Helianthus annuus (common sunflower): 110908649
Help
Entry
110908649 CDS
T05101
Name
(RefSeq) extensin-2
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Extensin_2
Pollen_Ole_e_1
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110908649
NCBI-ProteinID:
XP_022009291
LinkDB
All DBs
Position
14:complement(91844655..91849599)
Genome browser
AA seq
1242 aa
AA seq
DB search
MRAPAGGGGPFRVRLWPIVIAFTVFGVANLVAVSADKPYLYSSPPPPYEYKSPPPPVHSP
PPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYQSPPP
PVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYK
SPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPP
YEYKSPPPPVHSPPPPYVYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHS
PPPPYVYKSPPPPVHSPPPPYVYKSPPPPVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYVYKSPPP
PVHSPPPPYEYKSPPPPVHSPPPPYVYKSPPPPVHSPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPV
HSPPYVYKSPPPPPYIYKSPPPPPYVYKSPPPPVHSPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYV
YKSPPPPVHSPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPPYVYKSPPPPVHSPPYVYKSPPPPPYVYK
SPPPPVHSPPPPYVYKSPPPPVKSPPPPVYYYKSPPPPVHSPPPPYYYKSPPPPAKSPPP
PVYYYKSPPPPAKSPPHYYYTSPPPPTPYHPHPYPHHRELIVKVIGKVYCYSCYDWKYPI
KSHAKHHLKGAVVEVTCKADGEKKIVAYGKTKINGKFAITVDGLKYSKYGGAKACVAKLH
MAPNGTKCNVPTNLHGGLKGAELKVKSKNDYEVVLYAKPFAYAPKTPFKICEKPKPTPTP
YYYKSPPPPAPTYLYKSPPPPTPTYVYKSPPPPYHYSSPPPPVKSPPPPYYYTSPPPPVK
SPPPPYYYESPPPLVKHPTPPYHYTSPPPPKKSPPPPYHYTSPPPPKKSPPPPYHYTSPP
PPVKSPPPPYHYISPPPPVKSPPPPYHYTSPPPPKKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYHY
SSPPPPKKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYHYSSPPPPKKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPP
PYHYTSPPPPKKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYHYLSPPPPKKSPPPPYHYTSPPPPVK
SPPPPYHYTSPPPPKKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYHYTSPPPPKKSPPPPYHYTSPP
PPVKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPYHY
SSPPPPIKSPPPPYHYTSPPPPVKSPPPPMYIYASPPPPVHY
NT seq
3729 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagagctcccgccggtggcggcggccctttcagggtacgcttatggcccatagtcatc
gcatttaccgtatttggtgttgctaaccttgtagcagtttccgctgataagccttactta
tattcttcaccaccaccaccttacgagtacaagtctccaccaccacccgtccattcacca
ccaccaccgccatacgagtacaagtctccaccaccaccggtgcattcaccgccaccacct
tatgagtacaagtctccaccaccacccgtccattcaccgccaccaccgtatgagtacaag
tctccaccaccaccagtgcactcaccacctcctccttacgaatatcagtctcctccacca
ccggtacactcaccgccgccgccttacgagtacaagtctccaccaccaccggtgcactca
ccgccgccgccttacgagtacaagtctccaccaccaccggtgcactcaccgccaccaccg
tacgagtacaagtctccaccaccaccggtccactcaccaccaccaccttacgagtacaag
tctccaccaccacctgtccattcaccgccaccaccttatgagtacaagtctccaccacca
cccgtccattcaccgccaccaccgtacgagtacaagtctccaccaccaccagtgcactca
ccacctcctccttacgaatacaagtcccctccaccaccggtccactcaccgccgccgcct
tacgagtacaagtctccaccaccaccggtccactcaccaccaccgccttacgtgtacaag
tctccaccaccaccggtacattcaccgccaccaccttacgagtacaagtctccaccacca
ccagtccattcaccacctcccccttatgaatacaagtctccaccaccaccggtccattca
