Helicoverpa armigera (cotton bollworm): 110380472
Help
Entry
110380472 CDS
T05609
Name
(RefSeq) uncharacterized protein LOC110380472
KO
K11577
kinetochore-associated protein 1
Organism
haw
Helicoverpa armigera (cotton bollworm)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
haw00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03036 Chromosome and associated proteins [BR:
haw03036
]
110380472
Chromosome and associated proteins [BR:
haw03036
]
Eukaryotic type
Centromeric chromatin formation proteins
SAC (spindle assembly checkpoint) factors
Motor proteins
RZZ complex
110380472
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Rod_C
ARM_KNTC1_1st
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110380472
NCBI-ProteinID:
XP_021196153
LinkDB
All DBs
Position
3:complement(join(5597356..5602062,5604732..5605493))
Genome browser
AA seq
1822 aa
AA seq
DB search
MTITLSQVKSLNSCITSNIDAKLLYPKVVLFENKNSVRVVNLLENNEKIEEQNEYYTFEK
EIVDKILLDHFVWLVFKCGDIIAIDVVKGTQIKVTNDTNTSLKICQIGRISNHLHFISES
GDTFVIPLDTSELLKRLSENTNELTVPFKKAHVSHSSVKATENSINGLNIYIEDGTAMIK
CPITGIVENVTTKTKFDHIVSWKDQIVLTNGNQMWIIDLKESQVIHEFEKIEGNYYPVLD
HNDLFYYLVWSKEKVEIKCAGFTQDPSNLAGSDNNTDNCSVQKASQETLKAQLMMLVNTI
TTATKPETVLPELQPLYEAIDDFKFLIEITQQLCQLSIVYKSLLYPLQKRIFALNDNNLI
NIVSELSIKIDLIEYIQFTGNNSYEEINIFDQNPKELCVTFICKSDFDIACICWLKYSQL
KLSITTDDVACILNAISSSTKLASIIIWLKNFIPSLLEQNPFYIDLFVRWAMERVFLLEQ
SAFWPKIGLKFVEEIIVILETSLKSISVRPISMDDLDMLKTRISYIMELKDKYRINVLLN
ELSSQSPSEVALIMLRRCYTEDLTPFLQNYLPPYALQYSFDIDEILGSYIESEAASSGGG
IDGARLQILLEAFHSYNNKLECLLQVLKVLDVPWNSNVLELAVKTVTNAGKTFTVSDSER
LLSREIQTEINYANAKVVLKKYNFPMTCTDYMLVLHKILSVPVIELEDLKAIIGIMPIYS
NYGNALYIERCLQDCETRKALVYFNSLSSKEKKLLLKTVVAKYEQIVCGNTINLSVERNY
IDFMKGTHLLNDIEINDIETLYNFKNSYNIQLNMNDIRNERTCENAVNSWINQDGAIASS
SRGGSVIQLTQACHSQYSVLTALLRSTSTCCQVRKLVEYLIRMFSTKDVSVDDFTAVLSQ
FQYGENCDLLLNSFNVLIELIVNCSEEYLHNLMKQLALLNNLINASIIVKNLSIAWKFHY
IFLPISSSTAINELINFYKTIQYPNCLGTESSSINSKCDFTFMRMVSNCIINSEPVKPTW
QDDMSEIAKRLLAKVVTYQELDELLMTSLMLVLKSYEEDNSVLDILRGNNEQLPPNILGY
LSSPIIRCTFVFNNDSVCKEIGSSVSYPPPYILKSKFNINLADVALPDNSEETWEGKVIL
FYVLLHSPDTSFERLIELCRALNISTNDGLSLQLIALLSTWELKYKIVPDDLGHRQIYIE
NDESYLNKCFIIWHSIENKDFVKDILNDFWKNGEVTLHGRAVSINPYYYEVYLCIYRLIF
GTDTEVKNTKEYFLLHYLKEYKRKSTPKQNEYELFSVKGMFPEIGHFRLPFHLFMREDKW
ANLKSEITLETYERWLPAVALLELNPTAQIARDMICSNAVKQTMTSRKRNDDVDADTKNE
PWLLTSQEEALLRAAHRCVRHINNMEWAGACLFYVLQGCARGADQVAAAHLCYQFAQRWA
AEQPGNRAVRQMQRLYATLSTRHALYKIDWASEELVRLSTEPAQLIRTLYLHPDFISKMS
RHDVNRAVNEIADKNSINVSSIRIQILENILDKGNGDSKTVTVLNIKELMTAKYILKATC
PKMGAIYLSRIAFDDDSDNNKSKKLRALQCLMSLVDADTAIKVANRKRDALWMSLLELFG
VVSLESIDMPWIAATFTHDKLRGLEQLLQASEGNADGLRTAAELAREFGTSQLIRNLIPH
LLRAALYEEMIPLLLKLTSQLDSVIYTAWRAVILSPFQRADYPITERQRTKCLNAINLLP
ICPVIKDEDLVEIWKNCLRCKVFGLGCLILPYMTSQTRKSLTELQKIDRRNLIASLKNLH
ADTYLVSGAMHIIERLSLRAYR
NT seq
