Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_06795
Help
Entry
HCW_06795 CDS
T02032
Name
(GenBank) outer membrane protein HopG
KO
K15848
outer membrane protein SabA
Organism
hce
Helicobacter cetorum MIT 00-7128
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Motif
Pfam:
HP_OMP
TruD
Motif
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AFI04617
UniProt:
I0ENU8
LinkDB
All DBs
Position
complement(1465240..1467639)
Genome browser
AA seq
799 aa
AA seq
DB search
MPLLNSNQLDTLSNGVSSQITNLQNQINTLGSSATAEQKTQLAQLNIQKQAINVLQALQQ
DPSLFKNPQIENLAKSLQLNAGITQNGVGIMSLGLVMIQTNELLQLIKNNPTTNLIQTHS
KEQPTLITNNYATHSSPTSTTEVLKSLDSLRLSSIKGYLEGYLEELNGMMNGQYYQQGFQ
HNITLNTIKTKVQSILSALNSNQAFNSSSITESLKTIIDDLNANTIGRNDTITDKEILQN
GLIGWSENEGAKITPHAYLTPNFGINSLMLFQMLQGIAKNQKDVNYAYALSYAFQHFRKQ
YVNFFSNEVYNGCAFKSNDCGKLVSPPTLQNLIEKIDPKLIPTYKQLLNKASNEFQKTME
TADAIGSASAFTSAMTTLKNKISALANSNDKQQALNIIDKMLTDIPIYDAQSSNFNMQLS
AWMWGIVMNSPTTVHITVLSGQTKNGVKENSSVVISGSFVPADGCSGNCSEYQYTPKIKT
PQQLYHAVSDWWNNMGNIANALNSHNPKEIGVAIQSFGNFYNEQWKNNPHYQQGGSYLNK
NQIKQILNNINTSLPKADQQTLHFTFMALPTNSTNTLSQQHQATYNTLQVSKPIALASLS
TLASMFNNMNYLSSPTTTFTNNDKVIESKQQGYMLGFGIKGGYKQMFNHYIKGNRESKKK
YGQFGLRYYAFLDYNYGVLSQRNTNQVNMNMLTYGVGLDILVNIFENKLASYGIFGGFQI
AGNSWLATRNYSSSMKDKIRATHFQCLFDFGLRTNILSHHGIELGVKIPMLSQRYIDVAN
YKVNYKREYVYYVGYVWGF
NT seq
2400 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
gtgcctttactaaactctaatcaattagacacgctttctaatggtgtctctagtcaaatc
acaaatttacaaaaccaaataaacactttaggtagtagtgctacagcagagcaaaaaaca
caactcgctcaactaaacattcaaaaacaagctatcaatgttttacaagctttacaacaa
gaccctagcttgtttaaaaaccctcaaatagaaaatctagctaaaagcttgcaattaaat
gcaggaatcactcaaaatggtgtgggcattatgagcttaggtttagtgatgattcaaacc
aatgaattattgcaacttataaaaaataatccaactactaatcttattcaaacacattct
aaagaacaaccaacacttataacaaataactacgccactcattctagccctacctctact
acagaagtgcttaaaagccttgatagtttaagactttcatctattaaggggtatttggag
ggttatttagaagagttaaatggcatgatgaatggtcaatattatcaacaaggatttcag
cataacataactctaaataccataaaaacaaaggttcaaagtattttaagtgctttaaac
tctaatcaagcattcaatagctcaagcataactgaaagtttaaaaacaatcattgatgat
ttgaatgcaaacactatcggtaggaatgacaccattacagataaagagattttacaaaat
gggcttatagggtggagcgaaaatgaaggtgcaaaaataactccacatgcctatttgacc
cctaactttggtatcaactctcttatgctctttcaaatgctacaaggcatagctaaaaat
caaaaagatgtgaattacgcttacgcactaagctatgcgttccaacactttagaaaacaa
tatgtcaatttctttagtaatgaagtttataatggttgtgcttttaagtctaatgattgt
ggcaaacttgtatcacctcctactttgcaaaatttaatagaaaagatagaccccaaactt
attccaacctataagcaactccttaataaagccagcaatgaatttcaaaaaactatggag
actgccgacgctataggtagtgcaagtgcttttacttcagccatgacaacattaaaaaat
aagattagtgctttagccaattcaaatgataagcaacaagcccttaatattattgataaa
atgcttacagatattcctatttatgatgcccaaagctctaattttaacatgcaactaagt
gcatggatgtggggtattgttatgaatagcccaactacagtgcatattactgttcttagt
ggtcaaacaaaaaatggtgttaaggaaaattcaagcgttgttattagtggttcatttgtg
cctgctgatggttgcagtggcaactgcagtgaataccaatatacgcctaaaataaaaacc
ccacaacaactctatcatgctgtttcagattggtggaacaatatgggcaacatagctaac
gcccttaactctcataatcctaaagaaataggtgtggcaattcaaagctttggtaatttc
tataacgagcaatggaaaaataacccacattaccaacaaggtggaagttaccttaataaa
aaccaaatcaagcaaatccttaacaatatcaacacatctctacccaaagctgaccaacaa
accttgcattttacttttatggctctacccaccaactctactaatactctctctcaacaa
caccaagctacctacaatactctacaagtttctaaacccatagccttagcaagtctgagc
actttagcgagtatgtttaataacatgaactacttaagctcacctacgactacattcact
aacaatgataaagttatagaaagcaaacaacaaggttatatgctaggctttggaatcaag
ggtggctataaacaaatgtttaatcattatattaaaggcaatagagaaagtaaaaagaaa
tacggacaatttggattaagatattatgctttcttagattataactatggagtcttaagt
caaagaaacactaatcaagttaatatgaacatgcttacttatggtgtaggtttagatatt
ctagtgaatatctttgaaaataaactagctagttatggaatctttggtggttttcaaatt
gctggtaattcatggttagctactagaaattattctagtagtatgaaagataaaattaga
gcgactcattttcaatgtttgtttgattttggattaagaactaatattcttagtcatcat
ggtattgaattaggagtaaagattcctatgcttagtcaaagatatattgatgtagctaat
tataaagtgaattataaaagagagtatgtttattatgttgggtatgtgtgggggttttag
DBGET
integrated database retrieval system