Glaesserella parasuis SH0165: HAPS_0221
Help
Entry
HAPS_0221 CDS
T00825
Name
(GenBank) putative tubulin binding protein
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
hap
Glaesserella parasuis SH0165
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hap00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hap02000
]
HAPS_0221
Transporters [BR:
hap02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
HAPS_0221
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
T2SSN
DIP2116-like_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACL31913
UniProt:
B8F3L1
LinkDB
All DBs
Position
245219..249124
Genome browser
AA seq
1301 aa
AA seq
DB search
MEKEQSLTQSPNDTAVKPHNTKWRWLWRGLCVLLILLLLPLAFLATGMGQRTALTLADKW
LDPLSIGKVEGSLQNGLTLTDTAYQLNGVNVQVGQAELHLDFSCLLTYSACVEKIAIKDT
QVAVDTSKLPPSTPTKQTSGEFNLPIGVSLKQISIDNVKVQVDELNIGLQHFQSGIQGKG
KSLSLSPTQLQGLTVSLAPQQTTEKPQKVAEAPSQSIDWEALKQQLAQSILTKLDPIQLP
VNLSVPEFQAKQLQLSQKVKTAKGISEKSLFKISLLELQAKSDEQSVELQKLNLQSDKGT
ISGIGKLTLSGNYPLDWKLNAQIPHLKELAIPASQADLILSGELFGIAELDLKTSGAFEA
NIHSTLQFSEPKTPLDLSIKSPKFSYPFISGKGKDPLVFEKIDLALKGDLLNYYLNGSLS
AKGMNIPPADLSLKGQGELTYFAVNEALLNALQGQTKFSGKVDWTNGLEWQSNLALQNVN
TKSIFPEWVALLSGEFRSQGFVGRGETGNEWAVVLDNMDLHGNLQQKHLQLKGTLTADHN
TLLNIPEASLIYGENRIVMQGVLGEKSDFNATIKAPNLQGLIPHLKANINGQIKLQGNIN
EPSLDLDLIANNVAYDQFQLQHLNAKGKVRTAQQVQGDLEIGLRQLTYGEITLENANLTA
NGSEANHSLKLTAKGKPVGIQLQLAGQFDRSKQQWQGELSNLNIHTPVGEWKNDKNLQVS
YHNQELKADVSAHCWRNPKATLCLPQTFSAGKEGKVPFEIKQFNLEMLQEYLPKESILTG
IINAKGDVAWFSQKSPEINVELLSNNLKFTQKLNGRSFPLSLSSLKLNGKIAENNLSLDS
DIRIENNGRLTSKLLMKELTKQRGLSGNINIDQLNLRLIEPLLSTDEKVNGDINARLTLG
GTALSPQLLGNLNLTGLQVHSKSMPFDVTGGMLALNFKGASSTLKGNIQTKESQLLLEGD
ANWQKLEAWHTRIKAQANRFRVDIPNIAKVDLSPYIEVKATPKELILGGNIDIPWARIAV
EELPESAVTISSDEVIMDGSAKNKNKATALLNKNLPQNNNGMAIKADVAINIGNDVKLDA
YGLKTDLNGIIKVQQGNRGLGLYGQVHLKNGTFASFGQDLVIRKGLISFTGLSSQPTLDI
EAIRNPEAMEDANVTAGVKVTGIADAPEVKIFSTPSMSQDQALSYILTGRGLDGGSDADS
SNSVAAALIGMSLSKSSKTVGTVGSAFGINDLNVTTAGIGDNTKVVVSGSLTPKFKVKYG
VGLFAPLTELTLRYRLAPSLYLQWVSSINQAVDLMYRYEFD
NT seq
3906 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaaagagcaatctttaacacaatcacccaatgatacagcagtaaaaccccacaac
acaaaatggcgttggttatggcgtggtttatgtgtgctactgattttgcttttattgcct
ttagcttttcttgcaacaggaatggggcaaagaaccgctttaacccttgcagataaatgg
ttagatccgctttcgattggcaaagtggagggaagcctacaaaatggcttaacgcttacg
gatactgcgtatcagctcaacggggtcaatgttcaagttggacaagcggaattacattta
gatttcagttgcttattgacatattcagcctgtgtggaaaagattgcaatcaaagatacg
caagtggcggttgataccagcaaacttcccccttccacaccaaccaaacaaacaagcggt
gagtttaatcttccaattggcgtatcgttaaaacagataagcatagacaatgtgaaggtt
caagttgatgaacttaatattggcttacagcatttccaatcgggcattcaaggaaaaggg
aagagcctttcattatccccaactcaattacaaggtttaaccgtttcccttgcaccgcaa
caaaccacggaaaagcctcaaaaagtcgctgaagccccttctcagtcgatagattgggaa
gccttaaaacaacagcttgcacagtcgatcttaaccaaattagatcctattcaattacct
gttaatctctctgtgccggaatttcaagcaaaacaattgcagttgagccagaaagttaag
accgctaaaggtataagcgaaaaatcgctattcaaaatcagtttgcttgagttacaagcg
aaatctgacgaacaatcggtggaattgcaaaaactcaacctgcaaagcgacaaaggcacc
atttcaggaattggcaaactcaccttgtcaggtaattatcctttagattggaaactcaat
