Halocella sp. SP3-1: D7D81_00345
Help
Entry
D7D81_00345 CDS
T05769
Name
(GenBank) DUF1939 domain-containing protein
KO
K01176
alpha-amylase [EC:
3.2.1.1
]
Organism
hals
Halocella sp. SP3-1
Pathway
hals00500
Starch and sucrose metabolism
hals01100
Metabolic pathways
hals01110
Biosynthesis of secondary metabolites
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hals00001
]
09100 Metabolism
09101 Carbohydrate metabolism
00500 Starch and sucrose metabolism
D7D81_00345
Enzymes [BR:
hals01000
]
3. Hydrolases
3.2 Glycosylases
3.2.1 Glycosidases, i.e. enzymes that hydrolyse O- and S-glycosyl compounds
3.2.1.1 alpha-amylase
D7D81_00345
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Glyco_hydro_70
Alpha-amy_C_pro
ABC2_membrane_3
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZO93170
LinkDB
All DBs
Position
complement(79919..81430)
Genome browser
AA seq
503 aa
AA seq
DB search
MVKKYLQSLILFLIFVLVFLSLITLSVFSQRLPLINKQNKTLMQTFYWELAKDKYAVQYP
EENNLWNLLSKKALKLADLGITGVWLPPANKAAGGINDEGYAAYDLWDLGEFKQKDSIRT
KYGSKKELLKAVDSLHKNGIKVYYDAVLNHRMGGDSQEVVSLASGERTNFWTRFEMAGRE
KYFDKANDWNWGWQAFDSADGRLLKGKNWDDTADDDYLMGNDVDYQNLKVEEELIEWGKW
IVNDIGFDGFRLDAVKHIDRLFVNNWINAVQGETDKDLIFMGEAWYENSMGLYFYLLGMN
NEDLTVFDFSLRKQFSLMRDGNLNMSSLTKAGLVNKSGLGERVITFVDNHDTGRDEVEYT
TPIFQRKYQAYTYIMTREMGIPMLYWKDYYISGLKEGLDKIVKARKYFAYGPGYEVNNND
SNVYSYVRAGLKDVPGTGLVMMIAGGDTKSIISKEINSCQANQQFYDFTGNVKGIVETNA
KGIGQFKVINSEKKGWSIWVPQG
NT seq
1512 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggttaaaaaatatttacagagtctaattttgtttttgatatttgttttggttttttta
tcattaattactttatctgttttttctcaacggttaccccttataaataagcaaaataaa
accttgatgcagaccttctactgggaactggctaaggataaatatgctgtgcaatatcca
gaagaaaacaatttatggaatttactatctaaaaaggctttgaaattagctgatttaggg
attacgggggtttggctaccaccagcaaacaaagcagctggtggaataaatgatgaaggc
tatgctgcttatgatttgtgggacctgggtgagttcaaacagaaagatagtatcaggaca
aagtatggtagcaaaaaggaattactaaaagcagttgattcacttcataaaaatggaata
aaagtatattatgatgcggtattaaaccaccggatgggtggagatagccaggaagtagtt
tctttggcttcgggggaaagaactaatttttggacccggtttgaaatggctgggcgggaa
aaatattttgataaagctaatgattggaactggggttggcaggcttttgattctgctgat
ggtcgcttgcttaaggggaaaaactgggatgacacagccgatgatgattatttaatggga
aatgatgttgattatcaaaacttaaaagttgaagaagaattgattgaatggggtaagtgg
atagttaatgatattggttttgatggatttagattagatgctgtaaaacatattgataga
ttatttgttaataattggataaatgctgtgcagggtgaaacagataaagatttgattttt
atgggagaagcctggtatgaaaattctatgggtttatatttttatcttttaggtatgaat
aatgaggatcttacagtctttgatttttcgcttagaaagcaatttagtttaatgagggat
ggaaatttgaatatgtctagtcttactaaagcgggtctagttaataagtctggtcttggt
gaacgggttattacttttgtagataaccatgatacaggaagggatgaggttgaatatact
acccctattttccaaagaaaatatcaggcctatacttatattatgaccagggaaatggga
ataccaatgctatattggaaggattattatatatctggtttaaaggagggtttagataaa
atagttaaagcaaggaaatattttgcttatgggcccggttatgaggttaacaataatgat
agtaatgtatattcatatgtcagagcagggttaaaagatgttccaggtacagggcttgtg
atgatgatagcaggtggtgatactaagtcaataataagtaaagaaattaattcatgtcag
gctaaccagcaattttatgatttcacaggaaatgttaagggtattgttgagacaaatgct
aaaggaataggtcagtttaaagttattaatagtgaaaaaaagggttggtctatctgggtg
ccacagggataa
DBGET
integrated database retrieval system