KEGG   Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_06700
Entry
HCW_06700         CDS       T02032                                 
Name
(GenBank) putative outer membrane protein
Organism
hce  Helicobacter cetorum MIT 00-7128
SSDB
Motif
Pfam: HP_OMP
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFI04598
UniProt: I0ENS9
LinkDB
Position
complement(1437242..1442758)
AA seq 1838 aa
MKVQAMIFNKKFLKASLVLSVFLGGKEVLAKDCSTIFCDKASKNTKSILLKPKSFLMFDS
NNQFATSVPLDNLKGQSVNYAGKTFSNSVNLYNGTIDNYNGNHSSTLVFNGINNQFKNTT
FNNGQQNGSYNNSITFGVSNSKNTFNDVTFNNANGNNCQISYGNAIACNDTLTFNGTNIF
TNGVAFNGGSNVFNGTNTFANGVIFNGGSSTFNNSITFNGSAKNTINNYGGSSLTFNGAN
NQFNNSIFNNGKQTNYDSNRITFGTSNSQNAFNDVTFNNNNYYRTLTFNGNNTFTNGVTF
NSGINTFNGTNTFTNGVTFNGGSSTFNGNAIFNGSAKNTINNYGRSNLTFKGANNQFNNT
TFNNSQQNGYYGYSGNSITFGISNSQNTFNDVIFNNASSGNNCQDDNGNYIPCATLTFNG
NNTFNDVIFNNASSGNNCQDDSGNIPCTTLGTTLTFNDNNTFNDVIFNNASSGDTCYDDN
GNYIPCTTLTFNGTNTFTNGVTFNGGRSTFNNSITFNGSKQNTINNYGGSALTFNGANNQ
FKNTTFYNGKQNGSSNNSITFGASKGQNTFNDVIFNNANSNNCQDFDGGTITCNNTLTFN
GTNTFTDGVSFSNGSATFNGGRGIFDTNVTLNGITIDNSNGSTIIFRGANQFKNTTFNNG
QQNGSSNNSITFGISNSQNTFNDVTFNSNAYSCQNSSGVSIACNNTLTFNGNNTFTNGVT
FNNFYSNNTLTFNGANTFTNGVTFNDSSSIFNSSITFNGSAKNTINNYGGSTLTFSGNNN
QFNNVAFNNGQQNGYNNSITFGTSNGNSHNTFNDVTFNNAGGNNCQDDNGNYIPCTTLTF
NGTNTFTNGVTFNGGSSTFNGTNTFTNGVTFNGGSSTFNGNVTFNNVIQNAINTYNGSTL
TFKGANNQFDNVTFNNGKQNGYHNNSITFGTSKSQNTFNNVTFNNASSGNNCYNSSGNTI
PCKNTLTFNGNNTFTNGVTFNGGSSTFSGNVIFDSATLSGSGNFSFNNGTITFQGIDTLN
SSNSPFDNYGGHNSNGDNIDFASNSALNLNYSLDINNIYSIIDTSGTINYGNLSDLYKLI
EIDGIKGSLDKIVSNTLNNNATLAQANSIDETYDVTYDNVNGKDITLQETFTNNSISVSV
EKITKLSPKQANTETYNQDYSSAQKDLNTANTDTQANTTAQASDKTLATSNPTTVGNDLT
QLAKDAKAVASAQNTLQQDLSNEQQAIGTSNFDTYHNNIASDEQNLANAEQAFTNEQTTL
QNDVKIAQEEQKAKEKEQALKQANTQTYNKDNSSAQQDLNTANTDTQANTTAQANDESIA
QNSSSVAKDLKQLNTDSQNITKAQQALQQDLSNEQQAIGTSNFDTYHNKIAGDESSLANA
EQAFANEQTTLQNDVKIAQAKQNQNTNNPHVISGNGNQENHNKHNKVIAHHSDSSNKETN
NNNPHIANNPHQQATHSTPSIPTPHNNQSPQPKTTHSTTIPNSGSNPNPTTPTKIAINGT
PITLAPNSFKINQTTTSLLQLQNNLSELKTALETNQNPMLNSYENTKAYKEITKDLNNAF
SLIKQVSDTLNNNSKVSLTSLNNQMSNANEVLNTLATQIQNSIDSSVSNGNDNKENLKLL
ANTLSVIQNASKVVHQAQTNISQVATSSITYTQPTTQTQRTNSSAYGLDIQIGYKYFFGK
KKHFGIRGYATYSYMYSNNSNNNNNNNNLIKTNHHTYGAGFDFLYNFYESKNSLYTTGIL
LGIELLGSTWDNSNYALLNDYAKDIKALGGKAHINTSVFQLPLVIGFRSNFSKHSGIELG
FKIPLITNDYFTSNLKDYKETIIYRDNVNLYFNYVVNF
NT seq 5517 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaagttcaagcaatgatatttaataagaaattcttaaaagcctcattagtcttaagc
gtgtttttaggtggaaaggaagtgttggcaaaagattgctccacaatcttttgtgataaa
gcaagtaaaaatacaaaatctatcttgcttaaaccaaaatcttttttaatgtttgatagt
aacaatcagtttgctactagcgttccccttgataatcttaaaggacaaagcgttaattat
gctggtaaaacttttagcaactcggttaatttgtataatgggactattgataactacaat
