Halothece sp. PCC 7418: PCC7418_0570
Help
Entry
PCC7418_0570 CDS
T02379
Name
(GenBank) Cadherin
KO
K20276
large repetitive protein
Organism
hao
Halothece sp. PCC 7418
Pathway
hao02024
Quorum sensing
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hao00001
]
09140 Cellular Processes
09145 Cellular community - prokaryotes
02024 Quorum sensing
PCC7418_0570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Pesticin
Big_5
LVIVD
Cadherin
PPC
Y_Y_Y
Big_7
CarbopepD_reg_2
Big_13
CarboxypepD_reg
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFZ42798
UniProt:
K9Y9N0
LinkDB
All DBs
Position
complement(631433..641602)
Genome browser
AA seq
3389 aa
AA seq
DB search
MGITENRARVAAGLDPLFTDRELPVVLAANNGVTWDIDGNGEVSALTDGILVIRFLAGFT
GEALISGAVATEGATRTEAEAILSYLESAENLLDVDGNGTTAALSDGILAIRAFAGFTGE
ALIEGAIGDGATRTDDSAITAHIESFLPSAEDTTSPEVTADQVLSFQENLEQGSPIATVE
ASDNREVVGFAITGGNEDGFFTIDENGVLSLTATGVTSPANDFETSPNTFSLEITAEDAA
GNVSTAETVTVQVNDDTADNIEPVQISPTNGEEMVALTRETIVRFGQEIDPATINEESIF
LIANGEEIPGRIQVSSTNEFATFFYDDPLPASTEVRAVVDGDEITLTDGTALDADGDGTP
GGRETADFTTLPVTPIAGTDVFGYVFDSYNQNPDGSNIPLQGVNIRLDALDIEATTDETG
FFRLEDVPAPEFFAYIDGSEAVPVANEGVEIQSTQYASLGKPFHSVPGEEVQLSMEGEVM
DIFLPQMAVEDQVELSPDQDTDVSFGETSLQLLQQTVPDADPEMLAQTTVTFPAGSAQDD
EGNLATRAQIVPVAPDRIPGSLPPGQDPELVISVQAGGENGFNREAQGGATNFDVPAPVE
FPNMEGLEPGETSLLWSFNHDAGEWEVNGTMTVSEDGQTIVSDEGVGIQAPGWHFTNPGS
PVGPGNPTGGDGSGDGNGDGSGDGSGDGSGDGSGDGNGDGSGDGSGDGNGDGSGDGSGDG
DGGNDPAEEQIDIDFISNEEGGQQTEGYIPDAPGNMSGVTIGTGVDLGGLDIDELDIPDN
LKDKLRPYEGKQGEEAEEFLNENPLSINEQEADTLDRAVKDEIFSDLQRRYNQNSDIPFN
QLPPEAQTVIADVATQYGPNLENRTPNFWNEVTEQRWEDAINNLRDFGDDFPSRRNREAD
LLEDALAQGNIDQNSGGDGGGQIVAPTQGSSANGQSEPLQQENNQLVRANSINTSRTESL
LNSSTTTVTLANQTTLVPQGEKTHYFAIFNLDRDTIEIRGKSETGVALESPVVLAPNTNY
RVFVLQADTQWHGYHDFTTLDSGVGVGLTDIRIGPKVFIDSDEDGLSNTAEFILGTNAGQ
KSTSNDGISDGAKFEQGLDLFGGQGFPTGIISTLPLQGEAQEIVVEGSTENARDQFAYLA
TGSHGLAIVDVSQFDNPIVFGQLDLPGNATDIDVDADLQLAAVATNDGGLQIVDVSDPML
PVLTRTAEINTNQTNRVEVVEGIAYAAVDNQLQAIDLLTGDLLETITLQGSQITGIAQEG
SFLYTMSDNNTLQAVDISNEIPVARGNISLDNGGGQLFVGNGIAYATASSFFRGGFSTVD
VSDPENLTLISGSDVASPNIAPQEAIIANGSGQGILIGTAGDNAFDLIDLSDPANTDTFS
TLLTRFSLSAAPQDVAVGSGIAFVATNSGLEVVNYLPFDAQGQAPNVTISTPADIDADTE
GIQALEGATIPINTDVTDDVQVRNVQLLVDGEVVSNDVSFPFDFSTIAPSITPDVNSTEI
QVRATDTGGNSTLSNPLTINLVEDTFAPEVVDTTPAEGGRRRIINSIAVRFNEGIDTDLL
DLNGITLTNLGEDGTLGTEDDAVVPLTDLRTRNLDRTVVVTPNEEEFTPNDYQLSIDANI
ISDRAGNALASPFSFNFTKRPLQIDLSLTETVAETLFPGENEIFTFEGTSGQRLYYDGLT
TVDGIRSTLFSPTGAELFDINTERDRDPFSLIESGTYRLIVDGGFDNANGDFSFQLSSLD