gctcaaattccacatttaaaagagcttgcaattcctgcaagtcaggcagatctcatttta
tctggggaactctttggcattgctgagctagatctcaaaacaagcggtgcttttgaagca
aatattcacagtactttgcaattttcggaacctaaaacaccgcttgatctcagtattaaa
agcccaaaattcagctatccttttatctcagggaaaggtaaagatccgcttgtctttgaa
aaaatcgacctcgctttaaaaggcgatctactcaattactacttaaacggtagcttatcc
gccaaaggtatgaacattcccccagcagatttaagcctaaaagggcagggggaattaacc
tattttgcagtcaatgaagcattgctcaacgcactacaagggcaaaccaaattcagtggc
aaagtcgattggacaaacggcttagaatggcaatccaaccttgccttacagaatgtcaat
accaaatccatttttcctgaatgggttgcgttactatcgggggaatttcgttctcaaggc
tttgttgggcgaggtgaaacaggcaatgaatgggcggttgtgctagacaatatggatttg
cacggcaacttacagcaaaagcatttacagttaaaaggcaccttgacagcagatcataac
accttactcaatatccctgaagcaagtttaatttatggcgaaaaccgcattgtaatgcaa
ggtgttttgggcgaaaaatctgatttcaatgccaccattaaagccccgaatttacaaggt
ttaatcccacacttaaaagccaatatcaacggacaaattaagctacagggaaatatcaat
gaacctagtttagatctcgatcttatcgctaataatgtagcctatgatcaatttcagcta
caacatctcaatgccaaagggaaagtaagaaccgcacaacaagtgcaaggtgatctcgaa
ataggcttgcgtcaattaacttacggcgaaataacgctagagaacgctaatcttacagca
aatggtagtgaagcaaatcatagcctgaaactgaccgctaaaggaaagcctgtgggtatc
cagcttcagttagcagggcagtttgatcgtagcaaacaacaatggcaaggtgaactaagt
aatctcaatatccatacccctgttggcgaatggaaaaatgataaaaatctacaagttagc
tatcacaatcaagaacttaaagcagatgtttccgcacattgttggcgaaatccaaaagca
acgctctgcttgccacaaacatttagcgctggtaaagaggggaaagtgccgtttgaaatc
aaacaatttaaccttgaaatgctacaagaatacttgccgaaagagagtatattaacgggt
atcatcaatgccaaaggcgacgtagcttggtttagccaaaaatcgccagaaattaatgta
gagctactttcaaataaccttaaatttacacaaaaactgaacggacgcagtttccctctg
tccctttcatcattgaaattaaatggcaaaatcgcagaaaacaatttgagcttggatagt
gatattcgcatagaaaataacgggcgtttaaccagcaagctactgatgaaagaacttacc
aaacagcgaggactgtctggcaacatcaatatagatcagctaaatttacgtttaatcgaa
ccgctacttagcacagatgaaaaagttaatggggatattaacgctcgtttaacactgggt
ggaacagccctatctccacaactgctaggcaatttaaacttaacagggctacaagtgcat
tctaaatcaatgccatttgatgtaacaggtggaatgcttgccttaaactttaaaggtgca
agttcaaccttaaaaggcaatattcaaacgaaagaaagccaactattacttgaaggcgat
gcaaattggcaaaaactagaggcttggcatacacgaataaaagcacaggccaaccgcttc
cgtgttgatattcctaatatcgccaaagttgatctcagcccttatattgaagtaaaagct
acgccaaaagagttaatccttggcggaaatattgatattccttgggcaagaattgccgta
gaagaactacctgaaagtgctgtcactatcagtagcgacgaagtgattatggacggatca
gcaaaaaacaagaacaaagctaccgctttactaaacaagaacttgcctcaaaataacaac
ggaatggcaatcaaagctgatgtcgctattaacattggtaacgacgtaaaattagatgcc
tatggtcttaaaacagatctaaacggcattatcaaagtccaacaaggaaatcgaggatta
ggtttatatggacaagttcatttaaaaaacggcacctttgcctcttttggacaagatctc
gtaattcgtaaagggcttatatcctttactggattgtcttcccagccaaccctagacatt
gaagcgatccgcaacccagaagcaatggaagatgctaatgtaactgcaggggttaaagtc
acaggaattgctgatgcccccgaagtcaaaatcttctcaaccccgtcaatgtcacaggat
caggcattatcctacattttaactggacgaggattagatggcggtagcgatgcagattca
agcaattccgttgctgccgccttaattggaatgagtttatcaaaaagcagtaaaaccgtt
ggcaccgtgggcagtgcctttggtatcaacgatctcaatgtcactaccgcagggattgga
gacaacacaaaagtcgtcgtcagtggtagtttaacaccgaaattcaaagtaaaatatggc
gtaggacttttcgcccctcttaccgaattaaccttacgctaccgccttgccccaagcctc
tatttgcaatgggtgtcaagtatcaatcaagcggtagatttgatgtatcggtatgaattt
gattag
DBGET
integrated database retrieval system