Helicoverpa armigera (cotton bollworm): 110377596
Help
Entry
110377596 CDS
T05609
Name
(RefSeq) chaoptin
Organism
haw
Helicoverpa armigera (cotton bollworm)
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
LRR_8
LRR_4
LRR_1
LRR_5
LRR_9
DUF6792
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110377596
NCBI-ProteinID:
XP_063894978
EnsemblRapid:
LOC110377596
LinkDB
All DBs
Position
2:complement(join(7190019..7190305,7190914..7193906,7193995..7194105,7194205..7194349,7195578..7195752))
Genome browser
AA seq
1236 aa
AA seq
DB search
MVLGHGCARWALQWVALAACALAGAQAPERVEPCATSPLCSCRVAHMSCIAVPLHRFPEW
PRIELQHLDISMSNLEVLTESALDGLKLQTLVLVANKLHYIEMHAFSSMAGTLASLDLGY
NEFTEIPQQGLKDLKVLNWLNLQNNNIVYIGPDVKWHHLEETLTSLSLSNNQVTHLKSQA
LTSLYHLLQLDLEGNHLRTISADSLPASLTLLKLSNNFIHELSCDLLFSLPRLQSVHLRH
NFITFSDNYLCPANKSKKIEKLDLSNNKLNDTSQILVLRDVQIRQIILDLNELTTIPKLI
FTNNRLERLSVSYNMLSSISRDLFLSLRNSLEHLEVEHNRLSHLPDSLAQLVRLRHLSLA
YNQLEESPALPSRIQTLSLAGNFLTSIPSALQTLEAGSIRYLDLSYNRISNLLPNEFLDW
STSLGNINLRGNRIAQIYKNVFPASMSLKEIHLSFNDLYYVHPQSFANVTRSLRVLESSS
TLFSGYFPFEIEEGLENISWLSFDNNDFHILKLSDVVVFPFLKYLNLDYNRIVDIVITED
YHNESLYLSNLRLAYNFLHSLHSRSFIYMPELRNLDLSYNRINNLTKHTFTNLPNLRYLS
LAGNIIDSMEAETFANLPKLQILELQGNNFTYLSLNAFHNVSNVDITFTLNVSRNHIKFV
DGESAISVNIFDGSYNDLYEVPNNFFVAVAPSIRQIILAHNKIIHVSNEAFGDAKYLEIL
DLHKNNINNIKRKSFTDLISLQILDLSFNVISQLSVEQFYNLNKLRYLKLDHNNLRLLPR
DVFKNTIVEHLDLSYNDMSLFPGTALSQIGFTLRYLDMSHNRIEYLDSNIFRTTQFLLSL
NLGHNLLTVLSDNTFSSLGGLRQLDLSFNSIKANFKELFHNLPNLRHLNLANVSLKSVPY
LPLTNLTSLNLTSNYINSFKETDVKRLASLRHLDLSNNRLTSLVPKMWFHFNNLNVLDLS
YNPIVRITSNSFKWLSNLSHLNLNGLRYLDIVDQDSFRPLISLRSLHIQSWSTINHSTFR
ISNITSSLSTLYKLVIHWTDEIMDNQLHGIDARNIRYLEIRGTNLKRISDDAFQSFANSQ
EIFIRITMTSLTKLPTAFMRHLGQVPQLGIDLSYNQLTTLNPAIFYPNFTSWSHVATKLL
SGGLILTGNPLRCECELAWVGAWLRRWLQENEAGAELRRAVRSGTCKDAAGRRVPLLQLR
ADEAECHASALSSDATPRRTGLAHTLALALTTILLR
NT seq
3711 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggtgttggggcatggatgcgcgcgatgggcgctgcagtgggtggcgctggcggcgtgc
gcgctggcgggggcgcaggcgccggagcgcgtggagccctgcgccaccagcccgctgtgc
tcctgccgcgtggcgcacatgtcctgcatcgctgtgcctctgcacaggttcccagaatgg
ccccgaatagagctgcaacatctagatataagcatgtctaacctagaagtgctgacagag
agcgcactggatggattgaaattgcaaacattagttttagtcgctaacaaattacattac
atcgagatgcacgcatttagttccatggcgggtacactagcatctttagacctcggttac
aacgaattcactgaaataccgcagcagggcttaaaagatttaaaagttttaaactggttg
aatctgcagaacaacaatattgtgtacataggacctgatgtaaaatggcatcatttggaa
gaaacgctgacgagtttgtcactgagtaataaccaagtgacgcacttgaagtcccaggca
ctgacgtcgctgtaccacctgctgcagctggacttggaaggcaaccacctccgcaccatc
agcgccgactccctgcccgcttccctcacactcctgaagctatccaacaactttatccat
gaactatcctgtgatttactttttagtctgcctaggttacaatctgtacatttacgacat
aattttataactttctcagacaattatctttgtccagctaataagagtaaaaagattgaa
aagttagatttgagtaataacaaacttaatgatacttcccaaatacttgtacttcgggat
gttcaaattaggcaaattatattagatcttaacgaattaacaacgattccaaagttgatt
ttcacaaataatagactagaaaggttgtctgtatcgtacaacatgttgagttctatcagc
