Hemitrygon akajei (red stingray): 140739939
Help
Entry
140739939 CDS
T11019
Symbol
fbn2b
Name
(RefSeq) fibrillin-2b isoform X1
KO
K23342
fibrillin 2/3
Organism
haka Hemitrygon akajei (red stingray)
Pathway
haka04820
Cytoskeleton in muscle cells
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
haka00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
04820 Cytoskeleton in muscle cells
140739939 (fbn2b)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
00536 Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
haka00536
]
140739939 (fbn2b)
Glycosaminoglycan binding proteins [BR:
haka00536
]
Heparan sulfate / Heparin
Extracellular matrix molecules
140739939 (fbn2b)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
EGF_CA
cEGF
EGF
FXa_inhibition
TB
hEGF
EGF_3
Plasmod_Pvs28
Fibrillin_U_N
EGF_FBN_1st
EGF_Teneurin
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
140739939
NCBI-ProteinID:
XP_072924732
LinkDB
All DBs
Position
16:32244134..32513818
Genome browser
AA seq
2894 aa
AA seq
DB search
MRVRWIAKFVLGCTVLISLSTEEARIQRSGDFRAARFAGAGDRDSQSRVRRRGQDNLRGP
NVCGSRFHSYCCPGWKTLPGGNQCIVPICRNTCGDGFCSRPNMCTCSNGQLSPGCGSGSV
QQCNVRCMNGGSCSDDSCVCQKGYTGTHCGQPVCKNGCQNGGRCIGPSRCACVYGFTGPQ
CERDYRTGPCFTQVNNQMCQGQLSGIVCTKTLCCATIGRAWGHPCEMCPAQPHPCRRGFI
PNIRSGACQDVDECQAIPGLCQGGNCINTVGSYECKCPAGHKQNENNQKCEDIDECSTIS
GVCDGGECSNTVGSYVCNCPRGFITSLDGSRCIDQRSGTCFNSLLGGRCAGELHGHYTKM
QCCCDSGRCWAAGHTPEMCPVRGSDEYRRLCIEGLPFGPAYPGLGYPGFPAAVGPGVSGP
GGIGPGVFGPGGVDPGGIRPGVVRPGGMGPIGIGPAFSGLPGTGPAIGTATLNQTTDVCK
HYTNLCLNGRCIPTPSSYRCECNMGFKQDVRGECIDVDECFSSPCVNSDCFNTPGGYHCK
CHEGFQSTATKQSCIDIDECIQNGVLCRNARCVNTDGSFQCICNAGFELTEDGKNCMDHD
ECATTNMCLNGMCINEDGSFKCICKNGFVLAPNGRYCVDIDECQTPGICMNGRCINSEGS
FRCECPPGLAIGVDGRVCVDTHMRSTCYGAIKKGTCARPFPGAVTKSECCCASPDHGFGE
PCQPCPARTSAEFQALCSSGIGITADGRDINECALDPDICANGICENLRGSYRCICNIGY
QSDVSGKNCVDIDECSVNMLLCDNGLCRNTPGSYTCTCPTGYIFKPDTETCEDVNECESS
PCVNGYCRNMAGSFICECSLGSKLDPTRTICIDSMKGTCWLNIQGGRCEVNINGATLKSQ
CCATLGAAWGSPCEHCELDPSCPRGYARVKGVTCEDVNECDVFPGVCTNGRCVNTQGSFK
CECSEGLTLDGTGRTCVDVRLEHCYLKWEEDECTEPVGGRFRIDACCCSIGHAWGADCEE
CPQPGTPEYEAICPRGPGFANRGDVLTGRPFYKDINECKVFSSLCTYGTCRNTIGSFKCR
CENGFALNMEERNCTDINECRISPDLCGHGTCVNTPGSFECECFDGYESGFMMMKTCMDI
DECERDPLLCRGGTCVNTDGSYECICPPGHELTSEGDGCVDIDECSLSDNLCKNGRCVNM
IGTYQCACDSGYQSTSDRQGCVDIDECTIMNGGCDTHCTNSEGSYECSCSEGYALMPDKR
TCADIDECEENPDICEGGQCTNIPGEYRCLCYDGFMASMDMRTCLDVNECELNPNICLHG
DCENTKGSFICHCQLGYFVKKGTTGCTDIDECEIGAHNCDMHASCVNVPGSFKCKCRDGW
IGDGLECIDLDECATEEHQCNPSANCMNTPGSYRCACKDGFSGDGFSCSDVDECAENVNL
CENGQCLNAPGGYRCECEMGFTPTEDSKACQDIDECTFQNICVFGTCQNLPGMFRCVCDD
GYELDRSGGNCTDINECADPVNCINGLCVNTPGGYLCNCPTDFELNPTGVGCVDTRVGNC
