Helianthus annuus (common sunflower): 110872610
Help
Entry
110872610 CDS
T05101
Name
(RefSeq) pumilio homolog 1
KO
K17943
pumilio RNA-binding family
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
PUF
NABP
PUF_NOP9
COG5_C
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110872610
NCBI-ProteinID:
XP_021977131
LinkDB
All DBs
Position
8:34719023..34722985
Genome browser
AA seq
847 aa
AA seq
DB search
MMTDSYSKMMSEIGMRSSNEELGLLKRMSSSDRETEINMYRSGSAPPTVEGSLNAVSGLF
DGGISEQELRSDPAYADYYHANVNLNPRLPPPLLNKDDWRFSQQRLHGGGGGSAIGDMRK
MKKDNGNAGNAQGMAEWGGNGLIGLPGLGLGSRQKSIAEIIQDDMSQAASGSRQPSRPAS
RNAFDENADISDSHFGHLQGMGSGSHAYASALGSSLSRSNTPDPQLMARSASPLLPAVGG
GRINGPADLVNGFSGLSLSTNGMADEETQLPARVQNTAQLGKGSYHHMGKGGGPSNGHGS
PVNSYMKGPTGTNGSGNSPSRYQNLDSPSSSFYGLGGGNGYTMNPASPTMMANHVGGVNL
PPLYDNAAVAAAMGCEFGLGANRLMDPLYLQNLRSSEYISALNDATIDRELLAIQKAYLA
GLLSPQKSQYGLNHGYYGSPGYGLGMSYPGSPLGSPLLPNSAFGPGSPARHGDRSLRFPS
GIRNIVGESFASSLLDEFKSNKTKCFELSEIAGHVVEFSADQFGSRFIQQKLETATTEEK
DMVFNEIMPQAYSLMTDVFGNYVVQKFFEHGSATQVRELADQLTGHVLTLSLQMYGCRVI
QKAIEVVDLAQQTKMVTELDGHVMRCVRDQNGNHVIQKCIECVPENAIHFIISTFYDQVV
TLSTHPYGCRVIQRVLEHCHDPKTQSLVMDEILKSINMLAQDQYGNYVVQHVLEHGKPHE
RKCIIDQLTGQIVQMSQQKFASNVVEKCLTFGTPEQRQTLVTEMLGTTDENEPLQVMMKD
QFANYVVQKVLETCDDQQLEMILNRIKVHLNALKKYTYGKHIVARVEKLVAAGERRIGAM
AASATSA
NT seq
2544 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgatgactgatagctattcaaagatgatgtcggaaatcggaatgcgatcaagcaacgag
gagttagggttgctgaagcggatgagtagcagtgatcgtgagacggagattaacatgtac
cgaagtgggtctgcaccacccaccgttgaaggatcgttgaatgctgtttcaggcttgttt
gacggtggcatttccgaacaagagttgaggtctgatccagcttatgctgactattatcat
gctaatgttaatctcaaccctaggttacccccaccgcttttaaacaaggatgattggcgg
ttttcccagcagcggttgcacggtgggggtgggggctctgctattggggatatgaggaag
atgaagaaagataatgggaatgccggaaatgcgcagggtatggcggagtggggcggcaac
gggcttatcgggttgccgggtttgggtttagggagtaggcaaaagagcattgctgagatc
attcaggatgatatgagtcaggctgcttctggttctaggcaaccgtctcgtccagctagc
cgtaacgcatttgatgaaaatgccgatatttccgattcccattttgggcatcttcagggg
atgggatctgggtcacacgcctatgcgtcggctctgggttcatctttgtcgagaagcaac
actcctgaccctcagctcatggctcgatcggctagcccattgttgcctgcggttggggga
ggtaggataaacgggcctgcagatttggtgaacggtttctccggtttgagtctttcgact
aatggtatggcggatgaagagacgcagttaccggctcgagttcaaaacactgcgcaattg
ggtaaaggatcgtatcaccatatgggcaaaggtggcgggcctagcaatggtcacgggtca
cctgtgaattcatacatgaaagggcccacgggcaccaatggttcaggaaactctccttct
cgatatcagaatcttgatagtccaagttcgtccttttacggtttaggtggcggtaatggt
tatacgatgaatcccgcatcaccaaccatgatggcaaaccatgttggtggtgtaaatttg
ccgcctttatatgacaatgccgctgtagcagcggcaatgggctgtgagtttggtttagga
gctaatagacttatggatccgttgtatcttcaaaacttaagatcaagtgaatatatatcg
gcgttgaatgatgcaacgatcgatcgggaattactagcaattcagaaagcttacctggcg
ggtctattatctcctcaaaagtctcagtatggtcttaaccatggttactatggaagccct
ggttatgggcttgggatgtcctatcccggaagcccattgggcagcccacttttgcccaac
tctgcttttgggcctggtagtcctgcccgacatggtgaccggagcttgaggtttccttcc
gggatacgtaatatagtcggtgaaagttttgcatcttctttgctagatgagttcaagagc
aataagaccaaatgttttgagctttcggaaattgcggggcatgttgttgaattcagtgcg
gatcaatttggaagtcggtttattcaacaaaagcttgaaaccgctacaacagaagagaaa
gatatggtgtttaatgaaattatgcctcaagcttactcactaatgactgacgtattcggc
aattatgtcgtccagaagtttttcgaacacggaagtgctactcaagtaagagaactggct
gatcagctcactgggcatgttctaacacttagtcttcagatgtatggttgtcgggttatc
caaaaggctatcgaggttgttgatcttgcccaacaaacaaagatggttacggagcttgat
ggtcacgtaatgcgttgtgtacgtgatcaaaacggcaaccatgttattcaaaagtgtatt
gaatgtgtaccggaaaatgctatccattttatcatctctactttttatgatcaagttgta
acattgtcaactcatccgtatggttgtcgtgtcatacagagagtcttggaacattgtcat
gaccctaaaacacaaagcttagtgatggatgaaatcttgaaatctattaacatgctggcg
caagatcaatacggaaattacgtcgtccagcatgtactggaacatggaaagccgcatgaa
cgtaaatgtattatagatcaactaaccgggcagatagttcagatgagtcaacagaaattt
gcctcaaatgttgttgagaaatgtttgacttttggtacacctgaacaacgccagaccctt
gtcaccgaaatgctcggcaccactgatgaaaatgaaccgcttcaggtgatgatgaaggat
cagtttgctaattatgttgtgcagaaagttctagaaacatgcgacgaccaacaactcgag
atgattcttaatcgtatcaaggttcatttaaacgccctcaagaaatatacttatggaaaa
cacatagttgcccgtgttgagaaacttgttgctgctggagaaaggaggattggggctatg
gcggccagcgcgactagtgcttaa
DBGET
integrated database retrieval system