Gardnerella vaginalis HMP9231: HMPREF9231_1342
Help
Entry
HMPREF9231_1342 CDS
T01939
Name
(GenBank) FAD dependent oxidoreductase
Organism
gvh
Gardnerella vaginalis HMP9231
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Amino_oxidase
NAD_binding_8
DAO
FAD_oxidored
Pyr_redox_2
FAD_binding_2
FAD_binding_3
Pyr_redox
HI0933_like
Lycopene_cycl
NAD_binding_9
MCRA
Thi4
Trp_halogenase
Pyr_redox_3
GIDA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AEF30826
LinkDB
All DBs
Position
complement(1640659..1642275)
Genome browser
AA seq
538 aa
AA seq
DB search
MTDTQSQKQSVVIIGGGPAGLTAAWELVKDGGASRYDVTVLEASKEFGGISRTVKYNGNR
MDIGGHRFFSKDDRIMQWWRDMLPLQGAPSYDDKKLGRHHDLENGGPDPEVEDEVMLKRH
RVSRIFWNHHFFDYPISLSASTLRSMGFVLTMKVGFSYLWSMIHKLPETNLENFYINRFG
KKLYSMFFEGYTEKLWGRHPSQISADWGAQRVKGLSIVEVLKNAFSKLMPKKKANQEVET
SLIEEFWYPKLGPGQLWETVERRCRENGATVLTDAKVVAIKQCDGKISSVVVENQDGLQQ
ELHADQFISSMPIKDLVAAIEHGAEGNESVQVPAELQRVAKGLPYRDFVTVGLLVKRMRL
RNTTDIPTLGNPPIVPDCWIYVQDPGYKVGRLQIFNNWSPYLVKDVDNTVWIGLEYFCNE
GDDFWNMSDEEARKSAIDELTRMQVIDGEDDVLDAHRERVPKAYPAYFDTYAQMPELVKY
LDGFGNLYCVGRNGQHRYNNQDHSMATAIEAVSNINSGKQSKDNVWSVNTEKSYHEKK
NT seq
1617 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgactgatacacaatcccagaaacaatctgtagtgattattggtggcggtccggcaggg
ttgacggctgcatgggagcttgtaaaagatggcggagctagccgctacgatgtaactgtt
cttgaagcatctaaagagtttggcggaatttctcgcactgtaaaatacaacggaaaccgc
atggatattggcggtcaccgattcttctctaaagatgatcgaattatgcaatggtggcga
gatatgctgccactccaaggcgctccttcttacgacgacaaaaaacttggcagacaccac
gatttagagaatggcggcccagacccagaagtcgaagatgaggttatgcttaagcgtcat
cgcgtttctagaatcttctggaatcatcatttcttcgactaccctatctctctttctgcg
tctactttgcgctctatgggctttgttcttactatgaaggttggttttagctacctttgg
tctatgattcacaagttgccagaaactaatcttgagaacttttacattaaccgtttcggt
aagaaactttattcaatgttctttgagggctataccgagaagctttggggtaggcatcca
agtcagatttctgcagattggggtgctcagcgagttaagggtttgagcattgttgaagtt
ttaaagaatgctttctctaagcttatgccgaaaaagaaggcaaatcaggaagttgaaact
tcactgattgaagaattctggtatcctaagcttggtcctggtcagctttgggagactgtt
gaacgtcgttgccgtgaaaatggcgctactgttttaacagatgcaaaagttgttgctatt
aaacagtgcgacggtaaaatttctagtgttgtcgttgaaaatcaagatggtttgcagcaa
gaacttcatgcggatcagtttatttcttctatgccaataaaagatttggttgcagctatt
gagcatggcgccgaaggaaatgagtctgtgcaggttccagccgaattacaacgagttgct
aaaggcttgccttaccgtgatttcgtaaccgttggacttcttgttaagcgtatgcgtttg
cgtaatacgactgatattccaacgttaggtaaccctcctattgtgcctgattgctggatt
tatgtgcaggatccaggatacaaagttggtcgtttgcaaatctttaacaactggagccca
tatctcgttaaggatgttgacaacactgtgtggattggtcttgaatacttctgcaatgag
ggcgatgatttttggaatatgagcgacgaagaggctcgtaaatctgcgattgatgagctt
actcgtatgcaggttattgatggcgaagatgatgttttggatgcgcatcgtgagcgtgtt
ccaaaggcttatccagcttacttcgatacttatgctcagatgcctgagcttgttaagtat
ttggatggttttggtaacttgtattgtgttggtagaaatggtcagcatcgttacaataat
caggatcattctatggctactgctattgaagccgtgtctaatattaacagtggaaaacag
tctaaagataatgtttggtctgttaatacagaaaagtcatatcacgaaaagaagtag
DBGET
integrated database retrieval system
