Helianthus annuus (common sunflower): 110894687
Help
Entry
110894687 CDS
T05101
Name
(RefSeq) receptor protein kinase CLAVATA1-like
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
Pkinase
LRR_8
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_4
LRRNT_2
LRR_5
Pkinase_fungal
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110894687
NCBI-ProteinID:
XP_021997605
LinkDB
All DBs
Position
12:complement(37598006..37602125)
Genome browser
AA seq
967 aa
AA seq
DB search
MTKPLLILLHVILFVSFTFTTANPDFDALMKLKASMVAPNSTALSDWQTGTSHCSFTGIS
CDENLRVTALTVSYVPMYGTIPPEIGILNKLVNLTLVSDNLTGELPLQMANLTSLKFVNI
STNSFTGEFPGEIVAGMTDLEAFDVYNNNFTGELPVEFVKLKNLKVLYLGGNFFSGDIPE
SYSSFQSLKRLGLQGNSLSGTIPANLSRVSTLEYLWLGYYNAYTGGIPEQFGELKSLKLL
DLSSCNLTGTIPASLGGLKMMHTLFLQWNNLSGEIPGELSGLISLMSLDLSNNNLSGGIP
ESFGELRNLTLISLFHNRLAGPLPSFIGDLPNLEVLHIWKNNFTLELPANLGGSGRLLML
DVTGNHLTGPIPKDLCKGGKLRMLVLMENYFFGPLPDQLGSCNSLTKIRITKNFINGTIP
AGLFTLPNLTMLELDDNYLTGELPQTMSSHSLQSISISNNFLTGNIPSSFNNLTNLTTLT
LQSNNLAGEIPPEIFRLKKLYKLNVSDNDLTGEIPAFSTCVQLTSLDFSRNKFSGDFPRA
ILNLFDLNILNLSRNQFIGEIPRKLGHMNSLTVLDLSYNRFSGKVPVDGQLKDFSDTIFA
GNPNLCLPEASHCPVISRSGNENHTISTSRIMIMIIAIITIVTLLVLTFVKIKNKRIERS
KMWKLTTFQRSDLKVEDVLECLKDENIIGKGGAGIVYRGSMANGVDVAIKRLIGRNHGFD
AEIQTLGKIRHRNIVRLLGYVSNRDNKLLIYEYMSHGSLGEILHGSKGAYLGWDTRYKIA
GEAAKGLCYLHYDCSPMILHRDVKSNNILLDSDYEAHVADFGLAKFLRDTGASECMSSIA
GSYGYIAPEYAYTLKVDEKSDVYSFGVVLLELIAGKKPVGEFGDGVDIVRWVRETISEHS
EPSDAAAVLAVLDSRLKGYTLTSVINLFKIAMICVEDESSARPTMREVVHMLTNPPQPKS
QPCLLTP
NT seq
2904 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaaaaccccttctcatcctccttcacgtcatcctcttcgtctctttcaccttcaca
actgcaaacccagacttcgacgctctcatgaagctcaaagcatcaatggtggcaccaaac
agcaccgccttatccgactggcaaaccggcacctcacattgctccttcaccggaatctca
tgcgacgaaaacctccgcgtaaccgccttaaccgtctcctacgtccccatgtacggcacc
atcccaccggagatcggaatattaaacaaactcgttaatctcactctcgtttccgataat
ctcaccggtgagttaccgcttcagatggcgaatttaacatcgttaaaattcgttaacatc
tcaacaaactcgttcaccggagagtttccgggggaaatagtcgccgggatgactgatctg
gaagcgtttgatgtgtataacaataacttcactggtgaattaccggtggagtttgtgaag
ttgaaaaatctgaaagtgctttatctcggtggtaatttcttcagtggtgacattccagaa
agttattcaagttttcaaagcttaaaaaggttaggtttacaaggaaactcgctttctgga
accattccagcaaatttatcgcgtgtgtcgactctcgaatatctttggctcgggtattac
aacgcgtacaccggaggaatacccgagcaattcggagagttaaaatcgttaaagttgtta
gacctttcgagttgcaacctcaccggaacaatcccagcgagtttaggtggtttaaagatg
atgcatacactgtttcttcagtggaacaatttaagcggtgagataccgggtgaactgtct
ggattgataagtttgatgtcgcttgatttgtcgaataataatttgagtggggggataccg
gagagttttggtgagttgaggaatttgacgttgattagtttgtttcataaccggcttgct
ggaccgcttccgtcgtttattggtgatttgccgaatcttgaggtgttgcatatttggaag
aataattttacgctggagttgccggcgaatcttggggggagtgggaggttgcttatgctt
gatgttactgggaaccatcttactggacctattcccaaagatttgtgcaaaggaggcaag
ttacgaatgctagtcctaatggaaaactacttcttcggacccctaccagaccaactcggg
tcatgcaactccctaaccaagatccgaatcaccaaaaacttcatcaacggcaccattccc
gccggcctcttcactttaccgaacctcacgatgctcgagctcgacgacaactacctcacc
ggcgaacttcctcaaacaatgtccagccactctctccaaagcatttcaatctccaacaac
ttcctcaccggcaatattccttcatctttcaacaacctaacaaatctcacaactctcact
ctccaatcaaacaacctcgccggagaaattccgccagaaatattccggttaaaaaagttg
tataagctcaacgttagtgataacgatctaaccggtgagattccggctttttcaacttgc
gtgcagcttacgtcactcgatttcagccggaataaattttccggtgactttccgagagcc
attttgaatttgtttgatttgaatattttgaatctgtctcggaatcaatttatcggtgag
attccgagaaagttaggtcatatgaacagtttaacggtgttagatctatcgtacaatcgg
ttttccggtaaagttccggttgacggacagttgaaggattttagtgatacgatcttcgca
ggtaaccctaacctatgtttaccggaagcttctcactgtccggtaatctctagatctgga
aacgagaaccatacgatttcaacatcgaggattatgataatgattattgcgataatcacg
attgttacgttacttgtacttacatttgttaaaattaagaacaaacggattgagagatcg
aaaatgtggaagctaactacgtttcaacggtcagatctgaaagttgaggatgtgttagag
tgtttgaaggatgagaacataatcggtaaaggcggtgccggaatagtgtaccgtggatcg
atggcgaacggtgttgacgtcgcgattaagcggttgatcgggcggaatcatggttttgat
gcggagattcagactttggggaagattaggcacaggaatattgttaggttgcttggatat
gtgtcgaatcgcgataataagttgttgatttacgagtatatgtcgcatgggagcttaggt
gagattttgcatgggtcgaaaggggcgtacttggggtgggatacgaggtataagatcgcg
ggggaggccgcgaaggggttgtgttaccttcactatgattgctcgccgatgatcttacac
cgagatgtgaagtcgaataatattttgttggattctgattatgaagctcatgttgcggat
ttcgggcttgctaagtttctaagggacactggtgcgtccgaatgcatgtcttccattgct
ggatcctatgggtacatcgccccagaatatgcatacacgttgaaggtggatgagaagagt
gatgtgtatagttttggagtcgtgcttctagaactgatagctggaaagaagccggttggg
gagtttggtgatggggtggacatagtgaggtgggtccgggagaccatatcagagcactct
gagccgtctgatgctgcggcagtgctagcggtgttggattcgaggctcaaagggtacacg
ttgactagtgttataaacttgttcaaaatcgcgatgatttgtgttgaagatgagagctcg
gctcggcctacgatgagggaagtcgtccacatgttaactaatccacctcagccaaaatct
cagccatgtttgcttactccttga
DBGET
integrated database retrieval system
