Halocella sp. SP3-1: D7D81_09395
Help
Entry
D7D81_09395 CDS
T05769
Name
(GenBank) LytR family transcriptional regulator
KO
K01005
polyisoprenyl-teichoic acid--peptidoglycan teichoic acid transferase [EC:2.7.8.-]
Organism
hals
Halocella sp. SP3-1
Pathway
hals00552
Teichoic acid biosynthesis
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hals00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00552 Teichoic acid biosynthesis
D7D81_09395
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LytR_cpsA_psr
LytR_C
DUF6427
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZO94789
LinkDB
All DBs
Position
1979666..1980862
Genome browser
AA seq
398 aa
AA seq
DB search
MSSFKRRFLLFSGFILLLILGFSIAVFLNTDFWALQNSPFESSKLNILVVGYDSLVNGSP
RADTIILASIDLKTKDVGLLSIPRDTRVDIPGHGMNRVNASHAFGGIELTDKTLELFLDV
PIDYYVETNFNGFAKMVDALGGVEINVSQPFHYVDKAGDLYIDLPAGQQVLNGDEALQYV
RYRESIEGDIGRVARQQKFIKAMFKKVLRPDIVMKLPGIYTEVKKTVNTNIPLQDISPFI
HLLKDMDMNDFKTIMLPGQPKYINGASYWLADEKELDVVVNNLIRSKEFIRNSRICLGIY
NGNGQVGLAGQVSDQLGKYGFVIDRIANADHYNYQETRIKYYDRANEVTALNIQKVLGGK
VIYEKSTGEGEKAAANKEDISIIIGNDYNKASEDEITG
NT seq
1197 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagtagttttaaacgtagatttttgttgtttagtggatttatattattattaatactt
gggtttagtattgcagtctttctaaacactgatttctgggctttacaaaatagtcctttt
gaaagttctaaactaaatatactggttgtggggtatgattccctggttaatggttcacca
agggcagatacaattattctcgccagtattgacttaaagactaaagatgttggtctatta
tctataccccgtgatacccgtgttgatattcccggacatggtatgaatagggttaatgcc
tctcatgcctttggaggtatagaattaacagataaaacactggaattgtttctggatgta
ccaattgattattatgttgagacaaattttaatggttttgctaaaatggttgatgccctt
ggtggagtagagattaatgtctcacagccatttcattatgttgataaggctggtgattta
tatatagacttgcctgccggtcaacaggttttgaatggtgatgaggctctgcagtatgta
cgctatagggaatcgattgagggtgatataggtcgggttgcaagacagcagaagtttatc
aaagctatgtttaaaaaggttctgcgccccgatatagttatgaaactccctggtatatat
acggaagttaagaaaacggttaatactaatatcccattacaggatattagtccttttatc
catctgcttaaggatatggatatgaatgattttaaaacgataatgttaccaggtcaacct
aaatatataaatggggctagttattggctagcagatgagaaggaattagacgttgtggta
aataatttgataaggagtaaggaatttatcagaaacagtcgtatttgtctggggatatat
aatggaaatggtcaggtcggtcttgctggccaggtgtctgatcagttgggtaaatatggg
tttgtgatagatagaatagctaatgcagatcactataattatcaagagactagaataaaa
tactatgacagggcaaatgaagttactgccttaaatattcaaaaggtactgggtggtaaa
gttatctatgagaaatccacaggggagggcgaaaaagcagcagcaaataaagaggatatt
tcgattattattggtaatgattataataaagcatctgaagatgaaattacaggttaa
DBGET
integrated database retrieval system