Halotia branconii: QI031_03050
Help
Entry
QI031_03050 CDS
T09011
Name
(GenBank) filamentous hemagglutinin N-terminal domain-containing protein
Organism
hbq
Halotia branconii
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
TPS
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
WGV26504
UniProt:
A0AAJ6PA50
LinkDB
All DBs
Position
complement(688828..692760)
Genome browser
AA seq
1310 aa
AA seq
DB search
MSGKIQYWLHWCSSLVLGSVLIISWQEYVFAQITPDNTLPNNSIVTPNGSTFSITGGTQT
GSNLFHSFSEFSVPTGGTASFNNAVDIQNIISRVTGGSVSQIDGLIRSLGTANLFLINPK
GIIFGQGARLDIGGSFVGTTANAIGFGNQGFFSATNPNTSQLLTVNPSAFLFNQISTAPI
QNNSIAPAGVDSAGFSAFGLRVPDGKSLVLVGGNVSMDGGLLNAYGGRVELGGLGKPGNV
ALGVDGDSLSLKFPENVTRADVSLTNQAAIYVEGAGGGNIAVNASNLEILGGSILSAGIG
EGLGIPETVAGDITLNATEEIKVSSGSVVLNDVHLGSQGNGGNITIDSGSFSLQDGAQLQ
ASTSGRGNAGNVRVNAKDAVSLANAYILSTVESGGVGKGGNIDINAATLSLVDSAQLLTI
TREASATQPAGQRNAGNVNVNVTGAVDIVGEKNSFPSAIFSWVETGTVGNGGNITIDSGS
FSLQDGAQLQSSTFGQGNAGSVIVSAKDAVSLADASIFNTVEVGGVGKGGNIDINAATLS
LIDGAQLQTLTRGASDTQPAGRGDAGNVNVNVTGKVDIAGEKNGLVSGISSNMETGTVGD
GGNITIDSGSFLLQNDAQLIASTSGQGNAGNVIVSAKDAVSLADASILSTVEAGGVGKGG
NIDINAATLSLIDGAQLQTLTRGASDTQPAGRGDAGNVNFNVTGKVDIAGEKNGFVSAIS
SNMETGTVGNGGNITIDSGSFLLQNDAQLIASTSGQGNAGNVIVSAKDAVSLADAYIFST
VEAGGVGKGGNIDVNAATLSLIDGAQLVTLTSRASATQPAGQGDAGNVNVNVTGKVDIAG
EKNGLVSGIRSRVETGTVGNAGNITIDSGSFSLQDGAQLTASTFGQGNAGNVIVSAKDAV
SLAGNASIFSRLGAGGVGKGGNIDVNAATLSLIDGAQLQTLTSIASATQPAGRGNAGNVN
VNVTGKVDIAGEKNGLPSAIFSDVETGTVGNGGNITIDSGSFLLRDGAILKASTSGQGNA
GTIKVNAADFITISGSSSNFNSGLFVNSQSTTGTAGDIIVTSPRVTLDNSGTLNAKSTSG
NGGDINLQTDLLLLRRGAQISTTAGTAQAGGNGGNITINAPSGFILAIPSENSDITANAF
TGRGGRVDIKAFGIYGIQPRESPTPLSDITARSELGVQGTVALNTPEIDPDSGLVELPTI
PVDTQVAQGCYSPGYAQSRFVINGRGGLPANPKDILTPDATQMNWVSFKPSNNNRSLPPV
SIKPTFSTPKRIVEATGATLNAKGQIVLSANSSTVTLSSSRQNPIGCHGG
NT seq
3933 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgtcagggaaaattcaatattggctgcattggtgtagtagtttggtgttaggtagtgtg
ttaattatttcttggcaagagtatgtttttgctcaaattactccagataacaccttgcct
aataattccatcgttacaccaaatggcagtaccttcagtatcactggaggaacgcaaaca
ggaagcaatttgtttcacagctttagcgagttttctgtacctactggtggcactgcttct
tttaataatgctgttgatattcaaaatattattagtagagtaacaggtgggtcagtttct
cagattgatgggttaattcgcagcttaggtacagctaatttgtttttgataaatcccaag
gggattatttttggacagggtgcaaggctagatatcggtggttcttttgtagggactaca
gctaatgctattggatttggtaatcaaggttttttcagtgctactaatccgaatacttca
cagttgctaacagtaaatccttccgcttttttgtttaatcaaatttctactgcgccaatt
caaaataactcaatagcacccgcaggagttgattcagcaggctttagtgcatttggttta
cgagtaccagatggtaagagcttagtgctggtaggtggtaatgtcagcatggatggggga
ctactaaatgcttatggtggacgagttgagttaggaggattgggcaaacctggcaatgta
gcgctgggtgtagatggtgatagtctcagcttgaaatttcctgagaatgtgacgcgagca
gatgtatcccttaccaatcaagctgcaatatatgtagaaggggctggtggcggtaatatt
gcagtcaatgcctctaatctagagatattgggaggaagtattttaagtgctggtattggg
gaaggtttgggaatacctgaaactgttgcaggagatattacgcttaatgctaccgaggaa
atcaaagtttcatctgggagcgtagttttgaatgatgtgcatttggggtcacaaggcaat
ggcggtaacattactattgactctggctcattctcgttacaagatggcgctcaacttcaa
