KEGG   Helicobacter pylori HUP-B14: HPB14_00080
Entry
HPB14_00080       CDS       T02035                                 
Name
(GenBank) ComB4 competence protein
  KO
K12053  ComB4 competence protein
Organism
hcn  Helicobacter pylori HUP-B14
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:hcn00001]
 09180 Brite Hierarchies
  09183 Protein families: signaling and cellular processes
   02044 Secretion system [BR:hcn02044]
    HPB14_00080
Secretion system [BR:hcn02044]
 Type IV secretion system
  DNA uptake competence system protein
   HPB14_00080
SSDB
Motif
Pfam: CagE_TrbE_VirB TrwB_AAD_bind FtsK_SpoIIIE DUF87 AAA_29 nSTAND3 TraG-D_C RsgA_GTPase AAA_10 AAA_22 AAA_16 T2SSE DUF5727 AAA_23 AAA_7 PduV-EutP CbiA ABC_tran DUF5398 SMC_N ResIII
Other DBs
NCBI-ProteinID: AFI06739
UniProt: A0AB32ZNI0
LinkDB
Position
14140..16503
AA seq 787 aa
MLEKLLSAIKQKVSNYFLGVLPKSYSMNEENNILGLYDEHFLLTKNENLVGILRLEGVSY
THLSTEQLQDLFTERQMALDSLEKVVARLVVKRRKIDHQQNIQSDSQYLQAILNQFENKE
VYENQYFLVLESTHSLQGVLEHKKKSLMHANKENFKDILSYKAHFLQETLKSLEIQLKNY
APKILSSKEVLNFYAEYINGFDLPLKPLVWGYLSDSYIASSITFEKDYFIQESFNQKTYN
RLIGIKAYESERITSIAIGALLYQETPLDIIFSIEPMSVHKTLSFLKERAKFSMSNLVKN
ELLEYQELVKTKRLSMQKFALNVLIKAPSLEDLDAQTSLVLGLLFKENLVGVIETFGLKG
GYFSFFPERIHLNHRLRFLTSKALACLMVFERQNLGFKANSWGNSPLSVFKNLDYSPFLF
NFHNQEVSHNNAKEIARVNGHTLVIGATGSGKSTLISFLMMSALKYQNMRLLAFDRMQGL
YSFTEFFKGHYHDGQSFSINPFCLEPNLQNLEFLQSFFLSMLDLAPSRDKEALEDMNAVS
GAIKSLYETLYPKAFSLLDFKETLKRTSSNQLGLSLEPYLNNPLFNALNDAFNSNAFLNV
INLDAITQNPKDLGLLAYYLFYKILEESRKNDSGFLVFLDEFKSYVENDLLNTKINALIT
QARKANGVVVLALQDIYQLSGVKNAHSFLSNMGTLILYPQKNARELKHHFNVPLSETEIS
FLENTPLYARQVLVKNLGNGSSNMIDVSLESLGRYLKIFNSDSSHVNKVKALQKDYPTEW
REKLLKS
NT seq 2364 nt   +upstreamnt  +downstreamnt
atgttagaaaagcttttgagcgctatcaagcaaaaagtttcaaactattttttaggggtt
ttgcctaaaagctattctatgaacgaagaaaacaacattttaggcttgtatgatgagcat
tttttactcactaaaaacgaaaacttagtgggtattctccgtttagagggggtgagttac
acccatttaagcacagagcaattgcaagatcttttcactgagcgccagatggcgttggat
tctttagaaaaagtcgtggcacgcctggtggttaaaaggcgtaaaattgatcaccaacaa
aacattcaatctgattctcaatacttgcaagcgattttgaatcaatttgaaaacaaagaa
gtgtatgagaatcagtattttttagttttagaaagcacgcactccttacaaggtgttttg
gagcataagaaaaaatctctcatgcatgccaataaggaaaattttaaggatattctctct
tataaagcgcattttttgcaagaaactttaaaaagcctagaaatccagctcaaaaactat
gcccccaaaatcttaagctctaaagaggttttgaatttttatgcggaatatatcaatggg
tttgatctccctttaaaacccctagtatgggggtatttgagcgatagctatatcgctagt
tctatcacttttgaaaaagattatttcattcaagaaagctttaaccaaaaaacctataac
cgcttgattggcattaaagcttatgagagcgaacgcatcacttctatagcgatcggagcg
cttttataccaagagacgccactagatattatcttttctatagagcctatgagtgtgcat
aaaacgctgagttttttaaaagagagagccaagtttagcatgtctaatctcgttaaaaac
gagctgctagaataccaagaattggtcaaaaccaaacgcctatccatgcaaaaattcgcc
ctaaacgttcttatcaaagcccctagtttagaggatttagacgctcaaacgagcttagtt
ttagggcttttatttaaagaaaacttagtgggcgttatagaaacttttggcttgaaaggg
gggtatttttcctttttccctgaacgcatccatttaaaccaccgcttgcgttttttgacc
tctaaagccctagcgtgtttgatggtgtttgaaaggcaaaatttaggctttaaagctaat
tcatgggggaatagccctttgagcgtgtttaaaaatttggattattccccttttttattc
aatttccacaaccaagaagtgagccataataacgctaaagaaattgccagagtgaatggg
catactttagttataggggcaaccggaagcggtaaaagcacgctgattagctttttaatg
atgagcgctttaaaataccaaaacatgcgccttttagcttttgacaggatgcaagggctg
tattctttcaccgaattttttaaagggcattaccatgacggccaatcttttagcattaat
cccttttgtttagagcctaatttacagaatttagaatttttgcaatccttttttttgagc
atgttggatctcgccccttcaagggataaagaagccttagaagacatgaatgcggtttct
ggtgcgattaagagcctttatgagaccttataccctaaagcctttagtttgctagacttt
aaagaaacgcttaaaagaacctcatctaaccaattgggcttgagtttagagccgtatttg
aataaccccctttttaacgctttgaatgacgcattcaattccaacgcttttttaaatgta
atcaacttagacgctatcacccaaaaccctaaagacttaggacttttagcctattacttg
ttttataaaattttagaagaatccaggaaaaacgacagcggttttttggtttttttagac
gagtttaaatcctatgtggaaaacgatttattgaacaccaaaatcaacgctttaatcacg
caagccaggaaagctaatggcgtggtggtgttggctttgcaagatatttaccagttaagc
ggggtcaaaaacgcccatagttttttaagcaacatggggactctcattttgtatccgcaa
aaaaacgctagggagttgaaacaccacttcaatgtgcctttgagcgagactgaaatttct
tttttagaaaacacccctttgtatgccaggcaggttttagtcaaaaatctgggtaacggg
agttctaacatgattgatgtgagtttggagagcttggggcgttatttgaaaatctttaat
tcggattctagtcatgtgaataaagtgaaagcgttacaaaaagactaccctacagagtgg
cgtgagaaacttttgaagagttag

DBGET integrated database retrieval system