQADDGFFVSDSHVLTVIDT
SVPDWEDIYYAVTVGEILVLDNDGKPLEQILGKLQKMPRVELINIISHGRDGEIALANTH
VTAESLQQQASLWQAIGAQMDADAQIQVFGCEVAKTQKGKDFIDALADVTQAEVAGSINP
TGDAAQQGDWTLEYFADNRTGQQLNTFNSEQILRYSNILVDTTYNFNSFIQCNGSDWSAP
YSASCTTPIGDLTARAFGSSLMVGFYNSNLDVVIDDDGSAGTADKIGAIGGGGVGSAGSP
RYVEFRKTDNSLYSAKTVDLAIWTYHTNTGQPPYSDTLTITAYDGSNAQVGSITVDPVYR
DDYYYLDFSNPTAGYTRNNGFYSSAPTITASGSFNNIAKVRFKINQNTFYIDDLVLSVGA
SNNAPTNITLGTSSINQSATGAAAVVGSLTTTDLDGSDTHTYSLVTNGSSGYGSCGATGD
DNNSSFQISSANLQTASSLSAGSYNVCVQTNDGTDTYQKTFAITVNDDVAPSGHSVSFDD
TTINASEVSSQSFTFASAEVGATYSYTISSSGGGTNVTGSGTLSTATDQITGLSLSGLGD
GTLTLSVVVTDSSANAATAVTDTATLDSVAPSGHSVSLDSSTYNATSATSASFTFADGEI
GAAYSYTISSSGGGVNVTGSGILSTATDQITGIDLSSLGDGTLTISVVVTDVAGNAATTV
TDTATMDTTAPSGHSVSFDDSAINTSEASSQSFTFASGEVGASYSYSISSSGGGTPVTGS
GTLSTATDQITGLDLSGLSDGTLTLSVVLTDTAGNAATAVTDTAALDGTAPSGHSVSLDS
STYNSTSATSASFTFASGEVGASYSYSISSSGGGTNVTGSGTLSTATDQITGIDLSGLSD
GTLTISVVLTDPAGNAATAVTDTATLDATVPSGHSVSLDSSTYNATSATSASFTFAGGEV
GAGYSYSISSSGGGTNVTGSGTLSTATDQITGVDLSGLGDGTLTISVVVTDVAGNAATAV
TDTATLDTTAPSGHSISFDDSAYSATEAGSASFTFASGEVGASYSYSISSSGGGTNVTGS
GTLSSATDQISGLDLSGLGDGTLTVSVVLTDTAGNAATAVTDTATLDSTVPSGHSVSLDS
STYNSTSASSASFTFASGEIGAAYSYTISSSGGGTNVTGSGTLSTATDQITGIDLSGLGD
GTLTISVVVTDTAGNAATAVTDTATMDATAPSGHSVSFDDSAINTSEASSQSFTFASGEV
GASYSYSISSSGGGTPVTGSGTLSTATDQITGLDLSGLSDGTLTLSVVLTDTAGNAATAV
TDTAALDGTAPSGHSVSLDSSTYNSTSATSASFTFASGEVGASYSYTISSSGGGTNVTGS
GILSTATDQITGIDISGLGDGTLTISVIVTDPAGNAATAVTDTATLDATAPSGQSVSLDS
STYNATSATSASFTFAGGEVGAGYSYTISSSGGGTNVTGSGTLSTATDQITGVDLSGLGD
GTLTISVVVTDVAGNAATAVTDTATLDTTAPSGHSVSFDDSAINTSEASSQSFTFASGEV
GASYSYSISSSGGGTPVTGSGTLATATDQITGLDLSGLSNGTLTLSVVLTDTAGNAATAV
TDTAALDGTAPSGHSVSLDNSSYNATTATSASFTFASGEVGASYSYSISSSGGGTPVTGS
GTLATATDQITGIDLSGLSDGTLTISVIVTDPAGNAATAVTDTATLDATAPSGQSVTLDS
STYNATSASSASFTFAGGEVGAGYSYTISSSGGGTNVTGSGTLSSAIDQINSIDLSGLND
GTLTISVIVTDVAGNAATAVTDTATLDTTAPSGHSVSFDDSTIGSADASSQSFTFAGGEV
GASYSYSISSSGGGTPVTGSGTLTTATDQITGIDLSGLSDGTVTLSVIVTDTAGNAATAV
TNTATLDTAAPSGHSVSLDNSTYNTTDAASASFTFAGGEVGASYSYSISSSGGGTAVTGS
GTLSTATDQITGIDLTGLSDGTLTLSVVVTDPAGNAATAVTDTAILDAATPSGYSISVGD
TVLNASEATDLSFTFAGAEVGATYNYSISSSGGGTLVTGSGTLSSATQLIDSIDVSGLSD
GTLTISVTLTDTSGNTGAAVTATAELDRTAPTVATNSGLTLKTGYTKTISASLLSATDAV
SSSLTFTVTSVPTNGSLKRSGNVLANSDTFTQADLDAGLISYTHDGGSSTSDSFGFSVMD
AAGNSLTGQSFSLTVSNTNAAPTITGSPETSVAEDSAYSFIPTTSDSDGDTLTFSISNQP
LWTDFDSATGALTGTPVNGDVGSYSNIVISVSDGTASVSLAAFSITVSNVNDAPVITGTP
GTTAEIGVTYSFTPTASDVDIGDTLTFSISNQPSWASFDTSTGALTGTPASGDEGDYAGI
VISVSDGTASTSLPPFDITVVVATDTDGDNVPDYQEVIDGTDPNDPEDYLDTTDPVISAP
DDVVFDSTGLYTVISLTQLLGLDSDADTSTIDAALAALVSDNIDGDGCCEPNVVGMVNNA
