Halanaerobium hydrogeniformans: Halsa_0607
Help
Entry
Halsa_0607 CDS
T01349
Name
(GenBank) polysaccharide biosynthesis protein CapD
Organism
has
Halanaerobium hydrogeniformans
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
Polysacc_synt_2
Epimerase
CoA_binding_3
GDP_Man_Dehyd
RmlD_sub_bind
3Beta_HSD
NAD_binding_4
C2185-like_N
PglD_N
adh_short
KR
Shikimate_DH
ThiF
TrkA_N
CoA_binding
GFO_IDH_MocA
NAD_binding_10
NmrA
Lys_Orn_oxgnase
Pyr_redox_2
NAD_Gly3P_dh_C
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ14063
UniProt:
E4RLY0
LinkDB
All DBs
Position
703388..705262
Genome browser
AA seq
624 aa
AA seq
DB search
MLEYLLKLYKKPRLIIIDLLLINFALIFSFMLRFDENWLQYFRFSYFIAITIISFVILYF
SSLYNKMWQYASMSELYSIFKAALAINFVFVIYLYFFRVAFPRSIIAINLMSNIFLLGGF
RFSLRLLKDFLNRNQNKKSKSRVLIIGAGDAAEIIIREMHKHPELGKKIVGLVDDDPDKQ
SLEIHGYEVLGKTKKIPQLIEEYDVDEVIIAIPSAEGKTIKRLYKLSNKKDVKVKIVPGV
YEILKGDVSLNQIREVKVEDLLRRDQVDLITDEISDYLEEKTILVTGGGGSIGSELCRQL
AKFNPKEIIIFDINENNTYFLERDLEDEYPDLKITSIIGSIRDKNKLQNLFREFEIDVAF
HAAAHKHVPLMETSPEEAVKNNILGSRNVAEVAAEFKIDRFVLISTDKAVNPTNVMGASK
RAAEMIVQSINKKSETKFMAVRFGNVLGSQGSVIPLFKKQIANGGPLTVTHKDITRYFMT
IPEASQLVIQAGALGEGGEVFVLDMGEPVKIMELAEDLINLSGLTPYEDIDIDVVGLRPG
EKLYEELLCNTEDNIATKHQRIFINNLEAVDGEFLNMHLSKLERLAEQADALEIISALVN
LVDSYQPRRDNVKKIDFKNKQKSS
NT seq
1875 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgctcgaatatttattaaaattgtataaaaaaccacgtttaataatcatagatttatta
ttgattaattttgccttaatattttcttttatgcttcgttttgatgaaaattggctgcag
tattttagattcagctattttattgcaattactataattagttttgtaatcctatatttc
tcatctctatataacaagatgtggcagtatgccagcatgtcagaactatactccattttt
aaagctgctctagcgattaattttgtttttgtgatctacctatatttctttagagttgct
tttccccgcagtataatagcaattaatctgatgtcaaatatctttttgctgggtggattt
agattttctttgcggctgctcaaggactttttgaaccgcaaccaaaacaaaaaatctaaa
agtagagttttgattattggtgccggtgatgcagcagaaataatcattagagaaatgcac
aaacatccagaattaggcaaaaaaatagttggtttggtagatgatgatcctgacaaacaa
tcactggaaattcatggttatgaagtacttggaaaaaccaaaaagataccccaacttata
gaagaatatgatgtagatgaagttattatagcaataccttctgcagaaggtaagacaatt
aaaaggctatataaactcagtaataaaaaagatgtaaaggtcaaaatagtacctggagtt
tatgaaatactcaaaggtgatgtttccttaaatcagattagggaagttaaagtagaagac
cttttaagaagagatcaggtcgacttaattactgatgaaatatctgactatctggaagaa
aaaactattttagtaacaggtggtggaggttcaatcggttctgaactctgccgacagtta
gcaaaatttaatccaaaagaaataattatttttgatattaatgaaaacaatacatacttt
ttagaacgcgatttagaagatgaatatcctgatttaaagataacatctattatcggtagt
attagagataagaataaactacagaatttatttagagaatttgaaattgatgtagccttt
catgcagctgctcacaaacatgttcccttaatggaaacaagcccagaagaggctgttaaa
aataatattctaggaagtagaaatgtagctgaagttgctgctgaatttaagattgatcgt
tttgttttaatttccaccgataaagcggtaaatccaaccaatgttatgggggcttctaaa
agagctgccgaaatgatagtccagtcaattaataaaaagtctgaaacgaaatttatggca
gttcgctttggcaatgttttaggcagccagggaagtgtaattcctttatttaagaagcag
attgccaatggtgggcctttaacggtaacccacaaagatataacccgctattttatgacc
atccctgaggcttctcagcttgttatacaggccggagcattaggtgaagggggagaggtc
tttgtgctcgatatgggtgaaccggttaaaattatggaattagcagaggatttaattaat
ctttctggtttaactccctatgaagatattgatatcgatgtagttgggttaagaccggga
gaaaagctttatgaagaactgctctgtaatacagaagataatattgcgacaaaacatcaa
aggatctttatcaataatctggaggctgtggatggagagtttttaaatatgcatctaagt
aaattggaaagattagctgagcaagctgatgctttagagatcatctctgctttagttaat
cttgttgatagttatcaaccgaggcgagataatgtaaaaaagatcgattttaaaaataaa
cagaaatcatcttag
DBGET
integrated database retrieval system