Helianthus annuus (common sunflower): 110917282
Help
Entry
110917282 CDS
T05101
Name
(RefSeq) probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g74360
Organism
han
Helianthus annuus (common sunflower)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_1
LRR_8
Pkinase
PK_Tyr_Ser-Thr
LRR_4
LRR_6
ABC1
LRRNT_2
APH
SAM_3
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110917282
NCBI-ProteinID:
XP_022017563
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(75074579..75078324)
Genome browser
AA seq
1080 aa
AA seq
DB search
MSAPEAMQFILFVILITGKHAVGESLDSDKQVLLNLQMFLLQKNRINQGSYNKWDPQDPS
PCSWPGITCSGDRVTGINLPDNDIAGNLFSNFSGLSELTHLDLSKNTIDGAIPADLGRCR
SLKVLNLSHNIMGGELNFTGLSSLEVVDLSVNRISGDIRMSFPVMCRNLVVANLSSNNFT
GEISGSMDECSKLEYVDLSSNSLTGNLSFGFDRFKEFSVSENRLSGALSGSNFVGSCSLE
VLDLSGNQLTGQIPPEMSNCKNLTSLDLSGNKFSGNIPAEIGLITKLTQLLLGNNSLSRE
IPEALLGLMNLNYLDLSRNNFTGDVQAIFGRFTQLKYLLLHANGYSGGLNSSGILKLQNI
SRLDLSFNHFSGPLLPEISQMTGLRYLFLAGNRFSGRIPSEFGNLQGLQALDLSINELNG
SIPSSFGRLTSLLWLMLANNSLTGQIPPELGNCSSLLWLNLANNQLSGPISPELANIGRN
PTPTFLLNRRINPVAGSGECSAMKRWIPADYPPFSFVYTLLNRKKCRSLWDMILKGDGIF
QVCLPGSSIRTRQISGYIQLSGNRLSGLVPPEIAKMVNFSMLHLGYNEFSGTVPAEIAQM
PLAVLNLTSNKFTGRIPTQIGYLKCLSNLDLSYNNFSGTFPTSLNNLTELSKFNVSYNPY
ISGMIPSTGQLATFEKTSFLGDPLLSLPPFIANSTNNSSTNAGNRSNPRKWNSVLLFMFL
LLAFTVCGVMTILVCLVLKSPVDKPGYLYPDLKPPRNEFMSNSSGSSPWLSDTVKVIRLD
KTAFTHADVLKATGNFANDRIIGRGGFGTVYRGLLPDGRDVAIKKKLREGTEGEREFRAE
MEVLTRNGLGWPHPNLVTLYGWCLYGSEKLLVYEYMDGGNLEDIILDKTGFKWKRRINVA
IDVAHALVFLHHECYPSIVHRDVKASNVLLDKHGRAKVTDFGLARVMDVGDSHVSTMVAG
TIGYVAPEYGQTWQATTKGDVYSYGVLIMELATGRRAVDGGDECLVEWARRVMGDGHRRM
IPVSGLADGAVEMCELLRVGIRCTAESPQLRPNMKEVLDMLVRILTNRTDFCYASLLPSS
NT seq
3243 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagcaccagaagctatgcagttcatactcttcgtaatattaatcacaggaaaacat
gcagttggagaatcactggattccgacaagcaagtactcctgaatctccaaatgtttttg
ttacaaaaaaacagaatcaatcaaggaagctacaacaaatgggacccacaagacccatca
ccgtgcagttggccgggaattacttgctccggcgaccgggtcaccggaatcaaccttccc
gacaacgacatcgccggaaatttgttcagcaacttctccggcttgtcagagcttacacac
cttgacttgtcgaaaaacacgatagatggcgcgataccggctgatttgggcaggtgtagg
agcctcaaagtgttgaacctgtcacataatattatgggtggtgagctcaacttcaccgga
cttagtagtttggaggttgttgacttgtcggtcaaccgaatatctggcgatatccggatg
agcttcccggtgatgtgtagaaacttggtggtggctaatttatcatctaataacttcact
ggagagatttcagggtcaatggatgaatgctctaagctggagtatgtcgatttgagctcg
aattcgttgaccggaaacttatctttcgggttcgataggtttaaggagttttcggtttct
gaaaaccggttatccggtgctctttccgggtctaattttgtgggaagttgcagtttggag
gtgcttgacttgtccggaaatcaactcaccggacaaatcccgccggagatgtcaaattgt
