Halomonas sp. MS1: NF683_02935
Help
Entry
NF683_02935 CDS
T09972
Name
(GenBank) Ig-like domain-containing protein
Organism
hams
Halomonas sp. MS1
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Big_6
BapA_N
Cadherin_4
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTD56191
LinkDB
All DBs
Position
complement(622090..627654)
Genome browser
AA seq
1854 aa
AA seq
DB search
MDNALIVATPKSGGDAVEIPRGSVVDLQEPSVVTISVGPEETASFDRSGMDLIITLKSGE
QIVIAGFFDVPEGERSELLLEDADEVIWWGQYEIPWSGFAFSETLVAAGGLAQDSSNPSW
AAALGMLGLVGIAAAASSSSSSDSDSDADSDSDADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADTDADADSDTDSDSDSDA
DSDADAPDAPTVDSVTNTFDENGDPDGTTVSGTAEPGSTVEIRDADGNVVGSGEAGEDGS
YAITTDEPLADGEEYDVVAIDDMGNVSEPAMVTGDTTAPDAPTIDSIANTFDENGEPDGT
MVSGTAEPGSTVEIRDADGNVVGAGEAGEDGSYAITTDEPLADGEEYDVVAIDDMGNVSE
PAMVTGDTTAPDAPTVDSIANTFDENGDPDGTTVSGTAEPGSTVEIRDADGNVVGAGEAG
EDGSYAITTDEPLADGEEYDVVAIDDMDNVSEPAKVTGDTTAPDAPTVDSVTNTFDENGD
PDGTTVSGTAEPGSTVEIRDADGNVVGSGEAGEDGNYAITTDEPLADGEEYDVVAIDDMG
NVSEPTTVIGDFGDDGDADADADTDADADADADADADADADADADADADADADADADTDA
DADADADADADADADADTDADADADADADADADADADADADADADADADADADTDADADA
DADADADADADADADADADADADADTDADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADTDADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DTDADADADADADADADADADADADADADADADADADADTDADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADTDADADADADADADADADADADADADADADADADADADTDA
DADADADFELVNIDVAANLEREISYEPEETPATDSDSQFDLLGIGLLGGLASLDIGSGDH
PLIEFGLDENTNETTFNVDISGALEIGVLDDYVLIVESFENGEWGRVEDGENNLDEGLLS
LSLLGLGGTSGQVTLENLDAGDYRATLVPDPSLINVGVAITRELDVTATDLLEVEDIIVG
GVAEGNFIDEAASGDTVNLEVQSISFNGDEFTPVSGEIEVVGEYGTLAINADGSYTYTPD
AETGNQGVDSFTVNVVDTVTNEVKSANINAEVTIVDVPDEGDADADADADADADADADAD
ADADADVVAFDDLAAAGVGIVPVSASRSDSGTDTVLVNIGQVTNTYEFEVLEGSLTDVSF
TADVGGLLAVLDNTFVDLEVFEDGDWVSLEDSSSSGLLDLVGIFGEDAQVEASGLEAGDY
RVIYGGGSLLGVSTSVDWSAEFTDHSLTDFEGVAGDPITGNVITDPSFVEGEQDQLGVDD
LAAVHIQVGGAFVEAGAGTVVEGEYGTLTIDADGNYSYVPNVAVESIGLVETFAYQLVHP
DSSTDTANLYIRIDSEDADLIWDDNSPSAPATVMMANDNIDAGQVDVVNVVTTTSQEEAI
DYSWLLGIGGIVLGPTEGSTAFSLAEDTLTDLTINIDVGSLVSLLDSVDFQLYKLEGDGS
ETLVMDMDQASLLDLIGIFPTSLEIPVEGLDAGNYRLDVSNGSAVSLPGGVTVDLTYETT
DLTEFTAGEVFETIGNVIVDDNLGSEYTTLSVMNELGEFVMPGHGGIVIEGEYGVLSIMS
NGDYSYIPNADMANIGETEVFTYQLTHPNGTTDEATLSIGVEQYESPEAMSTFSLSDMDF
GDDTEELVFPESEDSKEEEEQVSSGPDGVEEVPMGDFSEPQNPLDDEFDQTLMV
NT seq
5565 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggacaatgcactcattgttgctacccctaagtcgggtggcgatgcggttgaaatacca
agaggaagtgttgttgatttgcaggaaccgagcgtcgttacgatttctgtaggacctgaa
gaaaccgcctcttttgatcggtcgggaatggatcttattatcaccctgaagtcgggggaa
cagattgtcattgctggcttttttgatgtcccggagggggagcggagtgagctgcttctc
gaagacgccgatgaagttatctggtgggggcagtacgagataccttggtctgggtttgcg