AIPTLELDTTITGALNPLESQVFQFSGIAGQRLYLDNIETDDRSGGNWRVYNQANQVINS
DSIGDDFEITLPTDGNFILVVESSSSDPLNYSFQVVSAETTTTELTLGETVTDSIAEPGE
INIYTFEGTPGQQLYFDGLDQESNIYAELLSPSGNRIFGEWTNRDETPVTLTESGTYQLM
IDPSGETTGDYNFNLFDIGASTELTFDTAITGTIDPGLESQVFQFAGTEGQQLYFDSLAD
VSGADWLLYNPGNDYLFWRSLGSDQEVTLPSDGLYSLILDGTSSDSTTNYNFQVTTPETT
TTELTLNTPVANSISESGETDIYTFTGTAGQQLYFDGLDESSDIYVELLTPSGNRLFWEW
TDQDGNPVTLIESGTYQLMIDPSGETTGDYNFNLFDIGASTELTFDTAITGTIDPGLESQ
VFQFTGTEGQQLYFDSLADVSGGRWLLYDPANQNLFNVGLSSDREVTLPSDGNYSLILDG
STPNGTINYNFEVTTLETVTTALTLGEAISSEISQAGEADIFTFTGSTGQRLYFDGLSSD
NNLDIELFSPSGDRLLNVDTDRDRAPFSLVESGTYEVVINPSGNTTGNYNFRLTDITTAT
DLTFGTAVSDTLDPGKETDLYKFTGSEGQRLDFDNLGSGSSANWRLYDPANQIVFSRSLN
SDQNNVLLPGDGTYVLEIDGEAPDSTINYNFQVNDVSDAAVTPSGFGTAQTGTLEAGNTQ
TFTFDAPAGLQVFFDDLGTPDDLRFDLDHPDGSRVFSSESSDRETFTLTQSGTYTLTVRG
EDETSTGDFNFQFLNLAADSTELTFNTPTTETLAAATTKIFRFDGTAGQQLNFDSRSNTD
FDVDVKLWSPSDQRLVRETSGDLDTEPFTLTETGTHFLVIDHQEDVANDYSFTLFDIATT
TALTFDTPINGTLDPGLEKQIFQFTGTEGQRLYFDSLNSATGGRWFLYNSANQVILNGRL
DSDGEVTLPTDGGYYLGLDGRTADSTVDYNFQVVTPETTTTELTLGTPISSSIADSGEID
RYTFTGSAGQRLYFDGLDSDSNLNAELFTPSSDRRLSIDTDRDGTPFTLIENGTYELIID
PNGATTGDYNFNLFDLGAATELEFDTPITGTLDPGIESQVFQFTGTEGQRLYFDSLNTAT
GGRWRLYDPANQEILDRRLDSDQEVTLPSDGNYSLILDGSNNESTVNYNFEVVTPETTTT
ELTLGTPISSSIADSGDIDRYTFTGSAGQRLVFDGLDSDSNLFAELFTPSSDRPLSLDTD
RDGTPFTLIENGTYELIIDPNGATTGDYNFNLFDLGAATELEFDTPITGTLDPGIESQVF
QFTGTEGQRLYFDSLNTATGGRWRLYDPANQEILDRRLDSDQEVTLPSDGNYSLILDGSS
SDTTVNYNFQVVTPETTTTELTLGTPTSGSITNSGEIDKFTFTGAAGQKLFFDGLDSDSN
LFAELFSPSGDRRFSEFTDRNENPFSLLEKGTYELIIDPNGATTGDYNFNLFDLDAATEL
EFETEISGTLDPGMESQVFQFTGTEGQELTFDSLSSGSNGTWQVYSPANESISFSNSLNR
DFDVELPGDGIYFLVLEGFATSGTINYQFQVSSDEATESLQASVFSSPSSNSLIAATPQN
LDAIIPDRDSITSNGINTSDLSEDDFLFT
NT seq
10170 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggaattacagaaaatagggcgcgtgtggcagcaggtctggatccgttatttacggat
cgtgagttaccagtagttttggcagcaaataatggagttacgtgggatatcgatggcaat
ggtgaagtttcagcactcaccgatggtatcttggtgattcggtttctggcagggtttact
ggggaagccctaattagcggagcagtagcaacagaaggagcaacccgtaccgaagcagaa
gcgattttgagctatctggagtctgcggagaatctcctcgatgtagatgggaatggcaca
acagccgctctgagcgacggaattctcgccattcgcgcctttgctggttttacaggtgag
gcgttaattgagggcgcaattggggatggtgcgactcggactgatgacagcgcgattact
gctcatatcgagagttttctcccgtctgctgaagataccacctcaccagaggttacagca
gaccaagttttatccttccaggaaaatttagaacaaggaagtcctattgccacggtagaa
gccagtgataatcgagaagtggtaggctttgctattaccggggggaatgaggatggcttt
tttaccattgatgagaatggggttcttagtttaaccgcaactggggtcaccagccccgcc