gcttcaactagtggacgagggaatgcgggaaatgtgagagtgaatgcaaaagatgctgtt
tctcttgcaaatgcttatatcctcagcacagtggaatcaggaggcgtcggtaaaggtggc
aatatcgatatcaatgctgcaaccctatcactagttgatagcgctcaactgctaactatt
actcgtgaagcatccgctacccagccagcaggacagagaaatgcggggaatgtcaatgtt
aacgtgactggcgctgttgatatcgttggggagaaaaacagttttcctagtgcaattttc
agctgggttgaaacggggacagttggtaatggaggtaacattactatcgattctggttca
ttttcgttacaagatggcgctcaacttcaaagctcaacatttggacaagggaatgcaggg
agtgtgatagtcagtgcaaaagatgctgtttctcttgcagatgcttctatcttcaacacg
gtggaagttggaggtgttggtaaaggtggcaatatcgacatcaatgcggcaacactgtca
ctaattgatggcgctcaactgcaaacccttactcgtggtgcatctgatacccagccagca
ggacggggggatgcggggaatgtcaatgttaatgttactggcaaagttgatattgctggg
gagaaaaatggtttagtcagtgggatttccagcaatatggaaacggggacagttggcgat
ggtggtaacattactattgattctggctcattcttgttacaaaatgacgcacaacttatt
gcctcaacttctggacaagggaatgcggggaatgtgatagtcagtgcaaaagatgctgtt
tctcttgcagatgcttctatcctcagcacggtggaagctggaggtgttggtaaaggtggc
aatatcgacatcaatgcggcaacactgtcactaattgatggcgctcaactgcaaaccctt
actcgtggtgcatctgatacccagccagcaggacggggggatgcggggaatgtcaatttt
aatgttactggcaaagttgatattgctggggagaaaaatggttttgtgagtgcgatttcc
agcaatatggaaacggggacagttggtaatggtggtaatattactattgattctggctca
ttcttgttacaaaatgacgcacaacttattgcctcaacttctggacaagggaatgcgggg
aatgtgatagtcagtgcaaaagatgctgtttctcttgcagatgcttatatcttcagcacg
gtggaagctggaggtgttggtaaaggtggcaacatcgacgtcaatgcggcaacactgtca
ctaattgatggcgctcaactggtaacccttactagtagagcatctgctacccaaccagca
ggacagggggatgcgggcaatgtcaatgttaatgttactggcaaagttgatattgctggg
gagaaaaatggtttagtcagtgggattcgcagcagggtggaaacgggaacagttggcaat
gcgggtaatattactattgattctggttcgttctcgttacaagatggcgctcaacttact
gcctcaacatttggacaagggaatgcggggaatgtgatagtcagtgcaaaagatgctgtt
tctcttgcaggtaatgcttctatcttcagcaggttgggagcagggggtgtaggtaagggt
ggcaacatcgatgtcaatgcggcaaccctgtcactcattgatggcgctcaactgcaaacc
cttactagtatagcatctgcgacccagccagcaggacgggggaatgcagggaatgtcaat
gttaatgttactggcaaagttgatattgctggggagaaaaatggtttgcctagtgcgatt
ttcagcgatgtggaaacgggaacagttggcaatgggggtaacattactattgattctggt
tctttcttgttacgcgatggcgctatacttaaagcctcaacttctggacaagggaatgca
ggcacaatcaaagttaatgcggctgattttattaccatctctggtagcagttcaaacttc
aacagtggcttgttcgtgaactctcaaagtacgacaggtactgctggagatattatcgtc
acctcacctagagttactctagacaacagtggtacactcaacgccaaatctacatcgggt
aatggtggcgacatcaatttacaaactgatttattgctactgcgtcgtggcgctcaaatt
tctaccaccgcaggtacagcacaagctgggggtaatggtggcaatatcaccatcaatgcc
ccgtcgggctttatcctcgccatccccagcgaaaacagcgacattaccgccaatgctttt
acaggcagaggtgggagagtggatatcaaagcctttggtatctatggtattcaaccccgt
gaaagtccaactcccttgagtgatatcactgctaggtcagaactcggtgtacaaggcact
gtagcactaaatacacctgagattgaccctgacagtggcttagttgaattgccaacaata
ccagttgacacccaagtagcccaaggctgctacagtccaggttatgcccaaagtcgtttt
gtaattaatgggcgtggcggtttaccagccaatcctaaagatattctcactcctgatgca
acccaaatgaattgggtatcttttaaacccagcaacaacaaccgttccctaccacctgtt
agcattaaaccaactttctctacacccaaacgtattgttgaagccacaggtgcaaccctc
aacgctaaaggacaaatagtcctaagtgctaattcatccaccgttactcttagtagttcc
agacaaaacccaattgggtgtcatggtggctaa
DBGET
integrated database retrieval system
