Gallibacterium salpingitidis: NYR30_07435
Help
Entry
NYR30_07435 CDS
T09222
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin N-terminal domain-containing protein
KO
K15125
filamentous hemagglutinin
Organism
gss
Gallibacterium salpingitidis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
gss00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gss00536
]
NYR30_07435
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
gss00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Microbial pathogens
NYR30_07435
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
ESPR
Fil_haemagg
Fil_haemagg_2
Glucodextran_B
ImpE
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WKS98616
LinkDB
All DBs
Position
1530791..1535971
Genome browser
AA seq
1726 aa
AA seq
DB search
MMNKHLYRIIFSKTLQRLVVVSEIATREGKAKHESQICHSASLTLSKRPRWTLKPLTIGL
YSLLGFFYLASAQADELQIRADSSAPKNQQPIVLQTANGLPQVNIQTPNDKGLSHNKYQQ
FDVAEKGAILNNSRKNVQTEQGGWVQANPYLVGGEAKVILNEVNATKPSQLKGYIEVAGG
KADVIIANPSGIHCEGCGVINAGRSTFTTGEVQIENGQVTGYRVEKGAVTVSGRGMDTSR
QDYTDIIAKEVKVNAGIWAKELKVTTGKNQVSAKNDSIQVIQAGDATEPVGYAVDVAELG
GMYANKIHLIGTENGLGVRNAGHIGAAVGEVKVTTEGQLVNTGYIGAQQDITLQSQHQME
NQASGVMYSQQGNLQTTSKQKGIQQQGSLLAKGKAQGKGNITLKAKETISQSGESLAEGN
ITYQAKHIETSTDAVLAAGVQFTPTATTEEKTINPHSEQGQTLHLLADQHTIAHGQNLAS
DHLQIEAAEIDLSQSQTSANRLTLLARQGDIYLANSEILIDKTATLHTPTTLATPNAQLQ
AQHFIVQANALNNQHGYWQQTGTNRLDFLLAQGLNNQQGVLRTLGDLNYQGAQFNNQQGV
VTTPQSLYLNTQQHTFNNQAGLVSAQQDIQLITNILQNQQGTIQSQHHLTITAPNLTNQQ
KGKLLAVEQLSITAQQLDNQTGLIQSNQANITTQQLDNRAGTIKANQADITAQQQLDNQA
LSQTGSLIQAATLRITTPLLLNQQTKAQNETPTQGLLANTVEIKTDQWFNQSGGAYVSQA
LNATVAKLFNNQQGELLSLNRLKVKGNQLQLDNQQGVIESHGNLTLNLKQWENIGQVKSA
ANAKLSIHNDFRLDTPITVDGKLTLKVDNHFSNQTQLVTGKGLTIEAKSIENPVQSELSS
QKTLLKTEYLLNRGLIDGVKNIIFANQLDNLGSGRIYGDQLAIQAHTLNNLPEQDQVATL
AARERLDLGVGTLTNYDHALILSQGNLYIGGTLDDRYHATGQATFVDNGSATVEALGNGN
INTQRLWNHDLHLRLGIHTDKEKFEEYAQNNNSRRYRQGVEGELDWTRKSRKAWFAFYDG
SRSPSQNDWFGWEYTRTTDTTTIEHRDPAKILIAGNLSLNGNQLHNQYSQILVGKALTLG
EQRFRKNTKNETLTANHVQLINEDLIGEIHRRDDGQSFMMVAYKDKNPFRPRYGHRSENY
QDYHHIHPIEYFNFKIVDNTIGQAIQPTGTAIRQQTIAQQAALNHLQVDFTQSTPLSAVP
HVRAVLPNQLLPQASLYRLNLATNSHVLVETDPRFTNQRQWLSSDYMFDALRADPQTMLK
RLGDGYYEQRLVNEQINQLTGQRFLGNYTSDYEQYKALMDAGIRYAQRYQLIPGVALSAA
QMQELTEDMVWLAPQTVTLKDGTQVQVLVPQVYLVKRDVDVQPTGAIISAREIDMAMDGI
VKNSGLIAGRHLTQISAQNLENYGTITADQLNFNITNRLYQQGGTLTANNLNLAANTILI
ESRFSENQDNGTFYRRQLDQQAQLNVKNDLTLTTQGDAQLNAVKINTDNATLYIGGNLTL
GTQAEINKEHYVMDADNYWKLDQHNDIATTLTAKGNTTLLAQKDINLRGTQIDTKKDLIL
ASQQGDIHVDAARKQEQLSSGIKHTDKGLLSRTTIMTKHDHQYDVAEGSQLAGNNVHLLA
NQGKVAVEGSTIVADKNVTLQAQELDISAAKNTRKEDDFYAKKNPV
NT seq
5181 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgaataaacatctttatcgcattatctttagtaaaacattacaacgtttagtcgtg
