KEGG   Gardnerella vaginalis ATCC 14019: HMPREF0421_20277
Entry
HMPREF0421_20277  CDS       T01344                                 
Name
(GenBank) Cna protein B-type domain protein
Organism
gvg  Gardnerella vaginalis ATCC 14019
SSDB
Motif
Pfam: SdrD_B CarboxypepD_reg SpaA
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADP38361
UniProt: E3D8G7
LinkDB
Position
328098..331052
AA seq 984 aa
MSEGRKYLMKMKIVTASLLTATLLTASLSSSALAQSSNDNAFTNRENIPTNKSSINNIDL
IPAPTQHFGKPDGKLPEVRTSISYVDGDSTDNHADTNKTNKILRPGSKLTLRATAKFIVP
EAGDVFRPYLRLAIPKILTVNANDFVVDAGSVANKVVQISDSKSFDNHNLGNYNLFDVYF
NYNEWSSDFANEMPYLAAIKGVNHSGNVLSNGDVVKNNQTVSIEIPTVVDSNANTSDLVD
LQNYKKGVKPLIQGRVSYMPFPTPIEYTSTIGGLKDFPNDKILQDNPCLVRSDLVTGWDG
RDDYGFWFTGLSMETSGVDYDSRSTMVESQNGVWLPQLIPANIEHNQFVTIYRNGNDNNP
IKLRFKIPFGSKDYTLNGTKQALKNHHLTVFRSPNNNAEARKIMGNIGIEKVAYENTEVF
GDILDSKYFDGWGTVPEQSRPSELLISGEFNPDSTVFGPDNISNGIWMSGKASASIKSYY
RALDCNDNYPDSTLKYPPIINKIQETVATYARSNRSKVSTVPIEIVIPASLSGRVWFDAN
HNGIQDKGESSIIGAKVQLVKQYGDSTVIDINGNEVKPITTTSPDGYYEFTNLLPGSYVV
KFTLPEGSEYFGFTYTHKGSDSSVDSDAIPGEPVTDRSVIENVSSETDNSTSKNSYVGNI
SLSAGEDKKHIDAGAFKKDEPKDPKPNTEPKNPQPKHEDPKDPKQNPNPKDPKKDKPKSK
DPKPKDPNPEKDKPKDPDNKPKQNPEPKKTDPKDYNPVKPDTPKSPDPKKDDPKPKDKPN
NPNYQDRDVPDTKPEDPKKPDNPTKPKDDKSDTPKEPESKEPKDPKPNDEPKKDEPEDPD
PKDTNPKSENPKDNENPKNPESKPDDPKSDTPKDPDTDDTESNDPPQYEDSQPKEDSSGP
NHSEIRESDNPIPNINNDLDSNNSQSNESSFDNNNADFKQEHVRDKLVNTGVSTVFTAVA
SVAMLALGATNKIKSYFCKGKHRQ
NT seq 2955 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgagcgaagggagaaaatacttaatgaaaatgaaaatagtgacagctagcttattaacg
gccacgttattaacagcaagtttatcttcttcggcgttagctcagtcgagcaatgataat
gctttcactaatcgtgagaacattccaacgaataaatccagtattaacaacattgattta
attcctgctcctacccagcatttcggcaagccagatgggaaacttccagaagtaagaact
tcaatcagctatgttgatggagattctactgacaatcatgcggatacgaataaaactaat
aaaattctgcgtccaggtagcaagcttacgctccgggctacagccaaatttattgttcct
gaagctggcgatgtttttagaccatatcttcgactagccattccgaaaattcttacagta
aacgcaaatgattttgttgttgatgctggcagtgttgcaaataaagtagtacagatttca
gattctaagtcgtttgataaccacaatctcggtaactataatctttttgacgtctacttt
aattacaacgagtggtcctctgattttgcaaacgaaatgccataccttgctgccataaaa
ggcgtgaaccactctggcaatgtattatccaatggtgatgtagtaaaaaataatcaaaca
gtttccattgaaatccccacagtagtcgacagtaatgcaaatacttctgatctagttgat
ttgcaaaattacaaaaaaggtgtgaaaccattaatccaaggcagagtgtcttatatgcct
