Halomonas binhaiensis: E4T21_17975
Help
Entry
E4T21_17975 CDS
T08791
Name
(GenBank) BapA prefix-like domain-containing protein
Organism
hbh
Halomonas binhaiensis
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
Big_13
FG-GAP_3
CarbopepD_reg_2
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
QEM83226
UniProt:
A0A856QTK4
LinkDB
All DBs
Position
complement(4104552..4110491)
Genome browser
AA seq
1979 aa
AA seq
DB search
MKRIIETISREEHVHQSFKQGDSANITLNIAESSVVLVQGNTQDVLRYERMGNDLIIHMK
DGSTIRCTQFFEKDAEGNHSELVFGEPGEDGQAVQHVIFDDAAMTDQLAQGEVIELAANV
EPLTTGIEPLLYGDVDGGALIPLIGAGLAVTLLGLAASAGHGGSSKGGSDDDNDGGGNDP
AVVVNPITGDDIITDDDAAGGVTIDGTSTPGSDVVVVIDGKEFPTIADGDGSWAVDIPEE
ALDGAGGDDSITVIVTDPEGGTTEIDHPVIIGTDDVPITVNPITGDDIITDEEAANGVTI
DGTTTPDSEVVVLIDGKEYPTTADDDGNWAVGIPEETLDGAGGDDSITVIVTEPDGDTAA
IDYPVIIGTDDVPITVNPITGDDIITDEEAANGVTIDGTTTPDSEVVVVIDGKEYPTTAD
GDGNWAVDIPAETLDGAGGDDSITVVVTDPDGNTTEIDHPVIIGTDDVPITVNPITGDDI
ITDEEAANGVTIDGTTTPNAEVVVVIDGKEYPTTADGDGNWAVDIPEETLDGANGEDSIT
VVVTEPDGDTAAIDYPVTIDTDDTDADADADADADADADADADADADADADADADADADA
DADADADADADADADADADADADADADADADADADTVPITVNPVTGDDIITGEEATGGVT
IDGTTTPGSDVVVKVGDEEFPAKADDKGNWSADIPAEAWAKENDGNVTVEVTEPDGSTGV
IDHPVTVGVDDVPITVNPVTGDDVIIGDEVTDGVVIDGTTTPGAEVVVVVDGKKFPTTAD
KEGNWAVDIPQYVMDGANGEESITVVVTEPDGDTAAIDHPVLIVTGGIPFVNPVTGDDIV
KADEAAAGVTIDGIAEPGSKIEVTLGSEQFNTTAGQDGRWAIDVPTEAWNGLDDATSVTV
VATDSVGNVDSVEHPISVVPVTIYPVTGDDVIDAAEEAADITIDGTALAGSELVVTVNGE
KYTTTSDESGHWAVNVPSEAWNGLDGATKVTAVATDTAGSAHSVDRTVILDDPGATSISI
DTFTDNVGPEVGKMPSGSETDDKTITLHGTLDAPLNEGYEIQVICRKVPGTEHYIGNAKV
DGTSWSMSLPASLADGDYEFSARIKHVESDTSAIVSNDFMVTVDANHDGNPEMGDVQQYA
EVEFTGFGALPNVIGSLSAPLDGDDVLFVTLNGRTYSNLRGEVVVDGERWSLQLPAGEEL
ALGNYAVQTKIVDAFEGTTHYGSGEVHIASPWAETPDSDISGAMQFTHYVHEDITTDNNK
TLGMSLALSEDGTWRMTTQQQVFTQQGADRNDYAQSSIIADADVRYASGDIDRDGDMDLV
SVRDQGDYSNLWKGNGDGTYSVEAILPFWKQGSSKTYGGIVALDMTGDGYVDFARAGDGL
ISTTAFMRNNKDGTFTEVSANNKTDDDYQIYDHALVAGVVDYNNDGAVDIIGRINENGSG
YSDLQVLENKSDNTFERVSLIDKFFSSSGSNGGTSSDGTWAILTADYNNDGQLDAWTSRS
NFGSDDPALALNNGDGTFSDGYKFVDLGGYENDEGSRAYSYSSIALGLDWDMDGDVDIAQ
MGDGKHDKTRATLSLNDGDGLSWTKADIDTLTYDEGRIVEGSTVVDYDWDGRQDILSIDT
DGHWWSDMNTNELDRDTYIALRIVDQEGFNVFYGNTVNLYDSSGNRVATQQINPSTGLST
FSTGLVYFYGLDPNETYSAELIRIQDGVRSDVDASVNQSWSGLSPAEGEFTNYVLTAERG
GESHDGSFVGTGYNDIFTATAGNDVYDGAGGWENTIDGAKWSDIGGDDRIDFGVAVTGVT
LDLSSDEAQDTGFNTSTLKDIESFSGGSGNDVVTGSVANNRLEGRGGDDTFIISNGGNDS
VVFRMLDAADATGGNGADRVSGFTLGSWGNTADADRIDLSDLLSGSAYYGSASASNGVLD
PEAGDIEDYLKVTVQGSDTEIAIDLDGSGIAHEMTTIVTLSGVQTDLATLLANHQLVVS
NT seq
5940 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaaagaatcattgaaaccatttcacgagaagagcacgttcatcagtcattcaaacaa
ggtgatagtgccaatattaccctgaatatcgcagagtccagtgtcgtgctggtgcagggt
aacactcaggatgtcctgcgttatgaacgcatgggaaatgacctgattatccatatgaag
gatggaagcacgattcgttgcacccagttctttgaaaaggatgcggaaggcaatcacagt
gaactggtttttggcgagcctggcgaggacggccaagcggtgcagcatgtcatctttgat
gatgcggcaatgacagatcagcttgcccagggcgaagtgatcgagttggcggccaacgta
