Candidatus Hepatoplasma crinochetorum: X271_00249
Help
Entry
X271_00249 CDS
T03053
Name
(GenBank) Y_Y_Y domain protein
KO
K21449
trimeric autotransporter adhesin
Organism
hcr
Candidatus Hepatoplasma crinochetorum
Brite
KEGG Orthology (KO) [BR:
hcr00001
]
09180 Brite Hierarchies
09183 Protein families: signaling and cellular processes
02000 Transporters [BR:
hcr02000
]
X271_00249
Transporters [BR:
hcr02000
]
Other transporters
Pores ion channels [TC:
1
]
X271_00249
BRITE hierarchy
SSDB
Ortholog
Paralog
Gene cluster
GFIT
Other DBs
NCBI-ProteinID:
AHK22355
UniProt:
W8GSE2
LinkDB
All DBs
Position
complement(263634..269441)
Genome browser
AA seq
1935 aa
AA seq
DB search
MEKGNELNFQENESDKSNFSEEKEKITASITDSAHVQTVNPVAEGGGFQQEVNENITQSI
NSILSGNTEIKTITSYINTINSASEGGTTQQQVNQKNKEAIDNLNDEFNNIVNGNTLIQT
VTSSIETINSTSEGGTTQKQVNEKNKQNIDNLNDEFNDIVNGNTLIQTVTSSIETINSTS
EGGTTQKQVNEKNKQNIDNLNNSIVVIDDKIDNLDFDINTSKVNATSSSLEGGSTQKDIN
IKNKVNFDSLNSDISDINDKMESFGEANTTYSIKAVDTTLEGGINQKEINQVNKKDIDSI
NTLISDISSKIDDNDLKTNTGNVSTVDSFFEGGPNQKEVNEANKKSIITLDSEIIKVNSE
ISDINEKIDCMECGCDSSGCDCDDITTSTINTVNSTTEGGTTQEIVNKSNKVAIDNLSDE
ISDIINNGVPGGNTSTITTTNSITEGGSTQKEVNEANKKAIDANTQAIDANTQAIDNLSD
PVTSDITTVDSNTEGGATQQEVNETNKIAIDANTQAIDANTQAIDDLSDPVTSDITTVDS
NTEGGATQQEVNETNKIAIDANTQAIDANTQAIDDLSDPVTSDITTVDSNTEGGATHTRS
KWANKIAIDANTQAIDANTQAIDDLNNPVTSDIATVDSNTEGGATQQEVNEANKIAINAN
TQAIGTNTQAIDDLNKIVSNILLSLNSISICTGCPLTPDQEVIFSNVITTDVTVNGGNDG
SIVFDVTIANFMNTAKAVLNSNSDVIGLNPTAIIDEITLVDGENAGLSFDNLIAGTYTIE
IYDGETLISSEADIVVSEPLPDPEATVSNVIPIDVTVNGGSDGSIGFDVTIANFVDSATA
ILNPAAGTSPINLVDGVNADLSFDNLIAGTYVIEIYDGETLISSEADIVINEPLPDPEAT
VSNVIPTDVTINGGSDGSIGFDVTIANFVDLATAILNPATGTSPINLVDGVNADLSFDNL
IAGTYVIEIYDGETLISSEADIVINEPLPDPEATVSNVVPIDVTVNGGSDGSIGFDVTIA
NFVDLATAILNPATGTSPISLVDGANADLSFDNLIAGTYTIEIYDGETLISSEADIVINE
PLPDPEATVSNVIPTDVTVNGGSDGSIGFDVTIANFVDLATAILNPATGTSPISLVDGAN
ADLSFDNLIAGTYTIEIYDGETLISSEADIVINEPLPDPEATVSNVIPTDVTVNGGSDGS
IGFDVTIANFVDLATAVLNPATGTSPISLVDGANADLSFDNLIAGTYTIEIYDGETLISS
EADIVVSEPLPDPEATVSNVIPTDVTINGGSDGSIGFDVTIANFVDLATAILNPATGTSP
ISLVDGANADLSFDNLIAGTYTIEIYDGETLISSEADIVVSEPLPDPEATVSNVIPTDVT
INGGSDGSIGFDVTIANFVDLATAVLNPATGTSPISLVDGANADLSFDNLIAGTYTIEIY
DGETLISSEADIVINEPLPDPEATVSNVIPTDVTINGGSDGSIGFDVTIANFVDLATAIL
NPATGTSPINLVDGVNADLSFDNLIAGTYVIEIYDGETLISSEADIVINEPLPDPEATVS
NVIPTDVTINGGSDGSIGFDVTIANFVDLATAVLNPATGTSPISLVDGANTGLIFDNLIA
GTYVIEIYDGEELISSEADIVVSEPNIGGNDFIPLTPEDDDANSKTSGEILDSYLNYDII
LSKNQHPNYVGNGLFIGKEIDINDSNQSGITSNNEIQKLIFTDPTNFNLDIIGDFTGIYY
LKGINVGLTPLITEGIYENNDNFTWLEDITQFNMIVQKWWDNTRNNFSYTLWEQTTDPEQ
NYIYVAKNAADTALNGWRFSNQEVSTGIGEGSYITMIYGFNFTSIDNLVISQTSDTFTLN
DYTSYDLLLFKIEGSNFAVGDWVIKVSDIVADGITNHSYSNYQQEHFTITGNVLTWTSGG
GLGHLELLGVKGIII
NT seq
5808 nt
NT seq
+upstream
nt +downstream
nt
atggaaaagggaaatgaattaaattttcaagaaaatgaatctgataaaagtaatttttca
gaagaaaaagaaaaaattacagcatcaattactgactctgctcatgtacaaacagtaaat
cctgttgctgaaggtgggggatttcaacaagaagtaaacgaaaatattacacaaagtatt