aatgattttgagacctcccccaataccttctctctagagattactgcagaagatgcagcc
gggaatgtttccacagcagaaaccgtgacggttcaagtcaatgatgacacggctgacaac
atcgaacctgtacaaatttctcctaccaatggggaagaaatggttgcgttaactcgtgaa
accattgttcggtttggacaagagattgatcctgcgactatcaatgaagagagtatcttt
ttaattgccaacggtgaggaaattccgggacggattcaggtttccagcaccaatgaattt
gctaccttcttctatgatgaccccttacctgcctctacagaagtgcgtgcggtcgtggat
ggtgatgagattacccttaccgatggcacagctttagatgccgatggggatggcacccct
ggggggagagaaacggctgatttcaccaccttacccgttacgcccattgctggcaccgat
gtctttggctatgtgtttgactcctacaatcagaatcccgatgggtcaaacattcctctg
caaggggtcaatattcgtctcgatgccttggatattgaagccacaaccgatgaaaccggg
ttcttccgtttagaagatgtgccagcaccagagttctttgcctatattgatggttcggaa
gcagtacccgttgctaatgaaggagtggaaatccaatctacgcagtatgccagtttaggg
aagccgtttcatagtgttcctggagaagaagtccagttgtcgatggagggggaagtgatg
gatatcttcctcccgcagatggcggtggaggatcaggtggaactttcacccgatcaggat
acagacgtcagttttggagagacttcattacaattattacaacaaacagttcctgatgct
gaccccgaaatgttggcgcagacaaccgtaacctttcctgcagggtcagcacaagatgat
gaggggaatttggcaacacgggcgcaaattgttcccgttgcccctgaccgtatcccaggt
tcgttacccccaggacaagacccagagttagtgatttcggtgcaagcggggggcgagaat
ggctttaaccgcgaggcacaagggggagcgaccaattttgatgtccctgcgccagtagaa
tttcccaatatggaaggattggaaccgggcgaaacgagtctgctgtggtcgtttaatcat
gatgctggggagtgggaagttaatggcacgatgactgtcagtgaggatggtcaaacgatt
gtttccgatgaaggagttgggatacaagctcctggctggcattttacgaatcctggctct
ccagtaggaccaggtaatcctacaggaggggatggcagtggcgatggcaatggcgatggc
agtggcgatggcagtggcgatggcagtggcgatggcagtggcgatggcaatggcgatggc
agtggcgatggcagtggcgatggcaatggcgatggcagtggcgatggcagtggcgatggc
gatggtggaaatgatcctgcagaagagcaaattgatattgatttcattagtaacgaggaa
ggtggacaacaaacagagggatatattccagatgctccgggaaatatgagtggggttaca
ataggaactggtgttgatctgggtggattagatattgatgaactggatattccagataat
ttgaaggataaactaagaccatatgaaggtaaacaaggtgaagaagcagaagaatttctg
aatgaaaatcctctgtctatcaacgaacaagaagctgatactttagatagagcagtaaaa
gatgaaattttttcagatctacagagacgttacaatcaaaactcagacataccttttaat
caacttcctccagaagcacagacagtaattgcagatgtagcgactcagtatggtccaaat
ctagaaaatagaacacctaacttctggaatgaagtaacagagcaacgctgggaagatgca
attaataaccttcgagattttggagatgactttcctagtagaagaaatagagaagcggat
cttttggaagatgctcttgctcagggaaatatagatcaaaatagcggtggagacggcggt
ggtcagattgtggctccaactcaaggctcctctgctaacggtcaatcagagcctcttcag
caagaaaacaatcagttagtgagggctaactcaattaatacatcacgaacagaatcattg
cttaattcttctacaactaccgttactttagccaatcaaactacattagttcctcaaggg
gaaaaaactcattactttgctatcttcaatcttgatcgtgacactattgagattagaggt
aaatcagaaactggagtggctcttgaaagtccagttgtgcttgctccaaacactaactac
