Paenibacillus sp. Y412MC10: GYMC10_4225
Help
Entry
GYMC10_4225 CDS
T01100
Name
(GenBank) collagen triple helix repeat protein
Organism
gym
Paenibacillus sp. Y412MC10
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Collagen
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACX66451
UniProt:
D3E6X8
LinkDB
All DBs
Position
complement(4811237..4813540)
Genome browser
AA seq
767 aa
AA seq
DB search
MIGATGVTGTTGETGATGVTGATGATGETGVTGATGATGAIGVTGATGTTGATGATGATG
VTGETGATGVTGATGETGATGITGATGATGVTGATGVTGATGVTGATGETGATGAAGVTG
ATGVTGATGSTGATGETGATGATGATGATGVTGATGDTGATGVTGATGAAGVTGATGATG
VTGATGATGVTGATGDTGATGVTGATGAVGVTGATGATGVTGATGATGVTGATGATGVTG
ATGVTGETGATGATGATGEAGATGVTGETGATGATGVMGVTGATGATGATGATGATGATG
VTGATGATGATGATGVTGATGATGATGITGATGATGATGATGVIGATGATGTTGETGATG
VTGATGATGETGVTGATGATGAIGVTGATGTTGATGATGATGVTGETGATGVTGATGETG
ATGITGATGATGVTGATGVTGATGVTGATGETGATGAAGVTGATGVTGATGTTGATGATG
ATGVTGATGATGATGITGATGATGATGATGVIGATGVTGTTGETGATGVTGATGATGETG
VTGATGATGAIGVTGATGTTGATGATGATGVTGETGATGVTGATGETGATGITGATGATG
VTGATGVTGATGVTGATGETGATGAAGVTGATGVTGATGTTGATGATGATGVTGATGATG
ATGITGATGATGATGATGVIGATGATGTTGETGATGVTGATGATGETGVTGATGATGAIG
VTGATGTTGETGVTGATGATGTTGAATGATGVRGNRSNRINSNRSYR
NT seq
2304 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgataggagctacgggagtaacaggtaccactggagagactggagcaactggggtaaca
ggagctacgggagcgacaggagaaacgggtgtaacaggagcaactggggcaacaggagca
attggggtaacaggagcaaccggaacaacaggagcaacgggggccacaggagcaacagga
gtaaccggagaaacaggggcaaccggggtaacaggagcgaccggagagacaggagcaacg
ggcatcaccggagcaaccggagcaacaggggtaacaggagcaactggggtaactggagcg
actggagtaacaggagcaacaggagaaactggagcaacaggagcagccggggtaacagga
gcaacaggggtaacaggagcaaccggatcaacaggagctacaggtgaaacgggagcaaca
ggagcaacaggggcaacaggagctacgggggtaacaggggcaactggagatactggagca
acaggggtaacaggagctactggagcggcaggagtaacgggagctacaggagctacgggg
gtaacaggggcaacaggagctacgggggtaacaggggcaactggagatactggagcaaca
ggggtaacaggagctactggagcggtaggagtaacgggagctacaggagcaacgggggta
acaggagcaacaggagcaacgggggtaacaggagcaacaggagcaacaggagtaacagga
gcgacaggtgtaacgggtgaaacgggtgcaacgggagcgacaggagcaacaggagaagcg
ggagcaacaggagtaacaggagaaacgggtgcaacaggagcaacaggggtaatgggagta
acaggagcaacaggagctacgggagcgacaggagctaccggagcaacaggagcaaccgga
gtaacaggagcaacaggagcaacgggagcaacgggagcaacaggagtaactggtgcaaca
ggagcaacgggagcaacaggaataactggtgcaaccggagcaacaggagccacgggtgca
acgggagtgataggagctacgggagcaacaggtaccactggagagactggagcaactggg
gtaacaggagctacgggagcgacaggagaaacgggtgtaacaggagcaactggggcaaca
ggagcaattggggtaacaggagcaaccggaacaacaggagcaacgggggccacaggagca
acaggagtaaccggagaaacaggggcaaccggggtaacaggagcgaccggagagacagga
gcaacggggataaccggagcaaccggagcaacaggggtaacaggagcaactggggtaact
ggagcgactggagtaacaggggcaacaggagaaactggggcaacaggagcagccggggta
acaggagcaaccggggtaacaggagcaaccggaacaacaggagcaacgggagccacggga
gcaacaggagtaactggtgcaacaggagcaacgggagcaacaggaataactggtgcaacc
ggagcaacaggagccacgggtgcaacgggagtgataggagctacgggagtaacaggtacc
actggagagactggagcaactggggtaacaggagctacgggagcgacaggagaaacgggt
gtaacaggagcaactggggcaacaggagcaattggggtaacaggagcaaccggaacaaca
ggagcaacgggggccacaggagcaacaggagtaaccggagaaacaggggcaaccggggta
acaggagcgaccggagagacaggagcaacggggataaccggagcaaccggagcaacaggg
gtaacaggagcaactggggtaactggagcgactggagtaacaggagcaacaggagaaact
ggggcaacaggagcagccggggtaacaggagcaaccggggtaacaggagcaaccggaaca
acaggagcaacgggagccacgggagcaacaggagtaactggtgcaacaggagcaacggga
gcaacaggaataactggtgcaaccggagcaacaggagccacgggtgcaacgggagtgata
ggagctacgggagcaacaggtaccactggagagactggagcaactggggtaacaggagct
acgggagcgacaggagaaacgggtgtaacaggagcaactggggcaacaggagcaattggg
gtaacaggtgcaacgggaacaacaggagaaacgggagtaacaggtgcaacgggagctaca
ggcacaacgggtgcagcaacgggagcaacaggggtaaggggtaacaggagcaaccggatc
aacagcaacaggagctacaggtga
DBGET
integrated database retrieval system
