KEGG   Candidatus Hodgkinia cicadicola TETUND2: HCTETUND2_141
Entry
HCTETUND2_141     CDS       T03596                                 
Symbol
rpoD
Name
(GenBank) RNA polymerase sigma factor
  KO
K03086  RNA polymerase primary sigma factor
Organism
hcd  Candidatus Hodgkinia cicadicola TETUND2
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hcd00001]
 09140 Cellular Processes
  09142 Cell motility
   02040 Flagellar assembly
    HCTETUND2_141 (rpoD)
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03021 Transcription machinery [BR:hcd03021]
    HCTETUND2_141 (rpoD)
Transcription machinery [BR:hcd03021]
 Prokaryotic type
  Bacterial type
   RNA polymerase
    Sigma factors
     HCTETUND2_141 (rpoD)
SSDB
Motif
Pfam: Sigma70_r4 Sigma70_r2
Other DBs
NCBI-ProteinID: AHL31078
LinkDB
Position
109051..110310
AA seq 419 aa
MAPISVNSVKTLRFTQSQIFSKLRCLQSVFFVNAVRLPIVTALMLSLLEEEYGDCLTGFK
LVDRRQIKLCSDFEQDEHIGTETCFVCEHETCDKRGWEYLLECGYSVSALASCFQFRACE
CRRCSLCWALVKLLMHNIKDNVDWQIQMTSLLLKANVDYKLAQLIRVVIITLKRKWLFNV
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REERVLRLRGHSLTDFKWSLAKIGFELGLSKERIRQIELLASARVRALNERAMLELLCL
NT seq 1260 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system