Gardnerella vaginalis 409-05: HMPREF0424_0065
Help
Entry
HMPREF0424_0065 CDS
T01146
Name
(GenBank) kinase domain protein
Organism
gva
Gardnerella vaginalis 409-05
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
APH
RIO1
Pkinase_fungal
FTA2
TCAD9
ABC1
Kdo
Kinase-like
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADB13726
LinkDB
All DBs
Position
76444..78285
Genome browser
AA seq
613 aa
AA seq
DB search
MEDTSMFDLQPGTNVGGYTLISRLGGGAMGSVWRVNDDGGNQYAMKILRASVHAKQSEDE
DSEQERARIRLKREALALQRIHHPGVCAIVDMELDASIAFIVTELIEGHNLREDVDENGP
YIADDLERLAHKLIEAVKAVHEAGIVHRDIKPTNVMISATGPVLVDFGIAMGEGESHVTR
TGLVMGTPGFIAPEIIEGGDSDELTDWWSVAAVLAFAATGKPVFGTKPMMAVLERAASGN
ADLTGLPPRTMAAFRKALNPIREQRCMPSDLENAISQDAMDPLAWPEVNRPFDRNATNIT
MRKMWCETSRETKEKTAILTNSRTCDAAGTAGITNLNSDGEMPTVTVRSTTVMPHSLDNS
EDDKTFCVDEKTRINALNDVDFQNIQDDNSNNSRIAQSSKLIRSSDNTFDNGNIENEAGD
SLHVKSDEVSSVDPVLNKHDYARRGTWILLICIILHLAIACLSILDSIGFAMVFMWISAT
SGYSISSSLRRWQLNDGIIPRHDSVVLIATLPWHIIRGFVYMLPRVIAIVVSGGIGAVIY
PFFCGNNPELLSIDVGSLRILLPTYSPNIFSSTAVGYALGFIVAWVVFAAVKWTTKFRLG
LGAVFYSGKSFEK
NT seq
1842 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaagatacaagcatgttcgatttgcaaccagggactaatgtaggcggatacacgctt
atttctaggcttggcggcggcgcaatggggtcagtttggcgcgttaatgacgatggcggc
aatcaatatgctatgaaaatattacgtgcttctgttcatgcaaaacagagtgaagatgaa
gattctgagcaggaacgtgctcgaatacgtttaaaacgtgaagctttggctttgcagagg
attcatcatccaggtgtttgcgcgatagtggatatggaattagatgcttcaatcgctttt
attgtgacagagttgattgaaggacataatttgcgcgaagacgtggatgagaatggacct
tatattgcagatgatttggagcgtcttgcgcataagcttattgaagctgttaaagcagtt
catgaagccggtattgttcatcgcgatattaaaccaactaatgtaatgatttctgctact
ggacctgtattggtagattttgggattgcgatgggcgaaggtgaaagccatgttactcgc
acgggattagtgatgggcactcctggttttattgctccagaaattattgaaggtggagat
tcagatgaacttacagattggtggtctgttgctgctgtgcttgcatttgcggctaccggt
aagcctgtttttggcacaaagcctatgatggcggttttggagcgtgctgcctcaggcaat
gcagatttaactgggttacctcctagaacaatggctgcttttcgtaaggctttgaatccg
attcgagagcagcgttgcatgccatctgatttagaaaatgcaattagtcaagatgctatg
gatcctttagcctggccggaggtgaaccgcccttttgaccgtaatgccactaacataact
atgcgtaaaatgtggtgtgaaacaagtcgtgaaacaaaagaaaaaactgctatactaaca
aattctcgtacctgcgatgcagctggtacagctggcataacaaatcttaattctgatgga
gaaatgccaaccgtaactgttcgttctactactgttatgccacattcattagataatagt
gaagacgataaaacattttgtgtggatgaaaaaacacgaattaatgcgttaaacgatgta
gattttcagaatatacaggacgacaattcaaacaattcacgcattgcacaatcttcaaaa
cttattcgttcttctgataacacttttgataatggcaatattgaaaatgaagcaggtgat
tctctacacgttaaaagtgatgaagtgtcttctgttgatcctgttcttaataaacatgat
tatgcgcgtagaggaacatggatactgctgatttgtataattcttcatttagccattgct
tgcttaagcattctcgattctattggttttgcgatggtttttatgtggattagtgcaaca
tccggctacagtatttcatcaagcttgcgaagatggcaacttaacgatggaataattcct
cgccatgattctgtagtgcttattgcaactttaccgtggcatattattcgaggatttgtt
tacatgcttccacgagttatagctattgttgtttctggaggtattggagctgttatatat
ccatttttctgcggtaataatcctgaattactttctatagatgttggatccttgcgtatt
cttttaccaacttactcacctaatattttttcaagtactgcagttggatatgctctagga
tttattgttgcatgggttgtttttgctgcagttaagtggactacaaaattccgtttagga
ttaggtgcggtattttattctggaaaatcatttgaaaaataa
DBGET
integrated database retrieval system