Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_04815
Help
Entry
HCW_04815 CDS
T02032
Symbol
fliD
Name
(GenBank) flagellar capping protein
KO
K02407
flagellar hook-associated protein 2
Organism
hce
Helicobacter cetorum MIT 00-7128
Pathway
hce02040
Flagellar assembly
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hce00001
]
09140 Cellular Processes
09142 Cell motility
02040 Flagellar assembly
HCW_04815 (fliD)
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02035 Bacterial motility proteins [BR:
hce02035
]
HCW_04815 (fliD)
Bacterial motility proteins [BR:
hce02035
]
Flagellar system
Flagellar assembly proteins
Filament
HCW_04815 (fliD)
SSDB
Ortholog
Paralog
GFIT
Motif
Pfam:
FliD_C
FliD_N
Flagellin_IN
Arp1_N
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI04230
UniProt:
I0EMR1
LinkDB
All DBs
Position
1037649..1039706
Genome browser
AA seq
685 aa
AA seq
DB search
MGVGSLSSLGLGSKVLNYDVIDKLKTADEKTLIAPLDKKMEQNIEKQKALVEIKTLLSAL
KTPIKTLSDYSTYIGRKSSVSGDALSASVGAGVPVQDIKVDVRKLAQGDINELGAKFSSR
DDVFSETNTTLKFYTQGKNYALPIKAGMTLGDVAQSITDATNGDVMGIVMKTGGDNPYQL
MVNTKNTGEDNRVYFGTHLKSSLKAQSALSLGVSESGESDVSLRLKGSDNEMHEVPIMLE
IPENYSVKQKNEAIQKAMLKALQDDPNFKDLIANGDISVDIVHNGDSLIINDRRGEPIEI
KGSKAKELGFEQTKTQDDDLFKSARTIKEGKLEGIISLNGETLDLSSLTSANNSSEQNTD
AIVDAINAKEGLSAYKNSEGKLVINAKKGLLKIRGEDALGKASLKDLGLSAGTTQSYAVA
QKELFLVKNLQKASDAEFTYNGVSITRPTNEVNDVIGGVSITLQQTTEPNKPAIISVSRD
NQAIIDSIKDFVKAYNELIPKLDEDTRFDPDTKIAGIFNGVSDIRTIRSSLNNVFSYTLY
TDGGVESLMKYGLGLDDKGTMSLDESRLSSALSSNPKATQDFFYGSDKNDVSGREIHQDG
IFTKFSQVISNLIDGGNAKLKIYEDSLDRDAKSLAKDKESAQETLKTRYNTMAERFAAYD
GQISKANQKFNSVQMMIDQAAAKKN
NT seq
2058 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atgggagtagggtcattaagctctttaggacttgggagtaaagtcttaaactatgatgtg
attgataagcttaaaactgcagatgaaaaaaccttaatcgcaccattagataaaaaaatg
gagcaaaatattgaaaagcaaaaagcacttgtagaaatcaaaacacttctttcagcgctt
aaaactcccattaagactctttcggattattctacctatattggcagaaaaagcagtgtt
tcaggagatgcgctaagtgcgagtgtgggagctggtgttcctgtgcaagatattaaggtt
gatgtgcgaaagttagcacaaggcgatattaatgaactaggagcaaagttttcttcaaga
gatgatgtttttagtgaaacaaataccacgcttaaattttacactcaaggtaagaattac
gcattacccattaaagcaggtatgactttaggcgatgtagctcaaagtattaccgatgca
accaatggtgatgtgatggggattgtgatgaaaacaggcggtgataatccctaccaactt
atggtaaataccaaaaataccggtgaagacaatagggtatattttggaacacatttaaaa
tcaagtcttaaagctcaaagtgcgctttctttgggggtaagtgagagtggagagagtgat
gtgagcttgcgattaaaaggtagcgataatgaaatgcatgaagtgcctatcatgctagaa
attcccgaaaattactctgttaaacaaaaaaatgaggcaatccaaaaagccatgctaaaa
gctttgcaagatgaccctaattttaaagatttaattgccaatggagatatttctgtagat
attgttcataatggggattctttaattatcaatgataggcgtggagagcctattgaaatt
aaaggtagtaaggctaaagagctaggttttgagcaaactaaaactcaagatgatgattta
tttaagagtgcacgcacaattaaggagggtaaattagaaggcataattagcttgaatggc
gaaaccctagatttatcttctttgacaagtgcgaataattctagcgagcaaaataccgat
gcgattgttgatgccattaatgctaaagagggattgagcgcttataaaaattcagagggc
aagctagttattaatgctaagaaaggtttgctaaaaattagaggcgaagatgcattggga
aaagcaagcttaaaagacttgggcttaagtgctggcactacacaatcatatgcagtggct
caaaaagaactttttttagttaaaaatttacaaaaagcaagcgatgcagaatttacctat
aatggtgtgagtatcacacgccctaccaatgaagttaatgatgtgattggtggggttagt
atcaccttacaacaaactactgagcccaataaacccgctatcattagtgtgagtagggac
aatcaagccattatagatagcattaaagattttgtaaaagcctataatgaattaattcct
aagcttgatgaggacactcgctttgaccctgataccaaaattgcagggatttttaatggg
gtgagtgatatacgcacgattcgctcatcgctcaacaatgtgttttcttatacattatat
acagatggcggtgtagaaagccttatgaaatatggtttaggcttagatgataaaggcaca
atgagtttagatgaatcaaggttgtctagcgctttaagctcaaatcctaaagctacgcaa
gattttttctatggaagcgataaaaatgatgtttcaggtagagaaatccatcaagatggt
atttttacgaagtttagtcaagttatttctaatctcattgatggagggaatgctaaatta
aagatttatgaggattctttagatagggatgctaaaagtttggctaaggataaagagagc
gctcaagaaaccttaaagactcgctataacacaatggcagagcgttttgcagcctatgat
ggtcaaatttctaaggctaatcaaaaatttaattcagtgcagatgatgattgaccaagca
gctgccaagaaaaactaa
DBGET
integrated database retrieval system