KEGG   Helicobacter cetorum MIT 00-7128: HCW_08115
Entry
HCW_08115         CDS       T02032                                 
Name
(GenBank) VirD4 coupling protein
Organism
hce  Helicobacter cetorum MIT 00-7128
SSDB
Motif
Pfam: T4SS-DNA_transf TraG-D_C TrwB_AAD_bind ARM_At3g06530
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFI04880
UniProt: I0EPL1
LinkDB
Position
1780793..1783027
AA seq 744 aa
MKMQFVKAFCVLFSILLIPLFFILANYYTFDALKSLRQAYFFSQSVFVGLYNGASIFDLK
FEVYITMLMSLTPLVATIYISFPKTTEISHGYARWANVKDIECFKVFSKEGFCKVVHRLG
VQFDNGFILGKFGFPKLRNVCYDKPLGAMIVAPPGAGKTACIALPNLLTLPNSCIITDIK
GELRDKTAGYRQKFLNNRILIFNPYGDDNTCYFNPFDKRIVEKMTFAEQLRHVKAVGDGI
FVDEEDHWVSKAKELFVFFALLQIVTKGYSSFYDVSIAPTDDYAPLIHPKSPYYKQLYQH
DKKTGEVILDPQTNAPMPVLQADILKLFLKQTADQKYIDVNDERNYNPNEPNPPYGTKDA
LDEIIRTGARKWARTPDDEFGSIMSSFVRFMFVYQDPKVREATSKMSFDYEELRTSKISI
YIVIAQIDIGTLSPLVRTFLESIAKNLMVKESSKPEERIFIIADEFVRFGKLPFLLEMPA
LCRSYNVVPLFITQDYAMIRKHYSDDDLKILKGVVHYNIVFKMNSAEDAEIVSKEVGEFT
RQSKNYSTEKGQLVFGGSSSYSHEGRNLLTAQDIMNINSDEVIVIVTGAKATPLKLKANY
WFKDKELLKRANLPIDLEVERKRVEGPTQPTTEIETTPNQNKANLEPSNEGENTENESNE
SNNKNNPTTELENSNLIESEQDNENPITSESKNENTEQGNHNEIDEILKKPMSEISMEEK
RALFKKMQQGDEESEQEILQSTQN
NT seq 2235 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgaaaatgcaatttgtgaaagctttttgtgtgctttttagcattttgcttatcccctta
ttttttatcttggctaattactacacttttgatgccctaaagtcgttgagacaagcttat
ttcttttctcaaagcgtttttgtagggctttataacggagcgagtatctttgatttaaaa
tttgaagtctatatcaccatgcttatgtctttaacacccttagtagctacaatctatatc
agttttccaaagactacagaaatttcgcatggttatgcgagatgggctaatgttaaagat
atagaatgctttaaagtctttagtaaagagggcttttgtaaggtagtgcatagattaggg
gtgcaatttgataatggctttattttaggtaaatttggttttcctaagcttagaaatgtg
tgctatgacaaacccttaggagcgatgattgttgcaccccctggagctggaaaaactgca
tgtattgctttgccaaacttattgactttacctaatagctgtattatcactgacattaaa
ggcgaactaagagataagactgctggatatagacaaaaattcttaaacaacaggatttta
atctttaatccctatggtgatgataacacttgctatttcaatccttttgataaaaggatt
gttgaaaagatgacctttgcagagcaattaaggcatgttaaggcagtgggcgatggcatt
tttgtagatgaagaagaccactgggtgtctaaagccaaagaactttttgtcttttttgct
cttttacaaatagtaaccaaagggtatagctctttttatgatgtctctatcgctccaaca
gatgattatgctcccttaatacaccctaaaagcccttactacaagcaactctatcagcat
gataaaaagacaggtgaagttatcctagacccacaaactaacgcccctatgccagtccta
caagctgatattttaaaactctttttaaagcaaacggctgaccaaaaatacatagatgta
aatgatgaaagaaattataatcctaatgagcctaacccaccttatggaacaaaggacgca
ctagatgaaatcataagaactggtgcgagaaaatgggctagaactcctgatgatgagttt
gggagcattatgtcttcttttgtgcgatttatgtttgtttatcaagaccccaaagtgcgt
gaagccacttctaaaatgagctttgattatgaagaattaagaacaagcaaaattagtatc
tacatcgtgattgctcaaattgatataggcacactctctccgttagtgagaactttttta
gaaagcattgctaaaaatcttatggttaaagaaagctctaaacctgaagagcgtattttt
atcatcgctgatgaatttgttagatttggtaagttgcctttcttgttagaaatgccagca
ttgtgtcgctcttataatgtcgttcccttattcatcacgcaagactacgcaatgattaga
aaacactacagcgatgatgatttgaaaatcctaaaaggcgtggtgcattataacattgtc
tttaagatgaatagtgcagaagatgctgagattgtctctaaggaagtgggcgaatttaca
agacaatctaaaaattattctactgaaaaaggtcagttagtctttggaggtagctcttct
tatagccatgagggtagaaacttactcacagcccaagacattatgaacatcaattctgat
gaagtcattgtcattgttacaggggcaaaagctacccccttaaaactcaaggctaactat
tggtttaaagataaagagcttttaaaaagagctaatttgcctattgatttagaagtagag
agaaaaagagttgaaggacctacgcaacccactacagagattgaaacaactcctaatcaa
aacaaagctaatttagaaccaagcaatgagggggaaaacacagagaatgagagtaatgaa
agcaacaacaagaataaccccactacagagcttgaaaattctaatctcatagaaagcgaa
caagataatgaaaaccccattacttcagaaagcaagaatgaaaatacagagcaaggaaat
cacaatgaaattgatgagattttaaaaaagccaatgagtgaaatcagcatggaagaaaaa
agagccttgtttaagaaaatgcaacaaggcgatgaagaaagcgaacaagaaattctacaa
agcacccaaaattaa

DBGET integrated database retrieval system