VLLPPGLNYVTWQATDHKGNTGSVDQIVRIRPLVSFAKDKTVVEGAPTRFKVLLNGAAPD
YPFSVPVIIDTANSTADSSDHDLSDNLVIFTSDEISKVIAFNINTDSTFEGTEILTLKLD
DQTSDSDDLSGGYDPDNIDIYDINSGVKNTMTFFLVEGNIAPEVTLNLQQNGSSTILVTP
DGGNATMTATVVDPNTGDTFTYSWSASASSLVDIEDDINEATFEFDPSVLKAGRYRLQLT
VTDSEGASDTARLYFQVVAALPTLIGSTDSDGDGTDDATEGTGDSDDDGIPDYLDNIVAT
NVLPEQARVTDSFLLECDPGVLCRLGQFAMMSEGGGARLSEDDLSNQSDLKVDKDYDFKG
GIFDFEIQDLPTLGQTVRIVLPLTEAIPENAVYRKYQNGEWSNFVEDANNEIHSAPGRLG
YCPPPGDDSWVSGMQVGYYCVQLTIEDGGANDADGLVNAVVEDPGAIGVRASSAIQGNGW
SGTAGVGLLALLGALLMGVRRNPKTPADKQ
NT seq
9453 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaatacaagaatacttccaggcaatttcatgaaacgaatttattaacccgctatcga
attgatgatcgttttgttcgcgacagaaccattcgacgggcggccattcggtatttgcgg
ttgttggaccaggatagcgtctctgctgcgcagcagagtaaagcggttcgcaaactcaag
cgttcctattcgaagtattcgtggttccataaggtttccaagaccctgacctttgcctcg
tttctgttgttcatgcaggggcagaatgcatatgcctccacgcaactggctgatgtgacc
tcgcaacggctggaaaaagacctcagtcattattctcaggcggtaccagtgctgccggct
gtcaacttggcatcagaaacactgatcgtcgccgatcaacaatcattgggctatggcgct
gatttgtcccttggcgacaaaaagcaattgctgcacattgtatctgcccgcccatccagt
tcgcaggctgatgatggtttctttgtgtctgactcccatgtactgaccgtcatcgatacc
tctgtgcctgattgggaggacatctactatgccgtgactgttggtgaaatactggttctc
gataatgacggcaaaccactggagcagatacttggcaaacttcagaaaatgcccagggtc
gaattgatcaatattatttcccacggccgggacggtgagattgcactggccaacacccat
gtcacggctgagtctctgcaacagcaggcgtcattgtggcaggccattggtgcgcagatg
gatgccgatgcgcagattcaggtgtttgggtgtgaagtggccaaaacccagaaaggtaag
gattttatcgatgccctggccgatgtgacccaggctgaggtggctggttccatcaatcct
accggtgacgccgcgcaacagggtgactggaccctggaatactttgccgacaatcggacc
ggtcagcagttgaatactttcaacagtgaacagattctgcgttacagcaatattctggta
gataccacttataactttaacagcttcatccaatgtaacggctccgactggagtgcgccg
tattccgcaagctgtaccacgcctattggggatctgactgccagagctttcggctcatcc
ctgatggtcggtttttataactccaacctcgatgtagtgattgatgacgatggttccgct
ggtacggccgataaaatcggtgccataggtggaggcggtgtgggcagtgcaggcagcccg
cgttatgtggagtttcgcaagaccgacaacagcctctattccgcaaaaacggtggatctg
gccatctggacctatcacaccaataccgggcagccaccgtactccgatacattgaccatt
accgcgtatgacggatccaatgcccaggtcggttccattactgtcgatccggtatatcgc
gacgactactattatctggacttttccaacccgacagcaggctatacccgtaataatggt
ttctattccagcgcaccaacgatcacggcatccggtagcttcaataacattgccaaagtc
cggttcaagattaatcagaataccttttatattgatgacctggtgttgtcggtgggggca
tccaacaatgcgccgaccaatattaccctcggaacatcgagtatcaaccaaagtgctacc
ggcgcagcggctgtcgttggtagcctgacgaccaccgatctggatggatcggacacccat
acctattctttggtcaccaatggcagctctggttatggcagttgtggtgctaccggtgat
gacaataacagcagcttccagatttccagtgccaacctgcaaacggccagcagtttgtca
gcgggtagctacaatgtttgcgtgcaaaccaatgatggtaccgacacgtatcaaaaaacc
tttgcgataactgtcaatgacgatgtggctccgagcggccacagtgtcagttttgacgac