agagtttttgtacttcaagcagatactcagtggcatggttatcatgactttacgacttta
gacagtggtgttggtgtgggtttgaccgatatcagaataggtcccaaggtttttattgat
tcagatgaggatggtctttcaaataccgctgaatttatccttggaactaatgctggtcaa
aaaagtaccagtaatgatgggataagcgatggagctaaatttgaacaaggactcgatctc
tttggcggtcaaggttttcccacagggattatctctactcttcctttgcagggagaagcc
caagaaattgttgtggaaggttcaactgaaaatgcccgtgaccagtttgcttacctggca
acggggtctcatggacttgctattgttgatgtttcccagtttgataatcccattgttttc
ggtcagctagatttacctggaaatgctactgacattgatgttgatgctgacctacaactg
gctgctgtcgcaaccaatgacggtgggttgcagattgtcgatgtgtctgaccccatgctt
ccagttcttacaagaacagcggaaattaatactaatcaaactaatcgagtggaagtggtt
gagggcattgcttatgctgctgtggataaccaactgcaagcgattgacttgttaactggg
gatttattagagaccattacgctacaaggcagtcagattacaggcattgctcaagagggg
tcattcctctacaccatgagtgataacaatactctgcaagcagtggatatttctaacgag
attcctgtggcacggggaaacattagcttagacaatggtggcggtcagctttttgtgggc
aatggcattgcctatgctactgctagcagtttcttccgagggggcttctcgaccgttgat
gtatctgaccctgaaaacctaactctgattagcggttctgatgttgcttctccgaatatt
gccccgcaagaggcaattatcgctaatggctctgggcaagggattctcattggaacagct
ggggataatgcgttcgatttaattgacttgagtgaccctgctaatactgatactttctcg
actctattgactcgttttagtttatctgctgcaccgcaagatgttgctgttggttcagga
attgcgtttgttgccacgaactcgggattagaagtggttaactacttaccgtttgatgct
caaggtcaagctcctaatgttacgattagcacgcctgctgacattgacgctgatactgag
ggcattcaagctctggaaggggcaaccattccgattaacaccgatgttactgatgatgtg
caagtgcggaatgtgcaacttttagtcgatggagaagtggtgagcaatgatgtgtctttt
cccttcgatttcagcacaattgccccttcaattacgcctgatgtcaattctactgaaatt
caagtccgcgcaacagatacagggggcaatagcaccctttctaatccgctaacgattaac
ttggtagaagatacttttgccccagaagttgttgataccacgccagcagaaggaggacga
cgacggattattaattccattgcggttcgattcaatgaaggaattgataccgacttactt
gacctgaatggcattaccctcaccaacttaggggaagatggaaccttgggaacggaagat
gatgcggttgttcccttaactgacctgcggactcgcaacttggatcggactgtggttgta
acgcctaatgaggaggagtttacgccaaatgactatcaactgagcattgatgcaaatatc
atcagcgatcgcgctggcaatgctttagcctcaccgtttagtttcaactttaccaaacgt
cccctgcaaattgatttatcccttactgaaacggttgcagaaaccttgtttccaggggaa
aatgaaatctttacctttgagggaacctctggtcaacgcctgtactacgatggcttaacc
actgttgatggcatccgaagcaccttattcagtccgacaggggcagaattatttgatatt
aatactgagcgcgatcgcgatcctttctccctaattgagtctggaacttatcgcctgatt
gtagatggcgggtttgacaacgccaatggagattttagcttccaactctcttccttggat
gcaatccccacccttgaacttgatacaacaatcacaggggctcttaatccccttgagagc
caagtatttcagttttcgggaatcgcaggacagcgtctgtatttggataacatcgaaact
gatgaccgttctggtggaaattggcgagtttataatcaagccaatcaagtaattaactct
gactccattggcgatgattttgaaattacgttacccactgacggcaactttatcttagtc