aattctattttaagtggtaatactgaaataaaaactattacatcatatattaatactatt
aactctgcttctgaaggtggaacaacacaacaacaagtaaatcaaaaaaataaagaagcg
attgataatttaaatgatgaatttaataatattgttaatggtaatactttaatacaaact
gttacttcttctattgaaacaattaattctacttctgaaggcggaacaacacaaaagcaa
gtaaatgaaaaaaataaacaaaacattgataatttaaatgatgaatttaatgatattgtt
aatggtaatactttaatacaaactgttacttcttctattgaaacaattaattctacttct
gaaggcggaacaacacaaaagcaagtaaatgaaaaaaataaacaaaacattgataattta
aataattcaattgttgtaattgatgataaaattgataatttagattttgatataaatact
tcaaaagttaatgcaactagttcttctttagaaggtggatcaacgcaaaaagatattaat
ataaaaaataaagttaattttgattcactaaattcagatatttctgatattaatgataaa
atggaatcttttggagaagctaataccacttattctattaaagcggtcgatactacttta
gaaggcggaataaatcaaaaagaaataaatcaagttaataaaaaagatattgatagtata
aataccttaattagtgacattagttctaagattgatgataatgatttaaaaaccaataca
ggaaatgtatctactgttgatagtttttttgaaggtgggccaaatcaaaaagaagtaaat
gaagctaataaaaaaagtattattactttagattctgaaattattaaagttaattctgaa
atttctgatattaatgaaaagattgattgtatggaatgtggttgtgattcttctggttgc
gattgcgatgatattacaacttcaactattaatactgtaaattctacgactgaaggtgga
acaacacaagaaattgtaaataaaagtaataaagtagcaattgataatttaagtgatgaa
attagtgatattataaataatggtgtgccaggaggaaatacttcaactattactactact
aattcaattactgaaggtggttctacacaaaaagaagtaaatgaagctaataaaaaagca
attgatgctaatactcaagcaattgatgctaatacccaagcaatagataatttaagtgat
ccagttacttcagatattactacagttgattctaatactgaagggggagcaacacaacaa
gaagtaaatgaaactaataaaattgcaattgatgcaaatacgcaagcaattgatgcaaat
acgcaagcaattgatgatttaagtgatccagttacttcagatattactacagttgattct
aatactgaagggggagcaacacaacaagaagtaaatgaaactaataaaattgcaattgat
gcaaatacgcaagcaattgatgcaaatacgcaagcaattgatgatttaagtgatccagtt
acttcagatattactacagttgattctaatactgaagggggagcaacacatacaagaagt
aaatgagctaataaaattgcaattgatgcaaatacgcaagcaattgatgcaaatacgcaa
gcaattgatgatttaaataatccagttacttcagatattgctacagttgattctaatact
gaaggtggggcaacacaacaagaagtaaatgaagctaataaaattgcgattaatgctaat
acacaagcaattggtactaatacccaagcaatagatgatttaaataaaattgtttctaat
attttattaagccttaattcaatatctatttgtactggatgccctttaactccagatcaa
gaagtaatattttcaaatgttattacaactgatgtaactgtaaatggtggtaatgatggt
tcaattgtatttgatgttacaattgctaactttatgaatacagcaaaagcagttttaaat
tcaaattcagatgtaataggattaaatcctacagcaataatagatgaaattactttagtt
gatggagaaaatgctggtttgagttttgataatttaattgctggaacatatacaattgaa
atttatgatggagaaactttaattagttcagaggcagatattgttgtttctgaacctctc
ccagatccagaggcaacagtttcaaatgttattccaattgatgtaactgtaaatggtggt
agtgatggttcaattggatttgatgttacaattgctaactttgttgattcagcaactgct
attttaaatcctgctgctggaacaagtccaattaacttagttgatggagtaaatgctgat
ttgagttttgataatttaattgctggaacatatgtaattgaaatttatgatggagaaact
ttaattagttcagaggcagatatagtgattaatgaacctctcccagatccagaggcaaca
gtttcaaatgttattccaactgatgtaactataaatggtggtagtgatggttcaattgga
tttgatgttacaattgctaactttgttgatttagcaactgctattttaaatcctgctact
ggaacaagtccaattaacttagttgatggagtaaatgctgatttgagttttgataattta
attgctggaacatatgtaattgaaatttatgatggagaaactttaattagttcagaggca
gatatagtgattaatgaacctctcccagatccagaggcaacagtttcaaatgtagttcca
