Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_01820
Help
Entry
HCW_01820 CDS
T02032
Name
(GenBank) putative outer membrane protein
Organism
hce
Helicobacter cetorum MIT 00-7128
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
DUF2715
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI03649
UniProt:
I0EL30
LinkDB
All DBs
Position
370596..374183
Genome browser
AA seq
1195 aa
AA seq
DB search
MKFIKFVSVVGSVALIGSVGMLDAKTKAQTQAQKNEKVYTADKASATNALKTTDYQALSG
ATLTKDKKADKTDTDALQTDASTIVKDAKKVTDDLANMKKDEANKTKFNADKTAFATDLG
NLKSTESDYTAKEKLIAKAVAKADTPPTPAAVTQAQKDETNLAKEETAVSQATTTNTNAT
TDGVLNQDLKTLTTDTATEQTEYNSATKASDKSADLTQLKADETKVASDTKALDTALKDS
QYKGAVPALQKAQTQKSAYDNGTGASGAVTPTTTEGKAIKAAEGLKTSSTIVSGDLTQLG
KDISAVNTASSKLQSDISAVPAPIVSKGKTTNKDAIATAKEQVAKEVTALQQAEATVSTD
ESNLNEDSSIAAAQKALTTLQGSVTSSTHVKSDTNVTSSWTTLGELTSTKGNTAIATTLT
NATSVKTDSSVQTDVQSLTTDETAVNSALTALENALKNEKKAPAPTKSKTAPKTEKTASD
TTKGAKGSVASGAKDNTKKVVAESGKDKEKPAVKKDEVAKAPKDDKKGAEVAQHDKSRAI
AITETAEQPKLSVSSLEQTFENDVTALQGAENTLSTAVGTAEVNEASSALTDLQKALSTG
SDAQNPLALASSVEAIKTAIKGLNTATTNISADLTSAQNFLTNHYVQKDLGVVKTDEASA
TQALNNVESALKAQNESESKSKTAEKSHAETKAIILAAQSESSSTLTTDETKLTSAEKAL
STSEQTLSQDLTLAKDYQTIDSLIKEYASSFSGLKTEFAKFSADKDGGAVKNKGVATAYT
NLSNAMTAIENALNGTGKDNGLDSAIAKLKSYKNGGTAASATKFGTQKASLATMMTELQK
NEANFQNLVKALEQAKANSITLGGTNYTLGSTDFTTNNTAQNLSNMQTNLKTLQGSLGTL
NYANDHAVMSALSNALAIVTTANDDLKNPQVNVSTLNHQMTEAKEAIANVVSEINAAIKT
AGANSDEATNLGNALKIVSNASAIVSQAKSNVVAVAAQKGILPQVALPATSTQSVSGSAY
GVDVQIGYKYFFGKTKHWGIRGYATYAYMQSNLGHTTNIQGAGLGVGQANNHTYGAGFDF
LYNFHESQDGIHTAGILLGTELLGSTWVNQGQSIWHARMEEIKALGGKASMNTSYFQIPL
VVGFRSNFSKHSGIELGLKIPLVVNYYFRSNYDGFEQSTFYKNNIKLYFNYVVNF
NT seq
3588 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgaaattcattaaatttgtttctgtagtaggtagtgtggcgcttattggtagcgtgggt
atgttagatgcgaaaaccaaggcgcaaacacaagcacaaaaaaacgaaaaagtttataca
gcagacaaagctagtgctactaatgctttaaagactacagattatcaagctcttagcggt
gctactcttacaaaagataaaaaagctgataagacagatacagacgcattgcaaactgac
gcaagcactattgtaaaagatgctaagaaagttacagatgatttagcaaacatgaaaaaa
gatgaggctaataagacgaagtttaacgctgataagactgcttttgccacagaccttggt
aacctcaaaagcactgagagtgattacacagctaaagaaaagcttatagcaaaagcggta
gcaaaagctgatacccctccaaccccagctgctgtaacacaagcgcaaaaagatgagact
aacttagcaaaagaagaaacagccgttagccaagcgactacaacaaacactaatgccaca
acagatggagtcttaaaccaagatttaaaaactcttacaacagatactgctacagagcaa
acagaatataatagtgctacaaaagcaagcgataagtcagcagacttaactcaattaaaa
gctgatgaaacaaaagtcgcaagcgatacaaaagcccttgatacagcgctcaaagactct
cagtataagggagcagttcctgcattacaaaaagctcaaactcaaaagagtgcgtatgac
aatggcacaggtgctagtggcgcagttactccaacaactactgagggtaaggctatcaaa
gcagcagaaggcttaaaaactagctctacaatagtaagtggggatttaacacagcttggc
aaagatattagtgcagtgaatactgctagttctaaactccaaagtgatattagtgctgtg