gaacctttgacgacaggcattgagccgttgctgtacggcgatgtcgatggcggtgccctg
atccctttgatcggcgctggtctggcagtgactttgcttggactcgccgccagtgctggc
catggtggtagcagcaagggcggtagcgacgatgataatgatggtggcggaaacgatccc
gctgttgtggtcaatccgataaccggcgatgacatcatcactgatgacgacgcagctggt
ggtgtgaccattgatggcacctctacccccggttcagatgttgtcgtggtgatcgatggc
aaggaattcccgaccatcgccgatggcgatggcagctgggcggtagatattcccgaagaa
gccctggatggggcaggcggtgacgacagcatcaccgtgatcgttaccgatccagagggc
ggaacaacagaaatagatcacccggtcatcatcggtactgatgatgtgccgatcacggtt
aacccgattaccggtgacgacattattactgatgaagaagcggccaatggcgtgaccatt
gatggcacgacgaccccggattcagaggtggtcgtattgatcgatggcaaggaatacccg
accaccgccgatgacgatggcaactgggcggtaggtattcccgaagaaaccctggatgga
gccggtggtgacgacagcatcacggtgatcgtcactgaaccggatggcgacactgcggca
attgactacccggtcatcatcggcactgatgatgtgccgatcacggttaacccgattacc
ggtgacgacatcatcactgatgaagaagctgccaatggcgtgaccatcgatggcacgacg
accccggattcagaggtggtcgtagtgatcgatggcaaggaatacccgacgactgctgat
ggtgatggcaattgggcggtggatattcctgcagagaccctggatggagccggcggtgac
gacagcatcaccgtggtggtcaccgatccagacggcaatacgacagagatagatcatccc
gtcatcattggtaccgatgatgtgccgatcacggttaatccgattaccggtgatgacatc
atcactgatgaagaagccgccaatggggtgaccattgatggcacaacgaccccgaatgca
gaggtggtcgtagtgatcgatggtaaggaatacccgacgactgctgatggcgatggcaat
tgggcggtggatattcctgaagaaactctggacggggctaacggtgaagacagcatcacc
gtggtcgtcactgaaccagacggcgacactgcggcaattgactacccagtcactatcgac
acggatgataccgacgccgatgcggatgctgacgccgacgccgacgccgacgccgacgcc
gacgccgacgccgacgccgatgcggatgctgacgccgatgcggatgctgacgccgatgcc
gatgccgatgccgatgccgacgccgatgcggatgctgacgccgatgcggatgctgacgcc
gatgccgatgccgatgccgatgctgacgctgacgctgacgcggacactgtgccaatcaca
gttaatccggttaccggggatgacattatcaccggcgaagaagccactggtggcgtgacg
attgatgggactaccacgccggggtctgatgttgtggtgaaggttggtgatgaggagttc
cctgccaaggctgacgacaagggcaattggtcagcggatattccagccgaggcctgggcc
aaggaaaacgatggcaatgtcaccgtagaggtgactgagccggatggcagtactggtgtg
atcgatcacccggtcaccgtgggtgtggacgatgtgccaatcaccgtcaaccctgttacc
ggagacgatgtcatcattggtgatgaggtcaccgatggcgtggtgattgatggcacaacg
accccaggtgccgaggtggtggttgtagtcgatggcaagaagtttccgaccacagctgat
aaggaaggtaactgggccgtcgatatccctcaatacgtgatggatggggcgaacggggaa
gagagcatcaccgtcgtagttaccgagcctgatggcgacacagcggcgattgatcaccct
gtccttatcgtgactggaggtataccgttcgtgaacccagtcacgggggatgatattgtc
aaagcagatgaagctgcagcgggcgttaccattgacggcatcgctgaaccgggctccaag
atagaggtcactctaggtagtgaacagttcaataccactgccggccaggatggtcgttgg
gctatagatgttcccactgaagcatggaacggccttgatgatgcaaccagtgttacggta
gtggcgactgatagtgttggcaatgtcgactcggttgaacatccgatctccgtggttccg
gttactatctatcctgtcacaggtgacgatgttattgatgcggctgaagaagccgcggac
atcaccattgacggtactgccttggctggttccgaactggtagtgacagtaaatggtgag
aagtatactacgacctctgatgaaagcggccactgggcggtaaacgttccctccgaagcc
tggaatggtctcgacggtgcgaccaaggtcactgctgtggcgaccgacacagcgggtagt
gctcatagtgtagatcgcaccgtgatactggacgatcccggggcaacctcgatcagtatt
gatacattcaccgataatgtcggaccggaagtcggtaaaatgcccagtggttcagagacc
gatgacaagacaatcacgttgcatggtactctggatgctccgctgaacgaggggtacgag