gtgtcagaaatcgcgacacgcgaaggtaaagccaaacatgaaagtcaaatttgtcattcc
gcttcgcttacacttagtaaacgtcctcgctggacattaaaaccccttactattggatta
tatagtcttttaggctttttctatttagcgtccgctcaagcagatgaattacaaattcga
gcagatagtagtgcgcctaaaaaccaacaaccgatcgttttgcaaacagcaaatggttta
ccgcaagttaatattcaaaccccaaatgataaaggcttatcacataataaatatcaacag
tttgatgtcgccgaaaaaggggcaattctcaacaatagccgtaagaatgtgcagaccgag
caaggtggctgggtacaagccaatccgtatttggtcggtggcgaagccaaagtgatatta
aatgaggtcaatgccaccaaaccaagccaactaaaaggctatattgaagtagcgggcggt
aaagccgatgtgattattgccaatccaagtgggattcattgcgaaggctgcggggtgatt
aatgcaggacgcagtacctttaccacaggtgaagtacaaattgagaatggacaagtcacc
gggtatcgcgtagaaaaaggcgctgtcactgtttctggccgaggaatggataccagccgt
caggattataccgacatcatcgctaaagaagtgaaagtcaatgccgggatttgggcaaaa
gaattaaaagtcacgactggaaaaaatcaggtttcagctaaaaatgacagtatccaagtg
atacaggctggtgacgcgaccgagcctgttggctatgcggttgatgtggctgaattaggt
ggtatgtatgccaataaaattcaccttattggaacagaaaatggcttaggcgtacgtaac
gcgggccatattggtgctgctgtaggtgaagtaaaagtcacaacggaagggcaactagtg
aataccggttatattggtgcccaacaagatattactctgcaaagtcaacatcagatggaa
aatcaggcgtctggcgtgatgtatagccaacaaggaaatctgcaaactaccagtaaacag
aaagggattcagcaacaaggtagtttgcttgccaaaggcaaagcacaagggaaaggcaat
attaccttaaaagccaaggaaacaattagtcaatccggtgagagtttggcagaagggaat
atcacttatcaagcgaagcatattgaaacttcaactgacgctgttctcgctgcgggtgta
cagtttacaccaacggcaacaacagaagaaaaaacaattaatccacatagcgaacaagga
caaacacttcatcttcttgctgaccaacatacgattgcacacggacaaaatcttgcctca
gatcatcttcaaattgaagcggcagaaatagatttatctcaaagtcaaaccagtgccaat
cgccttactttactcgctagacagggagatatttacctagctaatagtgaaattttaatt
gataaaacggctaccttacatactccgactacccttgccacaccaaatgctcaattacaa
gcccagcattttatcgttcaagcaaatgcacttaacaatcaacatggctattggcaacaa
accggtaccaatcgtttagattttctattggcgcaaggattaaataatcagcaaggtgtg
ttacgtacactcggtgatttaaattaccaaggtgctcagtttaataatcaacaaggcgtg
gtgaccacaccacaatccttatacttgaatacacaacagcatacttttaataaccaagct
ggtttagtctccgcacaacaagatattcaactcattacgaacatcctacaaaatcaacaa
gggacaatacaaagtcagcaccatttaaccattacggcacccaatttaactaaccaacaa
aagggtaaattattagcggttgaacagctgtctattactgctcaacaacttgataatcaa
actggacttatccagtctaatcaagcaaatattacaacccaacaacttgacaatcgtgct
ggaactatcaaagcaaaccaggctgacatcaccgcccaacaacagttagataaccaagca
ctaagtcaaacaggatcgttaatccaagcagctactttacgcattactaccccattacta
ttgaaccaacaaaccaaagcacaaaatgaaacaccaacacaagggttacttgcgaatact
gtggagattaaaaccgatcaatggtttaaccaatctggtggtgcttatgtgagtcaagca
ctcaatgccacagtggctaagctattcaataaccaacaaggtgagttgttgtcattaaat
aggctaaaagtaaaaggtaatcagctacaactagacaaccagcaaggtgtaatagaaagt
catggcaatttaaccttaaacttaaaacagtgggaaaacatcgggcaggtaaaaagtgct
gctaatgcgaaactctcaattcataatgacttccgtttagatacgccaattaccgtcgat
ggcaaattgactttaaaagtagataaccatttttcgaatcagacacaactcgttacagga