cctgctcctatagtatctaaaggcaagaccaccaataaagatgcgattgctacagctaaa
gagcaagttgctaaagaagttacagccttacaacaagctgaggctacggtaagcactgat
gagagcaatctaaatgaggatagcagtattgcagccgctcaaaaagctttaactacattg
caaggttctgttacttctagcactcatgtaaaatctgatactaatgtaacttctagttgg
actactctaggcgagcttactagcactaagggcaatactgctatagcaactactttaacc
aatgctacaagtgttaagactgatagtagtgtgcaaactgatgtgcaaagcttaacgact
gatgaaactgctgttaatagcgcattgactgctttagaaaacgctcttaaaaatgagaaa
aaagctccagcaccaactaaaagcaaaacagcacctaagaccgaaaagactgcaagcgat
actactaaaggcgctaaaggtagtgtagcaagtggtgcaaaagataacaccaagaaagtt
gttgctgagagtggtaaagataaagagaaacctgctgtaaagaaagatgaagttgcaaaa
gcccctaaagatgacaaaaagggtgctgaagtagcacaacatgataaaagtagagctata
gctattacagaaactgccgagcaaccaaaactaagtgtttcaagcttagagcaaactttt
gaaaatgatgtaaccgcattacaaggcgcagaaaacactctttcaacagctgtaggcaca
gcagaagtgaatgaggctagtagcgcattgactgatttacaaaaagcattaagcacaggt
tctgatgctcaaaaccctctagctcttgcaagcagtgttgaggcgattaaaacggctatt
aaaggcttgaatacagctacaaccaatatttcagcagatttaactagcgctcaaaatttt
ttaactaaccactatgtgcaaaaagatttgggtgtggttaagacagatgaggctagtgct
actcaagcattaaataatgtagaaagtgctttgaaagctcaaaacgaaagcgagtcaaaa
agtaaaacagctgaaaaatcacatgctgaaactaaagcaattattcttgctgctcaatca
gaaagtagtagcactcttactactgatgagactaagcttactagcgctgaaaaagcccta
agcacgagtgagcaaacactctcgcaagatttaactcttgctaaagattaccaaaccatt
gatagtcttattaaggaatatgcaagtagttttagtggtttaaaaacagagtttgcaaag
ttttctgctgataaagatggtggtgctgttaaaaataagggtgtagcaactgcttataca
aacttatctaatgcaatgacagctattgagaatgctttaaatgggacaggtaaagataat
ggactagattctgctattgcaaaattaaagtcttataaaaatggcggaaccgctgctagt
gcaactaagtttggcacacaaaaagctagtttagctactatgatgacagagttgcaaaag
aatgaggctaacttccaaaacttggtgaaagcattagaacaagctaaagctaattctata
actttgggtggcactaattatactttgggttctactgactttacaacaaataataccgct
caaaacctctctaacatgcaaactaaccttaaaaccttgcaaggtagtttaggaactctt
aattacgctaatgaccatgcagtaatgtcagctctaagcaatgctttagctatcgtaaca
acagctaatgatgatttgaaaaaccctcaagtcaatgtctctactctaaaccatcaaatg
actgaggctaaagaggctattgctaatgtggttagtgaaattaatgcagcgattaaaaca
gcaggtgctaatagtgatgaggcaactaatttaggaaacgctttaaaaattgttagcaat
gctagtgcaatagtgagtcaagctaaaagcaatgttgttgctgtagcagctcaaaaaggt
attctacctcaagttgctcttcctgctacttctacacaaagtgtgagcggttcagcctat
ggtgtagatgttcaaattggttataaatacttctttggtaaaacaaagcattggggtatt
agaggttatgccacttatgcttacatgcaatctaacttaggacacactactaatattcaa
ggtgcaggactaggagtaggacaagcaaataatcacacttatggtgcaggctttgatttc
ttatacaacttccatgaaagtcaagatggcattcatactgcaggtattctactaggaaca
gaactcttaggctctacttgggtcaatcaaggtcaatctatttggcatgctagaatggaa
gagattaaagccttaggtggaaaagctagtatgaatacaagctattttcaaattccttta
gtggtaggttttagaagcaatttctctaagcatagtggtattgaactaggtcttaagatt
cctttagtagtgaattactattttagaagtaattatgatggctttgagcaatccacattc
tataagaataacatcaagttgtatttcaactatgtggtgaatttttaa
DBGET
integrated database retrieval system