accaccattaacgcctcagaagtatcgagccagagtttcacctttgcctcagcggaagtc
ggtgccacttacagttacaccatttccagttccggtggcggcactaacgtcactggttcc
ggtaccctgagtacagcgaccgatcagatcactggtctgagtttatctggcctcggtgat
ggcacattaactttgtcggtagtggtgactgattcttctgccaatgccgccacagccgtt
accgataccgctacactggattctgttgcgccaagtggccacagcgtcagcctggatagc
agcacttacaacgcgacttctgctaccagtgccagctttacctttgcagacggtgaaatc
ggtgccgcgtacagttacaccatcagcagttccggcggcggtgtcaacgtcactggttcc
ggtattctcagcaccgccaccgatcaaatcactggcatcgatctctcgagcctgggtgat
ggcaccctgacgatctcggtagtcgtgactgatgttgcgggcaatgctgcaaccacggtg
accgataccgcaacgatggataccaccgcaccgagcggccacagcgtcagttttgacgac
agtgcgattaatacctccgaggcttccagccagagtttcacttttgccagtggcgaagtg
ggtgcgagctacagttacagcatctcaagctccggtggtggcacgccagtgaccggttcc
ggtaccctcagtaccgcgactgatcagattaccggtctggatctctccggcctgagtgat
ggcaccttaaccttatcggtggtgctcaccgataccgctggtaatgcggcgaccgccgtg
accgacaccgccgcactcgatggcaccgcgccaagcggccacagcgtcagtctggatagc
agcacttacaactctacttctgccaccagtgccagctttacctttgccagtggtgaagtc
ggcgcgagctacagttacagcatcagcagttccggtggcggcaccaacgtcaccggttcc
ggtaccttgagcaccgcgactgatcagattaccggcatcgatctgtccggcctgagcgac
ggcaccctgaccatctccgtagttctgactgacccggccggcaatgccgcaaccgccgtg
accgatacggctacgttggatgccaccgtacccagcggccatagcgtcagtctggatagc
agtacttacaacgctacttctgctaccagtgccagctttacctttgcgggtggcgaagtc
ggagcgggttacagttatagcatctcaagttccggcggcggcaccaacgtcacgggttcc
ggtaccctcagcactgcgactgatcagatcaccggcgtggatttgtcgggcctgggtgac
ggtactctgaccatctcggtagtggtgaccgatgttgctggcaatgccgcaaccgcggtg
accgataccgcaaccctggataccaccgcaccaagcggccacagcatcagttttgacgac
agtgcttacagtgccaccgaagccggcagcgccagctttacttttgccagtggtgaggtg
ggtgcgagttacagctacagcatcagtagttccggtggcggcaccaacgtcaccggctcc
ggtaccctgagcagtgccaccgatcagattagtggtctggatctttccggccttggtgat
ggtacgctgaccgtgtcggtggtgctcaccgataccgccggtaatgccgcaactgcggtg
accgatactgcgactctggacagcaccgtgccgagcggtcacagcgtcagtctggatagc
agcacttacaactctacttctgccagtagtgccagcttcacctttgccagtggtgaaatc
ggtgccgcgtacagttacaccattagcagttccggcggcggcaccaacgtcactggttcc
ggtaccctcagcaccgccaccgatcaaatcaccggcatcgatctctcgggtcttggtgat
ggcaccctgaccatctcagtagtcgtgactgacacggccggtaatgctgcaaccgcggtg
accgataccgcaacgatggatgccaccgcgccgagtggccacagcgtcagctttgacgac
agcgcaattaatacctccgaagcttccagtcagagtttcacttttgccagtggcgaagtg
ggtgcgagctatagctacagcatctcaagctccggcggtggcacgccagtgaccggttcc
ggtaccctcagtaccgccaccgatcagatcaccggtctggatctctccggcctgagtgat
ggcaccttaaccttatcagtggtgctcaccgataccgccggcaatgcggcgaccgccgtg
accgacaccgccgcgcttgatggcaccgcaccaagcggccacagcgtcagtctggatagc
agcacttacaactctacttctgctaccagtgccagctttacctttgccagtggtgaagtc
ggcgcgagctacagttacaccatcagcagttccggcggcggcaccaatgtcaccggttcc