ggcaatcatagttctacactagtttttaatgggattaataaccaatttaagaatactacc
tttaataatggtcagcaaaatggtagctacaacaacagcattacctttggcgtttcaaat
agtaaaaatacttttaatgatgttacttttaacaatgctaatggcaataattgccaaatt
tcttatggtaacgctattgcttgtaacgacaccctaactttcaatggaactaatattttc
actaatggagttgcatttaatggtggtagcaatgtgtttaatggcaccaacactttcgct
aatggtgtcatatttaatggcggtagttcaacttttaataactcaatcactttcaatggc
tctgcaaaaaatactatcaataactatggtggttctagcctaactttcaatggtgctaac
aatcaatttaataattctatttttaacaatggcaaacaaacaaattatgacagcaacaga
attacctttggcacttcaaatagtcaaaatgcttttaatgatgttacttttaataataat
aattattatagaactctaactttcaatggtaataacactttcactaatggagttacattt
aatagcggtatcaatacatttaatggaaccaacactttcactaatggcgttacatttaat
ggtggtagttctactttcaatggcaatgcaatctttaatggctctgccaaaaacactatc
aataactatggtcgctctaatctaactttcaaaggtgccaacaatcaatttaacaatact
acttttaataatagtcagcaaaatggttattatggttattctggtaacagcattaccttt
ggtatttcaaatagtcaaaatacttttaatgatgttatttttaataatgctagtagtggt
aataattgccaagacgataatggcaactatattccttgcgccaccctaactttcaatggt
aataacacttttaatgatgttatttttaataatgctagtagtggtaataattgccaagac
gatagtggcaatattccttgcacaaccctaggcacaaccctaactttcaatgataataac
acttttaatgatgttatttttaataatgctagtagtggtgatacgtgctatgacgataat
ggcaactatattccttgcaccaccctaactttcaatggcactaacactttcactaatgga
gttacttttaatggtggtcgttctacttttaataattcaatcacttttaatggttctaaa
caaaacactatcaataactatggtggctctgctctaactttcaatggagccaacaaccaa
tttaagaacactactttttacaatggaaaacaaaatggtagctctaataacagtattacc
tttggcgcttcaaagggtcaaaatacttttaatgatgttatttttaacaatgctaatagt
aataattgtcaagactttgatggaggcactattacttgcaacaataccctaactttcaat
ggtactaacacttttactgatggggttagttttagtaatggtagtgcaacctttaatggc
ggtagaggtatttttgacaccaatgttactcttaatggaattaccattgataattctaat
ggttctaccataatttttaggggagctaaccaatttaagaatactacctttaataatggt
cagcaaaatggtagctctaataacagcattacctttggtatttcaaatagtcaaaatacc
ttcaatgatgttacttttaatagtaatgcttatagttgccaaaattctagtggtgttagt
attgcttgcaacaacaccctaactttcaatggtaataacactttcactaatggtgttaca
tttaataatttttatagtaataatactctaacttttaatggtgctaacacttttactaat
ggcgttacatttaatgatagtagttcaatttttaatagttcaatcactttcaatggctct
gccaaaaacactatcaataattatggtggctctactctaactttcagtggcaataacaac
caatttaataatgttgcctttaataatggtcagcaaaatggttataacaacagtatcacc
tttggtacttcaaatggtaatagtcataatactttcaatgatgttacttttaataatgct
ggtggaaataattgccaagacgataatggcaactatattccttgcaccaccctaactttc
aatggcactaacactttcactaatggcgttacttttaatggtggtagttctactttcaat
ggcactaacactttcactaatggcgttacttttaatggtggtagttctacttttaatggc
aatgtaacatttaataatgttatacaaaatgccatcaatacttataatggctccactcta
actttcaagggtgctaataaccaatttgataatgttacctttaataatggcaaacagaat
ggttatcacaacaacagcattacctttggcacttcaaagagtcaaaacacttttaataat
gttacttttaataatgctagtagcggtaataattgctacaactctagtggtaacactatt
ccttgcaaaaacaccctaactttcaatggtaataatacttttactaatggggttacattt