gttgagagttccagcagtgacccgcttaactacagtttccaagttgttagcgcagaaacc
acaaccacagaactaaccctaggagaaactgttaccgatagcattgctgaaccgggagaa
atcaacatctacacctttgaaggaactccgggacaacaactatactttgatggtttagac
caagagtctaatatctatgcagaattgttgagtcccagtggaaaccgcatctttggtgaa
tggacaaaccgcgatgaaactcctgttactctcactgaaagcggaacttatcaactgatg
attgaccccagtggggaaactacaggagattacaacttcaatctctttgatattggcgca
agtacagaattaacctttgatactgcgattactggaaccattgaccctggtttagaaagc
caagtcttccagtttgcaggaactgaagggcaacagctatactttgatagcctcgccgat
gtgtccggtgcggattggttactttacaacccaggaaatgattatctcttctggcgttct
ctcggaagtgatcaagaagtgactcttcccagtgatggactctacagcctcatccttgat
ggaacaagcagcgatagtaccacgaactataattttcaagttactaccccagagacaaca
actactgagttaacccttaatacacccgttgcgaatagcatcagtgaatcaggagaaact
gatatctacacctttaccggaaccgcaggacagcaactctacttcgatggtttagatgaa
agttctgatatttatgtagagttactaactcccagtggaaatcgcctcttctgggaatgg
acagaccaagatggaaatcctgtcacgctgattgaaagcggaacttatcaactgatgatt
gaccccagtggggaaactacaggagattacaacttcaatctctttgatattggcgcaagt
acagaattaacctttgatactgcaattacgggaaccattgaccctggtttagaaagccaa
gttttccagtttacgggaaccgaaggacaacagttatacttcgatagcctagcggatgtc
tcaggaggacgctggctgctatacgaccccgctaatcagaatctgttcaatgtcggactt
agcagcgaccgagaagttactctgcccagtgacggcaactatagcctgattctcgatggc
agcacaccaaacgggacgattaactacaactttgaagttactaccctcgaaacggtcaca
actgctttaactttaggagaagccattagcagtgaaatttcccaagcgggagaagcggat
atcttcacctttacaggaagtacgggacaacggttgtactttgacggactcagtagcgat
aacaatctggatattgaactattcagtcccagtggtgatcgcctgttgaatgtggatacg
gatcgcgatcgcgctccctttagcttggtagagtcgggaacttatgaagtcgtcattaat
ccctctgggaacaccacaggaaactacaatttccgcttaacagacattacaactgcaacc
gacttaaccttcggaactgcagtcagcgatacccttgatcctggcaaagaaaccgatctg
tataagtttacgggaagcgaaggacagcgcctagattttgataatctcggttctggatca
agtgccaactggcggttgtatgaccctgccaatcagatcgttttcagtcgttctctcaat
tccgatcagaataatgtccttctcccaggagacggaacttatgttttggaaatagatgga
gaagcccctgacagcacaattaattataatttccaagttaatgatgttagtgatgctgcc
gtaacccccagtggcttcggaactgcacaaacgggaactcttgaagcgggaaacactcaa
acctttacctttgacgcgccagcaggattacaagttttctttgatgacttaggaacccct
gacgatctgcgctttgacttggatcatcctgatggcagtcgggtcttttcttcggaaagc
agcgatcgcgaaacctttaccctcactcaatccggaacctataccctaactgttcgggga
gaagacgaaaccagcacaggagattttaactttcaatttctcaatctggctgctgactcc
actgaactcactttcaacacgccaaccactgaaaccttagcagcagcaacaacaaaaata
ttccgttttgatgggacagctggacagcaattaaactttgacagtcgcagtaatacagat
tttgatgtggatgtcaaactttggagtcctagcgatcagcgtttagttcgtgaaaccagt
