KEGG   Glaesserella parasuis SH0165: HAPS_0452
Entry
HAPS_0452         CDS       T00825                                 
Symbol
vtaA4
Name
(GenBank) virulence-associated trimeric autotransporter
  KO
K21449  trimeric autotransporter adhesin
Organism
hap  Glaesserella parasuis SH0165
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hap00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02000 Transporters [BR:hap02000]
    HAPS_0452 (vtaA4)
Transporters [BR:hap02000]
 Other transporters
  Pores ion channels [TC:1]
   HAPS_0452 (vtaA4)
SSDB
Motif
Pfam: YadA_head YadA_stalk Collagen YadA_anchor ESPR DUF4261 Nudix_N FliO
Other DBs
NCBI-ProteinID: ADZ54065
UniProt: F2GDE0
LinkDB
Position
complement(482091..486233)
AA seq 1380 aa
MNKIFRVIWSHAQQAWVVVSELVKSHTKTSAYTDKRAQVCTSDYFLDKQQDKFKLSLLSL
VLLGIFFNPVAGSTTDLSYFQHGATYGNKHRSDAGTIGIGRQSTAGPGSIAIGQHTKADG
RTVVAIGYSAVTTDMGSPVAIGGHTKANGESAIAIGVHSSSGGKESIVLGHKANTTAGQT
VVIGAHASAKGQQSVAIGADTKADGYGSISIGGDDLKTTKYHANNSNHIPTTASGKASVA
IGGMSLARGDGSIVLGPVASATHTEGIAIGARSKSTADYGIAVGGGATAGKNAVAVGRDS
KGTGTNSIAIGNSAKTTGPDSVVVGANINVTDGQLVAIGYQASAKSRSTALGYKASAGGR
SSVAVGEEAKTTPDRSTALGNNTVVSVGGGVALGYGSNANTAGGVEGLKQTHSVTTEPST
DKNGFKSTGSVDNNPIGAVSVGVGSGNKLIKRQITNVAAGKELTDAVNVAQLKSLTMKIG
GNTNDNTQPKVGLWAGTLNVKGDNGLTSHANGDTITVKLKPDVKNKIDKIDGLETQINKG
ITFKGDNFTQTDSIKLGETLKVEGKDKETVVTAKNKQLIIGLDIGVINQLAQIDTKMSSF
KIKTNNTEATIKDGNTIQFTAGSNIKLEQTNGKITISTIGKLIKETKILADGGLKITYTD
GSSDTIAKGKDGKNGEKGEKGDGGEQGSAGTRGEAGPVGPAGSPGATGPAGPKGDTDQRG
ETGPAGPAGAKGDKSDTGPAGPVGPGGEPGPKGEQGIPGVAGPKGDRGEAGSMGPQGPQG
TAGAQEPKGDKGDPGQAGPAGPQGPASPTGSQGPAGSTGPAGPTGPQGPTGPTGPTGPAG
PKGENVGRGLGLKDDAESNKTALTPTDAQKAIAGDNKDGKGGLLAQTGDALNNVATVKDL
QAIAQAGLALTGNNADTTVHRPLGTKLTVEGEGKWDGKASAANNLYVEAQEADNKLVVKM
RNDLKNLNSVTLGTATMTGDKNTINLTGAGEKVEEEFVKWDPVTKQPILDENGNLQKYKE
KVDPRVKLSGIADGDISPNSTDAVNGRQVYVLNNRIRFFHTNDGHNAEEQINHKSNTVDS
RATGSYSTAVGYKAHAKGDRAVAFGNSTLAGIQSVAIGNVAIASGEKSIAIGDNAKAVGN
QSISIGTGNVVNGNNSGAFGDPSVINADNSYSVGNNNTIENENVFALGNKITNTTSNSVF
LGTNSGYVAAGATTAGAGALESQVTGGVYNAYAGGKATEVVGVVSVGNVDSNGKMETRRI
QNVAPGLISEQSTDAINGSQLYSLISQHKVHMGDIHNKINRNNKALRAGIAGSNAAAGLP
QVYLPGKSMVAASAGTFKGQSALAVGYSRASDNGKLILKLQGNANTSGEMGGSVGVGYQW
NT seq 4143 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaataaaatatttagagttatttggagtcatgctcaacaggcttgggtggttgtatct
gagttagtaaagtctcatactaaaacatccgcttacacggataaaagagctcaagtatgc
acctcagattattttttagataaacagcaagataaatttaaattaagtcttttaagtcta
gtattactgggtatattttttaatccagtagcaggttcaactactgatttatcatatttt
caacatggtgctacttacgggaacaaacataggtctgacgccggtactattggtattggt
agacagagtacggctgggcctggttctattgccatcggtcagcatacaaaagctgatggt
aggactgttgttgcgataggttattcagcagtaacgacagatatgggctcccctgttgcg
ataggcggccacactaaagcaaatggggagagcgcaattgccataggggttcattcaagt
tcgggaggaaaggaatctattgtcttaggccacaaagccaatacgacagctggtcaaaca
gttgtaataggtgcacatgctagtgcaaaagggcaacaatctgttgctatcggggcagat
accaaagcggatgggtatggctccatatcaatcggtggagatgatttaaagacaacgaaa
tatcacgctaataattcaaaccatatcccaacaacagcgagtggtaaagcctctgttgct
attgggggtatgtctttggctaggggcgacggatctattgttttaggtcctgtagcatct
gcaactcatactgaaggcattgctatcggtgcgagaagtaagtctaccgctgattacggt
attgcggttggtggtggtgcaactgctggaaagaacgccgttgctgttggtagggactcg
aaaggtactgggacaaattccattgcgataggtaattctgcgaaaacaacagggccagac
tctgttgttgtgggtgccaatatcaatgtgacagatggacaattagtggcaattggatac
