Halanaerobium hydrogeniformans: Halsa_0413
Help
Entry
Halsa_0413 CDS
T01349
Name
(GenBank) protein of unknown function DUF490
KO
K09800
translocation and assembly module TamB
Organism
has
Halanaerobium hydrogeniformans
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
has00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
has02000
]
Halsa_0413
Transporters [BR:
has02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
Halsa_0413
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TamB
TamB_N
YhdP
AsmA
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ13888
UniProt:
E4RP63
LinkDB
All DBs
Position
472226..476665
Genome browser
AA seq
1479 aa
AA seq
DB search
MDKQIKYLIGVLIFLILAAYVLSLLSGLPRFFEDDIIALLEREIGGDIAFESISLWPLNR
INIEEFEYSDELGNSFRAEEFELDYSFNFRADNGFIGIEFIGLKNAVIEIEELDIELPGA
GPDLEETTEEELEKELADRAAELELPAFLANFDLNIEDSVLYSRLEDYSFRLDSLNLGLR
ARSVKDFDFNFSSEVEISQILLPDGQYLSDFNLDKLELNLKQSEQQTDLYLNTSKIDLAS
LGQLLEVESYNLAEFTLDLDEIEGLAAFKGQINFGEGKIESYQAEIGLENIKLPANYQFE
NEAGQQREEFEFSLAEGDLLIDGPELRAAFAKSLIDIDNNIIELAFKYSVDGDFEIQAAA
DALRLDYEFLEEYLSSGIFDFKLFAEGEDDNFKKGSLELSAQNLSTALDFEIEQSSFELR
LLDEDIFLDRGELNFADGGELNLKGNYNYQNNNYLLNAEATELKLNQQLQNLIEEFELDN
PTLDLLLANEAKELDFLIDTAGIYTGDRDLSSTGELSLDLRLSEDREFSFLSSFWYYEEI
LNLSSFKMESDHGRLDLSGEINFADQSLDLSYAGRDIDPTLIASLNGFEEEFLADLNTVF
DHLEGSVSSSFNNPRATLTAEMSHLSYQNYNLENLTLRAVYEEHNLDLQRFSADLNQGEL
LGSGRIDNLNRPSEAELALNFNTDNFYYNDISEIINRELPLNGAVNIEVALGGTLFDPDI
NLHLEADNTIFLSAGQEFEFSTLNARLSRENSRFELEELRAVHQDLEFNAAGSYDQQDGF
EIDYQLQNFELSQYLGEFIPRSDTLSGIVDLEGELRGDIFAPQLDFNIISNSLSYQNLEI
EFLENSFSYLVLEDRLILEQFDFMVDQGSYDLSGELSELRTVQRADLELAIKEVPLKNTV
EKFANFYPLAEDMILNGRAEISGEGRDVAAQLDISGNFMEHQNSSFEISGKAGRELDIDF
SSSDIPIDFVYRQFDYNLSLISNFACEGSISGSIDAPLLELEHSLTEITLNEIAIESLEG
EFTFEDGNFISVQERIEFQQGGNLELEGSYSILEDQLDLDSEINSLPIAFLLSFFSEDMT
ADGQIDGNVSVTGSIEEAILGGELRIAGRSLELGLSHPIRDFKGVIELSRSNIIVQRLDG
LFADGNFDVSGNIDLFAEENAWNLDLKGERLYFLRGSVDGEFNLDGKFTGALLDPVLTGD
LEAYNMKIGIPFEWPEPQFDEDDFVPRVDIDIVPLDEVRVRNPNMNVLVESGSLNINFDN
TREDVLEMEGRLRSNQGVFNYYNSRFTLVNGQAIFTPVDEDNIPSLRVNAVTYAGGREIN
INLTGPADDMRITLTSTPEMTEEEILHLLTTRGALGTAILGDEEVGIESIILQELTRLLN
VFFQEDVISKIESGFQRALDLDRLEIDAFQYGLEREFAIYLGKDLSDKLYLEYASFFAEG
EEREGELSFQYRLTDITSLKGSYFGDDEYQISIETEFGF
NT seq
4440 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggataagcaaattaaatatctaattggtgttctgatattcttgattcttgctgcttat
gtactaagcttattatcaggccttccaagattttttgaagatgacattattgccctgctg
gaaagagaaatcgggggcgatattgcctttgaatccatttcactatggcctctcaacaga
ataaatattgaagaatttgagtacagtgatgaacttggtaattcctttagggccgaagag
tttgagcttgattatagttttaacttcagggctgataatggttttatcgggatagaattt
atcggcttaaaaaatgctgttatagagatcgaagaacttgatattgagctgcccggtgct
ggcccggatcttgaggaaacaaccgaagaagaactggaaaaagagttggcagatagggca
gcagaactagagttgccggcatttttggccaattttgatctaaatatagaagattcagtg
ctgtattcacgtctggaagattatagttttagattagattctttaaatttaggtttaaga
gcaaggtctgttaaagattttgattttaacttcagttctgaagttgagatatcccaaatt
ctactacctgatggtcagtatttaagtgatttcaatttagataaattggagctcaactta
aagcaatcagagcagcagacagatttatatttaaatacttctaaaatagatttagctagt
ttgggacagctgcttgaggtagaaagctataatttagctgagttcacacttgatctggat
gaaattgagggtctggcagcttttaaagggcagatcaattttggtgaaggtaaaatcgaa
agttatcaggcagaaatcgggctggagaatattaagctaccagctaattatcaatttgaa
aacgaagcaggtcaacagcgagaagagtttgagttcagtctggctgaaggagatttgttg
atagatggccccgaattgagggctgcctttgctaagagtttgatcgatatcgataacaat
attatagagcttgcatttaaatacagtgtagatggtgattttgaaattcaagctgcagct
gatgccttaagacttgactatgaatttttagaagaatatctcagctcaggaatcttcgat
