Halocella sp. SP3-1: D7D81_11005
Help
Entry
D7D81_11005 CDS
T05769
Symbol
pbpC
Name
(GenBank) penicillin-binding protein 1C
KO
K05367
penicillin-binding protein 1C [EC:
2.4.99.28
]
Organism
hals
Halocella sp. SP3-1
Pathway
hals00550
Peptidoglycan biosynthesis
hals01100
Metabolic pathways
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hals00001
]
09100 Metabolism
09107 Glycan biosynthesis and metabolism
00550 Peptidoglycan biosynthesis
D7D81_11005 (pbpC)
09180 Brite Hierarchies
09181 Protein families: metabolism
01003 Glycosyltransferases [BR:
hals01003
]
D7D81_11005 (pbpC)
01011 Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
hals01011
]
D7D81_11005 (pbpC)
Enzymes [BR:
hals01000
]
2. Transferases
2.4 Glycosyltransferases
2.4.99 Transferring other glycosyl groups
2.4.99.28 peptidoglycan glycosyltransferase
D7D81_11005 (pbpC)
Glycosyltransferases [BR:
hals01003
]
Polysaccharide
Bacterial polysaccharide (excluding LPS)
D7D81_11005 (pbpC)
Peptidoglycan biosynthesis and degradation proteins [BR:
hals01011
]
Peptidoglycan biosynthesis and degradation
Glycosyltransferase/DD-Transpeptidase (Class A PBP)
D7D81_11005 (pbpC)
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Transgly
BiPBP_C
Transpeptidase
CEP76_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AZO95076
LinkDB
All DBs
Position
2322728..2325064
Genome browser
AA seq
778 aa
AA seq
DB search
MNKIKLKRSILISLILIILISGGVWQLSRLPVPLFPDDYSTVVVDESGEYLRIFLNSKEQ
WIFPPGSKEIPEKLKVSVIYFEDKRFFNHSGIDFLAVARAVIQDLKAWSKVSGASTITMQ
VARLTRTKERTISNKLIEMIQALKIENKYSKEEILQLYLNHAPYGGNIIGYKAASLRYFG
KEPDQLTWGQASLLAVLPNSPGLITPTRGRERLRQKRDGLLDKLKARGIIDEMTCRLAKA
EEIPNREVPFNLAAPHLARRIKNKLNQDLIKTTINKKMQIQVNNLVKNYMEKMKQKGVNN
SAVLIADTRTGQVKAYIGSNDYFDQQHSGKIDGVQIKRSSGSILKPFLYALAMDEGLIIP
ESKIEDIPVSYGAYSPYNANHRFKGVVTAREALINSLNAPAVSLLDDYGVTEFYNFLTEA
GVSTLFRDAKGYGLPLILGGAEVKMWDMVALYRGLGNYGSFSGLHVLANGKNGQAKQLIT
KGSAYLTLNIIDDLKRPGLEYFWRDYSSKWRIAWKTGTSYGNRDAWAVGVSPEWTIAVWI
GNFDGQENEEISGLNAAAPLFFSIFNTLPKNYYQDFFAEPEGDLKKIKVSTKTGYRIRDK
IINERLGNLTEALVSKSAQPLIYSPYEKLIYTNRAGTYEVCSLCWDRDDLAKSLKLVYPP
QVVAYLKERGNEVYTTLPHKKDCPSVSNGNSIEFIYPQQDSIISIPRGADGKYQKVNFKV
AHTGKNSKLFWYLDQEYLGSTTGKHQKLLLPEHGKHILHVVDNEGHHQEISFYVKINN
NT seq
2337 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaataagataaagcttaaaaggtcgattttaataagtttaattctgattatattgata
agtggaggggtatggcagctgagtaggctgcctgttcctctgtttcctgatgactatagt
acagttgttgttgatgaatcaggtgaatatttacgaatatttttaaattctaaagagcag
tggattttcccgccgggcagtaaggagattcctgaaaaattgaaggtatcagtaatttac
tttgaagataagagattttttaaccatagcgggattgatttcctggcggtagctagagca
gttattcaggatttaaaggcctggagcaaagtgagtggagcaagcacaattactatgcaa
gtagctcgtttgactaggacaaaagaaagaacaattagtaacaaactaattgaaatgata
caggccttaaaaatagaaaataagtatagtaaagaagaaattttacaattatacttgaac
catgccccctatgggggaaatataatcggttataaagctgcttctttaaggtatttcggt
aaagaacctgatcagcttacctggggtcaggcttccttattagcagtattacctaatagt
ccaggtttaattacgcctactagaggtagagagagattgagacagaaaagagatggttta
ttagataaattaaaggccaggggtataattgatgagatgacctgtagattggctaaagct
gaggagatcccaaatcgagaagttccttttaatttagcagcacctcatttagccaggagg
attaaaaataagctgaatcaggatctgattaagactacaatcaataaaaaaatgcagatt
caggttaataatctagttaaaaattatatggaaaagatgaaacaaaaaggggtcaataat
agtgctgtattaattgctgatactagaaccgggcaagtgaaggcatatattggctctaat
gattattttgatcaacaacattccgggaagattgatggggtgcagattaaaagatccagt
ggttcaatcttaaagccattcttatatgccttagctatggatgaaggattaattattcca
gagagtaagatagaggatattcctgttagttatggggcatattccccatataatgctaat
caccgatttaaaggagtagttactgcaagagaggccttaattaattccttaaatgcccca
gcggttagtttgttggatgactatggggttacagagttttacaattttcttactgaggcg
ggggtaagcacattatttagagatgctaagggatatggcctccctttaattttaggtgga
gcagaagttaagatgtgggatatggtagctttgtatagaggactaggtaattatggcagt
ttttctgggttacatgttctggctaatggtaagaacgggcaggcaaaacaactaattact
aagggttcagcatatttaactttaaatattattgatgatctaaaacgtccaggtttagaa
tatttttggcgggattattcttctaaatggcggattgcctggaaaacagggactagttat
gggaatagagatgcctgggctgttggggtaagccctgaatggacgattgcagtctggata
ggtaattttgatggccaagaaaatgaggaaataagcgggttaaatgcagcagcaccatta
ttttttagtatttttaataccttacctaaaaattattatcaggatttttttgctgaaccc
gaaggagatttaaaaaaaataaaagtatcaactaaaactggttatcgaattagagataag
attattaatgagagactaggaaatttaacagaggctttagtctcaaaatcagcccagcct
ttgatatattctccttatgaaaagcttatttatactaatcgagcggggacttatgaggtt
tgttcactgtgttgggatagagatgacttagccaaaagtttaaaattagtttatccaccc
caggtagtagcctatttaaaagagagagggaatgaggtttataccactttacctcataag
aaggattgtcctagtgttagtaatggtaattcaattgaatttatttacccccaacaagat
agtataatttcaattcctaggggggcagatggaaagtaccagaaggtaaactttaaggta
gcccatactggtaagaatagtaagttattttggtatttagatcaagaatatttagggagt
actactggaaaacatcagaagttattactaccagaacatgggaaacatatccttcatgtt
gtagataatgagggtcatcatcaggaaataagtttctatgttaaaattaataattag
DBGET
integrated database retrieval system
