KEGG   Gardnerella vaginalis ATCC 14019: HMPREF0421_21350
Entry
HMPREF0421_21350  CDS       T01344                                 
Name
(GenBank) repeat protein
Organism
gvg  Gardnerella vaginalis ATCC 14019
SSDB
Motif
Pfam: Flg_new
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADP39432
UniProt: E3D8B9
LinkDB
Position
1646998..1650393
AA seq 1131 aa
MELTMRRNNKYKGMRILTASTIIAAMSLLSVYPISALAITPPPSTEVTVTNPAPKTQLVV
DGTNGSDTNDGSESKPLKTIQKALEKTAQKPANITIKGNFSLNTPVEIPQDITLSIDKSG
ATITGSNNTNDGITLKSGSTLRGDGELKMTAFKVALTAEKGSLITDGTYTFKDNAVEDSH
GIYLAGTVKGTSKDKLKITADDKCNTGFYADGITFENATINVKSQIRTWFDAYDLTLKNS
SLTVAGFGMSYYVNKLNMDNSEFVINKIGWRHSTGLTIQGDSTVTNNSRIVANAGSTAGI
SVGISNGKLAVTNSTLEFNNGGAGGLNVNSGKVILTNSTIKGDGKNSGALFGAQNSGSIE
LKGDCLIDSPANKNADGGAGTGNNYVVTGGSHMVTYAPGYHSNKGSTVPVNGEENGNEKL
SLFTLADSSVNEIKPINKKGNTYIYSVNKASKDNEKHVWVPAAKVTFELNDTKAEDSKKA
KGAIFSDSSTKAKESLAIRGYALNFAKTVAGGSTEVPANPIAPGYKFLGWFCKNAQHSEQ
KFTEKMIIKSDTTVYAKWEKDSSSYAVRYHNCAQDDATYIVSETSPKRTSKVLSFYEVVK
NNAKFARKGMVFKGWTTDKNGKGKTVKAGSNISISQSENLIDLYANWEEKEFTVKFSANG
GTFSNNSIFKTNTKVFEIKKDKRGGDVAVVKKTATFSENRTLINLIKSLDDNVNIDTPGI
SGKADSDSDTTYTNLATRKYYTLKNKDESYSIFGITIGSYYYWFKDKNGTEKASIDNNLR
VNDDLTFYLKWEINPNVKQIQQEDINLPADLLTGENTATTAYKVTPGQTIDFTGTITASV
VKDQMKTIEKKFNTVNAKDYDKITLEDMTSSFMATFTIPDGLTLPENITKNTLKLDGFSD
TFAIQDVQVKDKTVTVTINLKSGITTYAALQTAVQTNLGDAMKITIPGIKINQDFSGKAT
IVGTVSGSFHAAATFNGTTKLFDFTWNGSQTNDGKNSDAAAGANDISLTVEYDPQTPPTP
PTPPTPPTPVPEPTPVPEPTPVPEPTPVPEPTPKQTPEKTPWPKYKPTPEKTPNITPLPK
ENPNNKIVEKRKNDNNQLPKTGSAISLTAFSTILTFGLAEIIAKIKAHKNK
NT seq 3396 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggagctaacaatgagaagaaataataaatataaaggcatgcgcatacttactgcttca
actatcattgcagcaatgtcgctactttctgtatatccaataagtgcattagctattacc
ccccccccatcaacagaagtaaccgtaactaacccagctccaaaaacacaacttgttgta
gatggcacaaacggatcagacacaaacgatggatctgaaagtaagccattaaaaactatt
caaaaagctcttgaaaaaactgcacaaaaacctgcaaatattaccattaaaggcaatttt
tcacttaatacacctgtagaaattccacaagacattacactttctatcgataaatccggc
gccacaataacaggctcaaataataccaacgatggaatcacgctgaaatctggttccaca
cttcgcggtgacggcgaattgaaaatgactgcatttaaggtagctcttacagcggaaaaa
ggctctcttattacagatggcacatacactttcaaagataacgcagtagaagacagtcac
ggaatttaccttgcgggaacagtaaaaggcacaagcaaagataaattaaaaattactgct
gatgacaaatgtaatacaggtttttatgctgatggtattactttcgaaaatgctactatt
aacgttaaatcacaaattcgcacatggtttgacgcatatgatttaactttgaaaaattct
tcacttactgtagcaggcttcggaatgtcatactatgtaaacaaattaaacatggacaat
tcggagtttgtgattaataaaattggttggagacactcaactggtttaacaattcaaggc
gactcaactgttaccaataattcacgaattgttgctaatgcaggatctactgcaggcatt
tccgttggaatatcaaatggaaaattagccgttaccaactctactcttgaatttaataat