atacaggtgatatgccgaaaagtgcccggtacggaacactatatcggtaatgccaaggtc
gatggtacttcatggtctatgagcttgcccgcatcactagctgatggcgactatgaattc
tccgcgcgtatcaaacatgttgaaagcgatacgagcgcgattgtcagcaatgactttatg
gtgacggtcgatgccaaccatgatggtaatcctgaaatgggtgatgttcagcaatacgca
gaagtagaatttaccggatttggtgcgttgccaaacgttataggttcattgagtgctcct
ctagatggtgatgatgtgttgttcgtcaccctaaatggacggacatacagtaatctccgc
ggtgaagtggtagtggacggagagcgttggtcgctgcaattacccgctggcgaggaactg
gctcttggtaattatgctgtacagaccaagatagtggatgccttcgaaggcaccacgcat
tatggtagcggggaagtgcatatcgctagcccctgggcggaaacacctgactcggatatc
tcgggggccatgcagttcacccattatgtacacgaagatatcacgacggataacaataaa
accctgggcatgagcctggcactgagtgaagacggtacttggcggatgacgacccaacag
caagtctttacccagcaaggtgcggatcgtaatgactatgcccagtccagtatcatcgct
gatgcggatgtgcgttatgccagcggggacattgaccgtgatggggatatggacctggta
tccgtacgcgaccaaggcgactattcaaacctgtggaagggcaacggcgatgggacctac
agtgtggaagccatattacctttctggaagcagggatcaagcaagacttatggaggtata
gtagcactggacatgactggtgatggttatgtcgattttgcacgtgctggagatggtctg
atttccaccactgccttcatgaggaataataaagatggcacttttaccgaggtaagtgca
aataataaaacggatgatgattatcaaatatatgaccatgcgctagttgcgggagttgtt
gattataataatgatggagctgtggatattatcggccgtattaatgaaaatggctctggc
tatagtgatcttcaggtcttggagaataagtctgataatacatttgaaagagttagcttg
atcgataagttcttctcgtcctctggttcaaatggagggacttcttcagatggtacatgg
gctatacttactgctgattataataatgatggacagctggacgcatggacatcaagaagt
aactttggcagtgacgatccagcattagcgttaaataatggcgacgggacgttctctgac
gggtataagttcgtagatttggggggctacgagaatgatgaagggtccagggcttattcg
tattccagcatcgcgttgggcttggattgggacatggatggtgatgttgatatcgctcag
atgggggatggtaagcatgataagactagagcaaccctatctctcaatgatggcgatggc
ctttcttggaccaaggccgatatcgataccctgacttatgatgaaggtcgtatcgtagaa
ggatcaacggttgttgactatgattgggatggtcgtcaggacattctgagtatcgatact
gatggccattggtggtctgatatgaataccaatgagctggatcgcgatacttacatagct
ctgcgcattgttgatcaggaaggtttcaatgtgttttatggcaatacggtcaacctgtat
gacagttccggtaatcgtgtggccactcagcagatcaatccgtcgacaggcttgagtacc
ttctctacggggctggtgtatttctatggtctggatcctaacgaaacctacagtgcagag
ctgatacgcatccaagatggcgtgcgtagtgatgtcgatgcctcggtcaaccagagctgg
agtggtttgagtccggcggaaggtgagttcaccaactatgtgctgactgctgagcggggt
ggtgaaagccatgatggatccttcgttggtacaggctacaacgatatctttaccgccacg
gcaggcaatgatgtctacgatggtgcgggtggttgggaaaatacaattgatggtgcaaag
tggtcagatattggtggcgatgaccgcattgactttggcgtagccgtgacaggtgtaaca
ctggatctctccagtgacgaagcccaggacacgggtttcaatacatcgaccctgaaggac
atcgagtcgttctcaggtggtagcgggaatgatgtggtgacggggtctgtagccaataac
cgcttggagggtcgcggtggcgacgataccttcattatcagcaatggcggtaatgactcc
gtggtgttccgcatgttggatgctgctgatgctaccggtggtaatggagctgatcgagtc
agtggtttcactctcggcagttggggcaatactgctgatgcggatcgcattgacctcagt
gacctgctgtctgggagtgcatactatggctcagcaagtgccagtaatggtgtgctggat
ccagaggcgggggatattgaggattacctgaaagtgaccgtgcagggcagtgacacggaa
attgccatcgacctggatggttctggaattgcccatgagatgaccactatcgttaccctg
tctggtgtgcaaacggacctagccacgctgctggccaatcaccagttggtggtcagttga
DBGET
integrated database retrieval system