ccaccaccgccatatgtttacaaatctccaccaccacccgtccattcaccaccacctcct
tacgtgtataagtctccaccaccaccggtccattccccaccacccccctatgaatacaag
tctccaccaccaccagtccattccccaccacctccttatgtgtacaagtctccaccaccg
ccggtccattcaccaccacccccttatgaatacaagtctccaccaccacccgtccattca
ccgccacctccttacgtgtataagtctccaccaccaccagttcattcaccaccaccgcct
tatgtgtacaagtctccaccaccacctccttacgtatacaaatctccaccaccaccagtc
cattcaccaccttatgtctacaagtctccaccaccaccaccttacatatacaagtctcca
ccaccacctccttacgtatacaaatctccaccaccaccagtccattcaccgccttacgtc
tacaagtctcctccaccaccaccgtacgtatacaagtctccaccaccacctccttacgta
tacaaatctccaccaccaccagtccattcaccgccttacgtctacaagtctccaccacca
ccaccttacgtatacaagtctccaccaccacctccttacgtatacaaatctccaccacca
ccagtccattcaccgccttacgtctacaagtctcccccaccaccgccttatgtatacaag
tctccacccccacccgttcattcaccaccacctccttatgtctacaagtctccaccgcca
cctgtgaagtcaccaccaccaccggtatactactacaaatccccaccaccaccagtccat
tcaccacctcctccatactactacaagtccccaccaccaccagccaagtcaccaccacca
ccagtatactactacaaatccccaccaccaccagctaaatcacctccccactattactac
acttctccaccaccaccaactccctaccacccccacccctaccctcaccaccgcgaactg
atcgtgaaggtcatcggaaaagtttactgttacagctgctatgactggaaatacccaatc
aaatcccatgcaaagcaccatctcaaaggtgctgttgtggaggtcacatgcaaggctgat
ggtgagaaaaaaattgttgcatacggaaagactaagatcaatggtaaatttgcaattacc
gttgatggtttgaagtattcaaaatatggaggagctaaagcttgtgttgctaagcttcac
atggcaccaaatggtaccaaatgtaacgttccaacaaatctccatgggggtttgaagggt
gccgagcttaaggtcaagtctaagaacgattatgaggttgtactatatgccaaaccattt
gcatatgcccccaagactccttttaagatttgtgagaagccaaagccaactcccactcct
tattactacaaatctccaccaccgcccgcaccgacttacttgtataagtctccaccccca
ccaaccccgacttacgtttacaagtctccaccacccccgtaccactactcctcacctcca
ccacccgtgaagtccccccctcccccttactactatacgtcacccccaccaccagtaaaa
tcaccacctccaccatattactatgagtcacctccaccactggtcaaacatccaacacca
ccataccactacacatcacctccacctcccaagaaatcaccacccccaccataccactac
acatcacctccaccacctaagaagtcaccacccccaccataccactacacttcaccacct
ccacccgtaaaatctccaccaccaccataccactacatatcaccgccaccaccagtgaaa
tctcctcctccaccataccactacacatcgcctccaccgcctaagaagtcgccaccccca
ccataccactacacctcacctcctccaccggtaaaatctccaccaccaccataccactac
tcatcgcctccaccgcctaagaagtcgccacccccaccataccactacacttcacctcct
ccaccggtaaaatctccaccaccaccataccactactcatcgcctccaccgcctaagaaa
tcgccacccccaccataccactacacttcacctcctccaccggtaaaatctccaccacca
ccataccactacacatcaccaccacctcctaagaagtcaccacccccaccataccactac
acttcacctcccccaccagtaaaatctccaccaccaccatatcattacttatcgcctcca
ccccctaagaagtcaccacccccaccataccactacacttcacctcctccacccgtaaaa
tctccaccacctccataccactacacatctcctccaccacctaagaagtctccacctcca
ccctatcattacacttcacctcctccaccggtaaaatctccaccacctccataccactac
acatctcctccaccacctaagaagtcaccacctccaccctaccattacacttcacctcct
ccaccggtaaaatctcctccaccaccataccactacacatcacctcctccccccgtaaaa
tctccaccacctccctaccactacacatcacctccaccaccagtgaaatctcctcctcca
ccataccactacacatcgcctccaccacctgtaaaatctcctccccctccataccactac
tcctcacctcccccacctattaaatctcctcctcccccataccactatacatcaccccct
ccaccagtaaaatcacctccaccacccatgtacatctacgcttctcctccacccccagtt
cattactag
DBGET
integrated database retrieval system