FLETLARGDGGISCSAEIGVGVTRASCCCSLGRAWGNPCEFCPPVNSTEYKTLCPGGEGF
RPNPITVILEDIDECQELPGLCQGGNCVNTFGSFQCECPAGYYLNEDTRICEDIDECTTH
IGICGPGTCYNTLGNYTCVCPPEYMQVNGGNNCMDMRKSVCYRNFNDTCENELSFNMTKK
MCCCSYNVGKGWNKPCEPCPTPATSQYQLLCGNQAPGFIIDIHTGKPVDIDECREIPGIC
ANGVCINQIGNFRCECPMGFSYNNVFLICEDIDECTNGDNLCQRNADCINIPGSYRCECS
PGFKLSLSGACVDRNECQEIPNVCSHGECIDTEGSYRCLCHNGFKATADQTMCMDIDECD
RQPCGNGTCKNTVGSYNCLCFPGFDLTHNNDCMDIDECSTLIGQVCRNGQCINSIGSFQC
LCQDGYDLPPDGKNCVDINECISYPGTCAPGTCQNLDGSFRCICPPGYEVQNDHCIDINE
CEEDPNICLFGFCTNTPGSFQCNCANGFVLSENGRRCFDTRQSFCFTRFDNGKCSVPKAF
NTTKARCCCSKMPGEGWGDPCELCPQEEEVAFQELCPYGHGAIPGIGDTREDVNECVENP
GICVNGHCINTDGSFRCECPLGYNLDFTGVNCVDIVECSIGNPCGNGTCINVIGAFECEC
DDGFEPGPMATCEDINECSLNPLLCAFRCINTYGSYECTCPGGYTLRDDRKMCRDLDECL
EGLHDCESQGMMCKNLIGTFMCICPPGMMRRPDGEGCMDENECRTKPGICKNGRCINTVG
SYQCDCNEGFLENPSATECLDNRQGFCFIEVLQTMCQMSSTNRNLVTKSECCCNGGRGWG
NQCELCPLPGTAQYKKMCPHGPGYATDGRDIDECRVMPNLCKNGQCINTMGSFRCFCTKG
YTTDLTATSCIDHDECAQSPKPCNFICKNTEGSYQCSCPRGYILQENGKTCRDLDECSTK
QHNCQFLCVNTIGSFTCKCPPGFTQHHTSCIDNNECMSQSPVCGSKGTCQNTPGSFSCDC
QKGFLLDETGLNCEDVDECDGNHRCQHGCQNMLGGYRCSCPQGYMQHYQWNQCVDENECS
NPSACGAASCYNTLGSYKCLCPSGFDFDQYVGGCQDVNECSSSGNPCSYGCSNTEGGYLC
GCPGGYFRVGQGHCISGMGFGNGHYLPVDEEEVAEENMLSPETCYECKINGYPKRGRHRR
STNGTESPEQKHKISLASLDIDVPIPLNVNISEMGVHDHIMEFLPAIEPLENHVRYFITG
GNEASFFRIHQKNGLSYLHLSRKKAIRGKYTLEVSSMPLYRKKELLKLEDENDIDYLVGD
IGEALRMKLQIHLL
NT seq
8685 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagggtacggtggatagccaagtttgtgctgggatgtacggttctcatctctctctcc
acggaagaggcgcggatccaacgaagcggcgactttagagcggcaagattcgctggagcc
ggggacagagactcacaatcccgggtcaggagacgaggtcaagacaacctaagaggacct
aatgtatgcggatctcgatttcactcctattgctgtcctggatggaaaacattacctggt
ggtaaccaatgtattgtgcccatttgtcgcaacacttgcggtgatggtttctgctccaga
ccaaatatgtgcacttgctccaacgggcagctctctccagggtgtggatctggctctgtt
cagcaatgcaatgtcaggtgcatgaatggtggctcttgctcagacgacagctgtgtttgc
cagaaaggatatactggaacgcattgtggtcagcctgtgtgcaaaaatggctgccagaat
ggaggacgttgcattggaccaagtcgctgtgcgtgtgtgtatgggttcactggaccacag
tgtgaacgagattaccgaactggaccatgcttcacacaggtcaataaccaaatgtgccaa
ggacagctaagtggcattgtctgcaccaagactctctgctgtgccaccattggtcgagct
tggggccatccttgtgagatgtgccctgcacagcctcatccctgtcgccgtggtttcatc
cccaatattcgaagtggtgcctgtcaagatgtggatgaatgtcaggcaatcccaggtctc
tgccagggaggaaactgcatcaacacggtgggatcctatgaatgcaaatgtcctgctgga
cacaaacagaatgagaacaaccagaaatgtgaagatattgatgaatgcagcacaatttct
ggagtgtgtgatggcggtgaatgctcaaatactgttgggagctacgtctgtaactgccca
cgtggatttatcacaagcctggatggctccaggtgtattgaccagagatctggcacctgc
ttcaacagcctgctgggtggtcgatgcgcaggagaacttcacggacattataccaagatg
cagtgctgctgtgactcagggcgatgctgggcagcaggccacactccagagatgtgtcct
