Halomonas sp. MS1: NF683_03835
Help
Entry
NF683_03835 CDS
T09972
Name
(GenBank) TRAP transporter large permease
KO
K11690
TRAP-type transport system large permease protein
Organism
hams
Halomonas sp. MS1
Pathway
hams02020
Two-component system
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hams00001
]
09130 Environmental Information Processing
09132 Signal transduction
02020 Two-component system
NF683_03835
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hams02000
]
NF683_03835
Transporters [BR:
hams02000
]
Other transporters
Electrochemical potential-driven transporters [TC:
2
]
NF683_03835
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
DctM
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
UTD56355
LinkDB
All DBs
Position
complement(828339..829649)
Genome browser
AA seq
436 aa
AA seq
DB search
MEWYWMLTISFLFLLVLMGVGLPVFVAFLIANITGVLLTLGEKGFGMFSNSMYETLTSES
FVTIPLFVLMGEILFRSGAVDVLSTALDKWIGKVNGRMYYLVIGLSTFFGALSGAAAAVA
AMLGRSILPKMQKLGYDTNLTNFTILGGASLAPIIPPSLLVIVIGSLVRDTSIAGLLVAG
IIPGFLISLILFLYIYFRVSRDPNLSPDNNAGVENYSTKEKLGEVLKASPFFIVIFSVMG
LILLGVATPSEAAATGVVGAVITASIYKSFHLKMLWESLQSSVKISLMIVIIVASSKLFG
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YNFEPIWFWTIFLINLTVGSLTPPFGYTLFALKGSANSVLISDIYKSAWPVVALFLASIV
LFYFFPQVITYLPSVL
NT seq
1311 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaatggtactggatgcttacgatttcttttctgtttttacttgtgttaatgggagta
gggcttccggtttttgtggcattcctaattgctaatataacaggtgttttgctaacgcta
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atatctgatatatataagagtgcctggcctgttgtcgcgttgtttctcgcttcaattgtg
cttttctacttttttccgcaagttataacttacttgccaagtgtgttatag
DBGET
integrated database retrieval system