aaagggttaacgatcgaggcaaaatccattgaaaatccagtccaaagtgaattaagttcc
caaaaaacactgttaaaaaccgagtatttgcttaatcgcggtttaattgatggcgtcaaa
aatattatttttgctaatcaattagataatcttggcagtggtagaatttatggtgatcag
ctcgccattcaagctcatacattaaataacttacctgaacaagatcaagtagctacctta
gccgcacgcgaacgcttagatctcggtgtaggtaccctaactaactacgatcatgctctg
attttaagtcaaggtaatctctatattggtggtacgttggatgatcgttatcatgccact
ggacaagccacgtttgtggataatggtagtgcaacggttgaagcattaggaaatggcaat
atcaatacgcaacgcttatggaatcacgatttacacttacgtcttggtattcacacagat
aaagaaaaattcgaagaatatgcgcaaaataataatagtcgacgttatcgtcaaggcgtt
gaaggcgaattggattggacaaggaaaagcagaaaagcgtggtttgccttttatgatggc
agccgtagtccctctcaaaatgattggtttggctgggaatataccagaacaacggatacc
actaccattgaacatcgcgaccccgctaaaattctgattgcaggcaatctttcacttaat
ggcaatcaacttcacaaccaatatagccaaattttagtgggtaaagcattaaccttaggc
gaacaacgctttaggaaaaatactaaaaatgaaaccttaaccgccaatcatgttcaatta
atcaatgaagatttaattggtgagatccatcgccgagatgatggtcagagttttatgatg
gttgcttataaagacaagaaccctttcagacctcgttatggacatcgttcagagaattat
caggattatcatcatattcatccaattgaatattttaactttaagattgtagataatact
atcggacaggctattcaaccaacgggaacagcgattcgtcagcaaactattgctcaacaa
gccgcattaaatcatttacaggtggatttcactcaaagtacgccattgagtgcagtacct
cacgtacgtgcagtattaccgaatcagttattgcctcaagcaagtttatatcgtttaaat
cttgccactaacagccatgtattagttgaaactgatcctcgctttactaatcaacgccaa
tggttaagctcagattatatgtttgatgccctacgtgcagatccacaaaccatgctcaaa
cgattaggggatggttattacgagcaacgtttagtgaatgaacagattaatcaattaacg
ggacaacgtttcttaggtaattacacctctgattatgagcaatacaaggcattaatggat
gccggtattcgttatgcacaacgttatcaacttattcctggtgttgcgcttagtgctgca
caaatgcaggaattaaccgaagatatggtatggcttgcgcctcaaaccgtcaccttaaag
gacggtactcaagttcaagtgcttgtccctcaagtttatctcgtcaaacgtgatgtcgat
gttcagccaacaggtgctattatctctgcaagagagattgatatggctatggatgggata
gtgaaaaatagcgggttgattgcaggacgccatttgacacaaatttctgcacaaaacttg
gagaattatggcactatcaccgccgatcaactaaatttcaacatcaccaatcgtctctac
caacaaggtggaactttaactgccaataacctcaatttagcggctaatactattctgatt
gaaagtcgttttagtgagaatcaagataatggcaccttttatcgtcgccaacttgatcaa
caagcacaactgaatgtcaaaaatgatttaactcttaccacacaaggtgatgcgcaatta
aatgcagtcaagataaacactgacaatgcaacactttatatcggcggtaacttgacatta
ggtactcaagcagaaatcaataaagaacattatgttatggatgccgacaattattggaaa
ctcgatcaacataatgatattgcgaccacattgacagcaaaaggcaacactaccttactc
gcccaaaaggatattaatttacgcggtacccagattgacacgaaaaaggatcttattctg
gctagtcaacaaggtgatatccatgtcgatgcagcacgaaaacaagagcaactctcttca
ggcatcaaacatacggataaaggtctgctaagtcgtaccactatcatgactaaacatgat
caccaatatgatgtagcggaaggttctcaattagcaggcaataatgttcacctgctggca
aatcaaggcaaagttgctgttgaaggcagtacaattgttgcagacaaaaatgtgacatta
caagctcaagaacttgatatttcagcggctaaaaataccagaaaagaagatgatttttat
gcaaagaaaaatccggtttaa
DBGET
integrated database retrieval system