gtcaggggctctgatgagtatcggagactctgcattgaaggccttcccttcggacctgct
taccctggcttaggatatccaggctttcctgctgcagttggaccaggtgtgagcgggcct
ggtggaattggccctggtgtatttggccctggtggagtcgatcctggtggaattagacct
ggtgtggtcaggcctggtggaatggggccaattggaattggaccagctttttcaggcctt
cctggaactggaccagcgattggtacggccaccttgaatcagaccactgatgtctgtaaa
cactacaccaacctgtgcctgaatggacgttgtattccaactccatccagttaccgctgc
gaatgtaacatgggtttcaagcaggatgtacgtggggagtgtattgatgtcgatgaatgc
ttcagcagtccgtgtgtgaatagtgactgttttaatactcctggtggctaccactgcaag
tgtcatgagggtttccagagtactgctacaaagcagtcctgcattgatatagacgagtgt
atccaaaatggagttctgtgtcggaacgcccgatgtgttaacactgatggaagtttccaa
tgtatctgcaatgctgggtttgaactcaccgaagatggaaagaactgtatggatcacgat
gaatgtgccactaccaacatgtgtctgaatggaatgtgtatcaacgaagatggtagcttc
aagtgtatctgcaagaatggctttgtcttagctccaaatgggcgttactgtgtggatatt
gatgaatgtcagacacctggtatctgcatgaatgggcgctgtattaattcagaaggttca
ttcaggtgcgaatgtcctccaggtttagccattggagtggatggacgtgtgtgcgttgat
actcacatgcgcagcacttgctatggagccatcaagaagggaacctgtgcccgacccttt
cctggagctgttaccaaatcggaatgctgttgtgccagcccagaccatggttttggagag
ccctgtcagccctgtccagccaggacctctgctgaattccaggctctttgtagcagtggc
attgggatcacagcggatggacgagatatcaatgagtgtgctcttgatcctgatatctgt
gccaatgggatttgtgagaacctgcgcggcagttaccgctgtatttgtaatatcgggtat
cagtcagacgtcagtggcaagaactgtgttgacattgatgaatgttctgtcaacatgctg
ctgtgtgacaatggactgtgccgtaacactccaggcagttacacgtgcacctgccctact
ggttacatctttaaacctgatactgaaacctgtgaagatgtgaacgaatgtgaatccagc
ccatgtgtgaatggttactgcaggaacatggccggctcattcatctgtgaatgttcactt
ggcagcaaactggacccaaccagaaccatctgtattgacagcatgaaggggacgtgttgg
ctgaacattcagggcggtcgctgcgaagtgaacatcaacggagccacgctgaagtcgcag
tgctgtgccaccttgggagctgcctggggcagcccctgtgaacactgcgagctggatcca
tcttgtcccagaggctatgcaagagtgaagggtgttacttgtgaagatgtgaacgagtgt
gacgtgttccctggcgtttgcacaaatggacgttgtgtaaacacacagggctccttcaag
tgtgaatgttccgaagggctgactctagatggaactgggagaacatgtgtcgatgttcgc
ttggagcattgctacctgaagtgggaagaggacgaatgcacagagccagtgggtggccgc
ttccgcattgatgcttgctgctgctcgatcggccatgcgtggggagcagactgtgaggag
tgcccacagcctggcacaccggaatatgaggccatttgccctaggggaccaggttttgcc
aacaggggtgatgttttgacagggaggccattctataaagatatcaacgaatgtaaggta
ttctccagcctgtgcacatatggaacatgtcgtaacacaattggcagctttaagtgtcgc
tgtgagaatggctttgccctaaacatggaggagaggaattgtacagatatcaacgaatgt
cgcatttcaccagatctctgtgggcatggtacctgtgtgaacacaccaggcagtttcgaa
tgcgagtgttttgatggatatgaaagtggttttatgatgatgaaaacctgtatggacatc
gacgagtgtgagagagaccctttgctgtgtcggggcggaacttgtgtgaacacagatggc
agctatgaatgcatctgccccccaggtcatgagttgacctctgagggtgatggctgtgtg
gatatcgatgaatgctctctgagtgacaacctgtgcaagaatgggcgctgtgtgaacatg
attgggacctaccaatgtgcctgtgactcaggttatcagtccaccagtgacagacagggc
