Hevea brasiliensis (rubber tree): 110639570
Help
Entry
110639570 CDS
T05150
Name
(RefSeq) pre-mRNA-processing factor 39-like isoform X1
KO
K13217
pre-mRNA-processing factor 39
Organism
hbr
Hevea brasiliensis (rubber tree)
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hbr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09182 Protein families: genetic information processing
03041 Spliceosome [BR:
hbr03041
]
110639570
Spliceosome [BR:
hbr03041
]
Other splicing related proteins
Spliceosome associated proteins (SAPs)
Other SAPs
110639570
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
HAT_PRP39_N
HAT_PRP39_C
Suf
TPR_14
HAT_Syf1_CNRKL1_N
HAT_Syf1_CNRKL1_C
TPR_16
TPR_19
NRDE-2
TPR_MalT
TPR_12
Motif
Other DBs
NCBI-GeneID:
110639570
NCBI-ProteinID:
XP_021646266
LinkDB
All DBs
Position
Unknown
AA seq
835 aa
AA seq
DB search
MGDSEMVVTETTAVTEYASAGCASTGYGDTSSNVAPYSSVYTTEGTGVFAASADVAYTVP
TASSFVDGNVYGTDSNSVVQEAHVNAIYETKPDVGMGSTSENVVATKNASMAPSQAAGYE
TSVNGSIGGEAVSTASAENGTTADIVEGAAAATVDGLVPPMSGEEERLWSIVRANSLDFD
AWTALIDETEKVAGDKILKIRKVYDAFLAEFPLCYGYWKKYADHEARIGSMDKVVEVYER
AVLGVTYSVDIWLHYCIFAINTYEDPDTIRRLFERGLAYVGTDYLSYPLWDKYIEYEEMH
AQWGHVAMIYMRILEIPNRRLDDYFTRFKAFAASHPLSELKTAEEAAAAVPAPSEGGDLA
NEGEVHPDVAEQSAKPVSAGLTEAEELEKYIAIREEMYKKAKEFDSKISDFENAIRRPYF
HVRPINFAELENWHNYLDFIEREDDFNKVVKLYERCLIACANYPEYWVRYVLCMETCGSM
DLANNALARATQVFVKRQPEIHLFAARFREQNGDIPSARAAYKLVHTEITPGLLEAVVKH
ANMEHRLGNLKDAFSLYEQTIAIEKGKEHSQVLPMLYAQFSRFLYLVAGNVEKAREVLVE
ALENTPLSKPLLEAFIYLESIQSLPKRIDYLDSLVEKFIVPNSDSLNAAIAVEREELSCI
FLEFLGMFGDAQSIKKADDRHAKLFLPHRSKSELKKRHAEDYLVSDKTKLVKSYADAPSP
AQSLMGAYPSTQNQWATGYGLQPQAWPPVTQAQTPGYGQQATYGTYGGYGSSYTNPQVPT
SVGQTATYGAYPPTYPVQQAFPQQGYPQVQPAAAATLAPAHQPASVPQPYYGSYY
NT seq
2508 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagacagtgagatggtagttactgaaacaactgcagtcacggagtatgcatctgct
ggatgtgcttctactggctatggcgataccagttcaaatgttgctccttactctagtgtt
tataccactgagggcactggggtttttgctgcttctgctgatgtggcttatactgtacca
actgcttcaagttttgttgatgggaatgtatatggtacagattctaattcagtcgtacaa
gaggcccatgtcaacgcaatttatgagactaagccagatgttggaatgggaagtactagt
gagaatgtagttgctacgaagaatgcatctatggcgccatctcaagctgctggttatgag
acttctgtaaatggcagcattggtggtgaagcagtaagcactgcatctgctgagaatggt
actactgcagatattgtggagggagctgctgctgctactgtggatggtttggtgccacca
atgtcaggcgaagaagagcgattgtggagtattgtgagggctaattccttggattttgat
gcatggactgccttgattgatgagacagagaaggtggcaggggacaagatattgaaaatt
cgaaaagtgtatgatgcctttttggctgaattcccattgtgttatgggtattggaagaag
tatgcagatcatgaggcacgaattggttctatggacaaagttgtggaggtatatgaacga
gctgttctgggggtgacatattcggtggatatttggttgcattattgcatatttgccata
aacacatatgaagatcctgacaccattagaaggctttttgaacgtggattagcttatgtt
ggaactgattatctgtcttaccccctttgggacaagtacattgaatatgaagaaatgcat
gcgcagtggggccatgttgccatgatttacatgaggatattagagattccaaatagaagg
ttggatgattatttcactagatttaaggcttttgctgcaagtcatcccttatcagaatta
aaaacagctgaggaagctgctgctgcagtgcctgctccttcagagggtggtgacctagca
aacgagggagaagttcatcctgatgttgctgaacaatctgctaaacctgtaagtgctggc
ttaacagaagcagaggagttggagaagtatatcgccattagagaagagatgtataagaaa
gctaaagagtttgattctaagatatctgattttgaaaatgctattaggaggccttacttt
cacgtgcggcccatcaattttgcagagcttgaaaattggcataactatctggattttata
gaaagagaagatgattttaacaaggtggtcaagttatatgaaagatgcctaattgcttgt
gctaattatcctgagtattgggtacgttatgtcttgtgcatggaaacctgtggaagtatg
gatcttgctaataatgcacttgctcgtgcaactcaagtctttgtcaagagacaaccagag
attcacctctttgctgcccgatttagagagcagaatggagatatacccagtgcccgagct
gcatacaaacttgtacacactgaaatcacgcctggccttcttgaagcagtcgttaagcat
gcaaacatggaacatcggctggggaacctcaaagatgccttctctttgtatgaacagacc
atagccatcgaaaaaggaaaagagcattcacaggtgttgccaatgttgtatgcacaattc
tctcggtttctatatttggttgctggaaatgtagaaaaggctagggaggttctagttgaa
gcgcttgagaacactccattatcaaaaccacttcttgaggcctttatatatcttgaatca
attcagtcactaccaaagcgaattgattatttagattcgttagttgagaagttcatagtg
cccaactcagatagcctcaatgcagcaattgctgtcgaaagagaggagctatcttgcatt
ttcttggagtttttaggtatgtttggagatgctcaatctattaagaaggctgatgatcgg
catgccaagctctttttaccccataggagcaagtcggagttaaaaaagcgtcatgctgag
gattatctagtttcagataagacaaaattagtaaaatcttatgctgatgctccttcacct
gcacaatcacttatgggtgcatatccaagtacacaaaaccagtgggcaacaggttatggc
ttgcagcctcaagcttggccacctgttacacaagcacagacccctggctatggtcaacag
gctacatatggaacatatggtggttatggaagcagctatactaatccgcaagtgcccacg
tctgttggacaaacagcaacttatggtgcctatcccccaacatatcctgtccagcaggct
ttccctcaacaaggttatccacaagtacaaccagctgcggcagctacattggccccagcc
catcagccagcttctgttccacagccctattatggaagttactactga
DBGET
integrated database retrieval system