caagcaagtgctaaaagtcgttctactgccttgggttataaagcctctgccggtggtagg
agctctgttgctgtgggtgaagaggcaaagacaacaccagacagatcaaccgcacttggt
aataataccgttgtcagcgtgggtggcggtgtggcattaggttatggttctaatgcaaat
acagctggcggtgtagaggggttaaaacaaactcattctgtcacaacggaaccaagtact
gacaagaacggctttaaatctacaggaagtgttgataacaatcctattggtgcggtttct
gtcggtgtaggctcaggtaataaactcatcaaacgccaaatcaccaacgttgctgcaggt
aaagaattaaccgatgcggtaaacgtggcacagcttaaatctttgacgatgaaaattggt
ggtaataccaatgataatacacaaccaaaagttggcttgtgggctggtacgctcaacgta
aaaggcgacaacggtcttacttcccatgctaatggcgatacgattacggttaaattaaag
ccagatgtcaaaaataaaattgataagattgatggcttagagactcaaataaataaaggt
attacttttaaaggagataactttactcaaactgattcaattaagctaggggaaacacta
aaagttgaagggaaagacaaggaaacagtcgttactgcaaaaaataaacaacttattata
ggtttagatattggtgttataaatcaactggctcagattgacactaaaatgtcatccttt
aagattaaaacgaataacactgaagctacaattaaggatggaaatacgatccagtttact
gcaggaagtaatattaaattagaacaaacgaacggaaagattacgatttctacgattggt
aagttaattaaagagactaaaatcctagcagatggtggtttgaaaattacttatacggat
ggcagcagtgatactattgctaaggggaaagacggtaaaaatggtgagaaaggtgagaaa
ggtgatggaggggaacaaggctcagcagggactagaggtgaagctggtccagtgggtcca
gcaggatcaccaggtgcaactggtcctgcaggtccaaaaggtgatacagatcagagaggt
gaaactggccctgcgggtccagcaggggctaagggtgacaaaagtgatacgggccctgcg
ggtccagtagggcctgggggtgaaccaggtcctaaaggtgaacaagggattccaggggta
gcaggtcctaagggcgatagaggcgaagctggttcaatgggaccacaaggaccgcaggga
acagcgggtgctcaggaacctaagggggataaaggcgatccaggacaagcgggtccagca
ggaccacaaggccctgcgagtccaacgggatcacaaggacctgctggttcaacggggcct
gctggtccaacgggaccacaaggacctacgggtccaacgggtccaacggggcctgctggt
ccaaaaggagaaaatgtgggccgtggtttaggtttgaaagatgatgctgaatcaaataaa
acggcacttacccctacagatgcacaaaaagctattgctggtgataacaaagacggtaaa
ggcggcttattggctcaaacgggtgatgcgttaaataatgtagcgacagtgaaagattta
caagccattgcacaagcgggcttagccttgacgggtaacaacgccgataccactgtacat
cgtccattgggtacgaagttaaccgttgagggtgaaggcaaatgggatggtaaggcctca
gcggctaataacctttatgtggaagcgcaagaggcagataacaaacttgttgtgaaaatg
agaaatgatttaaagaacttaaattctgtgactttaggcactgcgacaatgactggtgat
aagaatacaatcaaccttactggtgcaggagagaaagtcgaggaagagtttgttaaatgg
gacccagtgactaaacaacctattcttgatgagaatggcaatctccagaaatataaagag
aaagttgatcctcgtgtgaaactgagtggtattgctgatggtgatatttcaccaaatagt
actgatgcagtgaatggtcgccaagtttatgttttaaacaatcgtatcaggttcttccac
accaatgatggtcataatgcagaggagcaaattaaccataagtcgaatacagtggactct
cgtgcaacaggttcatactctactgcagttggttacaaagctcacgcgaaaggggataga
gcggtcgcatttggtaacagtacattagctggcatacaatcggtggctattggtaacgtt
gcaattgcttcaggcgaaaaatcgatagctattggtgataatgctaaggctgtgggcaac
caatctatctctatcggtacgggtaacgtagtgaacggcaataactccggtgcatttggt
gacccaagtgtgattaatgctgataactcttattctgtgggtaacaataatacgattgag
aacgaaaatgtctttgcattgggtaacaagattaccaatacaaccagcaactcggtattc
ttgggaacaaactcaggctatgtggcagcaggtgcaaccactgcgggggcaggtgcttta
gaaagccaagtaacaggcggcgtgtataacgcttatgccggcggtaaagcaactgaagtt
gtaggcgtggtgagcgtgggtaatgtagacagtaatggcaaaatggaaactcgtcgtatt
caaaacgttgcacctggtttaatctctgagcaaagtaccgatgcgattaatggtagccag
ttgtatagcttaatatctcagcacaaggtgcatatgggcgatattcacaataagatcaac
cgtaataataaagctctgcgtgcgggtattgcaggttctaacgccgcagcaggtttacca
caggtttatctccctggtaaatcaatggttgcggcatcagcggggactttcaaaggtcaa
tctgcattggctgtgggttactcaagagcatcagataacggcaagctgatccttaaatta
caaggtaatgcaaatactagtggtgaaatgggcggctctgtgggggtaggttatcagtgg
tag

DBGET integrated database retrieval system