tgtgtggatattgatgaatgcaccattatgaacggaggatgtgatacacattgcacaaac
tcagaaggaagctatgagtgcagctgtagcgaaggttacgctctgatgcctgataagaga
acgtgtgcagatattgatgaatgtgaggagaatcctgatatttgtgaaggtgggcaatgt
accaacatccctggagaatatcgctgcctctgctatgacggattcatggcttccatggac
atgaggacttgtctggatgttaatgagtgtgagctgaatccaaatatctgtctccatggt
gactgtgagaacaccaaaggctctttcatctgccattgccagctgggatactttgtgaag
aaaggaactacaggatgcacagatattgacgaatgtgaaattggagctcacaactgcgac
atgcacgcctcctgtgtgaacgtgccagggagcttcaagtgcaaatgtcgtgatggatgg
atcggagatggtcttgagtgcatcgatttggatgagtgtgcgaccgaagagcaccaatgc
aaccccagcgccaactgcatgaacacgccaggctcataccgctgtgcctgcaaagatggc
ttcagtggggatggcttcagctgctcagatgttgacgagtgtgcagaaaacgtgaatcta
tgcgagaacggccaatgtctgaatgctcctgggggataccgctgtgaatgtgaaatggga
ttcacgccaacagaagacagcaaggcttgtcaagatattgatgaatgcacctttcagaac
atttgtgtttttggcacttgccagaacctacctggaatgttccgttgtgtttgtgatgat
ggctacgagctggacagaagtggtggcaattgcacagatatcaatgaatgtgccgatcca
gtcaactgtatcaatggcctttgtgtgaacacccccggcggctacctgtgtaactgcccc
acagatttcgagctgaaccccacaggggttggttgtgtggacacgcgagttggtaattgc
ttcctggagacattggcaaggggagacggtggcatttcatgcagtgcagagattggtgtt
ggcgtcactcgggcctcgtgttgctgttccttgggaagagcttggggaaacccctgtgaa
ttctgccctcctgtcaactcgactgagtacaagacgctctgtccgggcggagaaggtttc
agaccaaaccccatcactgtcatcctagaggatattgatgagtgtcaggaactaccaggc
ctgtgccaaggtggaaattgtgtcaacacatttggaagcttccagtgtgagtgcccagct
ggttactacctgaacgaggatacccgtatttgtgaagatattgatgagtgcaccacccac
attgggatctgtgggcctggaacatgctacaataccttgggcaactatacctgcgtctgc
cctccagagtacatgcaggtcaatggaggaaataactgtatggatatgaggaagagtgtc
tgctaccgcaacttcaatgacacatgtgagaacgagctctcattcaacatgaccaagaag
atgtgctgctgttcctacaatgtgggcaaaggctggaacaaaccttgtgaaccctgtccc
accccagccacatctcaataccagctcctttgtgggaatcaggctccaggtttcatcatt
gacattcacaccggcaagccagttgatattgatgagtgtcgggaaataccaggcatttgt
gcaaatggtgtctgtattaaccagattggaaacttccgctgtgagtgcccaatgggattt
agctacaacaacgtgttcctgatctgtgaagatatcgatgagtgcaccaatggggataac
ctatgccagaggaatgcagactgcatcaacatcccaggcagttaccgctgcgaatgctcc
ccaggctttaagttgtcgcttagtggagcctgtgtggatcgtaatgaatgccaggagatc
ccaaatgtctgcagccacggagaatgcatcgatactgaaggaagttatcggtgtctttgc
cacaatggtttcaaagcaacagctgaccagacaatgtgcatggatattgacgagtgtgat
cggcagccctgtggaaatggaacctgcaagaacacagttggatcctacaactgcctctgc
ttccctggatttgacctcactcacaacaatgactgtatggatattgatgagtgctcaact
ctgattggccaggtctgtagaaatggacagtgcataaacagcattggatcgttccagtgc
ttgtgtcaggatggctatgacctgccacccgatgggaagaattgcgttgatatcaatgaa
tgtatcagttaccccggcacctgtgctcctgggacctgccagaatttagatggttccttc
cggtgtatctgcccacctggatatgaagtacagaatgaccactgcattgatattaacgag
tgtgaggaggaccccaacatctgcctgtttggtttctgcaccaatacacctggaagcttc
