Halocella sp. SP3-1: D7D81_00010
Help
Entry
D7D81_00010 CDS
T05769
Name
(GenBank) hypothetical protein
KO
K02647
carbohydrate diacid regulator
Organism
hals
Halocella sp. SP3-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hals00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
hals03000
]
D7D81_00010
Transcription factors [BR:
hals03000
]
Prokaryotic type
Helix-turn-helix
Other families
D7D81_00010
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Diacid_rec
HTH_30
GGDEF_2
HTH_8
DUF4941
mCpol
GAF_2
SpoVT_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZO93108
LinkDB
All DBs
Position
complement(306..1457)
Genome browser
AA seq
383 aa
AA seq
DB search
MKLTMDLAKKIVKNTMDVLGKNINIMDYNGIIIASGNQERINMYHKGAAEVVKTGKMVII
KDKDIAGFKGVKPGINLPIRFNEQIIGVVGITGDANEVAGYGEIVKNMVELILQQEFLRR
EIEAENKACENFFQQLLSNSIKSKELLVDRAKLFDLTLDLARVVIVIEIHPIDNKLLTEQ
IRILDTFLRLNKKEDIIFSRGDNLILVKSFSKDNNIENYYEYTKKIINKILDRFNEIFDS
VIIGVGQRVSELEKLYISYQGAKHALKVGKKVYSNHENNIFFLDHLGYDYFLPYIDKEEG
LYFLHHLLGNNIIEVFENVDLGELIEALVENDLNISKAADSIYIHRNTLIYKLNKINEIT
GLNPRSAKDLFTLLIAYHLYLYQ
NT seq
1152 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgaaattaaccatggatttagcaaaaaaaatagttaaaaatactatggatgtattaggc
aagaacattaatataatggactacaacggtataattattgctagtgggaatcaagaaaga
ataaatatgtatcataagggtgcggcagaagtagttaaaactggtaaaatggtgatcata
aaagataaagatatagctggctttaagggggttaaacccggtatcaatcttccaataagg
tttaatgaacagattataggtgttgttggtataactggtgatgctaatgaagtagctggc
tatggagaaatagttaaaaatatggttgaattaatattacagcaggagtttttgcggaga
gaaattgaggcagaaaataaagcctgtgaaaatttctttcagcaactattaagtaacagt
ataaaaagtaaagaactgttagttgatagggctaagttgtttgatttgacattagacctt
gcccgggtagtaatagtgattgagatccatcctattgataataagttgttaactgaacag
attcgaatactggatacatttttaagactaaataaaaaagaggatattatctttagtaga
ggtgataatctcattttggtaaaaagttttagtaaagataacaacattgaaaattattat
gagtacacaaagaaaattatcaataaaatattggataggtttaatgaaatatttgattct
gtaataattggggttggacaaagggtctcagaattagagaaattatatatatcataccag
ggggcaaaacatgcccttaaggtggggaagaaagtatatagtaatcatgaaaataatata
ttttttctcgatcacctaggttatgattattttttgccttatatagataaagaggaagga
ctttattttctacatcatctattaggaaacaatataatagaagtctttgaaaatgtagat
cttggggagttaatagaagctcttgtagaaaatgatttaaatattagtaaagcagcagat
agtatatatattcaccgtaatacattaatatataaattaaacaaaataaatgaaataacc
ggattaaatcccagaagtgctaaggacctttttacactattaattgcttaccatttatat
ttatatcaataa
DBGET
integrated database retrieval system