Haliovirga abyssi: HLVA_13220
Help
Entry
HLVA_13220 CDS
T09313
Name
(GenBank) DNA polymerase I
Organism
haby
Haliovirga abyssi
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DNA_pol_A
5_3_exonuc_N
5_3_exonuc
HHH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
BDU50753
UniProt:
A0AAU9DEY2
LinkDB
All DBs
Position
complement(1514867..1517509)
Genome browser
AA seq
880 aa
AA seq
DB search
MKKAVLIDVSAVMYKAYYSLINMRNSNGEPTGAAYGFTNTLLSIIDKFKPDYIAACFDVR
REQLKRREMYEGYKKQRKAAPEELIAQISKIEEILDGFNIKKFKVIGYEADDLLGTLSKN
LAENNIKTYIVTGDKDLSQLLSENRKISLLGKGVGKFRVLETDDDVVEQLGVLPSQIPDL
FGLQGDSSDGIPGVRGVGPKTAVKFISEYGDLETLYENIDKTKGKMREKLEQDKELAFLS
RKLAIIDENVPVEVDVEKLEFKKLDNDRLYKIFNELEFKSLLKKLKIEAGEATIEENKKE
INNENLIEFKKEDIIIIDNNEKLRDIEFADEIALLFNGAGVAISSNEKLYYISLYHNYLG
ATNCDEMLLKEKIEKCNVIGYSLKNLIKKEYIKEKNYFDIMIAYYILDSDSKYDLENILN
SKFGIQLANYKETFGKEVIEKIDINRATEFYCKRVLYFENLKKSFEEELKQEELYDLFIN
IELPLVKVLAKMEKYGIKIDIKYFEKYSKELYGKLVKLEEEIYEMANEEFNINSPKQLSE
ILFIKMGINPVKKTKTGFSTNVEVLETLKNRGIEIADKLLQYRQYKKLQTTYVEALPKLV
DKNDRIHTTFNQTGTTTGRLSSVNPNLQNIPVKTSEGIKIRYGFLAEEGYSLVASDYSQV
ELRVLAELSKDKNLIEAYSKDLDLHDLTARKILGKDETEEITRAERGIAKIVNFSIIYGK
TPFGLSKEIGITVGEAKTYIDKYFETYENVKKFIDDTVEFAKENGYVKTRFGRKRRIIGI
NSKNKNIKNQAERMAVNSVVQGTAADVLKIVMIKLYAELKDKKDIKMLLQVHDELVFSIE
NSKIEEYSKLIKDVMENSINFENIKLITNINSGKRWSETK
NT seq
2643 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaaaagcagtattaatagatgtaagtgctgtaatgtacaaagcgtattattcattg
ataaatatgaggaattcaaatggagagccaactggagcagcatatggttttacaaataca
ctgctaagtataattgataaatttaaacctgattatattgcagcttgttttgatgtaaga
agagagcaattaaaaagacgagagatgtatgaaggatataaaaagcaaaggaaagctgca
ccagaagaattgatagcacaaatttcaaaaatagaagagattttagatggatttaatata
aaaaagtttaaagttattggatatgaagctgatgatctattggggacattatctaaaaat
ttagctgaaaacaatataaaaacttatattgttacaggagataaagatttatcacaactt
ttatctgaaaatagaaaaatatcacttcttggaaaaggtgttgggaaatttagggtttta
gaaacagatgatgatgttgtggaacaattgggagtattaccaagccagataccagacctt
tttggattgcaaggagatagttcagatggaattccaggagtaagaggagtggggcctaaa
acagcagtaaaatttatatctgaatatggagatttagaaacattatatgaaaatatagat
aaaactaaaggtaaaatgagagaaaaattagaacaagataaagaattagcatttttaagt
agaaaattagcaattatagatgaaaacgttccagtagaagtggatgttgaaaaactggaa
ttcaaaaaacttgataatgacagattatataaaatttttaatgagttagagtttaaatca
cttttgaaaaaattaaaaattgaagctggtgaagcaacaatagaagaaaataaaaaagaa
attaataatgaaaatttaattgaatttaagaaagaagatataataattatagataataat
gaaaaattaagagatattgaatttgcagatgaaatagccttgttatttaatggtgcaggg
gttgcaatatctagtaatgaaaaattatattatatttcgctttatcataattatttagga
gcaaccaattgtgatgagatgttattaaaagaaaaaattgaaaagtgtaatgttattggt
tatagtcttaaaaatttaataaaaaaagagtatataaaagagaaaaactattttgatatt
atgattgcatattatattttggattcagatagtaagtatgatttggaaaatattttaaat
agtaaatttggaatacaattagccaattataaagagacatttggaaaagaagttatagaa
aaaattgatataaatagagcaactgaattttattgcaagagagttttatattttgaaaat
ttaaaaaaaagttttgaagaggaactaaaacaagaagaactatatgatctttttataaat
atagaattgccattagtaaaagttttagcaaaaatggaaaaatatggaataaaaattgat
attaaatattttgaaaaatatagtaaagaattatacggaaaattagttaaattagaagaa
gaaatttatgaaatggcaaatgaagagtttaatattaattctccaaaacaattatcggaa
atactgtttataaaaatggggattaacccagttaaaaaaactaaaacaggtttttctaca
aatgtagaagttttggaaactttaaaaaatagagggattgaaatagcagataaactatta
caatataggcaatataaaaaattgcaaacaacttatgtggaagctttacctaaattagtt
gataaaaatgatagaatacacactacatttaatcaaactggtacaacaacaggtagatta
tcttctgtgaatccaaatttacaaaatataccagtaaaaacatcagaaggtataaaaata
agatatggatttcttgcagaagaaggatatagtttagtggcttcagattattcacaagtg
gaattaagagttttagcggaattaagtaaagataaaaatttaatagaagcttattctaaa
gatttggatttgcatgatttaacagcacgaaaaattttaggtaaagatgaaacagaagag
attacaagggcagaaagaggtattgcaaaaatagtaaattttagtataatttatggtaaa
actccatttggattatcaaaagagataggaattacagttggagaagctaaaacttatatt
gataaatattttgaaacttacgaaaatgtgaaaaagtttatagatgatacagtagaattt
gcaaaagaaaatggatatgtaaaaacacgttttggaagaaaaagaagaattataggaata
aatagtaaaaataaaaatataaaaaatcaagctgaaagaatggctgttaatagtgtagta
caagggacagcagctgatgtattaaaaattgtaatgataaaattatacgctgaattaaaa
gataaaaaagatataaaaatgcttttacaagtacatgatgaacttgtatttagtatagaa
aatagtaaaatagaggaatattcaaaattaataaaagatgtaatggagaatagtataaat
tttgagaatataaaattaataactaatataaatagtgggaaaaggtggagtgaaacaaaa
taa
DBGET
integrated database retrieval system