ttctctgaaaccctagtggcagcaggtggactagcgcaagatagtagcaacccttcctgg
gcagctgccttaggaatgcttggcttggttggtattgctgcggctgcttcctcttcgtct
tcttcagacagcgactctgacgctgacagcgactctgatgctgacgctgacgctgatgct
gatgcagacgcagacgcagatgcagatgcagatgcagatgcagatgcagatgcagatgca
gatgcagatgcagatgcagatgcagacgcagacgcagacgcagacgcagatgcagatgca
gatgcagatgcagatgcagatgcagacgcagacgcagacgcagatgcagatgcagatgct
gacgctgacaccgatgcagacgcagattcagatacggactctgactcagattcagatgcg
gactccgacgccgatgcaccagacgcaccgaccgttgatagcgttaccaacacttttgat
gagaacggcgatccagacggcaccacggttagcggtacggcagagccaggcagtacggtt
gaaatccgtgatgccgacggcaacgttgttgggtcaggtgaagctggcgaagacggcagc
tacgccatcaccacggatgagccgctggccgatggtgaagagtacgacgtagttgccatt
gacgacatgggtaatgtctctgagccggccatggtgacgggggataccacggcaccagac
gcaccgaccattgatagcattgccaacacttttgatgagaacggcgagccagacggcacc
atggttagcggtacggcagagccaggcagtacggttgaaatccgtgatgccgacggcaac
gttgttggggcgggtgaagctggcgaagacggtagctacgccatcaccacagatgagccg
ctggccgacggtgaagagtatgacgtagtcgccattgacgacatgggtaatgtctctgag
ccggccatggtgacgggggataccacggcaccagacgcaccgactgttgatagcattgcc
aacacttttgatgagaacggcgatccagacggcaccacggttagcggtacggcagagcca
ggcagtacggttgaaatccgtgatgccgacggcaacgttgttggggcgggtgaagctggc
gaagacggtagctacgccatcaccacagatgagccgctggccgacggtgaagagtatgac
gtagtcgccattgacgacatggataatgtctctgagccggccaaagtgacgggggatacc
acggcaccagacgcaccgaccgttgatagcgttaccaacacttttgatgagaacggcgat
ccagatggcaccacggttagcggtacggcagagccaggcagtacggttgaaatccgtgat
gccgacggcaacgttgttgggtcaggtgaagctggcgaagacggtaactacgccatcacc
acagatgagccactggccgatggtgaagagtacgacgtagtcgccattgacgatatgggt
aatgtctctgagccgaccacggtaatcggtgactttggtgacgatggtgatgcagacgca
gatgctgacacggatgccgatgccgatgcggacgctgacgccgatgcggatgcggatgcc
gacgccgatgccgacgccgatgccgatgccgatgccgatgccgatgctgacacggatgcc
gatgcagatgcagacgccgatgctgacgctgacgcggatgcagatgctgacaccgatgcg
gacgctgacgccgatgcggatgccgatgcggatgcggatgcggatgcggacgccgatgca
gatgcagatgcagatgcagatgcagatgcagatgcggacacggacgctgatgccgacgct
gacgctgacgctgacgctgacgctgacgctgacgctgacgctgacgctgacgcggatgca
gatgcagatgctgacaccgatgcagatgctgacgccgatgcggatgcggacgccgatgct
gacgcggatgcagatgcagatgcagatgctgacgccgatgctgatgctgatgcggacgca
gatgctgacgctgacgccgatgcagatgctgacacggatgccgatgcagatgcagatgca
gatgctgacgccgatgctgatgctgatgcggacgccgatgccgacgccgacgcagacgca
gacgcagacgcagacgcagacgcagacgcagacgctgatgcggacgccgatgctgatgct
gacacggacgcagatgcagacgcagatgcagacgcagatgcagacgcagatgcagacgca
gatgcagacgcagatgccgatgccgatgccgatgccgatgcggacgcagatgctgacacg
gatgccgatgcggatgctgacgccgacgcagatgcagatgcagatgctgacgcagatgct
gacgcagatgcagatgcagacgccgatgccgatgccgatgcggacgcagatgctgacacg
gatgccgatgcggatgcggatgctgacgccgacgcagatgcagatgcagatgcagatgct
gacgcagatgcggacgccgatgcagatgcagatgcagatgcagatgctgacacggacgcc
gatgcagatgctgacgccgacttcgaactagttaatatcgatgttgctgcgaatctggag