attgatgtaactgtaaatggtggtagtgatggttcaattggatttgatgttacaattgct
aactttgttgatttagcaactgctattttaaatcctgctactggaacaagtccaattagc
ttagttgatggagcaaatgctgatttaagttttgataatttaattgctggaacatataca
attgaaatttatgatggagaaactttaattagttcagaggcagatatagtgattaatgaa
cctcttccagatccagaggcaacagtttcaaatgttattccaactgatgtaactgtaaat
ggtggtagtgatggttcaattggatttgatgttacaattgctaactttgttgatttagca
actgctattttaaatcctgctactggaacaagtccaattagcttagttgatggagcaaat
gctgatttaagttttgataatttaattgctggaacatatacaattgaaatttatgatgga
gaaactttaattagttcagaggcagatatagtgattaatgaacctcttccagatccagag
gcaacagtttcaaatgttattccaactgatgtaactgtaaatggtggtagtgatggttca
attggatttgatgttacaattgctaactttgttgatttagcaactgcagttttaaatcct
gctactggaacaagtccaattagcttagttgatggagcaaatgctgatttaagttttgat
aatttaattgctggaacatatacaattgaaatttatgatggagaaactttaattagttca
gaggcagatattgttgtttctgaacctctcccagatccagaggcaacagtttcaaatgtt
attccaactgatgtaactataaatggtggtagtgatggttcaattggatttgatgttaca
attgctaactttgttgatttagcaactgctattttaaatcctgctactggaacaagtcca
attagcttagttgatggagcaaatgctgatttaagttttgataatttaattgctggaaca
tatacaattgaaatttatgatggagaaactttaattagttcagaggcagatattgttgtt
tctgaacctctcccagatccagaggcaacagtttcaaatgttattccaactgatgtaact
ataaatggtggtagtgatggttcaattggatttgatgttacaattgctaactttgttgat
ttagcaactgcagttttaaatcctgctactggaacaagtccaattagcttagttgatgga
gcaaatgctgatttaagttttgataatttaattgctggaacatatacaattgaaatttat
gatggagaaactttaattagttcagaggcagatatagtgattaatgaacctctcccagat
ccagaggcaacagtttcaaatgttattccaactgatgtaactataaatggtggtagtgat
ggttcaattggatttgatgttacaattgctaactttgttgatttagcaactgctatttta
aatcctgctactggaacaagtccaattaacttagttgatggagtaaatgctgatttgagt
tttgataatttaattgctggaacatatgtaattgaaatttatgatggagaaactttaatt
agttcagaggcagatatagtgattaatgaacctctcccagatccagaggcaacagtttca
aatgttattccaactgatgtaactataaatggtggtagtgatggttcaattggatttgat
gttacaattgctaactttgttgatttagcaactgcagttttaaatcctgctactggaaca
agtccaattagcttagttgatggagcaaatacaggattgatctttgataatttaattgct
ggaacatatgtaattgaaatttatgatggagaggaattaattagttcagaggcagatata
gttgtttctgaacctaatattggtggtaatgattttattccattaacacctgaggatgat
gatgctaatagtaaaacaagtggagaaatattagatagttatttaaattatgatattatt
ttgagtaaaaatcaacatcctaattatgtgggaaatggtttgtttattggtaaagaaata
gatattaatgattcaaatcaaagcggaattacaagtaataatgagattcaaaaattaata
tttactgatcctactaattttaatttagatattataggtgattttactggaatatattat
ttaaaaggaattaatgttgggctaacacctttaattacagaaggtatttatgaaaataat
gataattttacttgattagaagacattacacaatttaatatgattgttcaaaaatgatga
gataatacaagaaataattttagttatactttatgagaacaaacaacagatccagagcaa
aactatatttatgttgccaaaaatgctgctgatactgctcttaatggttgaagattttca
aaccaagaagtttcaacaggaataggtgaaggtagttacataacaatgatttatggtttt
aactttacatcaatagataatcttgtgatatctcaaacttctgatactttcactttaaat
gattacacttcttatgatttattattatttaaaattgaaggaagcaattttgctgttggt
gattgagttattaaagttagtgatattgttgctgatggtataacaaatcattcttattct
aattaccagcaagaacactttacaattactggaaatgttttaacttgaactagtggtggc
ggtttaggacatcttgaactattaggagtgaaaggaattataatttaa
DBGET
integrated database retrieval system
