Haliovirga abyssi: HLVA_04400
Help
Entry
HLVA_04400 CDS
T09313
Name
(GenBank) xylose ABC transporter permease
KO
K10544
D-xylose transport system permease protein
Organism
haby
Haliovirga abyssi
Pathway
haby02010
ABC transporters
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
haby00001
]
09130 Environmental Information Processing
09131 Membrane transport
02010 ABC transporters
HLVA_04400
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
haby02000
]
HLVA_04400
Transporters [BR:
haby02000
]
ABC transporters, prokaryotic type
Saccharide, polyol, and lipid transporters
D-Xylose transporter
HLVA_04400
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
BPD_transp_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU49871
UniProt:
A0AAU9D1K1
LinkDB
All DBs
Position
520190..521302
Genome browser
AA seq
370 aa
AA seq
DB search
MKKFLKSNATLIALLVMWVILAGISDVFFTPRNLSNLTLQVTTIGIIAVGMTMVILLGGI
DLSVGSLVGLSAIIVTLLMHHGVNVWLAIIIDILIVGVLVGLWNGFWIAKYKMPPFIVTL
AMMTVARGTAMVLSNGSSVPVTDSVFPLIGGAFISKSLSSILLLIGVVFAIYGIMNGVKQ
KKKYNIKVNNGEIIYNIVLTILGFGFAFMVFEGYKGIPFAVAIFIAVVFAGVFILRKTKF
GRNIYATGGNEEAARLSGINIFGVNLSVYTLIAILSAISGIILASRLNGASPNLGTMFEL
DAIASVAIGGTSLSGGSGTITGTIIGTLIIGTLNNGMSLMGISSFYQLIVKGLIILLAVW
FDVASKKKKA
NT seq
1113 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaatttttaaaaagtaatgcaactttaatagctttgttagtgatgtgggtgatt
ttagcaggaatatcagatgtattttttacaccaagaaatttaagtaacttgacactacaa
gtaacaactatagggataatagcagttgggatgacaatggtaatattattaggaggtatt
gatttatcggttggatctttagttggattatcagcgataatagttaccttattaatgcat
catggagttaatgtatggttagcaataataattgatattttaatagttggagtattagta
gggctttggaatggattttggattgcaaaatataaaatgccgccatttatagtaacactt
gccatgatgacagtagcaagaggaactgcaatggtgttatcaaatggaagttctgtacca
gtaactgattcagtttttccattaattggaggagcatttatttcaaaatctttatcaagt
attttattattaataggagtagtgtttgcaatatatgggattatgaatggtgttaagcaa
aaaaagaaatacaatataaaggttaataatggagaaattatatataatatagttttaaca
atattaggatttggatttgcatttatggtatttgagggatataaaggtataccttttgca
gttgcgatatttatagcagtagtctttgcaggagtgtttatattaagaaaaacaaaattt
ggaagaaatatttatgctactggtggaaatgaagaagctgctagattatcaggaattaat
atatttggagttaatttaagtgtatatacattaatagctatactatcagctatatcagga
ataatattagcttctagacttaatggagcatctccaaatttgggaactatgtttgagcta
gatgccatagcatcagttgcaattggaggtacaagtttaagtggtggttctggaacaatt
acaggaacaataataggaacacttataataggaacattaaataatggaatgagtttaatg
ggaataagttcattttatcaattaattgtaaaaggattaataatcttattagcagtttgg
tttgatgtagcaagtaaaaagaaaaaagcgtaa
DBGET
integrated database retrieval system