cgtgaaatcagctatgagccggaagaaacaccggctactgacagcgatagccagttcgac
ttgcttggtatcggccttctaggtgggctcgccagcctggatattggctctggtgaccat
ccgctgatcgagttcggtctagatgaaaataccaacgagaccacgttcaacgtcgatatc
tctggagctctggagatcggtgtactggacgactatgttctgatcgttgaaagctttgag
aacggggagtggggacgtgtcgaggatggtgagaataatctcgacgaaggactgctttca
ctgagtctgcttggcttgggtggtacttctgggcaggtgactctggaaaatctggatgcg
ggcgattatcgcgccaccctggttcccgatccaagcttgatcaatgttggtgtggccatc
actcgtgagcttgacgttactgctaccgacttgctggaggttgaggacatcattgttggt
ggggttgcggaaggcaactttattgatgaggccgccagcggagataccgtcaacctggaa
gttcagtccatctccttcaatggtgatgagttcacgcctgtgagtggtgagatagaagtc
gttggtgaatatggcactttggccataaatgccgatggttcttacacatacacgccggat
gcagagactggtaaccaaggggtggacagcttcacagtgaacgtcgtggatactgtgact
aacgaagtgaagtccgcgaatatcaacgctgaagtgaccatagtggatgtgccagacgag
ggggatgcagatgcagatgcagatgcagatgccgacgcagatgcagatgccgacgcagat
gcagatgccgacgccgacgttgtagccttcgatgatttggctgctgccggcgttggaatc
gtccctgtctctgcgagccgttcggattctggtaccgacaccgtgttggtgaacatcggt
caggtgacaaatacctacgagttcgaagtccttgaaggatcactgaccgatgttagcttc
accgccgatgtgggcgggctgttggcagtgctggataacaccttcgttgacctggaggtc
ttcgaggacggtgattgggtatcactggaggattcgtccagcagcggcctgcttgatcta
gttggaatcttcggcgaggacgcacaggttgaggcgtctggtctggaggctggtgactat
cgggtgatctacggtggcggtagtttgttaggtgtttcgaccagtgtggattggtctgcg
gagttcactgaccatagcctgacggacttcgaaggcgttgctggtgatccaatcactggt
aacgtgatcactgacccgagcttcgtcgaaggcgagcaggaccaattgggtgtcgatgac
cttgcggcagtacatatccaggtgggtggtgcgttcgtcgaggcaggtgctggaacggtg
gtcgaaggtgagtatggtacgttgaccattgatgctgatggcaactactcctacgtaccc
aatgtggctgtcgagagcattggcttggttgaaaccttcgcctaccagttggtacatcct
gacagttctaccgatacggcgaatctgtatatccgtatcgatagtgaggatgccgacctg
atctgggacgataacagcccgtcagctccagcgacagtaatgatggcgaacgacaacatc
gatgcagggcaggtcgatgtcgttaacgtggtgactaccacttcgcaagaggaggccatc
gactacagctggctccttggaatcggcggtattgtgcttggtccaacagaaggcagtacg
gcgttctcgctagctgaggatacgctcaccgatctcactatcaacatcgatgtaggtagc
ttggtgtccctgctcgactccgtcgacttccagctctacaagctggagggggatggtagc
gaaacgctggtcatggatatggatcaagcgagcctgctcgatctgatcggtattttccca
accagcctggaaattcccgtcgaagggcttgatgccggcaattaccgtctggatgtctcc
aacggtagtgcagtaagtctcccaggtggagtcacggtcgacttgacctacgagacaacc
gacctgactgagttcactgcgggcgaggtgttcgaaaccattggcaatgtcatcgtcgat
gacaacctgggttctgaatacaccacgctgagcgtgatgaacgagctaggtgagttcgtc
atgccggggcatggcggtattgtcattgagggtgagtatggtgtgttgagcatcatgtcc
aacggtgactatagctatataccgaatgccgatatggcgaacatcggtgaaacggaggtc
ttcacctaccagttgacccatccgaacggcacgaccgacgaagcaaccttgtcgattggt
gttgagcagtacgagtcgccagaggcgatgagtaccttcagccttagcgatatggacttt
ggtgatgacaccgaagagctggtattccctgagtctgaggacagcaaagaagaggaggag
caagtgtcgagtggtcctgatggcgttgaggaggtgccaatgggcgacttctccgagccg
cagaatccgcttgacgacgagtttgatcagactcttatggtctga
DBGET
integrated database retrieval system