ggtattttgagcaccgcgaccgatcagattaccggcatcgatatatccggcctgggtgac
ggcaccctgaccatctccgtgatcgtgacggatccggccggcaatgccgcaaccgctgtg
accgataccgcaaccctggatgccacggcaccgagcggccagagtgtcagtctggacagc
agtacttacaacgctacttctgccaccagtgccagctttacatttgcgggtggcgaagtc
ggcgcgggttacagttacaccatctcaagttccggcggcggcaccaacgtcacgggttcg
ggtaccctcagcactgcgactgatcagatcaccggcgtggatttgtcaggcctgggtgac
ggtactctgaccatctcggtagtggtgaccgatgttgccggcaatgccgcgaccgcggtg
accgataccgcaaccctggataccaccgcaccaagcggccacagcgtcagttttgacgac
agcgcaattaatacctccgaggcttccagccagagtttcacttttgccagtggcgaagtg
ggagcgagttacagttacagcatctcaagctccggtggcggtacgccggtgaccggttct
ggaacgttggctacagcgaccgatcagattaccggtttggatttatcgggcctgagtaat
ggcaccttaaccttatcggtggtgctcaccgataccgccggtaatgccgcgaccgcagtc
actgacaccgccgcactcgatggcaccgcgccaagcggccatagcgtcagcctcgataac
agctcttacaacgccaccaccgccaccagtgccagctttacctttgccagtggtgaggtt
ggtgcgagctacagttacagcatcagcagttctggtggaggcaccccagtgaccggctct
ggaacgttggcgacggcgaccgatcagatcaccggcatcgatctatccggcctgagtgat
ggcacgttgaccatctccgtgatcgtgacggatccggccggcaatgctgcaaccgccgtg
accgatactgcaaccctggatgccacggcaccgagcggccagagtgtcaccttggatagc
agtacttacaatgcgacttctgccagtagtgccagcttcacctttgcgggtggcgaggtc
ggagcgggttacagttacaccatctcaagctccggtggcggcaccaacgtcacgggttcc
ggtaccctcagctctgcgattgatcagatcaacagtatcgatctttccggcctgaatgat
ggcactctgaccatctcggtcatcgtgaccgatgttgccggcaatgccgcaaccgcggtg
accgataccgcaaccctggataccactgcgccgagcggtcacagcgtcagctttgacgac
agtaccattggtagcgctgacgcatcgagtcagagtttcacctttgccggcggtgaagtg
ggagcgagctacagttacagcatctcaagctccggtggcggaacaccggtgaccggttct
ggtacgttgaccacagcgaccgatcagatcactggtatcgatctctccggtctcagtgac
ggcaccgtgaccttgtcggtgatagtgactgacacagcaggtaatgcggcgactgcggtg
accaacaccgctacgctggatactgcagcgcccagtggccacagcgtcagcctggataac
agtacctacaacaccactgatgccgccagtgccagctttacttttgccggtggcgaggtt
ggcgcgagctacagctacagcatcagcagttctggtggtggcactgcagtgactggctcc
ggcaccctcagcaccgcgaccgatcagatcaccggcatcgatctcaccggtctcagtgac
ggcaccctgaccctctcggtggtcgtgactgacccggccggtaatgctgcgacggcggtg
actgatacggccattctggatgccgcgaccccaagtggttacagcatcagtgtaggggac
acagtgctcaatgcctccgaggcaaccgatctgagtttcacttttgccggcgctgaagtc
ggggcaacctataactacagcatcagcagttccggcggcggaacgctggtgaccggctcc
ggtacattgagcagtgcaactcagctgatcgatagtatcgatgtttctggcctcagtgac
ggcactctgaccatctccgtaactctgaccgacaccagtggcaacaccggagcagcggta
acggccactgcagagttggatcgcaccgcgccaaccgtggcaaccaacagcggtctgaca
ttgaagaccggctacaccaaaaccatcagcgccagtctgttgagtgcaacggatgcggtg
agtagcagtttgacattcacggtgaccagtgtgccgaccaatggcagcctgaaacgcagt
ggtaatgtgctggccaattccgatacctttactcaggcggatcttgatgccggcctgatc