cagtgtaactgcgcaaatggatttgtcctctccgagaatggaaggaggtgctttgatacc
agacagagcttctgcttcaccaggtttgataacggcaagtgttcggttcccaaggcattc
aacacgaccaaagcccgctgctgctgcagtaagatgccaggagagggctggggtgacccg
tgtgaactttgtcctcaggaagaagaagttgcttttcaggagctgtgcccatatggtcat
ggtgccatcccaggcattggggatacccgcgaagatgtgaatgagtgtgtagagaatcct
ggtatctgcgtgaatggacattgtataaacaccgatggttccttccgatgtgagtgtccc
ctaggatataacctggatttcaccggagtgaactgtgttgatattgtcgaatgcagcatc
ggtaacccctgtggtaatggtacctgcattaatgtcattggggcgtttgagtgcgaatgt
gatgatggatttgaacctggaccaatggccacttgtgaagatatcaacgaatgttctctc
aatcctctgctgtgtgcattccgctgcatcaacacctatggttcctatgaatgcacctgt
cctggaggttatactctgagggatgaccgcaagatgtgtagagatttggatgaatgcttg
gaaggattacatgactgtgagtcccaagggatgatgtgcaagaacctgattggcaccttc
atgtgtatctgcccgccgggaatgatgcgaagaccagatggagagggctgcatggatgaa
aatgagtgccgcactaaaccaggaatatgtaagaatggacgatgtatcaacacggtgggc
agctaccagtgtgactgtaatgaagggttcttggaaaatccatcagcgacagagtgcctt
gataatcgccagggcttctgtttcatcgaagttttacagacaatgtgccagatgtcatcc
accaaccgtaacctagtcaccaagtctgaatgctgctgtaatggaggcaggggttgggga
aatcagtgtgagctgtgccccctgccagggacagcccagtataagaaaatgtgcccacac
ggacctggctatgctacagatggtagagatatcgatgaatgcagagtgatgccgaacttg
tgtaaaaatggacagtgcataaatactatgggttccttccgctgtttctgtactaaggga
tacaccactgatttaacagccacctcctgcattgatcacgatgagtgcgcccaatcaccc
aaaccatgcaacttcatctgcaagaacacagaaggcagctaccaatgctcctgcccaaga
ggctacatcctgcaagaaaatggcaagacatgtagagaccttgatgaatgttccaccaag
cagcataattgtcagttcctgtgtgttaacacaattggatccttcacgtgcaagtgccca
ccaggtttcacacagcaccacacttcatgcattgacaataatgaatgcatgtctcagtcc
ccggtctgtggttccaagggcacttgccagaatacacccggaagtttcagctgtgattgc
cagaaaggattcttactggatgaaactggtttaaactgtgaagatgttgatgaatgtgat
ggaaaccaccgctgccagcacggctgccagaacatgttgggtgggtacagatgcagctgc
cctcaaggttacatgcagcactaccagtggaaccaatgtgtggatgagaatgaatgcagt
aatcccagtgcctgtggtgcagcctcctgttacaacacactgggcagctacaaatgcctc
tgcccttctgggtttgattttgaccagtacgttgggggatgtcaggatgtgaatgaatgc
tcatcttcaggaaacccctgctcttatggctgctccaacacagaaggtggctacctctgt
ggttgcccaggaggctacttcagggtgggccaaggacattgtatatctggaatgggattc
gggaatggtcactatctgcctgtggacgaggaggaggtggcagaagagaacatgctgtcc
cctgagacctgttatgagtgcaagatcaatggctatcccaaaagagggaggcaccggagg
agcacgaacggcactgaatcccctgagcagaagcacaagatcagtctcgcaagcttggac
atcgatgtgccaatcccattgaatgtgaatatctcagaaatgggagtccatgatcacatc
atggaattcctgcctgccatcgaacccttggaaaaccacgtgcgttacttcattaccgga
gggaacgaagccagcttcttccgaatccaccagaaaaatggtctcagttacctgcaccta
agccgcaaaaaggctatccgaggcaagtatacattggaggtgtccagtatgcctctctac
aggaagaaagaactcctgaagctagaagatgagaatgacattgactacctcgtgggtgat
attggtgaggcccttcgaatgaagcttcaaattcatcttctttga
DBGET
integrated database retrieval system