ttcccaacgcctatagaatatacttcgacaatcggcggattaaaagattttccaaacgat
aagatacttcaagataatccatgcttagtgcgttcggatctggtaactggatgggacggc
agagatgattatggattctggttcactgggctatctatggaaacgagcggcgtcgattat
gacagtagaagcactatggttgagtcgcagaatggtgtttggttaccacaattaatacct
gcaaatattgagcataaccaattcgtaactatttatcgcaatgggaacgacaataatccg
attaagttgagatttaaaattccatttggttctaaggactatactttaaatggaactaag
caagctcttaaaaatcatcatttaacagttttccgttcgcctaacaacaatgctgaagct
cgtaaaattatgggcaatatcggaatagaaaaagttgcttatgagaatactgaagttttc
ggcgatattttggattctaaatatttcgatggttggggaactgttccagaacaaagcaga
ccttctgaattgctaatatctggagaatttaacccagattcaactgtgtttggtcctgat
aatattagcaacggtatttggatgagtggaaaagcaagcgcatctataaaatcgtattat
cgtgcgttagattgtaatgataattatccagatagtactttgaaatatccgccaattatt
aacaagattcaggagactgttgcaacgtatgcgcgcagcaatcgcagcaaagttagcaca
gttcctattgaaatcgttattcctgcatctttgagtggacgcgtgtggtttgatgctaac
cataatggtattcaagataagggggagtcgagcataattggtgcaaaagtacagcttgtt
aaacagtatggagatagtacagtaatcgacataaatggcaatgaagttaagcctattacc
actacttcgcctgatggatactacgaatttactaatttgctgccaggaagctatgttgtt
aaattcacacttccagaaggtagtgaatattttggttttacatatacgcataaagggtca
gattcctctgtagattctgacgcgattcctggagagcctgtaacggataggtctgttata
gaaaacgtatcttcagaaactgataattcaacttcaaaaaactcatatgttggcaatata
agtctttctgctggcgaagataaaaagcatattgatgctggagcttttaagaaggatgag
cctaaggaccctaagccaaatactgagcctaagaatccgcagcctaaacatgaagatcct
aaggatcctaagcaaaatcctaatccgaaggatcctaagaaggataagccgaagtctaag
gaccctaagcctaaggatcctaatcctgagaaggataagcctaaggatcctgataataag
ccaaagcaaaatcctgagccgaaaaagactgatcctaaggattacaatcctgtaaaacct
gatactcctaagtctcctgatcctaagaaggatgatccaaagcctaaggataagcctaat
aatccaaattatcaggatagggatgtacctgatactaaacctgaagatcctaagaagcct
gataatcctacgaaacctaaggatgataagtctgatactcctaaggagcctgagtcgaag
gagcctaaggatcctaagcctaatgatgagcctaagaaggatgagcctgaagatcctgat
ccaaaggatactaatcctaagtctgaaaatccgaaggacaatgagaaccctaagaatcct
gagtctaagcctgatgatcctaagtctgatactcctaaggatcctgatactgatgacaca
gagtctaatgatccccctcagtatgaggattcccagcctaaggaggattcttcaggacct
aatcactctgagattcgtgaatcagataatccgataccaaacattaataatgatttagat
agcaataatagtcagtcgaatgaaagttcgtttgacaataataatgctgattttaagcaa
gagcatgtgagggataagcttgtaaacactggcgtaagcacagttttcacagctgttgcg
tccgttgctatgctcgctctgggtgctacaaataaaataaagagttatttctgcaagggc
aagcacaggcaataa

DBGET integrated database retrieval system