Gardnerella vaginalis HMP9231: HMPREF9231_0991
Help
Entry
HMPREF9231_0991 CDS
T01939
Symbol
polA
Name
(GenBank) DNA-directed DNA polymerase
Organism
gvh
Gardnerella vaginalis HMP9231
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
DNA_polI_exo1
UBA_6
CASP_dom
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEF31520
LinkDB
All DBs
Position
complement(1191469..1194570)
Genome browser
AA seq
1033 aa
AA seq
DB search
MNASIVANEDSLNNEDENGTLLVVDGHSLAFRAFYAISADNFSTKSGFATNAIWGFSTML
SQVIEKEKPDKLAVAFDVKGGTFRNKLLPQYKGTREAAPEELLAQLPVIQELLNALGVKY
ITKQGYEGDDIIATLATMGAKAKYKTLVLSGDRDAFQLIDEYINVLYPGRHFKDLKQMDT
DAIIEKYNVTPKQYSDLAALRGETSDNIPGVPGVGDGYAAKWINQFGGLEGIIEHADQVT
GKKGESLRESIDQIRLNKKVNTLVKDLDLGVSINDLEFGNVDAASVGELFERLEFGTRSR
RKILKEFTRGSKELLEENIKMMISAGSTHAGSDVSSTESDNSDDLEDFKTIVDKINIHKI
YSESDLDNWINLVSPCIEKSESNGSSELVKENTEYKSKATVDLFKLLESQEKPSLNLIRN
DLECAKTIKDHKELVIYALQKPNNSSQFGIYADVLVMLSQNNAAIVYSDVLNGDSSEDCN
KICHKLKDFIKMYESSIVLHDYKKHIALLKSLKIVDNNYSFNPLLDTRLASYLIEPDFRN
ENIEDMAEHVLNIHVENEKSNEEPAQGELDFVLEDSDNPEELNQEEDKRKNQEKRILETA
ITIRLLAKQYAIKLDERKQTGLMVDVEMPVSRVLRGMEDAGAAVDMNRLVSMRDNFAAEA
QFAQKMALDVANKPINLQSPKQLQQLLFEDMGLKPTRRTKSGSYTTNAEALQELYAKIDP
DEKASQFLGALLKHRETNKLKQIVQSLIDSARYEDGRIHTTFEQTIAATGRLSSSDPNLQ
NIPNRNVVGREIRAAFIPGNQYDQLMSCDYSQVELRIMAHASADETLIKAFKSGVDFHKF
VASLVYKIPVEQVSPDQRSHVKAMSYGLAYGLSTYGLAKQLSISPAAAEVLKEKYFDTFG
GVHDYLESLVDKARKLGYTQTMFGRRRYFPKLNSTNRASRESAERAALNAPIQGSAADIM
KLAMIQVDKDLREAKVKSRVILQIHDELVLEIAHGEADIVENIVKNAMEHTVELDVPLNV
STGLGADWQLAAH
NT seq
3102 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaatgccagcatcgttgcaaacgaggattctttgaataatgaggatgaaaatggaacg
ttgttggtggtagatggccactcacttgcgtttcgtgctttttacgcaatatctgcggat
aatttttcaacaaaatctggttttgcaaccaatgcaatatggggtttttcaacaatgctt
tctcaggttattgaaaaagaaaaaccagataagcttgctgttgcttttgatgttaaaggc
ggaacttttaggaataaacttttgccgcaatataaaggaactcgagaagctgcaccagaa
gagcttctagctcaacttcctgttatacaagaattgctcaatgcattaggtgttaaatat
attacaaaacagggttatgaaggcgacgatattattgcaaccttagccacaatgggcgct
aaagctaaatataagactcttgttctttctggagatcgtgatgcgttccaacttattgat
gaatatataaatgttttgtatccaggcaggcattttaaagatttaaaacaaatggatact
gatgcgattattgaaaaatataatgttacgcctaagcaatattcagatttagcagcgctt
agaggagaaacttctgataatattccaggtgttcctggcgtaggcgatggttatgcagca
aagtggattaatcaattcggtggattagaaggcattatagaacacgcggatcaggtgact
ggcaaaaaaggtgagtctttgcgagaaagcatagatcagattcgtctaaataagaaagta
aatactcttgttaaagatttagatcttggtgttagtattaatgatcttgaatttggaaat