ttcaaactatttgctgaaggtgaggatgataactttaaaaagggtagtctggaacttagt
gctcaaaatctgtcaacagcacttgattttgaaatcgagcagagcagctttgagttgaga
cttttagatgaagatatttttcttgatagaggagaattaaatttcgctgatggtggagag
cttaatctgaaaggaaactataattatcagaacaataactatcttttaaatgcagaagct
accgaacttaaattaaatcaacagctgcagaacttaattgaagagtttgaattagataat
cctactttagatctactgctggcaaatgaagctaaagagcttgattttttaatagatact
gccggtatttatacaggggatagagacctttcatctaccggagagttaagccttgacctc
agattgtctgaagacagagagttttcttttctttcttctttctggtattatgaagaaatt
ttaaatttaagcagctttaaaatggaatcagaccatggcaggttagatttaagtggagaa
atcaattttgccgatcagagccttgatttaagttatgctggccgggatattgatccaact
ttgatcgccagtttaaatggttttgaagaagaatttttagcagatttgaatacagtgttt
gaccatcttgagggttctgttagcagcagttttaataatccaagggctactttaaccgct
gagatgtctcatctcagttatcagaattataatttagaaaatttaactttaagagctgtt
tatgaagagcacaatctggatctgcagagattttcagctgatttaaatcagggagaacta
ctgggttcaggtagaattgataacctgaatcggccttcagaagcagagcttgctttaaac
tttaacacagataatttttattataatgatatttctgagataattaatagagaactaccc
ttaaatggagctgtaaacatcgaagttgctctaggtggtaccctctttgatccagatatt
aatcttcatctggaagcagataatactatatttctttctgcaggccaggaatttgaattt
tcaactttaaatgccagactgtctagagaaaattctcgttttgaactggaagaattacga
gcggttcaccaggatctggagttcaatgctgctggcagctatgatcagcaggatggtttt
gaaatcgactatcagcttcaaaactttgagcttagtcagtacttaggggagtttattcct
cgttctgatactttaagtgggattgtagatcttgaaggagaattaaggggcgatatcttc
gcacctcaattagattttaatattatctctaattctttaagttatcaaaatttagagata
gaatttttagaaaacagctttagctacctggttttagaagatcgtttaatccttgagcaa
tttgatttcatggttgatcagggtagctatgatctcagtggagaactgtcagagcttaga
actgtacagcgagctgatttagaattagcaattaaagaggttccgctaaaaaatactgta
gaaaaatttgctaatttttacccattagcagaagatatgatcctaaatggtcgggctgaa
ataagtggagaaggaagagatgttgcagctcaacttgatatcagtgggaactttatggaa
catcagaattctagttttgaaatcagtggtaaagcaggtagagaattagatatagatttt
agttcatctgatatcccgatagattttgtctacaggcagttcgattacaatttgagtttg
atcagtaattttgcctgtgagggtagtatcagcggtagtatagatgctccactgcttgag
cttgaacacagtttaacagagatcacccttaatgagatcgcaatagaatctttagaaggt
gaatttacctttgaagacggtaactttatttctgttcaggaaagaatagagtttcaacag
ggtggtaatcttgaacttgaaggcagttattcgattttagaagatcagcttgatcttgat
tctgagatcaattcactacctatagcctttttgctgtcctttttctctgaagatatgaca
gctgatgggcagatagatggtaatgttagtgttactggtagtatagaagaagctatttta
ggtggagaactaaggatcgccggtcgttcactagagctcggcttatcccatccgatcaga
gattttaagggggtaatcgaactaagccgttctaatattattgtacagagactggatggt
ttgtttgcagatggtaattttgatgtcagtggaaatatagatctttttgctgaagaaaat
gcctggaacctggatttaaaaggagaaagactctactttttaaggggttctgttgatgga
gagttcaatctcgatggtaaatttactggggccctgcttgatccggttttaacaggtgac
ttagaagcctataatatgaaaattggtataccatttgaatggcctgaaccacagtttgat
gaagatgattttgtgcctagagttgatatagatatagtacctttagatgaagtaagggtt
cgtaaccctaatatgaatgttctcgttgaaagtggcagtttaaatattaattttgacaat
acaagagaagatgtgctggaaatggaaggccgcttacgcagtaaccagggggtatttaat
tattataattctcgttttaccctggttaatggtcaggccatctttaccccggttgatgag
gataatataccatctctaagagttaatgcggttacctatgccggtggtagggagataaat
atcaatttaacaggaccggcagatgatatgcggataaccctgacttctactcctgagatg
actgaagaagaaatacttcacctgctgacaacaagaggtgctttgggtacagcgatttta
ggtgatgaagaagtagggatagaaagtatcattttgcaggaactgaccagattattaaat
gtttttttccaggaagatgtgatcagtaaaatagaaagtggttttcagagggcattagac
ctcgacagattagagattgatgcttttcagtatggattagaaagagaatttgcaatttat
cttggtaaagatcttagtgataagctttatctagaatatgcaagcttttttgctgagggt
gaagagagagaaggagaactttccttccagtatcgtttaacagatataacatctcttaaa
ggaagctattttggagatgatgaatatcaaattagtatagaaacagagtttggattttaa
DBGET
integrated database retrieval system
