Halanaerobium hydrogeniformans: Halsa_1078
Help
Entry
Halsa_1078 CDS
T01349
Name
(GenBank) alpha amylase catalytic region
Organism
has
Halanaerobium hydrogeniformans
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Alpha-amylase
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
ADQ14512
UniProt:
E4RMI1
LinkDB
All DBs
Position
complement(1222156..1223952)
Genome browser
AA seq
598 aa
AA seq
DB search
MRKYKSINLKEITKDKKYFKSPDAWDEEIFYFLLVDRFNSHQEDYPLYDPNKDYENAIQN
ETDKDKWIKAGDKWVGGTLRGIIEKLNYLKDLGVTVLWISPVLKQPKFSNNYHGYGIQNF
LEIDPHFGTKEDLKELVDKAHSMGLYIILDVIINHSGDVFAYENDNPAYNGQEYKVKAFR
DETGEPNIDPENPDYDKSWPEGGVWPQEIFNLETFSRKGYITDWDNDPEYREGDFYSLKN
INTGTGDIKNYHPSQALKILTECYKYWIAYADLDGFRLDTVKHINPGAVRYFVQELKEFA
QTIDKKDFFIVGEITGGMEFAKMICEKTGLNAALGINKIPENLEYVAKGYYPPENYFSIF
TNTEQMEEGKHQWYHKKVMTMLDDHDMVYKQHHKERFCADKKTAPLLINAEFINYFTAGI
PCIYYGTEQGFDGNGDNDKYIRESMFGGDFGAFRTKNRNFFNKNNPIYQEIKNFADIRNE
YVHLRIGRQYLRNISKFNEQEFHLPSFDEKRYKEIIAWSRVFSQEEFLLAVNCNLENEKS
ARVMVDGTLHQPGDKFECIYSSEKEHVGKEIEVIKTDTWNQHLEIHIPAQGRIIYKSI
NT seq
1797 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgagaaaatataaatcgataaatttaaaagaaataacaaaagataaaaaatattttaaa
tcaccagacgcctgggatgaagaaattttttattttttacttgttgataggtttaattca
catcaagaagattatcccttatatgacccaaacaaagattatgaaaatgcaattcaaaat
gaaactgataaagacaaatggattaaagctggagacaaatgggttggaggaactttaaga
ggaatcatcgaaaaattaaattatttaaaagatttaggagttactgtgctctggataagt
cctgtgcttaaacagcctaaattttctaacaattatcatggttatgggattcaaaacttt
ttagaaattgatcctcattttggcactaaagaggatttaaaagagctggtagataaagca
cattcaatggggctctatattatattagatgtgattattaatcattcaggtgatgttttt
gcctatgaaaatgataaccctgcctataatggccaagaatataaggttaaggcttttaga
gatgaaactggagagccaaatattgacccagaaaatcctgattatgataaaagctggcct
gaaggaggagtttggccccaggagatatttaatttagaaacatttagccgtaaaggctat
attactgattgggataatgatcctgaatatagggaaggtgatttttattctttaaaaaac
atcaacactggtactggagatataaaaaattatcatccttctcaagcattaaagattctt
acagaatgctataaatactggatcgcatatgctgatttagatggatttagacttgataca
gtaaaacatataaatcctggagctgtacgctattttgtacaagaattaaaggaatttgcc
cagacaatagataaaaaagatttctttattgttggagaaatcactggaggaatggaattt
gcaaaaatgatctgtgagaaaaccggtcttaacgctgctttgggaattaataaaataccc
gaaaatttagaatatgttgctaaaggatattatcctcccgaaaattatttttcgattttt
accaatactgagcagatggaggaaggtaaacatcaatggtatcataaaaaagtaatgacc
atgcttgatgatcatgatatggtttataaacagcatcataaagaaagattttgcgctgac
aaaaaaacagctcctttattaatcaacgctgaatttattaattactttacagctggcatt
ccctgcatttattatggaacagaacagggttttgatggcaatggtgacaatgataaatat
ataagagaatcgatgtttggcggtgattttggagctttcagaactaaaaacaggaatttt
tttaataaaaataatccgatttatcaggaaattaaaaattttgctgatattagaaatgaa
tatgttcatcttagaatcggtcgtcagtatttaagaaatatatcaaaatttaatgaacag
gaattccatctaccctctttcgatgaaaagagatataaagagataatcgcctggtccaga
gtttttagccaggaagaatttcttttagcagtaaattgtaatttagaaaatgaaaaaagc
gcaagggtaatggttgatggaaccctccatcagccaggagataaatttgagtgtatctac
tcttctgagaaagaacatgttggaaaagagatagaggtaataaaaactgatacatggaat
caacatcttgaaatccatatcccagctcagggaagaataatttataagtctatttaa
DBGET
integrated database retrieval system