KEGG   Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_00500
Entry
HCW_00500         CDS       T02032                                 
Name
(GenBank) transcription-repair coupling factor
  KO
K03723  transcription-repair coupling factor (superfamily II helicase) [EC:5.6.2.4]
Organism
hce  Helicobacter cetorum MIT 00-7128
Pathway
hce03420  Nucleotide excision repair
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hce00001]
 09120 Genetic Information Processing
  09124 Replication and repair
   03420 Nucleotide excision repair
    HCW_00500
 09180 Brite Hierarchies
  09182 Protein families: genetic information processing
   03400 DNA repair and recombination proteins [BR:hce03400]
    HCW_00500
Enzymes [BR:hce01000]
 5. Isomerases
  5.6  Isomerases altering macromolecular conformation
   5.6.2  Enzymes altering nucleic acid conformation
    5.6.2.4  DNA 3'-5' helicase
     HCW_00500
DNA repair and recombination proteins [BR:hce03400]
 Prokaryotic type
  SSBR (single strand breaks repair)
   NER (nucleotide excision repair)
    TCR (transcription coupled repair) factors
     TRCF (transcription-repair coupling factor)
      HCW_00500
SSDB
Motif
Pfam: DEAD Helicase_C TRCF CarD_TRCF_RID UvrB_inter ResIII
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFI03395
UniProt: I0EKC6
LinkDB
Position
complement(96643..99648)
AA seq 1001 aa
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NT seq 3006 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
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DBGET integrated database retrieval system