aaaaatttgaccagtttggacctctccgggaacaagttttccggcaatattccggcggaa
atcgggttgatcacgaaactgacgcaacttttgttaggtaacaattcgctttcgagggag
atcccagaggctctactcgggttgatgaacctgaactacttggaccttagccggaataac
ttcaccggagatgtacaagccattttcgggcggtttacgcagctgaaatatcttctcctg
cacgcgaatggatactccggcgggttaaactcgtcggggatactcaagctgcagaacatt
tcgcggttagacctcagtttcaaccacttttcgggtccattactgccggaaatatctcag
atgacaggtttacgatacttatttctggccggaaaccggttctccgggaggataccttct
gagtttggtaatttgcaaggacttcaagctctggatctttccataaacgagttaaacggg
tcgatcccatcaagtttcggacggttaacctctctactatggttaatgcttgccaacaac
tcgttaacgggccagataccgccggaattagggaactgtagcagcttattgtggctaaat
cttgcaaacaatcaactttcgggcccgatttcacccgaattggctaatatagggagaaac
ccgacaccgacatttttgttaaaccggagaattaacccggttgcgggttcaggagagtgt
tcagcaatgaaaagatggatccctgcagattatccacctttcagttttgtatacactctt
ctgaacagaaaaaagtgcagaagtttatgggatatgatacttaaaggggatggaatcttc
caagtttgtctaccaggttcgagtattcgaacccgtcagatatcggggtatatccagctc
agtgggaaccggttatcgggccttgtacccccagaaatcgcgaaaatggttaatttcagt
atgctgcatttggggtataatgagttttcagggacagttccggctgagatcgcgcaaatg
cctctcgcggtcttgaatcttactagtaacaagttcacggggcgaataccaacgcagatc
ggttatctcaagtgtttgagtaatcttgatctgtcatacaacaatttctcaggtacgttc
ccgaccagtttgaacaatctgactgaattaagcaagtttaacgtctcctacaatccgtac
atctccggtatgattccatcgaccggacagctggctacgttcgagaaaacgtcattcctc
ggagacccgttgttgagtctgcctccatttatagctaactcaacaaacaactcgtcaaca
aacgcaggtaacagatcaaacccgagaaaatggaattcggttttgttgttcatgtttcta
ctgttggctttcaccgtgtgcggtgtcatgacgatcctagtctgccttgtgttaaaaagc
ccggttgacaaacccggatatctataccccgatttaaagcctcccagaaacgaatttatg
tcgaattccagtggctcatcaccgtggttgtcggacacggttaaggtcatccgtttagac
aaaaccgcgttcactcacgcggatgtgttaaaagcgacgggtaactttgcgaatgacaga
ataatcgggaggggcgggtttggaaccgtttatagaggtttgttacctgatggaagagac
gtagcaataaagaagaaattgagagagggtactgaaggggagcgcgagttccgggctgaa
atggaggtgcttacgcgaaacgggctgggctggccccacccgaatttggtgacactttac
gggtggtgtttatacgggtcagaaaaactgttggtttatgagtacatggatggtggtaat
ttggaagatataattctagacaaaaccgggttcaaatggaaacgacgtataaacgttgcc
atcgatgtggcacacgctttggtgttcttacaccacgagtgttatccgtccattgttcac
agagatgtaaaagccagcaatgtgttgttggacaaacacgggcgggctaaggttaccgac
tttgggctagctcgggttatggatgtcggtgatagccacgtcagcacaatggtggcggga
actattggatacgtggcacctgaatacgggcaaacatggcaagccactacaaaaggcgat
gtgtatagttacggagtgttaataatggagttagcgacaggcagaagagcggtcgatgga
ggagacgagtgtctagttgaatgggctagacgggtaatgggagatgggcaccgtagaatg
atcccagtgtcgggccttgctgatggggcggtggaaatgtgcgaattacttcgagttgga
ataaggtgtaccgcggagtcgccacagttgaggccgaacatgaaagaggtgttagatatg
ttggtccgcattttgaccaaccgtacagatttttgctatgcttctttgttaccatcttca
taa
DBGET
integrated database retrieval system
