Halocella sp. SP3-1: D7D81_09290
Help
Entry
D7D81_09290 CDS
T05769
Name
(GenBank) transcription antiterminator
KO
K03483
mannitol operon transcriptional activator
Organism
hals
Halocella sp. SP3-1
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hals00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03000 Transcription factors [BR:
hals03000
]
D7D81_09290
Transcription factors [BR:
hals03000
]
Prokaryotic type
Other transcription factors
BglG family
D7D81_09290
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
PRD
PTS_EIIA_2
HTH_11
Mga
HTH_DeoR
PuR_N
PTS_IIB
PF0610-like_N
HTH_20
HTH_5
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZO94770
LinkDB
All DBs
Position
1961492..1963714
Genome browser
AA seq
740 aa
AA seq
DB search
MSLKSRSCQILKYLINQKEPVSIKSLATEFEVSPRTISYDLDDIEYSIGQYNVELIKKPG
VGISLKGDNCLLKKLKKKLLDVRGYQRILSSEERIYLILYRLFQAEEPIITKELELILKV
SKSTIIKDLDEVEDWLNIHNLKLIRRTNYGLKVEGKELDIRHAMMEVFKESVDERELGQF
LSQIKKKDIKDKHLEAGFLSELNKLITKVDLTSIEEIVSFVEEKLGFQLADEAYLDLLVY
LALVVSRILEGKDICLSNDKLTMIEKNSEYKIAEKSARIMGEVFKIKITSSEIAVITLHL
MGAKLWQNIDKKEYKSTSENDLDPDLLILTKEMIKVAEDYLKVNLMGDQQLLIALALHLK
PTINRINYDLSLKNPFLAEIKKKYKKLFIAAERSAKILQSELCKDISQDEVGYIAIHFGA
ALEKKRLINFNYKFKVALVCYSGMGTSNLLSSRLKQQFPEIEISKVLSVAHLEENRCDLE
KVDLVITTIPLNIESFPVLHVNPLLDNKDKLKIKEIIQKNLEDIRGEDNDYSIKEEYAFQ
LEELINVIKEDVIILKENNLKNSLKDFFKSKGIKVLDGLAFNQSKKEYHDSLLNLLDHDL
IKLVDKLSDWEEGIALIGELLKKDRFIEETYVQRSIEIIKQKGPYVVIAPHIALVHARPE
DGVIKKSIGLLIVKNGVKFNHRFDPVHLIFMLVPKDRLSHLLVLEDLLKLIDTDDLIKRI
LSAGDKNDVIKIIRCIIENY
NT seq
2223 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
ttgagcttgaagtctagaagctgccagatattaaagtatttaattaatcaaaaagagcca
gtctctattaaaagtttagccaccgaatttgaggttagtcctagaactattagctatgat
ttagatgatattgaatatagtattggacagtataatgttgagctaattaaaaaaccagga
gtaggaatttctttaaaaggtgataactgtttattaaagaagctaaagaaaaaattatta
gatgtacgtggttatcagagaattttatcttctgaagagaggatttacttgattttatat
agattatttcaagctgaagaacctattattactaaagaattagaattgatattaaaggtc
agtaaatcaacaataattaaggatttagatgaagtagaggactggcttaatattcataat
ttgaaattgattagaaggactaattatgggctaaaggtagaaggaaaagagttggatatt
agacatgctatgatggaggtttttaaagagtcagtcgatgaaagagaattagggcaattt
cttagtcagattaagaaaaaggatattaaagataaacatttagaagcaggctttttatca
gaattaaacaaattaattactaaagtagatctcactagtatagaagagatagtttctttt
gttgaagaaaaacttggttttcaactggccgatgaagcttatcttgatttgcttgtttat
ttagctttagtagtaagtagaatattagaaggtaaagatatttgtctttctaatgataaa
ttgactatgattgaaaaaaattctgaatataagattgctgaaaaatctgccaggataatg
ggagaagtttttaaaattaaaattacatcttcagaaatagctgttattactttgcattta
atgggggctaaactttggcagaatattgataaaaaagagtataaaagtacatcagaaaat
gacttagatcctgatttgcttattttaactaaagagatgattaaggttgctgaggattat
ttaaaagtaaatttaatgggagaccagcagctcttaattgctttagctttacatttgaag
ccgacgattaatagaataaactatgatttatcattaaagaaccctttcttagcagagata
aagaaaaaatataaaaaactctttattgcagctgaacggtctgccaagatattgcaaagt
gaattatgtaaagatattagtcaggatgaagtaggctatattgctatacattttggtgct
gctttagaaaaaaagagacttattaactttaattataaattcaaggttgctttggtctgt
tatagtggtatgggaacaagcaatttgctgtcttcaagattaaagcagcaatttccagag
attgagatttccaaggtgttgtcagttgctcatttagaagaaaatcgctgtgatttagag
aaagttgatttagtaattactacaattcctttaaatatagagtcttttcctgttttacat
gttaatccacttctggataataaagataaattaaaaataaaagagattattcaaaaaaac
ttagaagatattagaggagaagataatgattatagtataaaagaagagtatgccttccag
cttgaagagttgataaatgttataaaagaagatgttattattttaaaagaaaataattta
aaaaattctttaaaagatttttttaaatctaaaggaataaaagtattggacggacttgct
tttaatcaaagtaaaaaagagtatcatgattcactcctcaatttactggaccacgatttg
ataaaattagttgataaattatctgattgggaagaaggcatagctctaataggtgaatta
ctaaaaaaagataggtttatagaagaaacttatgttcaaagaagtatagagataattaaa
caaaaggggccctatgttgtaattgctccccatatagctttagttcatgctcgtccggaa
gatggggttataaaaaagagtattggattattaatagtgaagaacggtgttaaatttaat
cataggtttgatcctgttcacttaatatttatgcttgtacccaaagaccgtttatctcat
ttattagttcttgaagatttgctgaaattaattgatactgatgatttaattaaaagaata
ttatcagcaggtgataaaaatgatgtaataaagattataagatgtataattgaaaattat
taa
DBGET
integrated database retrieval system