cgagatctattcctgtcactgaggaactcgctagagcacctggaggtcgagcacaacaga
ctgtcgcacttgccggacagcctggcgcagctcgtgcgactccgccatttatcactggct
tacaaccagttggaggagtcgcccgcgctccccagtcggattcagacgctatcgctcgcc
ggcaactttttaacttcaataccctccgcacttcaaacgctcgaagccggttctattcgc
tatctcgacttaagctacaacaggatatctaatttgttaccaaacgaatttctagactgg
tccacttctcttgggaacatcaacttgagaggtaacaggattgcacagatttataagaac
gtttttccggcgagtatgtcattgaaagagatacatctaagttttaacgacttgtactac
gtgcatccacaatctttcgcgaacgtgactagatcgctccgtgtcctagaatcgtcttct
acgctttttagtggctacttcccgttcgagatcgaagagggcttagagaatatcagctgg
ctatcgttcgataacaacgactttcacatcctaaaactttcagatgtggttgtgtttcca
tttctaaaatatttaaatttagattacaatagaatcgttgatattgtcataactgaggac
tatcataacgagtcactatacctaagcaacttgagactcgcctacaattttttgcattca
ctgcacagcagaagttttatatacatgccggagttaagaaacttggatttatcttataac
agaatcaacaacttaactaagcacactttcacaaacttaccaaacttgagatatttatct
cttgcgggtaacataatcgattcgatggaagccgagacgtttgctaatttaccaaaactg
caaatattggagctccagggaaataactttacgtatttatcactgaacgcgtttcataac
gtttctaatgtagacataacgttcacgctaaatgttagcagaaaccacattaagtttgtg
gatggcgaatccgcaatatcggttaacatattcgacggctcatataatgatctgtatgaa
gtgccaaataacttttttgttgcggtcgcgccctccatacgacagattatattagcccat
aataaaatcatacatgtatcaaatgaagcgttcggtgatgcaaaatacttagaaatactc
gatttgcacaagaataatatcaataacattaagagaaagtcgttcacagatctaatttct
cttcaaatattagatttgtctttcaatgttatctcccaattatcagtggaacagttctat
aatttgaacaaacttagatatttgaaattggaccataataatttgcgtctgctgcctcga
gacgtgtttaagaacacgatcgtggagcacctggacctgagctacaacgacatgtcgctg
ttcccggggacggcgctctcgcagatcggcttcacgctgcgctacctcgacatgtctcac
aaccgcatcgagtatttagacagcaatatattccgcaccacacaattcctcttgagtctt
aatttaggtcacaatctattgacagtactatcagataacacgttctccagcctcggcgga
ctgcgccaactggacctcagctttaactctataaaggcaaactttaaggaactgtttcat
aaccttcccaacttgaggcatttgaatcttgcaaatgtaagcttaaagtcagtgccttat
ctacctttgacaaacttaactagcctcaatttgacttcaaattacattaacagttttaaa
gagactgatgtgaagcgactagcgagtcttcgtcatctagaccttagtaataatcgtctt
acctctttagtgccaaagatgtggtttcattttaataatttgaacgttcttgatttatcg
tacaaccctattgtaagaatcacgtcaaatagtttcaaatggttgagcaatttatctcat
ttgaatttaaatggacttagatacttagacatagttgaccaggattccttccgtcccttg
atatcgcttcggtcactgcatattcagtcgtggtcaactataaatcattccacgttccga
atttccaacatcacttcttccttatccaccctgtacaaattagtaatacactggactgat
gaaatcatggataatcaattacatgggatcgatgcgaggaacattcgctacttagaaatc
agaggaacaaatcttaaaagaatatcggacgatgcttttcaatcgttcgccaacagccaa
gagatatttatcaggatcacaatgacttccttaactaaattgccgacagcattcatgagg
catttgggacaagttccacaactcgggatcgacttgagctacaatcaacttacgacactt
aatccagcaattttctatccaaatttcaccagttggagccacgtagccacaaagttattg
tcaggagggctgatactgacgggtaacccgctgcggtgcgagtgcgagctggcctgggtg
ggcgcgtggctgcggcgctggctgcaggagaacgaggcgggcgcggagctgcggcgcgcc
gtgcgcagcggcacgtgcaaggacgcggcgggccggcgcgtgccgctgctgcagctgcgc
gccgacgaggcggagtgccacgccagcgcgctctccagcgacgccacgccgcgccgcacc
ggcctcgcgcacacgctcgcgcttgcgctcactaccatcctgctcagatga
DBGET
integrated database retrieval system
