Glaesserella parasuis SH0165: HAPS_0753
Help
Entry
HAPS_0753 CDS
T00825
Symbol
aidA
Name
(GenBank) putative pertactin family virulence factor, outer membrane autotransporter/Type V secretory pathway, adhesin AidA
Organism
hap
Glaesserella parasuis SH0165
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Autotransporter
GlxA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ACL32397
UniProt:
B8F4Z5
LinkDB
All DBs
Position
complement(763157..765733)
Genome browser
AA seq
858 aa
AA seq
DB search
MHFRKSPLALAILLCLSPIPEMNYANAQTYTVTGSSINDSEAQFRRALEQANDGDTIRLA
GDIQLMRGSGFFSFDKKITIDGQGNRLHFEGYNLSLGKDVTFSNVNLSLKPSRDLNNIFG
SGFNNLKAASTYIVTNGNKLILDNVRTNVNGEPADTRPMILLGNIDPTKNNNGHDALVVT
NAHPTETILSSVVVIGNNNSNTDTPVTISLGENVSFVNQVIFEREGEEDIYSGAVYLAGM
NNDQEHNRAINFSSSSNAITKIYTGEATNVSVTLNNINPETAITLQDVKDLTLNNSRITL
DKNLSVSETLTLNNQSAITTVASKDAFGDIAKTSLMLNNIHTNGNNSNITIVRDNALLIN
GNITGELTINTEDKDNNVSLPNGSTLVGENGSYVVKLKTEVTQPVSENTTTDSSNTDVTP
AKPTDSTPATTGEQTGSSDITSPTDTAATSNETTPPATTGDTATNSSNTDVPPATPTDST
PATTGEQTGSSDITSPTDTAQTDDQAEASSSDTATSTPAQPTGDVASTSEQATTSSTSTN
HNKITITTAEQETQRAIAESRYATVVSNFALNSIRNRLEHSRSSNAYPYLTATVNGMIPT
VSEPGRLWVNSSSDRITQDLYKFNNFGLQVGYDKSSALDNGTARFGFALDVEKGKANFAQ
FSETYKTQTYGMALYGAYETEDRHYLDVAVRMARASNELKSNASQAYHHNLYSASLAYSK
GFELSNRWEIEPYTQLFYTHLSSTNYIRNGLNVTADEINSLVGSIGAKAQYQLNQTLNFY
TKVAMHREFNATQDIHIIRSATDRVQHNINHRGTWTTLGLGMKARLGNNTHLYLDADKLF
GNGYKQSYQITLGLDWKF
NT seq
2577 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgcatttccgaaaatcccccttagcgttagctatcttattatgtttatcccctattcct
gaaatgaattatgcgaatgctcaaacgtatactgttacaggtagctctattaatgacagc
gaagcacaattcagacgtgctctcgaacaggctaatgacggagatactattcgtttagct
ggcgatattcaattaatgcgtggcagtggcttttttagttttgataaaaaaataacaatt
gatgggcaaggaaatcgcctacattttgaaggttataatttatcattaggaaaagatgtg
actttttcaaatgtgaatttatccttaaaacctagtcgagatttaaacaatatttttggt
tctggatttaataatttaaaagcagcatctacctatattgtgaccaatggaaataaattg
atcttggataatgttagaacgaatgttaatggtgaacctgcagatactcgcccaatgatt
ttacttggaaatattgatccaacaaaaaataataatggacacgatgctcttgtagtgaca
aatgctcacccaacagaaacaatattatcttcagtggttgttataggcaataacaattca
aatactgacaccccagtaacgattagtttaggggaaaatgtcagctttgttaatcaggta
atatttgagagagaaggagaagaggatatatatagtggtgcggtgtatctagctggaatg
aataatgatcaagaacataacagagctattaatttctctagttcatcaaatgctatcact
aaaatttatacgggagaagctacaaatgtttctgttacgttaaataacatcaatcctgaa
actgctatcactttacaagatgttaaagatttaacattaaataatagccgtattactttg
gataagaatttatctgtttcagaaaccttaactctgaataatcaatccgcaatcactaca
gtggcgagtaaagatgcttttggtgacatcgctaagactagtttgatgttaaataatatc
cataccaatggtaataatagtaatatcactatcgttcgggacaatgctcttttgattaat
ggtaatattactggtgaattgactattaatacagaagataaagataataacgttagtctt
cctaatggcagcactttagtaggagaaaatggcagctatgttgtgaagctaaaaacagaa
gtaactcaacctgtatcagaaaatacaactactgacagcagtaatactgatgtaacccct
gctaaacctacggatagcacaccagcaacaacaggcgaacaaactggttcgtcagatata
acatcgccaacagatacagctgcaactagcaatgaaactacaccgcctgctacaacggga
gatacagcgactaacagcagtaatactgatgtaccccctgctacacctacggatagcaca
ccagcaacaacaggcgaacaaactggttcgtcagatataacatcgccaacagatacagct
caaacagacgatcaagcggaggcttctagctctgacactgcaacatctacaccagcacaa
ccaacgggcgatgtagcttcaacaagtgaacaagcgacaacgtcgagtacatctacaaac
cacaataaaatcacaatcaccacggcagaacaggaaacacagcgagcgattgcggaaagt
cgttatgccaccgttgtatctaactttgcattaaattctatccgaaacagactagaacac
agccgttcaagtaatgcttatccgtatttaactgcaacggtaaacggcatgatcccgacg
gtttctgagccaggtaggttatgggttaattcaagctctgatcgaataacgcaggatcta
tataaattcaacaattttggattacaagtaggttatgataaatcctcggcgttggataat
ggcacagctcgttttggcttcgctttagatgttgaaaaaggcaaagctaactttgctcaa
ttctctgaaacatataaaacccaaacatacggtatggcgttatatggtgcttacgaaaca
gaagatcgccattatttagatgtcgcagtgagaatggcaagagcatctaatgaactaaaa
tccaatgcttcgcaggcgtatcatcacaatctctattctgcatcactggcttatagtaaa
ggttttgaattgagtaaccgctgggaaatcgaaccatatacgcagttattctatactcac
ctaagttctacgaactatattagaaatggcttgaatgtaacggctgacgaaatcaacagc
ttagttggtagtattggagctaaagcacaatatcaactcaatcaaactttgaatttctat
actaaagtcgcaatgcatagagaatttaacgctacacaagatattcatatcattcgtagt
gccacagacagggttcaacataatatcaatcatcgtggaacttggacaactttaggatta
ggtatgaaagctcgtctaggcaataatacccatttatatcttgatgcagataaattattt
ggtaatggctataaacaaagttatcaaataactttagggttagattggaaattttaa
DBGET
integrated database retrieval system