gttgatgccgcgtcagttggcgaattgtttgaaagactcgaatttggtactcgcagtaga
aggaagattttaaaagaatttacgcgtggaagcaaagagcttttagaagagaacattaag
atgatgatttctgctggaagcactcatgctggcagtgatgttagttctacagagtctgat
aattcagatgatttagaggatttcaaaactatagtagataaaataaatattcataaaatt
tattcagaatctgatttagataattggattaatctcgtgtcaccatgtattgagaaaagt
gagtcaaatggatcgtcagaattagttaaagagaatacggaatataaatctaaagcaacc
gtagatttgtttaaattacttgagtctcaagaaaaaccttctttaaatcttataagaaat
gatttagagtgtgcaaaaactattaaagatcacaaagaactagttatatatgcattgcaa
aaaccaaataatagcagtcagtttggtatttatgcagatgtgctagtaatgctatcgcaa
aataatgctgcaattgtatattctgatgttcttaatggggattctagcgaagattgtaat
aaaatctgccacaagctaaaagatttcataaaaatgtatgaatcttcaattgttttgcat
gactacaaaaaacatatagctcttcttaaatcgctgaaaattgtagataataattactct
tttaatccattacttgacactcgtttagcatcttatttgatagaaccagattttcgcaat
gaaaatattgaagatatggcggaacatgttctaaatattcatgtagaaaatgaaaaatct
aatgaagagcctgcacaaggagagcttgattttgttttagaagatagtgataatcctgaa
gagttaaatcaagaagaggataagcgtaaaaatcaagaaaagcgtattttggaaactgct
ataacaataagattgttggcaaagcaatatgctataaaactagatgaacgtaaacaaaca
ggattaatggtcgatgtcgaaatgcctgtttctagggtcttaagaggcatggaagatgca
ggtgctgccgtagatatgaacaggctcgtatctatgagagataattttgcggcagaagct
caatttgcacaaaaaatggctttggacgtagcaaacaagccgataaatttgcaaagtcct
aagcagcttcaacaattgctatttgaggatatgggtttaaagcctacaagaagaacgaaa
agtggatcttatactactaatgcagaagcattgcaagaattatatgcaaaaattgatccg
gatgaaaaagctagtcaattcttaggggctttgctaaaacatcgtgagacaaacaagtta
aagcagattgtacagagtcttattgattctgcaagatatgaagatggcaggattcatacc
acttttgaacaaactattgcagctactgggcgtttaagttcttcggacccaaatttgcaa
aatataccgaataggaatgtggtcggtagggaaattagagctgcttttattccaggaaat
caatacgatcagcttatgagttgtgattattctcaagtagagcttagaattatggctcat
gcttctgcagatgaaacacttattaaagcttttaagtctggtgttgattttcataagttt
gtagcaagcttggtttataagattccagttgaacaagttagcccagatcagagatcgcat
gttaaagcaatgagttacggattggcatatgggcttagtacttatggtttagcaaaacag
ctttctattagtcctgctgctgcagaagttcttaaagaaaagtatttcgatacctttggt
ggcgtgcatgactatttggagtctttagtagataaagctagaaagcttggatatactcaa
acgatgtttggtcgtagaaggtattttcctaagctaaattccacgaatagagcatctcgt
gaatctgcagagcgagcagctttaaatgctcctattcaaggaagtgctgcagatattatg
aagcttgcaatgattcaagtagataaggatttgcgagaagctaaagtaaaaagtcgtgtg
attttgcaaattcacgatgaacttgttctcgaaatagcacatggcgaagcagatattgta
gaaaatattgttaaaaacgctatggaacatactgttgagctagacgttccgcttaatgtg
tctactggattgggagctgactggcagcttgctgctcactga
DBGET
integrated database retrieval system