ggtggcgctggcggcttaaatgtaaatagcggaaaagtaattctcaccaattctacaatc
aaaggtgatggaaaaaatagtggagcgctttttggagctcaaaacagtggatctattgaa
cttaagggagactgcttaatagatagcccagcaaataaaaatgcagacggtggagctgga
acaggaaataactatgttgtgactggaggctcacacatggttacatatgctcctggatat
cacagcaacaagggaagcactgttcctgtaaacggtgaagaaaacggtaacgaaaagcta
agtctctttactcttgctgatagttctgtgaatgagataaaaccaattaacaaaaaagga
aatacctacatatactcagttaataaagcttctaaagataacgaaaagcacgtatgggtt
ccagcagcaaaagtgacattcgagctcaatgatacaaaagctgaggattctaaaaaagct
aaaggagctatattctctgactcttcaactaaagcaaaagaatcccttgctatacgcggt
tacgcattaaactttgcaaaaacagtggcaggaggaagtactgaagtaccagcaaatcca
attgctcctggatataagttcctcgggtggttctgcaaaaacgctcagcatagcgagcaa
aaatttactgaaaaaatgataattaaaagcgacacaacagtgtacgcaaagtgggaaaaa
gattcctcatcttatgctgttcgctaccataattgcgctcaagatgatgcaacatacatt
gttagtgaaactagtccaaaacgcactagcaaagttctttcattctacgaagttgttaaa
aataatgcaaaatttgcccgaaagggaatggtcttcaaaggttggactaccgataaaaac
ggcaaaggcaagactgtaaaagcaggtagcaatatttctatatcgcaaagtgaaaactta
attgacttatatgcaaattgggaagaaaaagaatttacagtaaaattctctgcaaatggc
ggaactttctccaataacagtatatttaagacaaatacaaaagtatttgagattaaaaaa
gataagcgcggtggagatgttgctgttgttaagaaaacagcaacatttagcgaaaacagg
acgctaatcaatcttattaaaagtttggatgataatgtcaatatagacacacctggcatt
agtggcaaagcagattctgattcagacacaacttatacaaatctagccacgcgcaaatac
tacacgcttaagaataaagatgaatcgtacagtatattcggaattacgattggaagttac
tactattggttcaaagacaagaatggaactgaaaaagctagtattgataacaatttacga
gtgaacgacgatcttaccttctaccttaagtgggagattaatccaaatgttaaacagata
caacaggaggatattaatcttcctgcagatttattaactggcgagaacacagcaactaca
gcgtataaagttactccaggacaaactattgatttcactggcacaatcacagcttcagta
gtaaaagaccaaatgaagacgatagaaaagaaatttaacacagtaaatgcgaaagattat
gacaaaattactctcgaagatatgacatcttcgttcatggctacatttactatcccagac
ggtttaacgctgcctgaaaatatcacaaaaaatacacttaagctcgatgggttctcagat
acttttgctatccaggatgtgcaagttaaagacaagactgtaacagttactattaatttg
aaatctggcattacaacgtatgcagcattgcagacagcagtacaaacaaatcttggcgac
gcaatgaaaatcactattccgggaataaagataaatcaagatttctccggaaaagctaca
atcgttggaacagtatctggctcattccacgcagctgcaacatttaatggaacaacgaaa
ttatttgactttacttggaacggctcacaaacaaacgatggtaagaactctgacgcagca
gcaggcgctaatgatatttctctcaccgtagaatatgatccacaaactcctccgacacct
ccaacgccacctacaccgcctacgcctgttcctgaacctacgcctgttcctgaacctacg
cctgttcctgaacctacgcctgttcctgaaccaacaccaaaacaaacaccagaaaaaaca
ccatggccaaaatataagccgactccagaaaaaacaccaaacattacgccactaccaaaa
gaaaatccaaataataaaatcgtagaaaaacgcaaaaatgataataaccaacttccaaaa
acaggaagcgcaatatcactaaccgctttttctacaattttaacgtttggacttgctgaa
atcatagcaaaaattaaagcacataaaaataaataa

DBGET integrated database retrieval system