ggagacttagacactgaaccctttactctcacagagacaggaactcatttcttggtcatt
gatcatcaggaagatgtcgccaatgactacagtttcactctctttgacattgcaaccaca
accgctttaacctttgatactcctattaatggcacccttgatcctggactggaaaaacaa
atcttccagtttacaggaacggaaggacaacgcctctacttcgatagcttgaactcagca
acaggaggacgctggttcttatataattcggctaatcaagtcatcttgaatgggcgacta
gattctgatggagaagtaaccttacctactgatggaggctattaccttggtctcgatgga
agaactgctgatagtacagttgactataacttccaagtcgttactcccgaaacaaccaca
acagaattaacactaggaacacccatttctagcagcattgccgactcaggagaaattgac
cgctacacttttactggtagtgctgggcaacggttatacttcgatggcttggacagcgat
agtaacctcaatgctgaactgttcacccccagcagcgatcgtcgcttgagtatagacacc
gaccgtgatggaactccttttaccctgattgaaaatggaacttatgaactgattatcgat
cccaacggagcaacaacaggagactataatttcaatctcttcgatttgggtgctgcgacc
gaacttgagtttgataccccgattactgggacacttgacccaggaatcgaaagtcaagtc
tttcagtttacaggaacggaaggacaacgcctctacttcgatagcctcaacacagcaacg
ggaggacgctggcgactctatgaccctgccaaccaggagattctagatcgacggctcgat
tcagaccaagaagtcactcttcccagcgatggcaactatagcctaattctggatgggtct
aataacgagagtaccgttaactataacttcgaggtagtaaccccagaaacaaccacaaca
gaattaacactaggaacccccatttctagcagcattgccgactcaggagacattgaccgc
tacaccttcactggtagtgctgggcaacggttagtcttcgatggcttggacagcgatagt
aacctctttgcggaactgttcacccccagcagcgatcgtcccttgagtctagataccgac
cgtgatggaactccttttaccctgattgaaaatggaacttatgaactgattatcgatccc
aacggagcaacaacaggagactataatttcaatctcttcgatttgggtgctgcgaccgaa
cttgagtttgataccccgattactgggacacttgacccaggaatcgaaagtcaagtcttt
cagtttacaggaacggaaggacaacgcctctacttcgatagcctcaacacagcaacggga
ggacgctggcgactctacgaccctgccaaccaggaaattctagatcgacggctcgattca
gaccaagaagtcactcttcccagcgatggcaactatagcctaattctagatgggtctagt
tcggacacgactgttaactataatttccaagtggtaacgccagaaacaactacaacggaa
ttaacgctgggaacccccacttcaggcagtatcactaactccggggaaattgacaaattt
acctttactggtgctgcgggacaaaaactcttctttgatggcttggacagcgatagtaac
ctctttgcggaactgtttagtcccagcggcgatcgtcgattcagcgagtttaccgatcgc
aatgaaaatccctttagcttgcttgaaaaggggacttatgagctcatcattgatcctaat
ggggcaacaacaggagactacaatttcaatctctttgatttggatgctgcgaccgaactt
gaattcgagaccgaaattagtggtacgcttgatcccggcatggaaagccaagtcttccag
tttacgggaacagagggacaagaattaacctttgatagtctctcttctggttctaacgga
acttggcaagtttatagtcctgcgaatgaaagcatctccttctctaattccctaaatcgt
gactttgatgtcgagttgccaggggatggaatctatttccttgttttagaaggctttgca
accagtggaacgattaactaccagtttcaagtttcgtcagatgaagcaaccgagagtctc
caagcgtcggtcttctctagtccaagcagtaattccttgatcgctgctacaccgcagaat
cttgatgctatcatccctgatcgcgattccattacgagtaatggaattaatacttcagac
cttagtgaagatgacttcctgtttacctaa
DBGET
integrated database retrieval system