aatggtggtagttcaacttttagtggcaatgttatattcgatagtgccaccttgagtggt
agtggaaactttagttttaataatggcactataacctttcaaggcattgatactctaaat
tctagcaattcaccttttgataattatggagggcataactctaatggcgataatattgac
tttgctagcaatagtgctttaaatctaaactattctttggatataaataacatttatagc
attattgatacaagcgggactattaattatggcaacctaagtgatttatacaagcttata
gaaattgatggcattaaaggcagtttagataagattgtctctaacactcttaataacaac
gctacactagctcaagctaattctattgatgaaacctatgatgtaacttatgataatgtt
aatggtaaagacattaccttgcaagaaacttttactaataactccattagtgttagtgtt
gaaaaaatcactaaacttagccccaagcaagccaacactgaaacttataaccaagactac
tctagcgctcaaaaagacttaaatacagcaaacactgatacacaagccaacactacagca
caagctagtgataaaactcttgctacctctaaccctacaacagtaggtaatgatttaaca
caactagccaaagacgctaaagcagtagctagtgctcaaaacaccctacaacaagactta
agtaacgagcaacaagcaataggtacaagcaactttgatacataccacaataatattgca
agcgatgaacaaaatctagccaatgctgaacaagcatttactaatgaacaaaccacacta
caaaatgatgtaaagatagcacaagaggaacaaaaggctaaagaaaaagaacaagccctt
aaacaagccaacactcaaacttacaacaaagataattctagcgctcaacaagacttaaac
acagcaaacactgatacacaagctaacactacagcacaagctaacgatgagagtattgcc
caaaatagctctagtgttgccaaagatttaaaacaacttaacacagactctcaaaacatt
actaaagctcaacaagccttacaacaagacttaagtaacgagcaacaagcaataggtaca
agcaactttgatacataccacaataagattgcaggcgatgaaagctctctagctaatgcc
gaacaagcatttgctaatgaacaaaccacactacaaaatgatgtaaagatagcacaagca
aagcaaaatcaaaacactaataatccacatgtaataagtggtaatggtaatcaagaaaat
cataataagcataataaggttatagctcatcatagcgatagctccaacaaggaaacaaat
aacaataatccgcatatagcaaataaccctcaccaacaagccactcactcaacaccaagc
attccaaccccacataacaaccaatccccacaacctaaaaccactcactcaaccacaatt
cccaatagtggctctaaccctaacccaacaaccccaactaaaatagctatcaatggaaca
cctatcactctagctccaaattcctttaaaataaatcaaaccaccacttctctcttgcaa
ttacaaaataaccttagtgagttaaaaacagcattagaaacaaatcaaaaccctatgctt
aattcatatgagaatacaaaagcttacaaggagattactaaagacttgaataatgccttt
agtcttattaaacaagttagtgatacattaaacaacaactctaaagtaagccttacttct
ttaaacaaccaaatgtctaatgctaatgaggttttaaacacattagctacacaaatacaa
aattctatagatagtagtgtgtctaatggcaatgacaataaagagaacttaaagctatta
gctaatactcttagtgttattcaaaacgctagtaaagtagttcatcaagcacaaactaat
atctcccaagtagccacaagctctattacctatacacagcctactactcaaacccaaaga
actaatagctcagcttatggactagatatccaaataggttataaatacttctttggtaag
aaaaagcattttggtattagaggttatgctacttactcttatatgtattctaacaatagc
aataacaacaataacaacaataatctaataaaaactaatcaccatacttatggagcaggt
tttgatttcttatataacttctatgagagtaagaatagtctctatactacaggtattcta
ttaggaatagaattgctaggttctacttgggataattcaaactatgctctattaaatgat
tatgcaaaagatattaaagctttagggggaaaagcacatataaatactagtgtctttcaa
cttcctctagttataggctttagaagtaatttctctaagcatagtgggattgaattaggg
tttaagattcctttaattactaatgattattttacaagtaatctaaaagattataaagag
actattatctatagagataatgttaatttgtattttaactatgtggtgaatttttaa

DBGET integrated database retrieval system