5469 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgacaataacactgtctcaagtaaaatcgcttaatagttgtattacttctaacatcgat
gctaaactattatatccaaaagtagtattatttgaaaataaaaacagtgtgcgagtagtg
aacttactggaaaacaatgaaaaaattgaagagcagaacgaatactatacatttgaaaag
gaaattgttgataaaatattattagatcactttgtgtggcttgttttcaaatgtggtgat
atcattgcaatagatgtagtaaaaggtacacaaattaaagtaacaaatgatactaacact
agcctcaaaatctgtcagattggaagaataagtaaccatttacatttcatcagtgagagt
ggagatacctttgttattccattagatacctcagagttgctgaagagattaagtgagaac
accaatgaactcactgttccttttaagaaagcccatgtctcgcattcaagtgttaaggca
acagagaattcaataaatggtttgaatatttacatagaggatggaactgcgatgataaaa
tgcccaataactggaatagttgaaaatgtaacaacaaaaacaaaattcgatcatattgtg
tcatggaaagaccagatagtcttaactaatggaaatcaaatgtggattattgatctgaag
gaatctcaagtaatacatgaatttgagaaaatagaagggaattattaccctgtgctggac
cacaatgatctcttttactaccttgtgtggagtaaggaaaaggtggagattaagtgtgct
ggatttacccaagacccttcaaatcttgctggaagtgataacaatactgataattgtagt
gtacaaaaagcatctcaagaaacactcaaggctcagctgatgatgttggtaaacactatt
acaactgcaacaaaaccagaaactgtattaccagaattacagcctctttatgaggctatt
gatgattttaaatttctaattgaaataactcagcaactatgccaactcagtattgtatat
aaatcattgctttaccctcttcaaaagagaatatttgcactaaatgataataatctaata
aatatagtgagtgaattgtctatcaaaatagatttgattgaatacattcaatttacaggc
aataactcatacgaggaaatcaacatctttgatcaaaatcccaaagaactttgtgttaca
tttatatgtaaaagtgattttgatattgcttgtatttgttggttgaaatattctcagttg
aagttgtctataactacagatgatgttgcatgtattttaaatgctataagtagtagtact
aaactagcttccatcattatttggttaaagaattttattccatcactgttagaacaaaat
ccattttacattgacttatttgtcagatgggctatggaaagagtttttttgttagagcaa
tctgcattttggccaaagataggcttgaaattcgttgaagaaatcatagtcattcttgaa
acatctcttaaatcaatctctgtaagacctatatccatggatgacctagacatgcttaaa
acaagaatatcatacataatggaattgaaggataaatatagaatcaatgtattgttaaat
gagttgagctctcagagtccaagtgaagtagctttgataatgctacgccgttgttatact
gaagacctgacaccattcttgcaaaattatttgccaccatatgctttgcagtattcattt
gacatcgatgaaattcttggttcatacattgaaagcgaagcagcaagcagtggtggtgga
attgatggtgcacggctacagatattactggaagctttccattcctacaataataaactt
gaatgtttattacaagttctaaaagtcctagatgtcccgtggaattcaaatgtcttagaa
ctggcagtaaaaacagtcaccaatgctggtaaaacctttactgtatctgattcagaaaga
ttactctcaagagaaatacaaacagaaattaattacgcaaatgcgaaagtggtactcaag
aaatataatttcccaatgacatgtactgattacatgttagtacttcataaaattttaagt
gtaccagttatagaattagaagatttaaaagcaataataggcataatgccgatttattca
aactatggcaatgctttatacattgaaagatgcttacaggattgtgaaactagaaaagca
ttggtatattttaatagcttatcatcaaaggaaaaaaagttgttactcaaaactgtggtg
gctaaatatgaacaaattgtttgtggaaacacaattaatttaagtgttgaaagaaattat
atagacttcatgaagggaacacatcttctaaatgatattgaaattaacgacattgaaaca
ctgtacaatttcaaaaattcttataatatacaacttaatatgaacgacatacgtaatgaa
agaacctgtgaaaatgcagttaattcttggatcaatcaagatggagcgattgcaagctct
agtcgtggtggaagtgttattcaactaacacaagcatgtcattctcaatactcagtactt
acggccttgttgcgaagtacttctacttgctgtcaagtgcgaaaacttgttgaatacctt
ataaggatgttttccacgaaagatgtatcagttgatgattttacagcagttttatctcag
tttcagtatggtgaaaactgtgatctattgctgaattccttcaatgtgttaattgagcta