agctatacccatgatggcggcagcagtaccagcgacagcttcggcttcagtgtcatggat
gcggctggcaatagtctgaccggtcaaagtttcagtctgaccgtcagcaacaccaacgct
gcaccgaccattaccggtagcccggagaccagtgttgccgaagacagtgcctatagtttc
attccaaccaccagtgacagcgatggcgataccctgactttcagtatcagtaatcaaccg
ttgtggacggattttgatagcgcgaccggtgccttgaccggaactccggtgaatggcgac
gtgggcagttacagcaatatcgtgatcagcgtcagcgacggtaccgccagtgtcagcctt
gccgcgttcagtattaccgtgagcaacgtcaatgatgcgccagtgataactggcacaccc
ggaaccaccgcggaaatcggtgtgacttacagctttaccccaactgccagtgatgtggac
attggtgatactctgacgttcagcatcagcaatcaaccgtcctgggccagctttgatacc
agcaccggtgcattgacgggtactcctgccagtggtgatgagggcgattatgcaggtatt
gtgatcagcgtcagcgatggtactgccagtaccagcttgccgcctttcgatatcactgtg
gtggtggccaccgataccgatggtgataacgttccggactatcaggaagtcattgacggt
actgatccaaatgatccggaagattatctcgataccaccgatccggtgattagtgcgcct
gatgacgtggtatttgattctaccggtctttataccgtgatctcgctgacacagctgctc
gggctcgacagcgatgccgataccagcactatcgatgcagcgttggcggcactggtaagc
gataacattgatggcgatggctgctgtgagccgaatgtcgttggcatggttaataatgcg
gtgctgctgccacccggactcaattacgtgacctggcaggccaccgaccacaaaggcaat
accggcagtgtggatcagatcgttcgcatccggccgctggtgtccttcgctaaagacaaa
accgtcgtggaaggcgcgcctacccgctttaaagtactactcaatggcgctgcaccggat
tatccattctctgtgccggtcattattgataccgccaacagcaccgctgacagcagtgat
cacgatctcagcgataacctggtgatctttaccagtgatgaaatatcgaaagttattgcc
ttcaatatcaataccgacagcactttcgaagggactgaaattctgaccctcaaactggat
gatcagaccagtgacagtgatgatctcagtggcggatatgatccggacaatatcgatatc
tacgacatcaactcgggcgtgaaaaacaccatgaccttcttcctggtggaaggcaacatc
gcaccggaagtcaccctgaatctgcaacagaacggcagcagtaccatactggtgacaccg
gatggtggtaatgccactatgacggctacggtggtcgatccgaacaccggtgataccttt
acctacagctggagtgccagtgccagcagtctggtggatattgaggacgacattaacgaa
gcaaccttcgagtttgatcccagtgtgctcaaagctggccgctatcgcctgcaactgacc
gtaaccgattcagagggtgccagcgacacggcccggttgtacttccaggttgtggcggca
ttaccgacactcattggcagcactgatagtgatggtgatggcactgatgacgcaaccgaa
ggtactggtgacagtgacgacgacggcattcctgattatcttgataacatcgttgccacc
aacgtactgccggaacaggccagggtgaccgactccttcctgctcgaatgtgatccggga
gtgctgtgtcggctgggtcagtttgccatgatgagcgaaggcggtggtgcacgactcagt
gaagacgatctgagtaatcaaagtgatcttaaagtcgataaagactacgactttaaaggt
ggcatattcgactttgagattcaggatctgccaactcttggacaaaccgtgcgcattgta
ttgccactgacagaagccattcctgaaaatgccgtttaccggaaatatcagaatggcgag
tggagtaactttgtggaagacgccaacaacgaaatccactccgcaccgggtcgtctgggt
tactgcccacctccgggagatgacagttgggtcagcggcatgcaggttggttactactgt
gtgcaattgaccattgaagacgggggtgccaatgatgccgatggactggtgaatgccgtc
gtcgaagatcccggtgccatcggggttagagcgtcctccgccatacagggcaacggttgg
tccggtactgcaggtgtgggactgctcgcactactgggcgcgttgctgatgggtgtacgg
agaaacccaaaaaccccggcggacaaacaatag
DBGET
integrated database retrieval system