KEGG   Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_01285
Entry
HCW_01285         CDS       T02032                                 
Name
(GenBank) DNA polymerase I
Organism
hce  Helicobacter cetorum MIT 00-7128
SSDB
Motif
Pfam: DNA_pol_A 5_3_exonuc_N 5_3_exonuc
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFI03546
UniProt: I0EKS7
LinkDB
Position
complement(240335..243004)
AA seq 889 aa
MEQPITKEGTLALIDTFAYLFRSYYMSAKTKPLTNAKGFPTGLLTGLVGMVKKFYKDRKN
MPFIVFALESQTKTKRAEKLGAYKQNRKDTPEEMLLQIPIALEWLQKMGFTCIEVSGFEA
DDVIASLATLSPYKTRIYSKDKDFNQLLSDKIVLFDGKTEFLAKDCFEKYGVMPSQFTDY
QGIVGDSSDNYKGIKGIGSKNAKELLQKLGSLEKIYGNLELAKNLLSPKMYQALIDDKES
AFLSKELATLERECIKEFDFSSCAFPSVNPLLRITDELKEYGFVSTLRDLENSTSLLSLA
IDSGEKTANTPKKLNMIALENTEQFNAFLERLETLHTRVFIRLVVNKKKEILALAFLCEN
QGYFLSLEEELFMPFSLEFLKNAFSKILKNAHIIGHDLKTLLSFLKAKYKVSLESVQLQD
TQILAFLKNSEKVKFDEVLNAYLKENLITHEEMKDFNTKSKAEKLEHMSLELKALKHLCE
YFEKGGLEESLLNLAKEIEMPFMKVLLDMEFQGFKIDVNYFTQLEQEFKNSLSELERKIL
DLIGTDFNLNSPKQLAEVLYEKLELPKNRSNSTDEKNLLKIIDKHPSIPFILEYRELNKL
ANTYVAPLLRLKDREDKIHTTFIQTGTTTGRLSSHTPNLQNIPVRSKKGLLIRKGFIPSS
KEYCLLGVDYSQIELRLLAHFSQDKDLMEAFLKGRDIHLETSKALFGENLAKDKRHIAKS
INFGLVYGMGSKKLSETLNISVNEAKSYIEAYFKRFPSIKDYLQFMQDEILKTSKATTLL
GRYRVFDFTNANDYVKGNYLREGVNAIFQGSASDLLKLAMLKVSERFKNDSSVKLLLQVH
DELIFEIEEKNALELKQEIEHILNNEVYSLRVPLETSAFLAKRWDNLKG
NT seq 2670 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atggaacaaccaatcactaaagaagggactttagccttaattgatacttttgcgtatttg
tttagaagctattatatgagcgctaaaactaagcccttaactaatgctaagggctttcct
acggggcttttgaccgggcttgtgggcatggttaagaaattttataaagacagaaaaaac
atgccctttatcgtgtttgccctagaaagtcaaaccaaaactaaaagggctgaaaaacta
ggcgcatacaaacaaaatcgtaaagacaccccagaagagatgcttttacaaattcctatc
gctttagaatggttgcaaaaaatgggttttacttgtatagaagtgagtgggtttgaagct
gatgatgtcatagctagtctagccacactaagcccttataaaacacgcatttattctaaa
gataaggattttaaccagcttttgagcgataaaattgtgctttttgatggtaaaacggag
tttttggctaaggattgttttgaaaaatacggggtaatgccaagtcaattcacagattat
cagggtattgtaggggatagtagcgacaattacaaagggattaaaggtattgggagcaag
aatgctaaagaattattgcaaaaattagggagtttagaaaagatttatggaaatttagag
ttagctaaaaatttgcttagccccaaaatgtatcaagctcttattgatgataaagagagt
gcgtttttgagcaaagaattggctacactagagagagaatgtattaaggaatttgatttt
tcaagttgtgcttttcctagcgttaatcccttattaagaattacagatgaattaaaagaa
tatggttttgtctctactttaagagatttagaaaattccacttcgcttttaagtttagct
attgatagtggcgaaaaaacagctaacactccaaaaaaattaaacatgatagctttagaa
aataccgagcaattcaatgcgtttttagagcgtttagagacactgcatactagagttttt
atacgcttagtggttaataaaaagaaagaaattctagccctagcattcttatgcgaaaat
caaggctattttttatccttagaagaagagttgtttatgcccttttctttagagttttta
aaaaacgctttttctaaaatattgaaaaatgctcacatcatagggcatgatttaaaaacc
ctattaagctttctaaaagcaaaatacaaggtgtctttagaaagcgttcaacttcaagac
actcaaattttagcgtttttgaaaaattcagaaaaagtgaaatttgatgaagttttaaat
gcgtatttaaaagaaaatttaattacgcatgaagagatgaaagacttcaacacaaaaagt
aaggctgaaaaattagaacacatgagtttggaactaaaagccttaaaacacttgtgcgag
tattttgaaaagggggggctagaagagagtttgctcaatttagccaaagaaattgaaatg
ccctttatgaaggtgcttctagatatggaatttcaaggctttaaaattgatgtgaattat
ttcacgcaattagagcaagaatttaaaaattcattgagtgaattagagcgtaaaatttta
gatttaataggcacagattttaatctcaactcccctaaacagcttgctgaagtcttgtat
gaaaagttagagcttcctaaaaatagaagcaattctactgatgaaaaaaacttattaaaa
atcattgacaaacacccaagcattcctttcattttagaatacagagagttaaacaagctc
gctaacacttatgtagcccctttattacgcttgaaagatagggaagataaaattcatacc
acttttatccaaaccggcactactacagggcgtttaagctcgcacacgccaaatttgcaa
aatattccggtgcgttctaaaaaagggctactcattcgtaagggctttattcctagttcc
aaagagtattgtttattaggggtggattattctcaaattgagttgcgtttgctagcgcat
tttagccaggataaggacttaatggaggcgtttttaaaagggcgagacattcatttagaa
acttctaaagcgttgtttggcgaaaacttagctaaagataaacgacatattgctaaaagc
attaattttgggcttgtatatggcatggggagcaagaaattaagcgaaaccttgaatatt
tctgtcaatgaggctaagagctatatagaggcgtatttcaaacgatttcctagcataaaa
gattatttacaattcatgcaagatgagattttaaagacttctaaagcaactactttgctt
gggcgttatagggtgtttgattttactaacgcaaacgattatgttaagggtaattatcta
agagagggcgtgaatgcgatttttcaagggagtgcgagcgatttattaaagcttgcgatg
ttgaaagtgagtgagcgttttaaaaatgattcttctgtgaaattgctcttacaagtgcat
gatgaattgatttttgagattgaagaaaaaaacgccttagagttaaaacaagaaatagag
catatccttaataacgaagtctattctttaagagtgccattagagacaagcgcctttcta
gccaagcgttgggataacttaaaaggctag

DBGET integrated database retrieval system