atagtgaactgcagtgaagaatatcttcacaatttaatgaaacaattggctttattgaac
aatctgatcaacgctagcataattgtgaaaaacttgtcaatagcatggaaattccattac
atatttctgcctatttcgtcgagtaccgctattaatgaactgataaatttctacaaaacc
atacaatatccaaactgtttaggaacggaatcgtcaagtattaacagtaaatgtgatttt
actttcatgagaatggtctcaaactgtattataaactctgaaccagtgaaaccaacatgg
caagatgacatgtctgagatagcaaaacgattgttagctaaagttgtcacataccaagag
cttgatgaattattaatgacaagtttaatgttagttctgaaaagttatgaagaagataat
agtgttctagatattctgagaggaaataatgaacaattgccccctaacatacttgggtac
ctttcatcacctattatccgttgcactttcgttttcaacaatgattcggtctgcaaagaa
attggtagttctgtatcgtatcctcctccgtacatacttaaaagtaagtttaacatcaat
ttggctgatgttgctctacctgataacagcgaagaaacttgggaaggaaaagttatcttg
ttttatgttctgctgcatagcccggataccagttttgagcgacttattgaattatgtcgt
gcgttaaacatttccacaaatgatggcctatcgcttcaattgatagctttattatcgacg
tgggaactgaaatataaaatagtgccagatgatttaggtcaccgccaaatatacatagaa
aatgacgaaagctatctgaacaaatgttttattatttggcatagcatagaaaataaagat
tttgtaaaagatatattgaacgatttttggaaaaatggtgaagtcactctgcatggtcgt
gcagtatctataaatccatattattatgaagtatatctttgcatatatcgcctgattttt
gggacagataccgaagtaaagaatacgaaagagtactttctattacactacctgaaagaa
tacaaacgtaaaagtactcctaaacaaaatgaatatgaactgttttctgtaaaaggaatg
tttcctgaaattggtcacttcaggttaccatttcatctttttatgcgagaagataagtgg
gcgaatttgaaatctgaaataactttagaaacgtatgaacgttggctacccgctgttgct
ttgctcgaattaaaccctacagcacaaattgctagagatatgatttgcagcaacgccgtg
aaacaaacaatgacttcaagaaaacggaacgatgacgtagatgcagataccaaaaatgaa
ccatggcttttgaccagccaggaagaagctttattacgtgcagcgcatagatgtgttcga
cacattaacaacatggagtgggcaggagcgtgtcttttctacgtgctacaaggatgtgca
cgaggagcagaccaagtggctgcagctcatctctgttaccaatttgcgcaacgctgggcc
gccgagcagcctggaaatcgtgcagttcgacaaatgcaaaggctgtatgcgactctatca
acaaggcacgctttatataaaattgattgggcatctgaagagcttgttcggctttcaaca
gagccagcacaactcattcgtactttatacctacatccggattttatatccaaaatgagc
cgacacgatgttaatcgagctgttaatgaaattgcagataagaattccattaatgttagt
tctataaggattcagattttagaaaacattctcgacaagggcaatggtgacagtaaaacg
gtgactgttttaaatataaaggaattaatgacggcaaagtacatattgaaagcaacatgc
cctaagatgggtgctatatacttatctcgtattgcatttgatgatgatagtgataataat
aaatcaaaaaaattaagagctctccagtgtctaatgagcttagtagatgctgacactgcc
atcaaagtagcgaatcgcaagagagatgcgctatggatgtcattgttagagttgtttggt
gtcgttagcttggaaagcattgatatgccgtggatagcggccacctttacgcatgataaa
cttcgtggtctagaacagttgcttcaggcttctgaaggtaacgcagatggattgagaaca
gctgccgaacttgcacgtgaatttggtacctcgcaattaattcgcaatcttattcctcat
ctattacgtgcagctctatatgaagaaatgattccattattattgaaactaacatctcaa
ctggatagcgtgatatatactgcatggcgtgctgttattttatctccattccaacgagct
gactacccgattacagagcgtcaacgaaccaagtgcttaaatgcaattaatttattacca
atctgtcctgttataaaggacgaagatttagtagaaatatggaaaaactgccttagatgt
aaagtatttggattaggttgtttaattttgccatacatgacatcgcaaacaagaaaatcg
cttaccgaattacagaaaattgacagaagaaatctgattgctagtttgaaaaatctacat
gctgatacttaccttgtatcaggtgcgatgcatataattgagagattatcattgagagcc
tacagataa
DBGET
integrated database retrieval system